Ключевое слово
08 | 12 | 2019
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me
  • Page:
  • 1
  • 2

TOPIC: Биосинтез _ Адресная регуляция

Биосинтез _ Адресная регуляция 16 Март 2019 12:51 #1

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Биосинтез _ Адресная регуляция
:(
Передача сигнала (биология)
ru.wikipedia.org/wiki

Signal_transduction_pathways_2019-03-16.png

Наиболее хорошо изученные сигнальные пути: PI3K-Akt, JAK-STAT, NF-kB, гетеротримерных G-белков, Ras-MAPK/ERK, Wnt, Hedgehog, Fas
Last Edit: 25 Март 2019 16:40 by hide.

Контексты и комментарии генома 16 Март 2019 13:11 #2

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Ну вот и определены терминалы для внешнего управление, правда нужна ещё и их последовательность включения.
Теперь дело за малым определить наборы частот ( скорее всего нужные наборы аминокислот) для их имитации в пространстве клетки и имитировать их появление в клеточном пространстве
Работы для «Группы Чукч...» хватит на долго, а то успокоились лишь на подпитке энергетики в Циклах Крэбса.

Контексты и комментарии генома 16 Март 2019 13:46 #3

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Поршень wrote:
правда нужна ещё и их последовательность включения.
Они могут активироваться в случайном порядке (от внешних воздействий)...И очень уж они спецефические.Для каждого нужна разработка ЦАП и драйвера... :flag:
Last Edit: 16 Март 2019 13:54 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 16 Март 2019 18:36 #4

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Data base природных механизмов и искусственных методик для дальнейшего исследования... ;)

Биосинтез _ Адресная регуляция 16 Март 2019 18:43 #5

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Регуляция образования белков-ферментов может осуществляться не только благодаря непосредственному влиянию репрессоров на молекулы ДНК. Интересны исследования, показывающие, что под влиянием различных воздействий меняется активность РНК-полимера-зы — фермента, катализирующего образование и-РНК на ДНК-мат-рице. Изменение активности этого фермента может оказать влияние на скорость процесса транскрипции. Следующим регуляторным механизмом может быть степень выхода уже образованных и-РНК из ядра. В случае, если под влиянием определенных воздействии поры в оболочке ядра закрываются, ото может тормозить или даже прекращать выход п-РНК из ядра в цитоплазму, что, естественно, приостанавливает синтез белков-ферментов. Для того чтобы служить матрицей, и-РНК должна освободиться от окружающего ее белка. По-видимому, и этот процесс может меняться в зависимости от условий (регуляции па уровне трансляции). Наконец, количество образовавшихся идентичных белков может регулироваться путем изменения времени жизни и-РНК. Рассмотренные примеры показывают различные возможности регуляции новообразования белков-ферментов. Благодаря этой регуляции организм может приспосабливаться к различным условиям среды. В основе изменении обмена, происходящих под влиянием внесших воздействий, лежит прежде всего изменение направленности и скорости ферментативных реакций. Регуляция образования и активности белков-ферментов лежит также в основе процессов дифференциации..."
ru-ecology.info/term/72901/
Last Edit: 16 Март 2019 19:21 by hide.

Контексты и комментарии генома 17 Март 2019 01:08 #6

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
На пост 173 ...
Вообще-то этот модельный вариант «Группа Чукч ...» опробовали включив по всей видимости сигнал «апоптос» на яблоках, проверяя различные формы ЭМ воздействия « розовый шум» , варианты мШЭИ ( среди которых и был вариант со свеже приготовленным соком этого же сорта яблока) через свои 3-х мерные антенные комплексы-спиральки.
Одно время П.Гаряев даже бегал по форумам выставляя это как не сомненый успех.
Правда потом что-то утих.

Биосинтез _ Адресная регуляция 17 Март 2019 16:03 #7

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Внутренняя регуляция. Процессы, протекающие в клетках, подвержены регуляции. На молекулярном уровне регуляторные механизмы существуют в виде обратных химических реакций, основу которых составляют реакции с участием ферментов, обеспечивающие замкнутость процессов регуляции по схеме синтез — распад — ресинтез. Синтез белков, включая ферменты, регулируется с помощью механизмов репрессии, индукции и позитивного контроля. Напротив, регуляция активности самих ферментов происходит по принципу обратной связи, заключающейся в ингибировании конечным продуктом. Известно также регулирование путем химической модификации ферментов. В регуляции активности клеток принимают участие гормоны, обеспечивающие химическую регуляцию...
...Информация, закодированная в ДНК, определяет последовательность аминокислот в полипетидиых цепях белков, т. е. их первичную структуру. Образование же структур более высоких порядков зависит от первичной структуры полипептидиой цепи и не нуждается в регуляции со стороны генома. Иными словами, генетический контроль первичной структуры определяет вторичную, третичную и четвертичную структуры белка"
ru-ecology.info/term/72901/
Last Edit: 17 Март 2019 16:08 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 17 Март 2019 16:13 #8

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Жизнедеятельность организма регулируется прежде всего на субклеточном и молекулярном уровнях. Это химическая авторегуляция реакций обмена веществ. Она решает местные задачи и является основой всех видов регуляции. Осуществляется она путем изменения концентраций метаболитов, повышения или снижения активности н количественного содержания ферментов, т. е. усиления или угнетения их синтеза, структурных изменений их и других функциональных белков..."
ru-ecology.info/term/72901/

Если кто-то думает иначе... :P
Last Edit: 18 Март 2019 12:17 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 17 Март 2019 20:33 #9

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Редактирование эпигенетических модификаций ДНК
И.Р. Грин, Д.В. Петрова, Д.О. Жарков

"...В клетках млекопитающих содержится три ак-
тивных ДНК-метилтрансферазы: DNMT1, DNMT3a
и DNMT3b
, которые катализируют перенос метиль-
ной группы с S-аденозилметионина на атом C5 ос-
нования цитозина..."
Адаптеры внешних агентов с ДНК... :)
Last Edit: 18 Март 2019 07:33 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 17 Март 2019 21:44 #10

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Методы избирательного воздействия на процессы метилирования и деметилирования ДНК
Warning: Spoiler! [ Click to expand ]

rlegroup.net/2016/08/04/metilirovanie

Биосинтез _ Адресная регуляция 19 Март 2019 21:18 #11

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Специфичность связывания аминацилированных изоакцепторных тРНК с кодонами мРНК

Spec.png

Современная генетика
Авторы: Ф. Айала, Д. Кайгер
Last Edit: 19 Март 2019 22:22 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 19 Март 2019 21:29 #12

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 38714
  • Thank you received: 87
  • Karma: 22
это будет на засыпку пословичному неграмотею и лоху от науки ув. Петровичу :beer:
Last Edit: 20 Март 2019 01:10 by Хайдук.

Биосинтез _ Адресная регуляция 19 Март 2019 22:21 #13

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Специфичность фермента определяется его прочным связыванием с акцепторным концом тРНК, DU-участком и вариабельной петлей. Некоторые ферменты, по-видимому, не распознают антикодоновый триплет и катализируют реакцию аминоацетилирования даже при измененном антикодоне. Однако отдельные ферменты проявляют пониженную активность по отношению к таким модифицированным тРНК и при замене антикодона присоединяют не ту аминокислоту..."
www.cellbiol.ru/book/export/html/151

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 07:38 #14

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"..К тому же в некоторых случаях изоакцепторные тРНК, различающиеся по первичной структуре, могут иметь одинаковые или похожие антикодоны и узнавать одни и те же кодоны. Для таких изоакцепторов не обнаружено функциональных различий, и их назначение остается совершенно непонятным..." :(
СТРОЕНИЕ ТРАНСПОРТНЫХ РНК И ИХ ФУНКЦИЯ НА ПЕРВОМ (ПРЕДРИБОСОМНОМ) ЭТАПЕ БИОСИНТЕЗА БЕЛКОВ
О. О. ФАВОРОВА

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 08:51 #15

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Дальнейшее изучение АРСаз и элементов узнавания ими тРНК позволит понять тонкие механизмы регуляции процесса биосинтеза белка в современных организмах. Например, различный уровень аминоацилирования изоакцепторных тРНК приводит к различной скорости считывания рибосомой триплетов, кодирующих одну аминокислоту, но встречающихся с различной частотой..."
АМИНОАЦИЛ-тРНК-СИНТЕТАЗЫ: ДВА КЛАССА ФЕРМЕНТОВ
Н. С. ЭНТЕЛИС

Разная скорость считывания означает и разную скорость (уровень) синтеза для одного и того же белка...

Screenshot_2019-03-20XuMuKru--.png
Last Edit: 20 Март 2019 08:51 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 09:28 #16

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Переходное предположение: минорные и мажорные последовательности изоакцепторных тРНК имеют корелляцию со специфическими анти-кодонами .

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 12:10 #17

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 38714
  • Thank you received: 87
  • Karma: 22
Петрович ничего не знает обо всём этом... :tired:

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 17:01 #18

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Итерация предположения:
Первичная последовательность родственных изоакцепторных тРНК имеет одинаковую локализацию кодонов (конформационные локации),ответственных за третичную структуру (L).Минорные и мажорные основания располагаются между ними и определяют,вместе со специфическим анти-кодоном,специфичность связывания аминокислот с аминацилированной тРНК (или кодоном мРНК).Вторым аспектом,влияющим на скорость синтеза является диспропорция в количестве специфических изоакцепторных тРНК...Возможно,второй вариант регуляции является основным.
Last Edit: 20 Март 2019 19:19 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 21:17 #19

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...удельная скорость элонгации ограничивается временем
задержки рибосомы на каждом кодоне и минимально допустимой дис-
танцией между рибосомами на мРНК...
...Наличие на рибосоме
специального сайта связывания деацилированной тРНК, с которого
предположительно осуществляется уход в раствор освободившейся в
цикле трансляции тРНК [63], и сравнительно низкая скорость диссо-
циации деацилированной тРНК из этого сайта [64] требуют существо-
вания специального механизма, облегчающего уход тРНК с рибосомы.
Постулировано, что в норме такую функцию выполняют аминоацил-
тРНК синтетазы. Сбои в работе этого механизма, связанные с нару-
шением функционирования аминоацил-тРНК сиптетаз при аминокис-
лотном голодании, приводят к задержке деацилированной тРНК па
выходном сайте, что, в свою очередь, вызывает торможение трапслока-
ции и замедление трансляции в целом..."
ТРАНСПОРТНАЯ РНК
КАК ФАКТОР РЕГУЛЯЦИИ БЕЛКОВОГО ГОМЕОСТАЗА
Б. С. Негруцкий
Last Edit: 20 Март 2019 21:19 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 22:15 #20

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...при изучении стадий связывания аминокислоты и последующего обратимого образования аминоациладенилата, регистрируемого по АТФ-пирофосфатномуобмену, оказалось, что фермент не может обеспечить столь высокой специфичности в дискриминации близких аминокислот на этих стадиях. Так, изолейциновая амино-ацил-тРНК-синтетаза может довольно эффективно связывать валин и образовывать валиладенилат. Точно так же валиновая аминоацил-тРНК-синтетазаможет связывать и активировать изолейцин, а также аланин, серии, цистеин и треонин. Фенилаланиновый фермент активирует метионин, лейцин и тирозин. Тем не менее, ни одна из перечисленных ложноактивированных аминокислот не становится акцептированной на тРНК..."
СПЕЦИФИЧНОСТЬ АМИНОАЦИЛИРОВАНИЯ тРНК

Биосинтез _ Адресная регуляция 20 Март 2019 22:51 #21

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 38714
  • Thank you received: 87
  • Karma: 22
зря выкладываешь, Петрович ни хрена не поймёт, поскольку ему лень вкалывать - гораздо легче молоть про мутные контексты и разумный биокомпьютинг отличающий КОД от КОГ :hihihi:
Last Edit: 20 Март 2019 22:52 by Хайдук.

Биосинтез _ Адресная регуляция 22 Март 2019 08:32 #22

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Атлас микроРНК
An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse
www.nature.com/articles/nbt.3947?foxtrot...back=true#affil-auth
fantom.gsc.riken.jp/5/suppl/De_Rie_et_al_2017/
Last Edit: 22 Март 2019 08:33 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 23 Март 2019 22:54 #23

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Кодоны, соответствующие минорным изоакцепторным тРНК, А.С. Спирин предлагает называть модулирующими, поскольку они могут изме-нять скорость трансляции соответствующих мРНК. Чем больше модулирующих кодонов в мРНК, тем медленнее она транслируется. Клетка может изменять эффективность трансляции определенных мРНК путем адаптации внутриклеточных концентраций изоакцепторных тРНК к числу модулирующих кодонов этих мРНК. Показано, что во время интенсивного синтеза фиброина в шелкоотделительных железах тутового шелкопряда внутриклеточный спектр изоакцепторных тРНК сильно меняется и становится идеально соответствующим потребностям белоксинтезирующего аппарата клеток, осуществляющего трансляцию мРНК фиброина..."
works.doklad.ru/view/iCoDQm5i2E4/all.html

Биосинтез _ Адресная регуляция 23 Март 2019 22:57 #24

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Относительное использование синонимичных кодонов (RSCU) для 50 случайно выбранных генов нескольких видов.

RSCU.png
Last Edit: 23 Март 2019 22:58 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 08:35 #25

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Современные исследования показывают, что СЧК (смещение частоты кодонов - codon-usage bias) позволяет контролировать экспрессию генов не только на уровне трансляции, но также транскрипции. В последнем случае, СЧК позволяет модулировать специфичность взаимодействия ряда транскрипционных факторов с экзонными (кодирующими) участками генов..."
biomolecula.ru/articles/tainstvennyi-kod-nashego-genoma
Last Edit: 24 Март 2019 19:14 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 09:29 #26

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Изоакцепторные транспортные РНК (тРНК) — это группа тРНК, связанных с одной и той же аминокислотой, но с разными антикодонами. Концентрации молекул тРНК, принадлежащих одной такой группе, могут различаться. Есть свидетельства связи этих концентраций и явления СЧК. Ещё один важный факт состоит в том, что наборы изоакцепторных тРНК различаются между видами..."

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 10:10 #27

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Частота встречаемости кодонов для различных организмов

www.kazusa.or.jp/codon/
Attachments:

Quote Selected
Last Edit: 26 Март 2019 15:51 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 19:41 #28

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1006
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
"...Ещё в 1970-х годах в работах Ванюшина Б.Ф. и ряда других сотрудников биофака МГУ была выявлена взаимосвязь этапов индивидуального развития и старения животных и человека с изменениями такой ферментативной модификации как метилирование ДНК[18]. За цикл работ «Метилирование ДНК — эпигенетический контроль за генетическими функциями организма» Ванюшину Б.Ф. была вручена премия имени А. Н. Белозерского.

В настоящее время хорошо известно, что ландшафт метилирования геномной ДНК изменяется в зависимости от возраста[19][20][21][22][23]. Этот процесс, называемый «эпигенетическим дрейфом»[24][25], тесно связан с хронологическим возрастом и вместе с тем, по утверждению некоторых авторов, не является маркером репликативного клеточного старения, так как обнаруживается и в «не стареющих» стволовых клетках[26][27]. Для репликативного клеточного старения найдены несколько иные эпигенетические биомаркеры также основанные на изменении метилирования ДНК в определённых местах генома[28] Определение эпигенетического старения по метилированию ДНК генов ITGA2B, ASPA и PDE4C позволяет определить биологический возраст человека со средним абсолютным отклонением от хронологического возраста не более 5 лет[29]. Эта точность выше, чем возрастные прогнозы на основе длины теломер...
...Эпигенетический возраст, как выяснилось, влияет на вероятность заболеть раком. Был разработан алгоритм для вычисления эпигенетического возраста по данным метилирования ДНК крови. Алгоритм основывается на 71 маркере метилирования ДНК, которые могут меняться в зависимости от окружающей человека среды, физических упражнений и диеты..."
ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%B5%D1%82...5_%D0%94%D0%9D%D0%9A

Эпигенетические биомаркеры старения
habr.com/ru/post/428377/
Last Edit: 24 Март 2019 19:44 by hide.

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 20:04 #29

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 38714
  • Thank you received: 87
  • Karma: 22
штудировать верхнее и учиццо ППГ самому догадывающемуся кому... :rofl:
Last Edit: 24 Март 2019 20:05 by Хайдук.

Биосинтез _ Адресная регуляция 24 Март 2019 22:54 #30

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 38714
  • Thank you received: 87
  • Karma: 22
хоть и чайник, хайд, ты видимо не лохъ как сами знаем кто... :hihihi: , где в Штатах/Канаде ошиваешься? :beer:
  • Page:
  • 1
  • 2
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум