Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 16:46 #635
Хайдук написал(а):
Петр, назовите хотя бы один кодон, который не синонимический, то бишь он и только он кодирует определённую аминокислоту
На то он и не синонимический, а омонимический, чтобы кодировать двойственно. Одну он будет кодировать только после прочтения рибосомой либо всей мРНК, либо необходимой части её. Как происходит прочтение, мы не знаем. Возможно, это солитонные (уединенные) волны делают это. А может, что-то другое...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 16:49 #636
Чукчa написал(а):
Вопрос не верный, команду стоп (конец кодирования) ставится как ... самопально или нужен какой то анализ ... если нузен анализ, то каков механизм его и как воплощено в реалилл...
Миша, это ты или клон? Клону: нузен нузен... после прочтения и анализа мРНК. Это и есть механизм.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 16:55 #639
PauLita написал(а):
ППГ написал(а):Как происходит прочтение, мы не знаем.
Не знаем и происходит ли...
Хотя всегда можем сказать, что знаем. И никто не узнает, что не знаем. И не будет знать, что знаем. А что знаем, никому не скажем. Потому, что не знаем, что знаем....
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 17:12 #642
Хайдук написал(а):
Да ведь рибосома не сумела прочитать мРНК, она целиком ещё не просунулась, а фсе же ставит стоп
Вот именно этот то момент и надо разбирать почему на каком основании... а то кодоны кодоны ... получается что мРНК по не понятной в современном видение проблемы сама как то решает, что делать ... а ведь нужен механизм который ей позволяет это выполнить, который и запускает этот процесс... и именно ВГ со своими взглядами пока это и пытается объяснить ... и примеры приводит... ну а носителем этой информации естественно и являются это сборище солитонов ( или пыли как тут приводили модельные примеры )
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 17:14 #643
ППГ написал(а):
омонимический, чтобы кодировать двойственно. Одну он будет кодировать только после прочтения рибосомой либо всей мРНК, либо необходимой части её.
Петр, Вы сумели привести примеры лишь 1-2 таких кодона, а утверждаете, что их целых 32. Два примера, которые привели, не вызывают смущений - другие участки определяют кодирование. Но целых 32 таких кодона, это не вызывает доверия с Вашей стороны
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 17:29 #645
Хайдук написал(а):
Петр, Вы сумели привести примеры лишь 1-2 таких кодона, а утверждаете, что их целых 32. Два примера, которые привели, не вызывают смущений - другие участки определяют кодирование. Но целых 32 таких кодона, это не вызывает доверия с Вашей стороны
А вы доверьтесь - и все будет хорошо в вашей голове. Не напрягайте её больше. Совет дня.
Разберемся, как в экспериментах получили mimicing dust effect с ДНК. Ежели добыча связана с оплатой, то не надо. Могу, конечно, выслать, но это геморрой.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 17:55 #647
ППГ написал(а):
Разберемся, как в экспериментах получили mimicing dust effect с ДНК.
Никакой mimicing dust effect в экспериментах с ДНК не получили и не могли получить. То, что вы по своей тупости (или незнанию английского) называете эффектом, это общеизвестный прием численного симулирования.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 18:04 #648
Специально для Миши и ППГ. Глотайте.
A single transplant originating from the sMmYCp235 synthetic genome was sequenced. We refer to this strain as M. mycoides JCVI-syn1.0. The sequence matched the intended design with the exception of the known polymorphisms, 8 new single nucleotide polymorphisms, an E. coli transposon insertion, and an 85-bp duplication (table S1). The transposon insertion exactly matches the size and sequence of IS1, a transposon in E. coli. It is likely that IS1 infected the 10-kb sub-assembly following its transfer to E. coli. The IS1 insert is flanked by direct repeats of M. mycoides sequence suggesting that it was inserted by a transposition mechanism. The 85-bp duplication is a result of a non-homologous end joining event, which was not detected in our sequence analysis at the 10-kb stage. These two insertions disrupt two genes that are evidently non-essential. We did not find any sequences in the synthetic genome that could be identified as belonging to M. capricolum. This indicates that there was a complete replacement of the M. capricolum genome by our synthetic genome during the transplant process.
Специально для Вас подчеркнул и выделил ключевые фразы, чтобы даже жевать не нада было.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 18:20 #652
PP написал(а):
Специально для Вас подчеркнул и выделил ключевые фразы, чтобы даже жевать не нада было
Э... так не пойдет ... именно в синтетическом геноме произошли НОВЫЕ БЫСТРЫЕ изменения, тут говорится, что эти изменения не принадлежали этой популяции клеток... произошло усложнение информации в ДНК и нужные варианты были добавлены (но откуда ... и каким способом организм клетки это сделал ...) мы пока только предложили способ возможностей КАК это могло быть сделано ... и не более того ...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 18:47 #654
Петр, значит примерно 3 кодона (60 : 20) заботяццо о синтезе каждой аминокислоты. Какое самое большое число синонимии (2,3,4,5,6 кодонов на одну аминокислоту?)? Бывает ли синонимия степени 1 или даже 0?
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 18:55 #655
PP написал(а):
Как по Вашему оказался встроен кусок E.coli и чем Вас не устраивает простое объяснение Вентера
Генетический критерий. Гомологичными считаются структуры, в основе развития которых лежит одна и та же генетическая программа (система взаимодействующих генов), унаследованная от общих предков. У них общих предков нет. Транспозон — последовательность ДНК, способная перемещаться внутри генома в результате процесса, называемого транспозицией. Однако для таких действий должен быть некий стимул. Вентер объясняет это как почти подсознательное действия припудрив его словами о вероятности. Применения тут термина вероятности почти совпадает по смыслу с детерминированным. Но сам процесс этот им же и НЕ ОПИСАН.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 19:05 #656
Миша,
Повторю свой вопрос. Вы понимаете, как проходил синтез генома? Когда поймете Вам станет ясно откуда взялся кусочек из E.coli. Продолжаю ждать лучшее объяснение появления этого кусочка с позиций ВГ.
И пожалуйста обратите внимание на
We did not find any sequences in the synthetic genome that could be identified as belonging to M. capricolum.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№10)
18 Июнь 2010 19:32 #658
PP написал(а):
объяснение появления этого кусочка
Вы о том что при синтезе этого генома клетки E.coli не могут синтезировать фрагменты ДНК необходимого им размера и, в поисках замены, авторы обнаружили, что дрожжи способны не только клонировать крупные фрагменты ДНК, но и объединять их между собой с помощью механизма гомологичной рекомбинации.... следовательно своеобразный оттиск информации был присущ уже этому искусственно созданному геному ... но формально он был записан на другом виде носителя ... но не в виде кодонов (скорее как сборище солитонов на ДНК под видом кванта ВГ), перенесяя ЭТО ДНК в тело новой клетки... это сборище солитонов проецировало голограмму на мембраны, в процессе деления это и сыграло решающую роль в проявлении этой последовательности на геноме синтетической клетки ...