Петрович - зайдите пожалуйста в скайп - там пообщаемся по поводу Вашей просьбы (статьи). Только перед тем как зайти в скайп - напишите мне, пожалуйста, на форуме и на почту - я почту и форум вижу все время, а в скайпе не сижу - он мне память грузит, поэтому я не увижу что Вы появились в скайпе
Петрович - зайдите пожалуйста в скайп - там пообщаемся по поводу Вашей просьбы (статьи). Только перед тем как зайти в скайп - напишите мне, пожалуйста, на форуме и на почту - я почту и форум вижу все время, а в скайпе не сижу - он мне память грузит, поэтому я не увижу что Вы появились в скайпе
А что сказать про тебя? Ну силен, пишет умнО. Давай, выкладывай свой мэйнстрим. Кто мешает?
Ну может и не требуете, а просите. - Из моего вопроса #1518 не следует ни требование, ни просьба ссылок.
Не будем заниматься казуисткой, если вы научную дискуссию не ведете, то к чему эти бесконечные вопросы?
Гаряев рекоммендую вам почитать этот подробнейший обзор, чтобы вы ознакомились наконец с современными представлениями о процессе трансляции и перестали перевирать гипотезу Крика. Т
Олег wrote:
там не все так просто и надежды, что все решится физико-химией там мало
а чем может решиться, Олег, ты как думаешь з бодуна?
Находят мол. массы пептидов и пытаются по этим данным как бы воссоздать белок. Вы или не понимаете что есть коллинеарность, или, понимая, намеренно уводите в сторону.
Коллинеарностью в статьях где используется масс-спек напрямую не занимаются, так как ее доказал в начале шестедисятых еще товарищ Крик, но отсутствие коллинеарности должно безусловно привести к обнаружению пептидов, которые невозможны при нормальной трансляции. Статьи показывают, что такого не происходит. Параллельно на прямую проверять на коллинеарность сразу тысячи белков технологически невозможно, поэтому и используют масс-спек.nonlocality wrote:
В чём я переврал Ф.Крика в отношении его Вобл-гипотезы? Ваше утверждение не соответствует действительности. Итак, в чём?
nonlocality wrote:
а 3-й нулеотид может быть любым по Крику = не участвует в кодировании
То, что в третьей позиции допускается не каноническая пара совсем не означает, что там может находиться любое основание и что это основание ни на что не влияет. Конкретно указываются набор ограничений в результате которых у нас и получается однозначный код. Я кстати привел тут ссылку на обзор, почитайте, выходите на литературу.
Хорошо бы провести аттестацию Олега в математичееской ветке, дабы выявить может ли он решить что либо. Тогда появятся основания прислушиваться к его мнению о разрешимости задач физхимии.
Гаряев рекоммендую вам почитать этот подробнейший обзор, чтобы вы ознакомились наконец с современными представлениями о процессе трансляции и перестали перевирать гипотезу Крика. Там в числе прочего подробно разбирается вопрос с третьей позицией. www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867409000841
nonlocality wrote:
Из резюме никак не следует, что проблема неоднозначности кодирования решена... как в не синонимических кодонах решается задачка придания им точного смысла, то есть выбора одной аминокислоты из двух.
как не надоело, Петрович, десятилетия уже ломиться в открытую дверь и вопрошать об одном и том же?? НЕТУ иных кодонов-ТРИПЛЕТОВ окромя синонимических, все 64 таких кодона застуканы и учтены; было какое-то ин-витро исключение из синонимичности ТРИПЛЕТОВ, о котором Олег талдычил и которому должно давно нашли объяснение
лично Вас должно заинтересовать заключение статьи, где сокрушаются о якобы дальнодействующей сигнализации/эффектах в рибосомах, может вашему пресловутому мШЭИ повезёт пощеголять в качестве такой сигнализации?
Among the questions that need to be addressed next are how perturbations in the adjacent P-site and the more distant E-site of the small ribosome subunit can alter A-site behavior so dramatically. More generally, how is ribosome function impacted by long-range signaling? A number of studies in recent years have highlighted the existence of extended signaling networks within the ribosome that allow for communication between the interior and the exterior of the ribonucleoprotein complex. For example, the growing polypeptide chain, positioned within the exit tunnel, appears to communicate with the peptidyl transfer center to control catalysis and with the exterior of the ribosome to control external factor interactions (reviewed in Tenson and Ehrenberg, 2002). The molecular triggers of such events, the paths of signal transduction, and the long-range effects on structure and function all remain to be determined. These questions are directly related to those previously posed for tRNA and release factor selection in the A-site for which we now have considerable molecular understanding of the initiating events in the ribosome functional centers for decoding and peptidyl transfer. There now remains much to learn about signaling throughout the ribosome and the resulting downstream consequences for translation fidelity.
Пользователь nonlocality совсем зациклился на этих кодонах, ему уже практически пальцем показывают ( пост 1519, пост 1436, пользователь Хайдук в предыдущем посту) где может быть применен этот подход, вот переведенная цитата из этого текста ..
Среди вопросов, которые необходимо решить в следующем являются как возмущения в соседнем P-сайте и более отдаленном E-сайта малого рибосомы субъединицы может изменить месте поведения так резко. В целом, как это рибосома функция оказывает влияние сигналов на большие расстояния? Ряд исследований последних лет выявили существование длительных сигнальных сетей в рибосомы, которые позволяют для связи между внутренней и внешней рибонуклеопротеиновой комплекса. Например, растущую полипептидную цепь, расположенный внутри выходного туннеля, по-видимому, связь с передаточной пептидил центра для контроля и катализ с внешней части рибосомы, чтобы контролировать внешние взаимодействия фактор (обзор в Тензорные и Эренбергом, 2002). Молекулярные триггеры таких событий, пути передачи сигнала, а также долгосрочных последствий на структуры и функции все еще предстоит определить. Эти вопросы напрямую связаны с тем, как ранее позировала для тРНК и отпустите выбор фактор в А-сайте, для которого у нас теперь есть значительный молекулярный понимание исходных событий в рибосом функциональных центров декодирования и передачи пептидиловой. Там сейчас остается многое узнать о сигнализации по всей рибосомы и в результате ниже по течению последствия для перевода верности.
ps Мы часто говорим, что у нас нет выбора, забывая при этом, что когда он есть, всё намного сложнее.
Коллинеарностью в статьях где используется масс-спек напрямую не занимаются, так как ее доказал в начале шестедисятых еще товарищ Крик, но отсутствие коллинеарности должно безусловно привести к обнаружению пептидов, которые невозможны при нормальной трансляции. Статьи показывают, что такого не происходит. Параллельно на прямую проверять на коллинеарность сразу тысячи белков технологически невозможно, поэтому и используют масс-спек
Отсутствие коллинеарности, сопутствующее кодонам омонимам, не препятствует синтезу белков, оно делает его гибким и приспосабливающимся к условием внешней среды. Это о пробных белках.
Итак, подводим итог. Доказательств тотальной коллинеарности для всех белков и их мРНК нет и быть не может. Классик генетики Инге-Вечтомов еще в 80-х годах прошлого века демонстрировал ПЕРЕКОДИРОВКИ кодонов, возникающие у организмов вследствие аминокислотного голодания, теплового шока, антибиотиков и пр. Какая уж тут коллинеарность. Поражение г-ну PP засчитано.
как не надоело, Петрович, десятилетия уже ломиться в открытую дверь и вопрошать об одном и том же?? НЕТУ иных кодонов-ТРИПЛЕТОВ окромя синонимических, все 64 таких кодона застуканы и учтены; было какое-то ин-витро исключение из синонимичности ТРИПЛЕТОВ, о котором Олег талдычил и которому должно давно нашли объяснение
Это грубая ошибка, что все синонимические. А 3-й нуклеотид в кодоне действительно может быть любым. Отсюда все та же задачка - как НЕ СИНОНИМИЧЕСКИЕ кодоны (их 32) могут однозначно кодировать разные аминокислоты. Кодирует-то дублет. Это еще Лагерквист в 1978 году показал - правило "два из трёх". А не надоело потому, что надо.
лично Вас должно заинтересовать заключение статьи, где сокрушаются о якобы дальнодействующей сигнализации/эффектах в рибосомах, может вашему пресловутому мШЭИ повезёт пощеголять в качестве такой сигнализации?
Among the questions that need to be addressed next are how perturbations in the adjacent P-site and the more distant E-site of the small ribosome subunit can alter A-site behavior so dramatically. More generally, how is ribosome function impacted by long-range signaling? A number of studies in recent years have highlighted the existence of extended signaling networks within the ribosome that allow for communication between the interior and the exterior of the ribonucleoprotein complex. For example, the growing polypeptide chain, positioned within the exit tunnel, appears to communicate with the peptidyl transfer center to control catalysis and with the exterior of the ribosome to control external factor interactions (reviewed in Tenson and Ehrenberg, 2002). The molecular triggers of such events, the paths of signal transduction, and the long-range effects on structure and function all remain to be determined. These questions are directly related to those previously posed for tRNA and release factor selection in the A-site for which we now have considerable molecular understanding of the initiating events in the ribosome functional centers for decoding and peptidyl transfer. There now remains much to learn about signaling throughout the ribosome and the resulting downstream consequences for translation fidelity.
За ссылку спасибо! Но она не открывается. Более точно дать можете?
Так что там в той статье Петрович которую Вы просили ? Рассказывайте
Благодарю!
Статью посмотрю. Но таких сотни. Да и Нобеля по рибосомам не так давно дали. Но это не гарантия от ошибок.
И ще раз напомню завороженным Криком товарищам, что он вместе с Ниренбергом признал неоднозначность кодирования триплетом UUU. И фактически перечеркнул их же модель. А перед уходом написал книгу, где еще раз и окончательно признался в ошибочности кода. Все это давал, цитировал. Но PP и Ко хотят быть святее Папы Римского. Однако это их проблемы.
Хуже с проблемами биосферы, генетику которой не хотят и не могут понять. Некоторые. Власть предержащие.
лично Вас должно заинтересовать заключение статьи, где сокрушаются о якобы дальнодействующей сигнализации/эффектах в рибосомах, может вашему пресловутому мШЭИ повезёт пощеголять в качестве такой сигнализации?
Among the questions that need to be addressed next are how perturbations in the adjacent P-site and the more distant E-site of the small ribosome subunit can alter A-site behavior so dramatically. More generally, how is ribosome function impacted by long-range signaling? A number of studies in recent years have highlighted the existence of extended signaling networks within the ribosome that allow for communication between the interior and the exterior of the ribonucleoprotein complex. For example, the growing polypeptide chain, positioned within the exit tunnel, appears to communicate with the peptidyl transfer center to control catalysis and with the exterior of the ribosome to control external factor interactions (reviewed in Tenson and Ehrenberg, 2002). The molecular triggers of such events, the paths of signal transduction, and the long-range effects on structure and function all remain to be determined. These questions are directly related to those previously posed for tRNA and release factor selection in the A-site for which we now have considerable molecular understanding of the initiating events in the ribosome functional centers for decoding and peptidyl transfer. There now remains much to learn about signaling throughout the ribosome and the resulting downstream consequences for translation fidelity.
За ссылку спасибо! Но она не открывается. Более точно дать можете?
Это из статьи, которую Игорь по вашей просьбе вам скинул. Вы ее получили, как я поняла.
Хорошо бы провести аттестацию Олега в математичееской ветке, дабы выявить может ли он решить что либо. Тогда появятся основания прислушиваться к его мнению о разрешимости задач физхимии. 
Потому как подозреваю что Вы не в Одессе 
А при чём тут Крым ? 
