TOPIC: Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах
Контексты и комментарии генома
14 Март 2019 18:53 #541
Vladimirovich wrote:
Это не факт, а определение инвариантности
Я Вам изложил все возможные варианты с математической точки зрения
А Вы что отвечаете?
Совершенная тупость с Вашей стороны при логическом обсуждении
Учите матчасть - Логику
Увы, не вижу логики у Вас. Только общие слова в ответ на конкретные и предметные соображения, связанные с Вашими детскими ошибками незнания предмета обсуждения. Первоклашки начинают с азбуки. Последуйте же их примеру.
Контексты и комментарии генома
14 Март 2019 20:07 #543
Вернемся к "Дискуссии"... Vladimirovich wrote:
Какие есть варианты...
Инвариантность будет что трансляция кодона приводит к синтезу одного и того же (аминокислот белка например)
ПГ: вы же ничего не объясняете. Откуда кодоны, какие кодоны? Я должен догадываться? Так не дискутируют...
1. Инвариантна уже пара нуклеотидов. Для любого третьего итог тот же.
ПГ: Откуда взята пара? Я же не гадалка. Сказали бы - из синонимов, мол. Тогда было бы ясно. И элементарно.
2. Инвариантна тройка нуклеотидов. То бишь третий влияет на.
ПГ: Снова то же. Откуда тройка? Какая? Запутать что ли хотели? Так не годится
3. Даже одна и та же тройка нуклеотидов может транслироваться в разные вещи в зависимости от контекста.
ПГ: Ну это-то мне понятно...
Я так понимаю, что при определенных условиях может быть любой из этих вариантов
Так вот задача биолога - объяснить когда точно происходит то, а когда это.
Это и будет инвариантом следующего уровня.
ПГ: Точно уже объяснял, когда ставил условия задачи. Вы их не задали. о я не гадалка.
Это вот наука, Петр.
Но Вы не можете этого объяснить народу уже сколько времени.
ПГ: Странно, что вам надо объяснять, что надо четко формулировать вопрос, а не кидать огрызки мыслей...
А вопить 99% времени слова контекст, Крик дурак, омоним и сиом это матрица Бендера, Петр
ПГ: Нет, не умеете вести дискуссию. Вижу только желание дать бессвязность с непонятно какой целью. Намеренно запутать.
ПГ:Вон Хайд относительно четко формулировал вопросы, правда, тоже без особых знаний о предмете дискуссии. Ему ответил достаточно четко. Но поймет вряд ли. Изначально слабая у него подготовка. Как у Вас.
Контексты и комментарии генома
14 Март 2019 20:13 #545
nonlocality wrote:
ПГ: Странно, что вам надо объяснять, что надо четко формулировать вопрос, а не кидать огрызки мыслей...
Если Вы профи, то должны понимать вопросы любителей
А Вы способны тольо щеки надувать, как мы видим nonlocality wrote:
1. Инвариантна уже пара нуклеотидов. Для любого третьего итог тот же.
ПГ: Откуда взята пара? Я же не гадалка. Сказали бы - из синонимов, мол. Тогда было бы ясно. И элементарно.
Кто сказал про синонимы? Вы, Петр, считать до двух не умеете? Vladimirovich wrote:
По классической таблице UCU UCC UCA UCG кодируются в Серин
Это вариант №1 - Инвариантна уже пара нуклеотидов.
UC - ЭТО ПАРА! Третий не играет. Надо биологию изучать, Петр nonlocality wrote:
2. Инвариантна тройка нуклеотидов. То бишь третий влияет на.
ПГ: Снова то же. Откуда тройка? Какая? Запутать что ли хотели? Так не годится
Vladimirovich wrote:
Далее, UUU UUC Фенилаланин, а UUA UUG Лейцин
Это ТРОЙКА.
И т.д.
Тут ПАРЫ не хватает для инвариантности.
Контексты и комментарии генома
14 Март 2019 21:34 #546
Vladimirovich wrote:
Кто сказал про синонимы? Вы, Петр, считать до двух не умеете?
Vladimirovich wrote:
По классической таблице UCU UCC UCA UCG кодируются в Серин
Это вариант №1 - Инвариантна уже пара нуклеотидов.
Я сказал про синонимы. CU UCC UCA UCG - именно синонимы. Вот вы и не умеете до двух считать. Математик без арифметики - уже не математик.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 02:19 #548
hide wrote:
Дело в том,что жизнедеятельность организма возможна в некотором "коридоре" внешних условий и воздействий. Именно поэтому их генетический код обладает механизмами,которые осуществляют адаптационные перестройки обмена веществ.В частности - биоинтеза белка. Конкретно,это выражается в том,что геном подразделяется на два основных пула кодонов,дифференцированных по способу ответа на изменение условий: Первый,т.н. "синонимы", регулируют интенсивность белкового обмена,используя неравнозначность процесса узнавания "кодон - антикодон" для триплетов с альтернативным третьим нуклеотидом в мРНК. Второй,т.н. "омонимы",в зависимиости от условий (контекстно) функционирующие как канонические STOP-кодоны или же как трансляционные кодоны.Суть контекста для данного пула - экстремальные измененияусловий (crash-ситуации).При этом дополнительно включается экспрессия необходимого белка,синтез которого в достаточном, для данных условий, количестве не обеспечивается канонической трансляцией.
Для механизма этих адаптаций характерно то,что запрос,в виде изменения условий,и ответ организма,в виде адаптационной реакции происходят в плоскости биохимии белков,т.е. на каноническом материальном уровне.
Инвариантненько?
никак , таких священных глупостей не писал даже лжеучёный Петрович
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 06:33 #550
nonlocality wrote:
Я сказал про синонимы.
Это Вы не сказали, а ярлык повесили
Они ведь все, Очкарики, такие. Им главное название придумать. Пока не придумал, смотреть на него жалко, дурак дураком. Ну а как придумал какой-нибудь синоним гравиконцентратор, тут ему словно все понятно становится, и сразу ему жить легче. (с)
nonlocality wrote:
CU UCC UCA UCG - именно синонимы. Вот вы и не умеете до двух считать.
UC - это ДВА символа, Петр? Или сколько?
ДВА или не ДВА? ДА или НЕТ?
Если ДВА, то Вы должны признать, что я прав.
Это вариант №1 - Инвариантна уже пара нуклеотидов.
Если не два, сходите к окулисту или психотерапевту
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 07:56 #551
Vladimirovich wrote:
nonlocality wrote:
CU UCC UCA UCG - именно синонимы. Вот вы и не умеете до двух считать.
UC - это ДВА символа, Петр? Или сколько?
ДВА или не ДВА? ДА или НЕТ?
Если ДВА, то Вы должны признать, что я прав.
Это вариант №1 - Инвариантна уже пара нуклеотидов.
Если не два, сходите к окулисту или психотерапевту
Что вы уперлись - ну два первых нуклеотида в кодонах - значащих, инвариантно кодирующих во всех 8-ми син -семействах свои аминокислоты, синонимических. 3-й вобулирует, может быть любым из 4-х. Это известно уже более 50 лет. Тут все ясно и инвариантность скучна. Это избыточность точности кодирования.
А вот в других 8-ми семействах кодонов всё по другому. И этого не могли понять ни отца Кода, ни теперешние биологи. Тупость жуткая. Эти 8 семейств и есть СИОМЫ - гибриды синонимов и омонимов. Тут-то и начинается весёлая лингвистика двусмысленостей, убираемых контекстами (смыслами) мРНК. Тут тоже есть инвариантность, но она внутрипарная, внутри двух двоек кодонов, а между парами-двойками - омонимия www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=85202 Табл.3. Вот главное, что не уидели Отцы кода. Это эволюционный поворот кодирования к ОСМЫСЛЕННОСТИ, к реальным Высшим ТЕКСТАМ-Программам.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 07:59 #552
nonlocality wrote:
Что вы уперлись - ну два первых нуклеотида в кодонах - значащих, инвариантно кодирующих во всех 8-ми син -семействах свои аминокислоты, синонимических. 3-й вобулирует, может быть любым из 4-х. Это известно уже более 50 лет. Тут все ясно и инвариантность скучна. Это избыточность точности кодирования.
Нет, Петр, так не пойдет, Вы меня знаете
Сначала Вы вопите, как недорезанный, а теперь я "уперся"...
Нет, сначала давайте признайте, что ПАРА - это ДВА, а я говорил все правильно
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 08:12 #555
Vladimirovich wrote:
Нет, сначала давайте признайте, что ПАРА - это ДВА, а я говорил все правильно
Признать надо одно. Оба толкуем об одном и том же с разных сторон. Вам нравится термин ИНВАРИАНТНОСТЬ, а мне - ДВУМЕРНАЯ ВЫРОЖДЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА. В Итоге - внутрипарная сиомная инвариантность ведет к ДВУМЕРНОЙ ВЫРОЖДЕННОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА. Еще короче, итогово - ГЕНОМ СООБРАЖАЕТ.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 08:31 #558
hide wrote:
nonlocality wrote:
убираемых контекстами (смыслами) мРНК
А вот об этих смыслах Вы ничего сказать -то и не можете...Почему?
Смысл в смысле КрКр у каждого свой для чего угодно. По примитивному инфолиоподходу он (смысл) должен быть
однозначно
объективно
разным у генома, у муравьёв, у партий, а не только у квантофорумчанина отдельно взятого или от УСРЕДНЕННОГО.
Короче: как гипотеза - имеет место быть
осмысление смысла того, как
1. точнодаже растения приспосабливаются
2. (хотя бы в смысле выживания).
3. И ЭТО может происходить в соответствии с ВЫСШИМ смыслом, например- божественным. (кнс- каждый назовет свое ОСМЫСЛЕНИЕ смысла - даже в т.н. бессмыслице).
З павагай да неабыякавых
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 09:26 #559
Vladimirovich wrote:
Нет, сначала давайте признайте, что ПАРА - это ДВА, а я говорил все правильно
Пара - это два. Боже, какое глубокомыслие, если присобачить к этому соответствующий контекст. Прямо таки по сказке "Щи из топора". Придется согласиться - да, пара - это два... первых нуклеотидов в кодонах, значащих, в синонимах. С назначенными смыслами после делегирования 3-му значения 4-х ген. букв.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 09:35 #560
nonlocality wrote:
Признать надо одно. Оба толкуем об одном и том же с разных сторон.
Ну тогда зачем надо было орать? Надо было понять сначала nonlocality wrote:
Вам нравится термин ИНВАРИАНТНОСТЬ, а мне - ДВУМЕРНАЯ ВЫРОЖДЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА.
А вот это неверно. Это разные термины.
Инвариантность это грубо (без формальностей) X=C где C константа
Т.е UC+X= Серин и связь UC-Серин не зависит от Х, т.е имеем инвариантность
Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
величин - см. в Вики например Вырожденная Матрица ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D1%8B%D1%80...80%D0%B8%D1%86%D0%B0
Формально вырожденность можно связать конечно - существует инвариант для некоей связи между двумя величинами
Например 1*0.5 = поллитра Здесь 1 - инвариант
Но это НЕ ТОТ инвариант. Говоря вырожденность, Вы говорите зависимость.
И тем самым выносите народу мозг
Вот в чем проблема.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 12:52 #563
Vladimirovich wrote:
Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот (своя для каждого из 8 семейств), постоянство, игнорирующее кодовые функции 3'-нуклеотида в син. кодонах.
Для сиом кодонов иначе - это мРНК-КОНТЕКСТНО-НАВЯЗАННАЯ ЗАВИСИМОСТЬ от 3'-нуклеотида кодона с делегированным буквенным значением.
Попробуйте сказать короче. Кто-то требовал смысл контекстуальных манипуляций рибосом с мРНК. ВОТ ОН.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:05 #564
дэбилизьм Петровича зашкаливает уже, вон снизу таблица железная, только пары-другой исключений пока воспрянуло
ниже видно, что речь НЕ про группу CU UCC UCA UCG, а про группу серинаUCU UCC UCA UCG
эти 4 кодона никак НЕ лучше или хуже кодонов AGU и AGC, что тоже кодируют серин , остальное суть дэбилизьм непостижимых масштабов с лёгкой руки нашего друга ув. Петровича
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:09 #565
Ваша основная ошибка ППГ, что Вы по не понятной для всех причине « привязались» к « буквенному значению», тем самым ЯВНО не понимаете того факта, что на уровне молекул нет подобных бирок. Есть ЭМ-Облако и оно имеет и другие «сигнальные» значения.
Именно этот факт и сдвигает Вас на уровень лох-ученого
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:15 #566
nonlocality wrote:
Vladimirovich wrote:
Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот (своя для каждого из 8 семейств), постоянство, игнорирующее кодовые функции 3'-нуклеотида в син. кодонах.
Для сиом кодонов иначе - это мРНК-КОНТЕКСТНО-НАВЯЗАННАЯ ЗАВИСИМОСТЬ от 3'-нуклеотида кодона с делегированным буквенным значением.
Попробуйте сказать короче. Кто-то требовал смысл контекстуальных манипуляций рибосом с мРНК. ВОТ ОН.
Вы манипулируете терминами,словно теми нуклеотидами в кодонах...Без раскрытия их сущности при выборе того или иного сценария трансляции...Понятно,что контекстно.Почему этот контекст вданное время и в данном месте определяет данную инструкцию?
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:28 #567
контекстно лишь для пары-другой триплетов сферху, хайд, и давно застукано какая именно пара-другая контекстов выделяет эту пару-другую триплетов, не стоит цепляться за бредъ Петровича
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:36 #568
nonlocality wrote:
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот
Ну вот, наконец, мы пошли по правильному пути
А чей это термин? Хорошо ли придумывать термины, которые противоречат математическим?
Ибо в математике не бывает двусмысленности
А если она есть в биологии, это проблемы биологии
"-- Второй смысл -- вот что вздор! Строгость бывает только одна -- первая, она же и последняя.
А если термин второго смысла, то это означает, что он тухлый!
Строгость, строгость и строгость, вот что должно быть девизом всякого буфетчика биолога." (с)
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 13:46 #569
Да тут вааще неправильно подразделяются кодоны...Упор надо делать на функциональные различия при трансляции. Основным должен быть вопрос : Почему та или иная аминокислота кодируется различным числом кодонов.
Контексты и комментарии генома
15 Март 2019 14:03 #570
нету функциональных различий, хайд, и бОльше одного триплета кодирует одну АК, поскольку имеем 20+ АК, а дуплетов (!) из 4х букв AUCG всего 16 и значит дуплетов не хватит; триплетов из тех же букв 64, что много бОльше 20 и потому будет большой избыток кодирования, it's as simple as that but still выше башки Петровича
