Следует указать еще на один момент, почему эукариотическая клетка использует положительные механизмы регуляции экспрессии генов. Подсчитано, что в геноме человека содержится около 100000 генов, соответственно каждая клетка при отрицательном механизме регуляции могла бы синтезировать 100000 разных репрессоров, причем в достаточных количествах. При положительном механизме регуляции большинство генов в принципе неактивно, соответственно молекула РНК-полимеразы не связывается с промотором и клетка синтезирует ограниченный и избирательный круг активаторных белков, необходимых для инициации транскрипции.
У эукариот выделены и охарактеризованы также пять регуляторных белков, получивших название транскрипционных факторов (TF: IIА, IIВ, IID, IIЕ и IIF). Они необходимы для узнавания участка (сайта) ДНК, названного TATA (concensus последовательности, ТАТАААА). Детальный молекулярный механизм действия факторов транскрипции пока не раскрыт.
Следует отметить, однако, что некоторые из них или почти все регуляторные белки активируют транскрипцию не прямо, а опосредованно – через промежуточные белки, названные коактиваторами. Происхождение и механизм действия последних также не выяснены.
Так вы просто давайте ссылки на учебники или статьи... Или ГУГЛ.
крупная шарм-симметрия обманчива, ув. Владимирович, поскольку красная половина внутренне разнородна в отличие от синей; на самом деле таблица вычурна и случайна, на засыпку верующему Петровичу
Докажите вычурность и, особенно, случайность. Голословие не годится. И что вы понимаете под словом "вычурность" в контексте темы?
Похоже,все управление интенсивностью синтеза пептидов происходит при помощи белков-посредников.Значит,внешнее управление будет ориентировано на их активацию/деактивацию...
Любезный, ссылаться на первоисточник надо здесь и везде. Иначе нечистоплотно выглядит. Как плагиат.
крупная шарм-симметрия обманчива, ув. Владимирович, поскольку красная половина внутренне разнородна в отличие от синей; на самом деле таблица вычурна и случайна, на засыпку верующему Петровичу
Vladimirovich wrote:
Очень многое неплохо структурировано, а нарушения симметрии невелики.
если не учитывать исследований частот разных табличных пар кодон-АК на множестве всех геномов, белков и существ, то "структурированность" таблицы в "форме Петровича" совершенно поверхностная, сугубо внешняя и надуманная, не имеющая никаких реальных роли и функции. Сине-красная "симметрия" получена за счёт жулья подборки руками имён/букв строк и колонок, некоторые (но все) синие АК кодируются вдобавок парами красных кодонов, не всегда будут красные пары, стоп-кодоны срублены с бодуна и пр., даже не хочется входить в детали видимо случайного ген. кода.
Следующее сравнение схватывает суть обмана Петровича: серьёзные математики занимаются теорией (натуральных) чисел, но никогда нумерологией или числовыми фокусами; так вот, "таблица Петровича" суть генетическая нумерология
Vladimirovich wrote:
почему столько воплей из-за столь незначительного без ясного проникновения в суть вещей
если не учитывать исследований частот разных табличных пар кодон-АК на множестве всех геномов, белков и существ, то "структурированность" таблицы в "форме Петровича" совершенно поверхностная, сугубо внешняя и надуманная, не имеющая никаких реальных роли и функции. Сине-красная "симметрия" получена за счёт жулья подборки руками имён/букв строк и колонок, некоторые (но все) синие АК кодируются вдобавок парами красных кодонов, не всегда будут красные пары, стоп-кодоны срублены с бодуна и пр., даже не хочется входить в детали видимо случайного ген. кода.
Вообще-то симметрий ген. кода множество. До поры не обращал на них внимания. Надо было ссылки хранить. Особенно мощная симметрия обнаружена В.И.Щербаком - симметрии нуклонного состава аминокислот и кодонов. Отсюда он вывел (чисто формально), что Код использует предельно абстрактное умственное понятие нуля для собственных мат. манипуляций с функциями кодонов. Уже исходя из этого, Щербак обосновывает фундаментальное, что Код - искусственное (ментальное) образование, возникшее не в ходе эволюции, но как Вселенский Акт, если рассматривать Вселенную (Природу) в духе Спинозы - как Causa Sui (Причину самой Себя).
И добавлю. Для меня сиом-синонимическое симметричное построение таблицы Кода - лишь повод и причина утвердиться в мысли о функциональной уравновешенности кодирования белков. В этой системе отношений начала Жизни важно равновесно сочетать супер точность кодирования, обеспечиваемой избыточностью синонимической информации, с ее гибкостью и приспособительностью, даваемой сиомами. Параллельно не менее важен скачек в новое качество кодирования, несколько нарушающего симметрию - это выход на многомерие ментального кодирования текстами, кои выступают как инобытие МЫСЛИ.
полагаю, что после верхнего ни у кого не должно остаться сомнений какие мистические, потусторонные и антинаучные силы дёргают нитки нашему православному Петровичу
ну вот, этот наглый и беззастенчивый оскал только-что подтвердил, что как вор и жулик от науки вы совершенно умышлено и нарочито манипулируете и распространяете эту заведомую ху*ню про красные кодоны, поскольку та дует в поруса вашим православным грёзам и мифам
любому чайнику ясно, что доказывать обязаны именно вы, если сможете, а я буду проверять вашу работу и, скорее всего, вызову на пересдачу
ну вот, этот наглый и беззастенчивый оскал только-что подтвердил, что как вор и жулик от науки вы совершенно умышлено и нарочито манипулируете и распространяете эту заведомую ху*ню про красные кодоны, поскольку та дует в поруса вашим православным грёзам и мифам
любому чайнику ясно, что доказывать обязаны именно вы, если сможете, а я буду проверять вашу работу и, скорее всего, вызову на пересдачу
ХАЙдук, дуя в свои пОруса, пойдите вон отсюда. Прихватите и ХАЙда, ген. родственного вам.
ну вот, этот наглый и беззастенчивый оскал только-что подтвердил, что как вор и жулик от науки вы совершенно умышлено и нарочито манипулируете и распространяете эту заведомую ху*ню про красные кодоны, поскольку та дует в поруса вашим православным грёзам и мифам
любому чайнику ясно, что доказывать обязаны именно вы, если сможете, а я буду проверять вашу работу и, скорее всего, вызову на пересдачу
А еще на всякий случай предупредим тех, кто не достаточно в курсе
Если кому-то кажется, что Инквизиция должна что-то сделать, а она не делает, то Инквизиция ничего не должна
ну вот, этот наглый и беззастенчивый оскал только-что подтвердил, что как вор и жулик от науки вы совершенно умышлено и нарочито манипулируете и распространяете эту заведомую ху*ню про красные кодоны, поскольку та дует в поруса вашим православным грёзам и мифам
любому чайнику ясно, что доказывать обязаны именно вы, если сможете, а я буду проверять вашу работу и, скорее всего, вызову на пересдачу
Не нервничайте вы так. Вредно.
А если серьёзно, то доказательства того, что 32 красных СИОМА могут кодировать любую аминокислоту за пределами прокрустова ложа 8 семейств сиом "стандартного" ген. кода E.coli лежат в четком русле проверки навязанного ему "удобного", но фальшивого постулата о КОЛЛИНЕАРНОСТИ "кодон-аминокислота". Сей постулат de facto не доказан статистически на большом количестве белков. За это, замечу в скобках, до сих пор не взялся НИКТО. За исключением Лолли и Прюита в Science 2004 года, где они, сами не желая, продемонстрировали это на гене "Горячая Голова" Арабидопсиса. Казалось бы, чего проще доказать коллинеарность белков и их мРНК. Их секвенировано множество. Ан нет. Тихо. Почему? Догадайтесь на раз два три.
Если браться за такую работу, то она тяжела по многим техническим причинам. Не говоря уже о том, что покушение на канон-модель Кода чревато многими орг. последствиями. Лолли и Прюит на своих шкурках хорошо почувствовали это.
Так что оскал Хайдука в мой адрес обернулся ему очередной отвратительной гримасой хайдучьей чайник-безграмотности.
А еще на всякий случай предупредим тех, кто не достаточно в курсе
Если кому-то кажется, что Инквизиция должна что-то сделать, а она не делает, то Инквизиция ничего не должна
кто такой постулат КОЛЛИНЕАРНОСТИ "кодон-аминокислота"? и почему тогда 32 синим якобы "синонимам" не начать тоже кодировать любую аминокислоту за пределами прокрустова ложа стандартного кода? возлюбленный бредъ инь-ян не перестаёт смешить ни падеццки
кто такой постулат КОЛЛИНЕАРНОСТИ "кодон-аминокислота"? и почему тогда 32 синим якобы "синонимам" не начать кодировать любую аминокислоту за пределами прокрустова ложа стандартного кода? возлюбленный бредъ инь-ян не перестаёт смешить ни падеццки
Вам смешно... Однако "смешно дураку, что нос на боку".
Turanov A. A., Lobanov A. V., Fomenko D. E., Morrison H. G., Sogin M. L., Klobutcher L. A., Hatfield D. L., Gladyshev V. N.Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2009. — 9 January (vol. 323, no. 5911). — P. 259—261. —
Так вот, к чему это. Потенциальные нарушения коллинеарности предсказаны в указанной выше монографии. Они реализуются именно по причине двойного кодирования 32 сиомами, где неоднозначность кодирования снимается контекстом мРНК. Это же может приводить к нарушениям коллинеарности, что случайно (для авторов), но не для науки, и подтверждено исследованием Приюита и Лолли (об этом в www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=85202). А сама идея двойного кодирования подтверждена в работе Туранова и др. (см. ссылку выше и в www.gazeta.ru/science/2009/01/12_a_2923205.shtml .
Коллинеарность — свойство, обусловливающее соответствие между последовательностью кодонов нуклеиновых кислот и аминокислот полипептидных цепей. Иными словами, коллинеарность — свойство, благодаря которому в белке воспроизводится та же последовательность аминокислот, в какой соответствующие кодоны располагаются в гене. Это означает, что положение каждой аминокислоты в полипептидной цепи зависит от особого участка гена. Генетический код считается коллинеарным, если кодоны нуклеиновых кислот и соответствующие им аминокислоты в белке расположены в одинаковом линейном порядке.
Явление коллинеарности доказано экспериментально. Установлено, что серповидноклеточная анемия, при которой нарушено строение молекулы гемоглобина, обусловлено дефектами расположения нуклеотидов в гене, ответственном за синтез гемоглобина. Было установлено расстояние между аминокислотами, зависимыми от этих мутаций, и расположение мутонов на генетической карте гена триптофансинтетазы, совпадающее с расположением аминокислот в этом ферменте. Таким образом, аминокислоты заменялись в соответствии с изменением нуклеотидного состава соответствующих триплетов.
Гипотеза о том, что последовательность аминокислот в белке определяется последовательностью нуклеотидов в гене, была высказана Г.А. Гамовым. Данные о коллинеарности полипептидов подтвердили ее. Благодаря концепции коллинеарности можно определить примерный порядок нуклеотидов внутри гена и информационной РНК, если известен состав полипептидов. Наоборот, определив состав нуклеотидов ДНК, можно предсказать аминокислотный состав белка. Из этой концепции также следует, что изменение порядка нуклеотидов внутри гена (мутация) приводит к изменению аминокислотного состава белков. www.medkurs.ru/lecture1k/med_biology/qm63/2598.html
Коллинеарность — свойство, обусловливающее соответствие между последовательностью кодонов нуклеиновых кислот и аминокислот полипептидных цепей.
nonlocality wrote:
Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот
Очевидно, соответствие есть зависимость.
Т.е. Петровичу все равно зависимость тут или независимость...
Лишь бы слово умное было
Они ведь все, Очкарики, такие. Им главное название придумать. Пока не придумал, смотреть на него жалко, дурак дураком. Ну а как придумал какой-нибудь синоним гравиконцентратор, тут ему словно все понятно становится, и сразу ему жить легче. (с)