Ключевое слово
09 | 12 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Транскрипция ДНК

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 16:58 #121

  • Автор: Чукча не из Сибири
  • Автор: Чукча не из Сибири's Avatar
mittelspiel написал
.....однозначно определяется трехмерной структурой двойной спирали (которая, как Вы понимаете, несимметрична в 3' и 5' направлениях) а так же структурой промотера и трехмерным комплексом транскрипционных факторов
Вот именно этот электронный маяк сигнализирующий [в виде мультисолитона (с вариантом применения суперпозиции на «такте» сдвига )] и является той сигналограммой по которой при ее совпадение (естественно при пороговых величинах) со стороны как и ДНК так и молекул участвующих в этом действии (напомним что отрицательные и положительные заряды притягиваются) находящийся псевдо стационарно на теле рас плетения ДНК и по вашей терминологии ...однозначно определяется... пока других принципов физика еще не придумала, вариант с бирками инвентарными серьезно рассматривать не нужно ... как не нужно рассматривать пассажи Пети Гаряева о том, что ..
ППГ написал(а):
попытка грохнуть Россиян кончится тем, что они грохнут и самих себя.
особенно с примерами приведенной в статье из прошлого тысячелетия ... и без согласования с профессором АН по фактам работы генератора....

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 18:00 #122

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
Петрович, неужели и ты ли, Брут?, скатилсо в нацфашизм шовинизм и ксенофобию?
паулиту скатило, меня - нет. Ко всем нациям отношусь одинаково, а .... и Русских много.

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 18:04 #123

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Чукча не из Сибири написал(а):
без согласования с профессором АН по фактам работы генератора....
Согласуем с другими, более продвинутыми. А профессору спасибо за лазер (семейство таковых). Им памятник из золота ставить надо - и лазеру, и профессору. Вывели на ЛВГ.

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 18:40 #124

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 109802
  • Thank you received: 2227
  • Karma: 108
Хайдук написал(а):
так как сайт у него на Родине, под х***/рукою
Ув.Хайдук, Вы таки участвуете в научной дискуссии ....
Каждому - своё.

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 21:36 #125

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Виноват-с

Транскрипция ДНК 27 Дек 2010 21:40 #126

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
ППГ написал(а):
профессору спасибо за лазер (семейство таковых). Им памятник из золота ставить надо - и лазеру, и профессору. Вывели на ЛВГ.
Профессор кто, а Петрович?

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 05:48 #127

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
Профессор кто, а Петрович?
Александр Николаевич Власов. Много о нем толковали и его детище. Забыли? Вот Гелий-Кадмиевый, синий, забабахаем, вот уж выдаст так выдаст способность генерировать мШЭИ из сних фотонов. У них Коттон эффект намного ядрёней по сравнению с красными фотонами от Гелий-Неонового лазера, ежели использовать их синие спин-поляризации как носители ген. информации.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 14:03 #128

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 14:58 #129

  • Автор: Чукча не из Сибири
  • Автор: Чукча не из Сибири's Avatar
Эта искренняя радость вызвана тем что вызванная к жизни воронка вероятности стохастических проблем ( из параграфа 80) будет названа бессмертным именем предложившим этот вариант, а именно Великим Петром Хайдук, что и будет увековечено в Постулатах (протоколах) Фантомной Теории, что обессмертит имя ее предложившего ...
ps
Распространяйте о себе хорошие слухи, источник забудется, а смысл останется!

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 15:22 #130

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7541
  • Thank you received: 43
  • Karma: 8
ППГ написал(а):
Александр Николаевич Власов. Много о нем толковали и его детище. Забыли? Вот Гелий-Кадмиевый, синий, забабахаем, вот уж выдаст так выдаст способность генерировать мШЭИ из сних фотонов. У них Коттон эффект намного ядрёней по сравнению с красными фотонами от Гелий-Неонового лазера, ежели использовать их синие спин-поляризации как носители ген. информации.
Таким образом будет развит обнаруженный Петровичем био-эффект фрактальных mp3 записей красных спин-поляризованных шумов Импульсного Блока Питания лазера ЛГН-303. Эффект полностью подтвержден теоретичкским феноменом Имитации Пыли

Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 16:13 #131

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
WsK написал(а):
Так вот я пытаюсь у Вас узнать именно тот самый побудительный механизм, который указывает, что в данный момент времени необходимо включить в процесс транскрипции 1386, а не какой-то другой ген от начала левой цепочки ДНК. Этот ген существенно не отличается от иных 120000 генов данной цепочки. Однако имеется динамический информационный механизм, который делает этот ген существенно отличимым от иных генов на время необходимое для присоединения РНК-полимеразы. Этот механизм имеет место быть, что подтверждается функционированием клетки, иначе считывание шло бы не выборочно и сплошным фронтом, в итоге стала бы невозможной специализация клеток, а она есть, в чём сомневаться не приходится.
У каждого гена свой промотер и энхенсор. Промотер узнается РНК-полимеразой, а энхенсор узнается транскрипционным факторами. Только при наличии определенной комбинации транскрипционных факторов на энхенсоре РНК-полимераза связанная с промотером может начать транскрипцию. Типичный энхенсор в геноме эукариота состоит из 10-15 сайтов связывания для 3-5 различных видов транскрипционных факторов. Можете прикинуть (математики в лице Владимировича и РР вам помогут подсчитать) сколько различных комбинаций можно составить из трех различных транскрипционных факторов на 15 сайтах связывания (это миллиарды комбинаций). Поэтому каждому гену соответствует однозначная комбинация транскрипционных факторов при которой он включен. Вот почитайте --

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 16:23 #132

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
миттельшпиль, а как насчет идеи с бодуна вышибать якобы мусорные участки ДНК и посмотреть что произойдёт с транскрипцией/синтезом?

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 16:57 #133

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Хайдук написал(а):
миттельшпиль, а как насчет идеи с бодуна вышибать якобы мусорные участки ДНК и посмотреть что произойдёт с транскрипцией/синтезом?
У венторовской бактерии геном настолько маленький что там почти нету мусора. Его специально редуцировали для того чтобы минимальный геном был чтобы меньше синтезировать. А у высших организмов типа мухи-дрозофилы регуляторные участки-энхенсеры меняют, удаляют все это достаточно детально изучается. Естественно если изменить регуляторный участок (который не ген а около гена, например энхенсор) то ген начинает работать совсем по другому.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 17:27 #134

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 109802
  • Thank you received: 2227
  • Karma: 108
mittelspiel написал(а):
Можете прикинуть (математики в лице Владимировича и РР вам помогут подсчитать) сколько различных комбинаций можно составить из трех различных транскрипционных факторов на 15 сайтах связывания (это миллиарды комбинаций). Поэтому каждому гену соответствует однозначная комбинация транскрипционных факторов при которой он включен.
Можно ли сказать, что вероятность того, что случайная комбинация транскрипционных факторов включит ген, крайне низка?
Каждому - своё.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 18:06 #135

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Vladimirovich написал(а):
Можно ли сказать, что вероятность того, что случайная комбинация транскрипционных факторов включит ген, крайне низка?
Хороший вопрос. Таких оценок не знаю. По крайней мере экспериментально известно, что имеет место стохастический шум и гены включаются-выключаются по ошибке довольно часто. Кроме того, есть некая градация, скорее как в аналоговом приборе чем как в цифровом. То есть там работает принцип не вкл/выкл., а более плавное включение и выключение с разными уровнями экспрессии гена.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 18:23 #136

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 109802
  • Thank you received: 2227
  • Karma: 108
Я опять же не специалист... Правильно ли я понимаю, что ТФ это не часть ДНК, а белок вокруг ДНК, участвующий в процессе считывания информации?
Каждому - своё.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 18:38 #137

  • Автор: Чукча не из Сибири
  • Автор: Чукча не из Сибири's Avatar
Vladimirovich написал(а):
Можно ли сказать, что вероятность того, что случайная комбинация транскрипционных факторов включит ген, крайне низка?
Тут конечно мне кажется идет подмена понятий, так как из ответа уважаемого mittelspiel применение комбинаторной математики в лоб парируется тем, что процесс то явно детерминирован... (так как транскрипция все таки происходит) и ссылка на множества многообразных факторов вокруг этого процесса только затрудняет его видение .. и о чем Наш как всегда скромный Инквизитор соизволяет намекнуть ...
ps
Вообщем как всегда по этому принципу ..
Любовь вечна!....только партнеры меняются.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 20:57 #138

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Vladimirovich написал(а):
Я опять же не специалист... Правильно ли я понимаю, что ТФ это не часть ДНК, а белок вокруг ДНК, участвующий в процессе считывания информации?
да, правильно. вот концептуальная картинка. на этой картинке черная нитка - ДНК. желтые цилиндрики вокруг которых лна намотана - нуклеосомы. красные прямоугольнки - регуляторные участки ДНК которые содержат сайты связывания транскрипционных факторов. все остальные цветные фигурки - разные транскрипционные факторы.

Транскрипция ДНК 28 Дек 2010 21:02 #139

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Чукча не из Сибири написал(а):
Тут конечно мне кажется идет подмена понятий, так как из ответа уважаемого mittelspiel применение комбинаторной математики в лоб парируется тем, что процесс то явно детерминирован... (так как транскрипция все таки происходит) и ссылка на множества многообразных факторов вокруг этого процесса только затрудняет его видение .. и о чем Наш как всегда скромный Инквизитор соизволяет намекнуть ...
процесс детерминирован на уровне вероятностей. то есть вероятность связывания для каждого транскрипционного фактора однозначно определена, но число связанных молекул варьирует стохастически около среднего значения. транскрипционный шум - вполне измеряемая величина. то есть процесс не детерминирован в том смысле какой вы вкладываете. точно так же как движение любой молекулы не детерминировано. точность работы достигается за счет того что клмпонентов много и их связывание кооперативное

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 00:55 #140

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
mittelspiel написал(а):
процесс детерминирован на уровне вероятностей. то есть вероятность связывания для каждого транскрипционного фактора однозначно определена
... той же концентрацией?


mittelspiel написал(а):
транскрипционный шум - вполне измеряемая величина
... но пренебрежим, пока не единствен, а случаются и правильные, желанные связывания?


mittelspiel написал(а):
точность работы достигается за счет того что компонентов много и их связывание кооперативное
То бишь то, что нужно, произойдёт с достаточной вероятностью, дабы обеспечить следующие, также достаточно вероятные, хоть и обязательные стадии/процессы?


ЗЫ. Ауу, Петрович, capice?

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 04:17 #141

  • mishabara
  • mishabara's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 1191
  • Thank you received: 1
  • Karma: 0
На пункт 139
предполагаемая воронка вереятности события связывания транскрипционных факторов
Давайте немного разберемся с терминологией …
ru.wikipedia.org/wiki/%D0%94%D0%B5%D1%82...BE%D1%81%D1%82%D1%8C Детерминированность (от лат. Слова determinans — определяющий) — определяемость…. В нашем случае это …
… «Детерминированность в решении какой-либо практической задачи или в алгоритме означает, что способ решения задачи определён однозначно в виде последовательности шагов. На любом шаге не допускаются никакие двусмысленности или неопределённости и независимо от единичных вещей»...
Примером такого алгоритма можно quantoforum.ru/biology/193-transkriptsiya-dnk?start=30#64481 увидеть в пп.42 оценного почитателями оного принципа.
Также разберемся в тонкостях определения … вашего понятия «транскриптационный шум»
… «В популярных работах чувствительность к первоначальным условиям часто ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D0%B5%D0%BE...B0%D0%BE%D1%81%D0%B0 путается с самим хаосом. Грань очень тонкая, поскольку зависит от выбора показателей измерения и определения расстояний в конкретной стадии системы»…. Это Ваше положение о понятии «транскриптационный шум» может быть описано и следующим образом как ..… « Клеточный автомат — это набор клеток, образующих некоторую периодическую решетку с заданными правилами перехода. Клеточный автомат является дискретной динамической системой, поведение которой полностью определяется в терминах локальных зависимостей. Эволюция даже простых дискретных систем, таких как клеточные автоматы может сильно зависеть от начальных условий.»…
Основным выводом можно считать следующее …
… «Большинство типов движения описывается простыми аттракторами, являющиеся ограниченными циклами»….
И тут уместно вспомнить что такое Аттрактор (англ. attract — привлекать, притягивать) — множество состояний (точнее — точек фазового пространства) динамической системы, к которому она стремится с течением времени….
Тот факт, что происходит сам процесс транскрипции говорит о том, что в системе ДЕЙСТВУЕТ ПОСТОЯННЫЙ ФУНКЦИОНАЛ и наша концептуальная задача перейти от общих фраз к поиску этого функционала . Первый шаг в этом направлении и сделал Наш Великий Сам Знаете Кто о Ком Не Принято Говорить (т.е. ВГ ППГ) и чьи мысли были изложены в newsample.com/01/TezisPPG.htm Кратких Постулатах (протоколах) Фантомной Теории ...

Отредактировано mishabara (2010-12-29 08:17:47)
Last Edit: 08 Окт 2015 18:48 by Vladimirovich.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 06:49 #142

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
То бишь то, что нужно, произойдёт с достаточной вероятностью, дабы обеспечить следующие, также достаточно вероятные, хоть и обязательные стадии/процессы?


ЗЫ. Ауу, Петрович, capice?
Вероятностные процессы находятся в русле волновых детерминант, задаваемых клеточным компьютингом.
Last Edit: 08 Окт 2015 18:48 by Vladimirovich.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 07:01 #143

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7541
  • Thank you received: 43
  • Karma: 8
ППГ написал(а):
Вероятностные процессы находятся в русле волновых детерминант
А детерминированные процессы находятся в русле вероятностных детерминант...

Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 07:36 #144

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
PauLita написал(а):
А детерминированные процессы находятся в русле вероятностных детерминант...
Врага России, паулиту, приговорить к расстрелу КИСЛЫМ МОЛОКОМ. Приговор окончательный, обжалованью не подлежит.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 07:49 #145

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7541
  • Thank you received: 43
  • Karma: 8
ППГ написал(а):
Приговор окончательный, обжалованью не подлежит.
Nastja написал(а):
Я тут на днях разработала альтернативную теорию, которая все объясняет...

Значит так. Всеми биологическими процессами управляют маленькие зеленые человечки. Если с ними просто по-хорошему договориться, то можно получить просто потрясающие результаты во всех областях биологии и медицины, причем без дорогостоящего оборудования и изнурительных экспериментов. Уже есть немало свидетельств людей, которые с этими зелеными человечками общались. Вот лишь малая часть деятельности зеленых человечков за последнее время: три уборщицы подряд ушли в декрет, в одной лаборатории дематериализовались все компьютеры, получен штамм E.coli, производящий чистейший диэтиламид лизергиновой кислоты (к сожалению, из-за роковой случайности он оказался в канализации).

Перед теорией волнового генома у моей теории есть следующие преимущества:
1. Все мы знаем, что обычные компьютеры не могут работать сами по себе, и к тому же имеют свойство глючить. Так что никакой квантовый биокомпьютер не сможет обеспечить функционирование живого организма, если не будет существовать армия операторов, программистов и системных администраторов. Эту роль и выполняют маленькие зеленые человечки (далее МЗЧ).
2. Для работы с МЗЧ не требуется дорогого лазера, достаточно просто поговорить с МЗЧ, можно мысленно.
3. Чтобы разобраться в теории МЗЧ, не требуется знания физики.Хотя желательно к разговору к МЗЧ привлекать физиков, а еще лучше - геологов.
4. В теории МЗЧ нигде не утверждается, что скорость передачи сигнала может превышать скорость света.
5. Совершенно не важно, являются ли МЗЧ квантово локальными или нелокальными
Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 07:58 #146

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
PauLita написал(а):
геологов.
4. В теории МЗЧ нигде не утверждается, ч
Плагиат, уже обыгрывал это в molbiol.ru в 2003г. Там было существенно больше юмора. Понятно, перед расстрелом не до шуток. Глаза завязывать? Завязывать... Ясное дело - трус. В аду ты среди своих... Это, надеюсь, утешает?

Итак.... ПЛИ!

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 08:50 #147

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 109802
  • Thank you received: 2227
  • Karma: 108
ППГ написал(а):
Врага России....
Ну Петр... Мы только только начали нормальную научную дискуссию, в чем большая заслуга ув. mittelspielя
И опять...
Научнее надо быть, содержательнее. И народ потянется к вам


Каждому - своё.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 11:11 #148

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Vladimirovich написал(а):
Ну Петр... Мы только только начали нормальную научную дискуссию, в чем большая заслуга ув. mittelspielя
И опять...
Научнее надо быть, содержательнее. И народ потянется к вам
Что-то не пойму... Критерии уважения у нас разные. ув. mittelspiel открыто заявлял в моей теме, что за деньги любое научное г... протолкнет в печать... С паулитой вести нормальную научную дискуссию...? Смеетесь... Легко заметить, что с порядочными людьми разговариавю нормально. А оставлять подлость без ответа - не в моих правилах.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 11:43 #149

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 109802
  • Thank you received: 2227
  • Karma: 108
Нормальную дискуссию можно вести всегда. А личные выпады делают ее ненормальной.
Каждому - своё.

Транскрипция ДНК 29 Дек 2010 14:45 #150

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49565
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
ППГ написал(а):
Вероятностные процессы находятся в русле волновых детерминант, задаваемых клеточным компьютингом
Очень неясное изречение, Петрович, затуманивает существо вопроса

Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум