Дайте один белок чья аминокислотная последовательность противоречит набору кодонов на уровне матричной РНК

ППГ написал(а):ППГ написал(а):ППГ написал(а):

mittelspiel написал(а):
Я вообще не воспринимаю ситуацию так, что надо бить камнями по голове. Я это вопринимаю как игру. Про крючок - согласен. Поймать можно только там, где он пытается играть по научным правилам и их нарушает. Вот вкратце основные эти веши:
1) Утверждал что триплетный код якобы неоднозначен, но не смог это доказать.

ППГ: доказал. Не вам. Все равно не поймете.

2) Утверждал, что современная наука не может объяснить трансляцию белков на рибосоме, но не смог указать в чем именно нобелевские лауреаты 2009 года ошибаются.

ППГ: простенький расчет, что лукавство мит-а проскочит. Кто-то будет рыться в анналах многотомной темы в поисках моего ответа, который БЫЛ. Очень коротко, нет времени и желания повторять. Нобелиаты видят эту проблему, но не решают ее даже за счет факта наличия особых структурных особенностей некоторых тРНК, т.к. остается неясным, почему и как идет ВЫБОР (фактически разумный (рибосомно-компьютерный)) таких аминоацилированных тРНК с особыми конформационными метками на стебельной и кодоновой частях. Остается неясным по причине игнорирования ГЛАВНОГО – контекстных ориентаций рибосомы, т.е. квази-разумных биокомпьютерных функций рибосомы.

3) Ссылался на статью в Science (Kudla et al., 2009, Science 324, 255 - 258) как на единственную работу, где якобы получено, что после замены синонимичных нуклеотидов спектры белков меняются, но оказалось что в этой статье про изменение спектров вообще ничего не написано.

ППГ: причем здесь спектры? Это я говорил, что спектры GFP ДОЖНЫ БЫТЬ РАЗНЫМИ, поскольку аминокислотные последовательности GFP ДОЛЖНЫ БЫТЬ РАЗНЫМИ. Это деталь. А главное – то, что работа Kudla et al является прекрасной схемой, где можно ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО доказать влияние контекстов мРНК на получаемую аминокислотную последовательность. См. заключительную часть моей монографии www.wavegenetic.ru/Petr_Gariaev.pdf

4) Ссылался на статью в Macromlecules (Allison et al., 1990, Macromolecules, 23, 1110-1118) как на единственное независимое подтвержение якобы обнаруженного им Фантомного Эффекта ДНК, но оказалось, что эта статья чисто теоретическая и вообще не имеет отношения к его работе.

ППГ: см. выше цитированные мной фрагменты этой работы, где авторы излагают экспериментальную часть своей статьи.

5) Ссылался на прыгающие гены как на феномен, который якобы не может быть объяснен генетикой. Однако оказалось, что в генетике было показано, что этот эффект объясняется переносом информации при помощи РНК (не только ДНК).

ППГ: Барбара Мак Клинток получила Нобелевскую за «прыгающие гены». Биологический смысл этих прыганий до сих пор не понят генетиками. Я дал объяснение. Как происходят прыжки меня интересует во вторую очередь.

6) Ссылался на пчел, которые якобы погибли из-за геномодифицированных растений, но оказалось, что растения тут не при чем, а генетиками уже выделен микроогранизм - возбудитель вирусного заболевания этих пчел.

ППГ: вирус – это не микроорганизм. В школу. Бактерия, поражающая пчел – следствие условий ее развития, условий, созданных именно в трансгенных растениях.

7) Не смог объяснить, как на той длине волны, которую он использует, можно передать информацию (вопрос Quantrinas). К этому я так же добавлю свой вопрос, как эти волны проходят через мембрану ядра и клетки, которые непрозрачны примерно в той же области спектра что и ДНК

ППГ: используется весь диапазон длин волн - от УФ до ИК. Ядра и цитоплазма имеют разные спектры поглощения. Указанного диапазона достаточно, чтобы сканировать и ядро, и цитоплазму и передать полученную управляющую информацию как внутри многоклеточной биосистемы, так и за ее пределы. Доказано нашими эксп. Работами, а также исследованиями Цзян Кань Дженя, Казначеева-Михайловой-Трофимова, Будаговского, Бурлакова.

Как видим, все «доказательства» мит-а рассыпаются в пыль даже при их легком анализе.

PauLita написал(а):Вырывать из контекста - приём слабаков. Но им другого не дано.

ППГ написал(а):Это нелегко зделать, Петр, потому что любому, вкл. ультраслабому классическому полю нужно огромное число фотонов с уже утраченным/разрушенным энтанглментом . Слабому полю можно, хоть и с трудом, обеспечить тепличные условия для его мыслительной деятельности, но исходящие из такой деятельности команды нужно каким-то образом усиливать, дабы всколыхнули большие биомакромолекулы и т.д. Выглядит все это весьма неправдоподобно...

ППГ написал(а):Я наконец начал понимать Вашу мысль. Это уже некий прогресс. Итак, по Вашему, рибосома читая всю мРНК решает какие аминокислоты присобачивать поняв контекст, а лишившись контекста начнет ошибаться, правильно я понял? Давайте попытаемся сформулировать верифицируемое следствие этой гипотезы. Например, когда рибосома транслирует искусственно синтезированый короткий кусок мРНК, должны возникать ошибки? Сейчас есть много работ где люди транслируют всякие короткие фрагменты мРНК. Почему народ не обнаружил рост в количестве ошибок? Такая есть компания Pacific Biosciences, так они создали технологию где можно на уровне одной молекулы наблюдать за биохимическим процессом. У них появилась статья, где они меряют кинетику синтеза пептидов. Видят, как одна за одной, присоединяются аминокислоты. И представьте пока народ не кричит, что вырванный из контекста фрагмент транслируется иначе. Вас это не удивляет?

Сперва откликнемся на апологетов теории и их последствий ..

PP написал(а):Вы тут немножко не правы, так как активационные молекулы не изменяются это некий стандарт действия ... но то что они должны делать некий ВЫБОР на множестве ДНК а механизм этого выбора не однозначен... как и последовательность их стыковки с молекулой ДНК, эрланговая система должна получиться и без привлечения ВГ это невозможно....

чайник555 написал(а):Тут с пользователем Паулитой проигрывался вопрос фиксации голографического образа на поверхность мембраны. Что имеется в наличие.. На ДНК имеется осциллятор ( и может быть не один) смотри Лемму 1 постулатов Фантомной Теории, идет генерация (в первом приближения для упрощения Фурье голограммы) следствие 4 указанных постулатов... и все это записывается на поверхность мембраны в так называемую долговременную память клетки. И это было бы интересной теорией, но создали на Западе искусственную клетку.... в чужеродное тело клетки ввели новый синтезированный геном .... и вдруг оказалось что через некоторое время (деление клеток) геном был изменен... В чем причина ... а оказывается забыли про эту долговременную память в виде голографического образа на стенках ... Вот эта память клетки и внесла при деление оной эти изменения ... А тут говорят о ВГ покажите его в действии ...
Специально для подтверждении теории ППГ и была синтезирована эта клетка ...

mishabara написал(а):Кто Вам это сказал, что не изменяются? Насколько я помню, ДНК само и кодирует набор активационных молекул. Так что спокойно себе меняются,- в процессе эволюции.

PP написал(а):Эволюция это сколько делений клеток .... мы говорим о стандарте и именно в том, что эта активационная молекула в период жизни самой клетки НЕ МЕНЯЕТСЯ... так сказать для упрощения расчетов ..

Отредактировано mishabara (2010-06-16 01:21:40)

mishabara написал(а):Идите учите биологию. Вы похоже вообще ничего о геномных перестроениях не слышали.

ППГ написал(а):То есть как? Не бывают ли только 21-24 кодона (сколько у нас аминокислот), а остальные либо лишние, либо повторяют эти 21-24?

PP написал(а):Вы наверное начитались вот этого материала .. n-t.ru/tp/ns/tp.htm смею Вас разуверить, что такие изменения в этой синтетической клетки произошли НЕРЕАЛЬНО быстро... именно в этом то и дело ...

ППГ написал(а):Петрович, дави их интеллектом. Физики-шизике не знают что метод броуновской динамики это эксперимент. Объясни им что компутерные расчеты методом броуновской динамики это еще какой экшперимент.

Отредактировано чукча (2010-06-16 10:09:23)

ППГ написал(а):Правильно! Нечего на спектры пенять нах.

mishabara написал(а):Нереально. Истину глаголешь. Во имя ацца и святага духа ППГ

ППГ написал(а):П
рыгающие гены

дави их интеллектом, ты можешь Петрович

почитай тут, и у тебя все получится

ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%80%D0%B0...BE%D0%B7%D0%BE%D0%BD

чукча написал(а):60 лет назад открыла Мак Клинток, а Петрович открыл для нас истину сегодня.

ППГ написал(а):броуновская динамика. Суть этого метода состоит в численном интегрировании системы Лан-жевена уравнений, описывающих движение взаимодействующих броуновских частиц и моделирующих взаимодействие броуновских частиц с окружающей средой (напр., с растворителем). Эти ур-ния отличаются от ур-ний Ньютона тем, что их правая часть содержит случайную силу со спектром белого шума и силу трения, пропорциональную скорости частицы. Случайные силы и компоненты тензора трения можно детально изучить с помощью M. д. м., описанного ранее. T. о., оба M. д. м., применяемые вместе, составляют замкнутый аппарат.

Белый шум, белый шум,
Ах фантом мой фантом.

ППГ написал(а):Петр, из 4 нуклеотода/букв (А, C, G, U) можно составить 4.3.2 = 24 триплета (с перестановками) и значит не бОльше аминокислот. Откуда у Вас числа 32/64?

4^3 = 64

Не будет ли 4 тройки из 4 элементов, у каждой тройки 3! = 6 перестановок и значит 4х6 = 24?

чукча написал(а):О, БОЖЕ ! ШЕФ ! ВСЁ ПРОПАЛО !!! У КЛИЕНТА ГИПС СНИМАЮТ!!!!!

чукча написал(а):Был бы интиллллллект, задавил бы... А так, увы, о юный отрок...

Чукча написал(а):Так, отрок чукча ! Ставлю Вам по греческой мифологии двойку ! Да и по русским сказкам тоже банан. Я имел ввиду Антея!

ППГ написал(а):Комментарии то будут?

ППГ написал(а):Весьма характерный пассажжжж: а кто Вы такой, акадэмик Гаряев, чтобы провозглашать якобы революцию в генетике, да и во всей биологии ? Что Вы показали своими экспериментами ? Кто повторил Ваши эксперименты ? Только Вы и ваши соратники по альтернативной науке...

Вот и получается, что свою безграмотность Вы подаёте как глубокие мысли с критическим уклоном...

В Бобруйск, жывотное....

Опять клоны - клопы пошли в действие ... однако только похожие и с маленькой буквы .... Видно опять надавили на мозоль научную с мобилру связанную.

ППГ написал(а):

На пост 383
Для Шурика ... не читающие русские сказки Афанасьева (том третий)... для того что бы не повторить подвиг Антея, носил с собой все время узелок с Землей Русской Наш былинный Герой ... Это к тому, что бы не разбрасываться фруктами бананами ...

чукча написал(а):Тут я с вами согласен, но хотел бы уточнить... Перепутался белый шум и фантомная пыль...

Прохожий написал(а):А, как Миша Баранов, работать с яблоками