Ключевое слово
28 | 03 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 02 Янв 2018 13:23 #5611

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
nonlocality wrote:
Игорь, ты как гений гаучного сыска, помоги мне найти адреса Туранова и др. Русских, авторов блестящей статьи

А Вы что - мое письмо не получили ? :dontknow:
The following user(s) said Thank You: Paul-2

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 02 Янв 2018 14:33 #5612

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
ППГ - письма не читает, он же писатель

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 02 Янв 2018 20:32 #5613

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
limarodessa wrote:
А Вы что - мое письмо не получили ?
Только что посмотрел. Гигант! Спасибо! Всего всего доброго в 2018 г. и в дальнейшем!

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 03 Янв 2018 07:18 #5614

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
limarodessa wrote:
Если ВладимирычЪ не прокомментирует мои сегодняшние предновогодние опусы - вердиктЪ будет сурофф :unsure:

Мой вердиктЪ: я на Владимырыча обиделсо !.. :unsure:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 03 Янв 2018 07:45 #5615

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Злобники ополчились на нашега доблестнага Петровича:

Peter Gariaev, wave genetics, and the problem of being a dilettante

So, if Gariaev is the next Einstein, why no papers in Nature or Science? [ Click to expand ]
Last Edit: 03 Янв 2018 07:46 by limarodessa.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 03 Янв 2018 09:26 #5616

  • Как
  • Как's Avatar
Они просто подчеркивают что пользователь ППГ НИЧЕМ не отличается от знаменитой рыбы-прилипалы.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 03 Янв 2018 09:27 #5617

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Кругом безобразия творятся... бякостники попухли вконец :unsure:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 10:30 #5618

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Помилуйте, народ, а почему вы решили что Гаряев первым выдумал лингвистический геном ? Вы ваще посмотрите в каком журнале и когда это опубликовано :confused: Да Петрович просто невинное дитя после этого :O

Linguistic Features of Noncoding DNA Sequences
We extend the Zipf approach to analyzing linguistic texts to the statistical study of DNA base pair sequences and find that the noncoding regions are more similar to natural languages than the coding regions. We also adapt the Shannon approach to quantifying the "redundancy" of a linguistic text in terms of a measurable entropy function, and demonstrate that noncoding regions in eukaryotes display a smaller entropy and larger redundancy than coding regions, supporting the possibility that noncoding regions of DNA may carry biological information.
Last Edit: 05 Янв 2018 10:57 by limarodessa.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 10:31 #5619

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Вообще степень моего офигения после найденного не поддается количественному выражению. Я даже не знаю что теперь скажут оппоненты. Им (оппонентам то бишь), наверное, просто везло все эти годы что я не брался всерьез за анализ теории Гаряева, потому как сейчас я не знаю что вся компания сможет возразить и инкриминировать Петровичу :dontknow:
Comment on “Linguistic Features of Noncoding DNA Sequences”
A Comment on the Letter by R. N. Mantegna et al., Phys. Rev. Lett. 73, 3169 (1994). The authors of the Letter offer a Reply.

STATISTICAL AND LINGUISTIC FEATURES OF DNA SEQUENCES
We present evidence supporting the idea that the DNA sequence in genes containing noncoding regions is correlated, and that the correlation is remarkably long range—indeed, base pairs thousands of base pairs distant are correlated. We do not find such a long-range correlation in the coding regions of the gene. We resolve the problem of the “non-stationarity” feature of the sequence of base pairs by applying a new algorithm called Detrended Fluctuation Analysis (DFA). We address the claim of Voss that there is no difference in the statistical properties of coding and noncoding regions of DNA by systematically applying the DFA algorithm, as well as standard FFT analysis, to all eukaryotic DNA sequences (33 301 coding and 29 453 noncoding) in the entire GenBank database. We describe a simple model to account for the presence of long-range power-law correlations which is based upon a generalization of the classic Lévy walk. Finally, we describe briefly some recent work showing that the noncoding sequences have certain statistical features in common with natural languages. Specifically, we adapt to DNA the Zipf approach to analyzing linguistic texts, and the Shannon approach to quantifying the “redundancy” of a linguistic text in terms of a measurable entropy function. We suggest that noncoding regions in plants and invertebrates may display a smaller entropy and larger redundancy than coding regions, further supporting the possibility that noncoding regions of DNA may carry biological information.
Last Edit: 05 Янв 2018 10:44 by limarodessa.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 10:31 #5620

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
В обчем, народ, что тут много говорить... жопа подкралась незаметно хоть о её существовании нас предупреждали... : :| Я если чесна, народ, - сам введен случившемся в прострацию

Lack of Biological Significance in the ‘Linguistic Features’ of Noncoding DNA—A Quantitative Analysis
Recently, the application of two statistical methods (related to Zipf's distribution and Shannon's redundancy), called ‘linguistic’ tests, to the primary structure of DNA sequences of living organisms has excited considerable interest. Of particular importance is the claim that noncoding DNA sequences in eukaryotes display specific ‘linguistic’ features, being reminiscent of natural languages. Furthermore, this implies that noncoding regions of DNA may carry some new, thus far unknown, biological information which is revealed by these tests. In this paper these claims are tested quantitatively. With the aid of computer simulations of natural DNA sequences, and by applying the same ‘linguistic’ tests to both natural and artificial sequences, we investigate in detail the reasons of the appearance of the claimed ‘linguistic’ features and the associated differences between coding and noncoding DNAs. The presented results show quantitatively that the ‘linguistic’ tests failed to reveal any new biological information in (noncoding or coding) DNA.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 10:32 #5621

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Не понятно другое, народ, вы посмотрите на кол-во цитирований сих опусофф. То бишь это вещи как бэ известные. Как так получилось что на форуме столько лет об этом никто ничего не знал ? :clapping:

The Linguistics of DNA: Words, Sentences, Grammar, Phonetics, and Semantics

Statistical and linguistic features of noncoding DNA: A heterogeneous «Complex system»

Explaining Linguistic Features of Noncoding DNA

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 10:41 #5622

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Ну вот это исчо: :eek:

Linguistic approaches to biological sequences

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 12:23 #5623

  • Как
  • Как's Avatar
Что Вас так удивляет пользователь из Одессы? Тот факт, что бывший ученый передрал иностранные тексты и как М.Ломоносов пытался их "привить" т.е выдать за свои идеи? ну не получилось у него, он так и застрял в прошлом. Опыты в Торонто он провалил, с тех пор только лох-матрицами и торгует, да "поститься" на форумах выдавая себя за новоявленного гуру с подмоченной репутацией для привлечения покупателей.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 12:31 #5624

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Как wrote:
Что Вас так удивляет пользователь из Одессы? Тот факт, что бывший ученый передрал иностранные тексты и как М.Ломоносов пытался их "привить" т.е выдать за свои идеи?

Петрович, это правда ? :dontknow: :(

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 13:23 #5625

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
limarodessa wrote:
Петрович, это правда ?
Разумеется нет. Кстати, ключевым доказательством речеподобности (лингистичности) генов белков служит функция 3-го нуклеотида в кодонах известных 31 кодах белков. В литературе об этом ничего. Это обнуляет все рассуждения.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 13:45 #5626

  • Как
  • Как's Avatar
Во дает дилетант от науки П.Гаряев, сброшенные ссылки пользователя из Одессы показывают что синоним словосочетаний («заумь» и «заумный язык») с позиции лингвистичности как отображении происходящих процессов служит НЕКАЯ ФУНКЦИЯ. Именно это и есть ключевое различие между наукой и мифом.
Вот эту не явную функцию и эксплуатирует вечно отстающий престарелый пенсионер.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 14:45 #5627

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49331
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
nonlocality wrote:
ключевым доказательством речеподобности (лингистичности) генов белков служит функция 3-го нуклеотида в кодонах известных 31 кодах белков.
ну, тогда почему этот 3-ий ВСЕГДА один и тот же в каждом из тех же известных 31 кодов белков/АК? для любой из тех 31-ой АК 3-ий ВСЕГДА один и тот же за исключением 1-2 случаев из милльонов? :popcorn:
Last Edit: 06 Янв 2018 03:38 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 21:48 #5628

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
ну, тогда почему этот 3-ий ВСЕГДА один и тот же в каждом из тех же известных 31 кодов белков/АК? для любой из тех 31 АК 3-ий ВСЕГДА один и тот же за исключением 1-2 случаев из милльонов?
Проснулся, милай. Это произвол статики, навязанный кодонам омонимам люд ям другими людьми, нобелиатами. Для сининимов все 4 разных нуклеотида (T,C,A,G) могут меняться местами как угодно. Это не меняет их кодовых функций (см. Таблицу). Для омонимов это принципиально не по Таблице. Там замены приведут к изменениям кодирования, но такие замены НЕ ПРОИЗВОЛЬНЫ, как требует Вобл гипотеза Ф.Крика, значения первых двух нуклеотидов кодонов омонимов задается контекстами мРНК, а третьему нуклеотиду остается роль а) молчать и не участвовать в кодировании, б) участвовать в кодировании с "делегированной функцией", в) чисто физически укреплять кодон-антикодоновую пару.
Что такое "делегированная функция"? Поскольку порядок нуклеотидов в белковом гене и, соответственно в мРНК, жесткий (наследственный), то при чтении рибосомой мРНК и встрече с дублетом омонимом (с 1-м и 2-м нуклеотидами кодона) возникает ситуация неопределенности, связанной с 3-м вобулирующим по Ф.Крику (и по Природе кода) нуклеотидом. Какова его роль в тексте кодона? Тут-то и происходит делегирование функции по схеме контекстных ориентаций. Пример: "он услышал как коР? замяукал" и "он забыл коГ? своей электронной почты". Исходя из контекста предложений в слове коР букве Р надо делегировать функцию буквы Т, а во втором букве Г функции буквы Д. В результате дуплеты омонимы перестают быть таковыми и в составе целостного триплета (кодона) приобретают точную и ЕДИНСТВЕННУЮ семантику кодирующего слова. Принцип прост, как всё гениальное, придуманное Природой. Это те самые перекодировки кодонов, которые давно известны, но не поняты пока большинством в отношении двусмысленных (омонимических) дублетов в составе кодонов. В лингвистике есть канон пример роли концов слов в предложении (в контексте) для делегирования смысла словам: "Глокая куздра штеко будланула бокра и курдячит бокрёнка". Вроде бессмыслица, а на самом деле всё понятно. :) Таков и язык генов (ДНК), а может, и РНК.

Поздравляю с хорошим вопросом. Для этого стоило более 10 лет воевать со мной.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 21:53 #5629

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Да, и главное. Мои соображения о двойственном кодировании триплетами омонимами получено нашими ребятами в США в 2009г. genetiku.ru/news/item/f00/s02/n0000254/index.shtml

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 05 Янв 2018 21:55 #5630

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Это было предсказано мной в 1997г. в монографии "Волновой генетический код". Есть в ГУГЛе.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 06 Янв 2018 06:40 #5631

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
nonlocality wrote:
Поздравляю с хорошим вопросом. Для этого стоило более 10 лет воевать со мной.

В материалах по приведенным мною выше ссылкам четко указано, что некодирующая (в том числе мусорная, Junk DNA) ассоциируется с некими лингвистическими (как у Гаряева) свойствами и может нести некую необходимую для жизнедеятельности организма информацию.

Но у меня вопрос: если действительно определенная часть Junk_DNA несет эту "лингвистическую информацию" то как происходит транскрипция этих участков Junk_DNA, то есть это что - всё считывается на иРНК или какая-то часть ДНК в силу этого в иРНК не записывается ?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 06 Янв 2018 13:11 #5632

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49331
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
кстати да, никогда не задумывался над тем, что иРНК может и наверно намного коротче, чем ДНК и может "мусор" засоряющий последнюю и определяет что входит или не в короткую цепочку иРНК, где уже "бездельничающего" мусора не будет и любой участок будет нешуточно колыхать рибосому :xren:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 06 Янв 2018 20:54 #5633

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
limarodessa wrote:
В материалах по приведенным мною выше ссылкам четко указано, что некодирующая (в том числе мусорная, Junk DNA) ассоциируется с некими лингвистическими (как у Гаряева) свойствами и может нести некую необходимую для жизнедеятельности организма информацию.

Но у меня вопрос: если действительно определенная часть Junk_DNA несет эту "лингвистическую информацию" то как происходит транскрипция этих участков Junk_DNA, то есть это что - всё считывается на иРНК или какая-то часть ДНК в силу этого в иРНК не записывается ?
Не нашел место, где ссылка на меня. Но это соответствует. В мусорной ДНК нет текстов. Там короткие повторы, из которых строится голограмма.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 08:06 #5634

  • Как
  • Как's Avatar
Ну а вот тут интересно - каков механизм "из которых строится голограмма" из этих повторов? Где излучатель, где отражатель, где зеркала???

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 12:25 #5635

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Как wrote:
Ну а вот тут интересно - каков механизм "из которых строится голограмма" из этих повторов? Где излучатель, где отражатель, где зеркала???
Ликбез. Голограммы можно строить математически. Геном - это компьютер. Это для высших стадий эволюции. Но в начале её голограммы отбирались путём естественного отбора по Дарвину за сче случайных комбинаторик жидких кристаллов ДНК. Для считывания их достаточно белого света (суммы цветов) солнца.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 13:28 #5636

  • Как
  • Как's Avatar
Начнем с конца...
1. Где в клеточной массе горит "белый свет"?
2. У кого и кеи отбирались голограммы???
3. Если Геном - компьютер, то где система хранения и вывода информации?
4. Если голограммы можно строить математически, то какой прибор в клетке обладает знаниями математики и их опознает, принимает решение и двигает остальные молекулы ?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 15:23 #5637

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49331
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
Боже упаси какими примитивизмом и убогостью щеголяет ваша (Петровича с Каком) перепалка здеся... :tired:
Last Edit: 07 Янв 2018 15:45 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 15:33 #5638

  • Чукчи не из Сибири..
  • Чукчи не из Сибири..'s Avatar
Ну это Вы зря. Нам тут в "Чуме ..." искренне интересно, как эти на первый взгляд простые вопросы ПОТОПЯТ измы от П.Гаряева.
ps
У постели умирающего сидит медсестра. В палату заходит врач.
- Сестра, что вы сидите?
- А что такое?
- Ну, хоть клизму ему поставьте, что ли!
- Так он же все равно умрет с минуты на минуту!
- Он-то умрет, зато вы будете при деле!

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 18:55 #5639

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Как wrote:
Начнем с конца...
1. Где в клеточной массе горит "белый свет"?

ПГ: Всё. ПОСЛЕ этой безграмотности НА ОСТАЛЬНЫЕ ОТВЕЧАТЬ БЕССМЫСЛЕННО. Читайте научную литературу. ВКЛЮЧАЯ МОИ КНИГИ.

2. У кого и кеи отбирались голограммы???
3. Если Геном - компьютер, то где система хранения и вывода информации?
4. Если голограммы можно строить математически, то какой прибор в клетке обладает знаниями математики и их опознает, принимает решение и двигает остальные молекулы ?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 07 Янв 2018 18:58 #5640

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
Боже упаси какими примитивизмом и убогостью щеголяет ваша (Петровича с Каком) перепалка здеся...
а Я ТО ДУМАЛ, ЧТО ВЫ ПОУМНЕЛИ. ВОПРОС КЛАССНЫЙ ЗАДАЛИ, В ПРОТИВОПОЛОЖНОСТЬ ДЕСЯТИЛЕТИЮ ИДИОТИЗМА. КВЕРКУС ВЫ ПО ПРЕЖНЕМУ.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум