меняется только степень использования их для регуляции уровня включения лейцина в белок
Так и я о том же...ЭТО функция избыточности кода.А Крик постулировал воблирование как случайный процесс???
А теперь об омонимах...В чем смысл их контекстного переключения?
Так и я о том же...ЭТО функция избыточности кода.А Крик постулировал воблирование как случайный процесс???
А теперь об омонимах...В чем смысл их контекстного переключения?
В функции кодирования не входит количественный аспект кодирования, т.е. СКОЛЬКО кодировать.
Кодирование - это прежде всего ЗНАКОВЫЕ функции, обозначение кодируемого объекта, субъекта, процесса. Это КАЧЕСТВЕННОЕ взаимоотображение Обозначаемого и Знака. Категория МЕРЫ сюда не входит. А если входит, то опосредованно через ВЕРОЯТНОСТЬ. Поэтому и дал вам ссылку на монографию В.В.Налимова "Вероятностная модель языка", полагаю применимую к языку генов. У этой модели есть формализм, связанный с уравнением Бейеса-Налимова. С этим сейчас и разбираюсь.
А смысл контекстных переключений сиом-кодонов - в снятии их неоднозначности кодирования аминокислот и стопов с приданием точного однозначного смысла сиомам, смысла (значения), получаемого рибосомами при чтении контекста мРНК.
Думал, что вы это давно поняли...
В функции кодирования не входит количественный аспект кодирования, т.е. СКОЛЬКО кодировать
Это почему же? Вы сами говорите об УРОВНЕ включения... nonlocality wrote:
А смысл контекстных переключений сиом-кодонов - в снятии их неоднозначности кодирования аминокислот и стопов с приданием точного однозначного смысла сиомам, смысла (значения), получаемого рибосомами при чтении контекста мРН
Это общее положение...В чем конкретно смысл контекста?
nonlocality wrote:
В функции кодирования не входит количественный аспект кодирования, т.е. СКОЛЬКО кодировать
Это почему же? Вы сами говорите об УРОВНЕ включения...
nonlocality wrote:
Nonlock: этот уровень - не результат кодирования-декодирования, но чистая биохимия.
А смысл контекстных переключений сиом-кодонов - в снятии их неоднозначности кодирования аминокислот и стопов с приданием точного однозначного смысла сиомам, смысла (значения), получаемого рибосомами при чтении контекста мРН
Hide: Это общее положение...В чем конкретно смысл контекста?
Nonlock: смысл контекста, частности, в придании точного СМЫСЛА словам-омонимам (в т.ч. сиомам), например, словам с двойными смыслами - коса, ключ, рейд, бокс и т.д. То же относится к 32 кодонам-сиомам.
Nonlock: смысл контекста, частности, в придании точного СМЫСЛА словам-омонимам (в т.ч. сиомам), например, словам с двойными смыслами - коса, ключ, рейд, бокс и т.д. То же относится к 32 кодонам-сиомам.
Петр, это ниачем... В этом мире ВСЁ зависит от контекста
500
500
евро
рубли
Без второй строки сиом. Со второй строкой уже не сиом
Это все, что Вы имеете сказать по вопросу?
Я уже говорил Вам, Петр, смысл науки обобщенно - это поиск инвариантов
Вы говорите, что инвариантов Вы не видите.
Ну значит и не видите...
Причем тут наука?
И тут пятьсот и тут пятьсот
Но контекст...
И такая фигня является предметов Ваших тридцатилетних воплей?
Не густо
hide wrote:
Так в чем же этот точный смысл - вот о чем вопрос...
Обрезанный вопрос сродни непониманию вами самого вопроса. Поставьте его расширенно. С контекстом...
Хорошо...В каких случаях контекст мРНК диктует СТОП,а в каких - трансляцию белка у кодона - омонима? Ответ - "в определённых" - не подходит...
Хорошо...В каких случаях контекст мРНК диктует СТОП,а в каких - трансляцию белка у кодона - омонима? Ответ - "в определённых" - не подходит...
Да вы, оказывается, вообще ничего не поняли. Вопросы свидетельствуют об этом.
Можно было бы коротко, но не получится. Не поймете. Переоценил. Учите мат часть.
То же Владимировичу. Но поздно.
Я уже говорил Вам, Петр, смысл науки обобщенно - это поиск инвариантов
Вы говорите, что инвариантов Вы не видите.
Ну значит и не видите...
Причем тут наука?
И тут пятьсот и тут пятьсот
Но контекст...
И такая фигня является предметов Ваших тридцатилетних воплей?
Не густо
Покойный Ф.Крик почти 50 лет пытался увидеть в 3'-нуклеотидах кодонов нечто..., но так и не увидел. Вы тоже... И это сближает вас, и обнадеживает. Но повторю, поздновато.
Д.Уотсон жив, но тоже не понимает, следовательно, близок вам. Приятно... не правда ли? Вы на уровне Нобелиатов
Общеизвестно,что схоласты,демагоги,про ходимцы от науки и псевдо-ученые,как только вопросы начинают касаться конкретики,сразу обвиняют оппонентов в безграмотности,неспособности в чем-либо разобраться и отправляют учить матчасть...Согласны?
Общеизвестно,что схоласты,демагоги,про ходимцы от науки и псевдо-ученые,как только вопросы начинают касаться конкретики,сразу обвиняют оппонентов в безграмотности,неспособности в чем-либо разобраться и отправляют учить матчасть...Согласны?
Конкретики вам дал много, но "не в коня корм". Вы любите жвачку, а вам дают свежее мясо...
Покойный Ф.Крик почти 50 лет пытался увидеть в 3'-нуклеотидах кодонов нечто..., но так и не увидел. Вы тоже... И это сближает вас, и обнадеживает. Но повторю, поздновато.
Д.Уотсон жив, но тоже не понимает, следовательно, близок вам. Приятно... не правда ли? Вы на уровне Нобелиатов
Нет, Петр, я гораздо дальше
Вы поймите одну простую вещь... А то Вы тупите...
Какие есть варианты...
Инвариантность будет что трансляция кодона приводит к синтезу одного и того же (аминокислот белка например)
1. Инвариантна уже пара нуклеотидов. Для любого третьего итог тот же.
2. Инвариантна тройка нуклеотидов. То бишь третий влияет на.
3. Даже одна и та же тройка нуклеотидов может транслироваться в разные вещи в зависимости от контекста.
Я так понимаю, что при определенных условиях может быть любой из этих вариантов
Так вот задача биолога - объяснить когда точно происходит то, а когда это.
Это и будет инвариантом следующего уровня.
Это вот наука, Петр.
Но Вы не можете этого объяснить народу уже сколько времени.
А вопить 99% времени слова контекст, Крик дурак, омоним и сиом это матрица Бендера, Петр
Общеизвестно,что схоласты,демагоги,про ходимцы от науки и псевдо-ученые,как только вопросы начинают касаться конкретики,сразу обвиняют оппонентов в безграмотности,неспособности в чем-либо разобраться и отправляют учить матчасть...Согласны?
Дело в том,что жизнедеятельность организма возможна в некотором "коридоре" внешних условий и воздействий. Именно поэтому их генетический код обладает механизмами,которые осуществляют адаптационные перестройки обмена веществ.В частности - биоинтеза белка. Конкретно,это выражается в том,что геном подразделяется на два основных пула кодонов,дифференцированных по способу ответа на изменение условий: Первый,т.н. "синонимы", регулируют интенсивность белкового обмена,используя неравнозначность процесса узнавания "кодон - антикодон" для триплетов с альтернативным третьим нуклеотидом в мРНК. Второй,т.н. "омонимы",в зависимиости от условий (контекстно) функционирующие как канонические STOP-кодоны или же как трансляционные кодоны.Суть контекста для данного пула - экстремальные измененияусловий (crash-ситуации).При этом дополнительно включается экспрессия необходимого белка,синтез которого в достаточном, для данных условий, количестве не обеспечивается канонической трансляцией.
Для механизма этих адаптаций характерно то,что запрос,в виде изменения условий,и ответ организма,в виде адаптационной реакции происходят в плоскости биохимии белков,т.е. на каноническом материальном уровне.
Инвариантненько?
Нет, Петр, я гораздо дальше
Вы поймите одну простую вещь... А то Вы тупите...
Какие есть варианты...
Инвариантность будет что трансляция кодона приводит к синтезу одного и того же (аминокислот белка например)
ПГ: Уже ошибка. Тупите. Трансляция с кодона одной и той же аминокислоты будет,
П О В Т О Р Я Ю, если кодоны есть СИНОНИМЫ, а их 8 семейств по 4 кодона в каждом. И в каждом кодируются СВОИ аминокислоты. Если это не понято, дальше говорить бесполезно. Что еще сказать? Только - учите мат. часть. Тем более, это свойство синонимов известно уже 50 лет и проходят на 1-м курсе биол. ф-тов и мед инст-в.
1. Инвариантна уже пара нуклеотидов. Для любого третьего итог тот же.
ПГ: Нет, ну так нельзя. Какая пара? Комплементарная? Или пара в последовательности нуклеотидов в ДНК гена или в мРНК? Надо же владеть школьным материалом... И в чем инвариантность? Если речь о комплементарных нуклеотидах, то инвариантности нет и в помине...
2. Инвариантна тройка нуклеотидов. То бишь третий влияет на.
ПГ: Тут-то, в триплете, в чем инвариантность? "Третий влияет на..." что? Тут особая песня влияний, тут фокус событий... Что имеется в виду?
3. Даже одна и та же тройка нуклеотидов может транслироваться в разные вещи в зависимости от контекста.
ПГ: Ну хоть что-то верно.
Я так понимаю, что при определенных условиях может быть любой из этих вариантов
Так вот задача биолога - объяснить когда точно происходит то, а когда это.
Это и будет инвариантом следующего уровня.
ПГ: только последний вариант может иметь место быть. Я не брюзжу, но отмечу - незнание основ мол. биологии и генетики открывает лицо без маски многозначительности.
Дело в том,что жизнедеятельность организма возможна в некотором "коридоре" внешних условий и воздействий. Именно поэтому их генетический код обладает механизмами,которые осуществляют адаптационные перестройки обмена веществ.В частности - биоинтеза белка.
Конкретно,это выражается в том,что геном подразделяется на два основных пула кодонов,дифференцированных по способу ответа на изменение условий:
Первый,т.н. "синонимы", регулируют интенсивность белкового обмена,используя неравнозначность процесса узнавания "кодон - антикодон" для триплетов с альтернативным третьим нуклеотидом в мРНК.
Второй,т.н. "омонимы",в зависимиости от условий (контекстно) функционирующие как канонические STOP-кодоны или же как трансляционные кодоны.Суть контекста для данного пула - экстремальные изменения условий (crash-ситуации).При этом дополнительно включается экспрессия необходимого белка,синтез которого в достаточном, для данных условий, количестве не обеспечивается канонической трансляцией.
Для механизма этих адаптаций характерно то,что запрос,в виде изменения условий,и ответ организма,в виде адаптационной реакции лв плоскости биохимии белков,т.е. на каноническом материальном уровне.
Инвариантненько?
Первый путь "дифференциации кодонов" (синонимов) по Хайду не имеет отношения к "дифференциации", поскольку идет по пути участия одного из рибосомальных белков в биохимическом переходе Цитозин-->5метил-цитозин в ТТ-классе сиом кодонов. Это резко увеличивает частоту включения лейцина в один из рибосомальных белков, участвующих в ускорении перехода Цитозин-->5метил-цитозин. Имеется в виду - пример, приведенный Хайдом выше. Таким образом, первый путь - это не дифференциация кодонов синонимов, но обычная биохимия, не затрагивающая кодовые процессы в кодонах-синонимах.
Второй путь дифференциации кодонов понят Хайдом тоже неправильно. Таковыми кодонами Хайд считает стоп кодоны. Их три - один в TG сиом-семействе, другие два - в ТА сиом-семействе. При этом стоп кодоны образуют синонимические пары (внутрипарная синонимия) и противостоят другим парам как омонимы. "Экстремальные ситуации" не имеют отношения к кодовым функциям триплетов и никакие дополнительные экспрессии сиом кодонов в таких "ситуациях" не работают. Все сиом кодоны, включая стоповые, реализуют стратегический мРНК контекст зависимый процесс выбора аминокислот и стоп позиций в ситуациях встречи рибосом с сиом кодонами, которые имеют двойное (неопределенное) кодирование. Здесь же реализуется стратегический акт делегирования буквенного значения 3'-вобулирующему третьему нуклеотиду в сиомах. Этот процесс давал здесь неоднократно. Повторять не буду, да и ссылку на нашу статью об этом тоже давал. Это хайд должен был усвоить и запомнить. Или, по крайней мере, обосновать его ошибочность, если он так считает.
Таким образом, "все сложнее, чем на самом деле".
П О В Т О Р Я Ю, если кодоны есть СИНОНИМЫ, а их 8 семейств по 4 кодона в каждом. И в каждом кодируются СВОИ аминокислоты. Если это не понято, дальше говорить бесполезно.
Не умничайте тут Конечно свои
По классической таблице UCU UCC UCA UCG кодируются в Серин
Это вариант №1 - Инвариантна уже пара нуклеотидов. Для любого третьего итог тот же.
А Вы, Петр, что вопите?
Далее, UUU UUC Фенилаланин, а UUA UUG Лейцин
Это вариант №2 - Инвариантна тройка нуклеотидов. То бишь третий влияет на.
Ферштеен пока?
А вот AUG может быть стартовым и транслирует метионин
Это вариант №3 - Даже одна и та же тройка нуклеотидов может транслироваться в разные вещи в зависимости от контекста.
А теперь, что вопите Вы?nonlocality wrote:
только последний вариант может иметь место быть. Я не брюзжу, но отмечу - незнание основ мол. биологии и генетики открывает лицо без маски многозначительности.
Нет, Петр, основы биологии не такие. А какие я сказал. Даже биологии Вас приходтся учить
А если биология не такова, и основы неверны, то это вопрос уже совсем другой и мне простительно не знать об этом.