TOPIC: Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 10:32 #331
Quantrinas написал(а):
Могу только ответить на конкретные вопросы.
Вводная часть … мы рассматриваем модель расплетения ДНК newsample.com/01/Model_DNK.htm . Такой вид расплетений - упрощенная модель для ДНК БЕЗ белков. В хромосомах же ДНК покрыта слоем беков - гистонов и протаминов. Только в случае депротеинизации при синтезе мРНК идет расплетание по этому механизму. Разобравшись с возможным механизмами передчи ЭМ информации на более простом и уже описанном варианте, этот процесс можно развить и далее (при положительном варианте).
Сперва вопрос возможности любого ЭМ излучения … Согласно предложенного Вами варианта … . выделили организацию такого взаимодействия как квадруполь который тут можно рассматривать как совокупность двух одинаковых диполей с равными по величине и противоположными по направлению дипольными моментами, расположенных на некотором расстоянии друг от друга....
При обсуждении были высказаны сомнения в том, что сосредоточение в левой и правой части этого расширения (поперек а не вдоль ДНК т.е не путать с передним фронтом и задним фронтом этого расплетения) неких зарядов не могут дать этот вариант излучения. Как разрешить этот возможный казус ...
ps
ППГ написал(а):
Поменялся КОНТЕКСТНЫЙ ПЕЙЗАЖ ДНК нового генома и результат этого – смена смыслов некоторых мРНК.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 10:37 #332
mishabara написал(а):
При обсуждении были высказаны сомнения в том, что сосредоточение в левой и правой части этого расширения (поперек а не вдоль ДНК) неких зарядов не могут дать этот вариант излучения. Как разрешить этот возможный казус ...
Да очень просто - поменяйте левую и правую части на нижнюю и верхнюю половину соответственно.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 11:02 #333
Для особо любознательных ... верхняя и нижняя часть этих фронтов не вращаются и находятся в стационарном положении относительно левой и правой части, кои вращаются с определенной скоростью ...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 11:30 #335
Вася ты опять гонишь ... ВСЕ по частям... сперва нужно убедительно показать Твердому Орешку, что ЭМ тут существует, а потом и будем демонтировать методы добавления энергии и скорости ... для того что бы и получить искомое ... счастье ...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 11:38 #336
Но вот работающий сегодня в США ваш соотечественник с коллегами предложили для объяснения этой загадки собственную идею. Прежде всего они обратили внимание на тот факт, что разные фрагменты ДНК обладают разным распределением заряда, в зависимости от конкретного набора азотистых оснований. Исходя из этой посылки, ученые подсчитали распределение заряда и попытались найти в нем закономерности. Оказалось, что закономерности имеются. Разные части ДНК обладают разными особенностями распределения заряда. А это означает: в принципе, по одним участкам ток может течь, а другие служат естественными «изоляторами» тока. Это позволяет представить цепочку ДНК, как набор проводящих и непроводящих фрагментов. Таким образом при расплетении набора проводящих и непроводящих фрагментов и генерируется ЭМ.
Role of the particle’s stepping cycle in an asymmetric exclusion process: A model of mRNA translation
L. Ciandrini1,*, I. Stansfield2, and M. C. Romano1,2
1Institute for Complex Systems and Mathematical Biology, King’s College, University of Aberdeen, AB24 3UE Aberdeen, United Kingdom
2Institute of Medical Sciences, Foresterhill, University of Aberdeen, AB25 2ZD Aberdeen, United Kingdom
Received 14 December 2009; published 5 May 2010
Messenger RNA translation is often studied by means of statistical-mechanical models based on the asymmetric simple exclusion process (ASEP), which considers hopping particles (the ribosomes) on a lattice (the polynucleotide chain). In this work we extend this class of models and consider the two fundamental steps of the ribosome’s biochemical cycle following a coarse-grained perspective. In order to achieve a better understanding of the underlying biological processes and compare the theoretical predictions with experimental results, we provide a description lying between the minimal ASEP-like models and the more detailed models, which are analytically hard to treat. We use a mean-field approach to study the dynamics of particles associated with an internal stepping cycle. In this framework it is possible to characterize analytically different phases of the system (high density, low density or maximal current phase). Crucially, we show that the transitions between these different phases occur at different parameter values than the equivalent transitions in a standard ASEP, indicating the importance of including the two fundamental steps of the ribosome’s biochemical cycle into the model.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 13:37 #340
ППГ написал(а):
команда Вентера действительно получила новые «синтетические» клетки, но они, скорее всего, не идентичны клеткам-Донорам генома и не идентичны клеткам-Реципиентам генома. Получилась новая линия микоплазмы, фактически – мутант.
Петр, это очевидно и само собой
- ясно, что любые изменения последовательности нуклеотидов в принципе (в потенции) могут оказаться существенными. Никчему привлекать умные слова как лингвистика, семанатика, КОНТЕКСТНЫЙ ПЕЙЗАЖ и т.д. В команде Вентера хорошо знают какие участки нуклеотидов скорее действенные и какие являются пустым местом или даже можно опустить/вырезать, чтобы не засоряли тот же самый пейзаж. Что им мешало засунуть в чужую клетку совершенно естественный геном другой бактерии? Даже не надо было утруждать себе жизнь с искусственным синтезом того, что Природа уже создала, где тут смысл?
Однако ребята Вентера попросту экспериментируют, балуются, хотят посмотреть как одни участки кодонов влияют на другие в разных комбинациях - это как раз то, что Вы, Петр, громогласно называете лингвистико-семантическо-смысловой КОНТЕКСТНЫЙ ПЕЙЗАЖ ДНК
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 14:38 #341
Quantrinas написал(а):
Профессионал проверит общий английский, но исказит специальную терминологию. Раньше в академических институтах были специальные переводчики, которые учились переводить научные тексты. Более того, только один раз мою статью, написанную для ЖЭТФ на русском, перевел на английский профессиональный журнальный переводчик, больше я таких экспериментов не делал, ибо сам лучше знаю конкретные нюансы. Вы должны писать сами и только потом показывать переводчику для проверки языка.
Помнится, даже на мехмате МГУ у тамошних англичанок были сложные отношения с математическим английским (т.е., языком, на котором написаны действительно математические статьи и книги, а не научпоп). Как то раз нам задали изложить на 2-3 страничках краткое содержание какой-нибудь серьезной математической книги. Ну я там написал что-то от себя, а потом, каюсь, дословно передрал большой кусок из введения (резонно рассчитывая, что англичанка саму книгу не видела, и не увидит). Так вот, в том, что я сам написал, ошибок было почти не найдено. А вот в передранном куске (написанном очень серьезным математиком, носителем языка), она нашла много стилистических и терминологических ошибок
Arabic morphology in the neural language system.
Boudelaa S, Pulvermller F, Hauk O, Shtyrov Y, Marslen-Wilson W.
MRC Cognition and Brain Sciences Unit, Cambridge, UK.
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Abstract
There are two views about morphology, the aspect of language concerned with the internal structure of words. One view holds that morphology is a domain of knowledge with a specific type of neurocognitive representation supported by specific brain mechanisms lateralized to left fronto-temporal cortex. The alternate view characterizes morphological effects as being a by-product of the correlation between form and meaning and where no brain area is predicted to subserve morphological processing per se. Here we provided evidence from Arabic that morphemes do have specific memory traces, which differ as a function of their functional properties. In an MMN study, we showed that the abstract consonantal root, which conveys semantic meaning (similarly to monomorphemic content words in English), elicits an MMN starting from 160 msec after the deviation point, whereas the abstract vocalic word pattern, which plays a range of grammatical roles, elicits an MMN response starting from 250 msec after the deviation point. Topographically, the root MMN has a symmetric fronto-central distribution, whereas the word pattern MMN lateralizes significantly to the left, indicating stronger involvement of left peri-sylvian areas. In languages with rich morphologies, morphemic processing seems to be supported by distinct neural networks, thereby providing evidence for a specific neuronal basis for morphology as part of the cerebral language machinery.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 18:19 #350
Из блога Яблокова. Известный биолог. Вот вам шуточки с ГМ продуктами. Они - следствие недопонимания работы белок синтезирующего аппарата, т.е. слепая вера, что модель триплетного кода правильная и не содержит принципальной ошибки. Пытался снова поднять этот вопрос в молбиол ру, но идиотка ок вновь все стерла. Вредитель и враг народа.
yablokov
(#)
Уважаемые защитники ГМО!
Как это Вы просмотрели недавнюю пресс-конференцию в РИА «НОВОСТИ», с результатами многолетнего опыта, проведенного в Институте проблем экологии и эволюции РАН на лабораторной популяции хомячков Кэмпбелла (Phodopus campbelli). Из одновозрастных половозрелых особей были сформированы семейные пары, которые были разбиты на 4 группы по 5 репродуктивных пар в каждой. Первая группа получала корм с добавлением чистой не-трансгенной сои. Вторая и третья группы отличались между собой по количеству ГМ-сои в корме.
У хомячков было обнаружено отставание в развитии и росте; нарушение соотношения полов в выводках с увеличением доли самок; уменьшение числа детенышей в помёте, вплоть до их полного отсутствия у второго поколения животных, нарушения развития репродуктивной системы у самцов и самок у животных, получавших ГМ-корм, по сравнению с контрольными особями.
В результате влияния ГМ-корма уже второе поколение оказалось практически бесплодным. «…Природа поставила крест на генетических перспективах животных, которые питаются ГМ-кормом». В главном журнале РАН – Докладах, за апрель этого года есть интресная статья с некоторыми подробностями результатов этого эжксперимента. Меня поразило то, что у получавших ГМ-корма хомячков волосы стали расти … во рту! Посмотрите эти фотографии.
На сайте Общероссийской ассоциации генетической безопасности (www.oagb.ru) есть немало материалов по весьма страшному влиянию ГМ-продуктов.
Хорошо, что в «Доктрине продовольственной безопасности Российской Федерации» указано о необходимости «исключить бесконтрольное распространение пищевой продукции, полученной из генетически модифицированных растений», плохо, что это требование пока остается декларацией.
Насчет французского профессора Сералини, проведшего множество экспертиз ГМО надо бы выяснить откуда получает деньги его лаборатория молекулярной биологии. До этого окапзывалось что ярые защитники ГМО оыбчно связаны с фирмами-производителями.
Ответить
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 18:35 #351
Хайдук написал(а):
Однако ребята Вентера попросту экспериментируют, балуются, хотят посмотреть как одни участки кодонов влияют на другие в разных комбинациях
Ну можно ли всерьёз отвечать на этот малограмотный бред... Хайдук, пошевели мозгами, или хотя бы усами... о каких кодонах толкуешь? На этом, кодоновом, уровне они не работают, такие вопросы не задают... только в твоем неграмотном вооображении такие баловливые задачки ими поставлены... Охренидзе. Ну ни одного толкового биолога не вижу... с кем дискутировать? Физики вообще не в счет.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 18:40 #352
ППГ написал(а):
ни одного толкового биолога не вижу... с кем дискутировать
А не могла Вас ослепить спермо-вспышка Тертышного? Ударить голограммой спермы по сетчатке? Или даже нейроны могло задеть, нарушить потенциалы действия, создать в мозгу стоячие волны!
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№9)
29 Май 2010 18:49 #355
PP написал(а):
А не могла Вас ослепить спермо-вспышка Тертышного? Ударить голограммой спермы по сетчатке? Или даже нейроны могло задеть, нарушить потенциалы действия, создать в мозгу стоячие волны
