TOPIC: Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
21 Дек 2017 18:32 #5551
Пятиклассник П.Гаряев так и не смог до сих пор понять, что нет одинаковых кодонов. Все эти обозначения типа U это набор молекул, имеющие свои индивидуальные особенности в своих электронных оболочках, и эти особенности и являются различимы, что Природа и показала.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
22 Дек 2017 07:50 #5552
Господа, чем вы тут окодемига накачали?
Бедняга омонимы с синонимами путает. Дает определение одному, приводит пример другого.
Таблицу свою по памяти не может... Монографию забыл начисто.
Отнимите у него лазер
Воблированием шутить нельзя!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
22 Дек 2017 17:19 #5555
ПетровичЪ, меня нижеприведенное заинтересовало по квантовым делам - в митохондриях ДНК. То есть при делении она удваивается. То есть - формируется квантовая запутанность. Да ещё и в мозге...
Ранние этапы формирования кокаиновой зависимости у мышей сопровождаются делением и уменьшением размера митохондрий в нейронах участков головного мозга, отвечающих за формирование мотивации и вознаграждения. Подавление этого процесса ослабляет тягу животных к кокаину. Как предполагают авторы работы, опубликованной в журнале Neuron, вещества, препятствующие делению митохондрий, можно рассматривать как потенциальные препараты для лечения наркозависимости...
Так как наркозависимость напрямую связана с системой вознаграждения в мозге, исследователей заинтересовала, изменяется ли динамика митохондрий при развитии кокаиновой зависимости. За формирование мотивации, положительного (вознаграждение) и отрицательного (отвращение) подкрепления отвечает прилежащее ядро полосатого тела (nucleus accumbens) — группа нейронов в «древней» части мозга. Именно за митохондриями в нейронах прилежащего ядра мышей при повторяющемся приеме кокаина наблюдали исследователи из университета Мэриленда (США) под руководством Мэри Кей Лобо (Mary Kay Lobo).
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
22 Дек 2017 17:25 #5556
Не хочет ли пользователь из Одессы намекнуть, что у пользователя ППГ стойкая зависимость к этому Волновому Геному сравнимая с кокаиновой?! и может лечиться таким способом?!
Both classical physics and quantum mechanics may be operational in cell communication. Living cells seem to ‘talk’ to each other with incredible precision and accuracy to maintain synchrony, unity of purpose and health. Gurwitsch called emissions from living cells ‘mitogenic rays’. Kaznacheyev demonstrated optical coupling between two separated cell cultures. Popp termed the communicating coherent rays, bio-photons, which concentrated in the cell nucleus. Albrecht-Buehler suggested that cells exhibited intelligence. Communication (abscopal, bystander, bio-photon, teleportation) between cells or animals seems to rely on frequency-specific transmission from DNA. Garjajev found that DNA not used for protein synthesis was instead used for hyper-communication as an optical biochip. Mothersill found abundant evidence for bystander data transfer from irradiated to nonirradiated cells, tissues or animals. Communication appears unbelievably coordinated and coherent possibly utilizing bio-photon and/or quantum mediated transfer of information
Koruga [9] states that DNA and proteins could not be investigated separately: in
quantum entanglement approach they have to be considered as a unique system
proteins are “second side of DNA code”
A particular attention is paid to gadolinium and copper
doped DNA systems, their unusual magnetism being treated. The problem of classical and quantum transport (including transfer of
genetic information during replication and transcription) and electron localization in biological systems is discussed.
Investigation of the properties of peptide plane in protein chain from both classical and quantum approach is presented. We calculated interatomic force constants for peptide plane and hydrogen bonds between peptide planes in protein chain. On the basis of force constants, displacements of each atom in peptide plane, and time of action we found that the value of the peptide plane action is close to the Planck constant. This indicates that peptide plane from the energy viewpoint possesses synergetic classical/quantum properties. Consideration of peptide planes in protein chain from information viewpoint also shows that protein chain possesses classical and quantum properties. So, it appears that protein chain behaves as a triple dual system: (1) structural - amino acids and peptide planes, (2) energy - classical and quantum state, and (3) information - classical and quantum coding. Based on experimental facts of protein chain, we proposed from the structure-energy-information viewpoint its synergetic code system.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
23 Дек 2017 15:04 #5562
Смотрим статью "Классические и квантовые информационные каналы в белковой цепи"... читаем
....Основываясь на экспериментальных фактах белковой цепи, авторы предложили из структурно-энергетической информации его синергетическую кодовую систему....
.... и понимаем, что нет ссылок на вЯликого Гуру и эту как-бы "кодовую систему" еще будут в будущем как бы еще анализировать..
В переводе на более понятный язык для пользователя Пети Гаряева - действие силовых констант ВОЗМОЖНО близки к постоянной Планка и обладают какими то - свойствами, которые еще надо бы изучать.
Так, что жалеть нужно не удачника ППГ.
Газета The Guardian назвала лучших злодеев на телевидении за 2017 год. Перечень опубликован на сайте издания.
В частности, в список попал Перри Райт в исполнении Александра Скарсгарда из сериала "Большая маленькая ложь". Как отмечает издание, здесь нет особенно хороших персонажей, но самым "прогнившим" был именно этот.
Также отмечен "Рассказ служанки", где лучшими злодеями оказалось 90% героев, в том числе правящий мужской класс и их жены.
The interaction between a cationic poly(amido amine) (PAMAM) dendrimer of generation 4 and double-stranded salmon sperm DNA in 10 mM NaBr solution has been investigated using dynamic light scattering (DLS) and steady-state fluorescence spectroscopy. The structural parameters of the formed aggregates as well as the complex formation process were studied in dilute solutions. When DNA is mixed with PAMAM dendrimers, it undergoes a transition from a semiflexible coil to a more compact conformation due to the electrostatic interaction present between the cationic dendrimer and the anionic polyelectrolyte. The DLS results reveal that one salmon sperm DNA molecule forms a discrete aggregate in dilute solution with several PAMAM dendrimers with a mean apparent hydrodynamic radius of 50 nm. These discrete complexes coexist with free DNA at low molar ratios of dendrimer to DNA, which shows that cooperativity is present in the complex formation. The formation of the complexes was confirmed by agarose gel electrophoresis measurements. DNA in the complexes was also found to be significantly more protected against DNase catalyzed digestion compared to free DNA. The number of dendrimers per DNA chain in the complexes was found to be approximately 35 as determined by steady-state fluorescence spectroscopy.
In this paper, we consider the mutagenic properties of the 2-aminopurine (2AP), which has intrigued molecular biologists, biophysicists and physical chemists for a long time and been widely studied by both experimentalists and theorists. We have shown for the first time using QM calculations, that 2AP very effectively produces incorporation errors binding with cytosine (C) into the wobble (w) C·2AP(w) mispair, which is supported by the N4H⋯N1 and N2H⋯N3 H-bonds and is tautomerized into the Watson–Crick (WC)-like base mispair C*·2AP(WC) (asterisk denotes the mutagenic tautomer of the base), that quite easily in the process of the thermal fluctuations acquires enzymatically competent conformation. 2AP less effectively produces transversions forming the wobble mispair with A base – A·2AP(w), stabilized by the participation of the N6H⋯N1 and N2H⋯N1 H-bonds, followed by further tautomerization A·2AP(w) → A*·2AP(WC) and subsequent conformational transition A*·2AP(WC) → A*·2APsyn thus acquiring enzymatically competent structure. In this case, incorporation errors occur only in those case, when 2AP belongs to the incoming nucleotide. Thus, answering the question posed in the title of the article, we affirm for certain that 2AP induces incorporation errors at the DNA replication. Obtained results are consistent well with numerous experimental data.
Пошук універсальних фізико-хімічних підвалин специфічності взаємодії між компонентами нуклеопротеїдних комплексів і встановлення ролі прототоропної таутомерії і конформаційної мінливості компонентів нуклеїнових кислот та перенесення протону в елементарних актах білково-нуклеїнового та нуклеїново-нуклеїнового впізнавання.
Дослідження методами обчислювальної біології фізико-хімічних властивостей ДНК, її компонентів та білково-нуклеїнових комплексів; пошук фізико-хімічних механізмів, відповідальних за точність синтезу ДНК.
Первый соавтор работы указанной в моем предыдущем посте является сотрудником в том числе этого отдела
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
30 Дек 2017 06:25 #5572
Лимародессе.
Игорь, багодарю за статью, которая однозначно и независимо доказывает омонимию ген. кода, которую предсказал и опубликвал в 1997г. в моногорафии Волновой генетический код. Доказывает на примере кодирования селеноцистеина. Экспериментально очень мощная рабта, но слабая в теор. плане. Авторы не понимают роли двусмысленного кодирования аминокислот кодоном омонимом.
Вот эта работа:
-9-2009
Genetic Code Supports Targeted Insertion of Two
Amino Acids by One Codon
Anton Turanov
University of Nebraska - Lincoln
Alexei Lobanov
University of Nebraska - Lincoln
Dmitri E. Fomenko
University of Nebraska - Lincoln,
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Hilary Morrison
Josephine Bay Paul Center, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA
Mitchell Sogin
Josephine Bay Paul Center, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA
Абстракт
Считается, что строгое взаимно однозначное соответствие между кодонами и аминокислотами является важной особенностью генетического кода. Тем не менее, мы сообщаем, что один кодон может кодировать две разные аминокислоты с выбором вставленной аминокислоты, определенной специфической 3'-нетранслируемой структурой области и расположением кодона с двойной функциональностью в РНК-мессенджере (мРНК). Мы обнаружили, что кодон UGA указывает на введение селеноцистеина и цистеина в ресничном Euplotes crassus , что двойное использование этого кодона может происходить даже внутри одного и того же гена и что структурные механизмы мРНК Euplotes сохраняют зависимую от местоположения двойную функцию UGA, когда выраженный в клетках млекопитающих. Таким образом, генетический код поддерживает использование одного кодона для кодирования нескольких аминокислот.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
30 Дек 2017 07:04 #5573
Петрович это спасибо не мне, эту работу в свое время нашел и разместил здесь на форуме покойный Олег. Вы просто невнимательно читали его внешне сумасбродные посты.
...один и тот же триплет используется и для цистеина, и для селеноцистеина. Эти аминокислоты встраиваются в белок разными тРНК, но обе тРНК «узнают» триплет ТГА.
Но как это происходит? Как рибосома читает эту мРНК и как она «узнает», какую аминокислоту встроить?
Чтобы ответить на этот вопрос, мы изучили белок тиоредоксинредуктазу, ген которого содержит 7 кодонов ТГА. Первые 6 всегда кодируют цистеин, а последний - селеноцистеин. Чтобы понять, связана ли эта функция с конкретной позицией или же положением относительно начала и конца мРНК, мы стали переставлять ТГА-кодон в разные места. Постепенно стало понятно, что с начала белковой цепочки и почти до самого конца (20 последних аминокислот) встраивается цистеин. Но если этот триплет находится среди последних 20 «генетических букв», на место цистеина встает селеноцистеин.
Тогда и стало понятно, как всё работает. В «нечитаемой» области мРНК стоит петлеобразная структура. По-видимому, когда рибосома начинает транслировать мРНК, эта структура просто недоступна, и никак не может повлиять на процесс трансляции. В таких случаях на место ТГА встаёт цистеин.
Как только рибосома продвигается дальше, это каким-то образом сказывается не только на области трансляции, но и на всей молекуле мРНК. В результате в синтезируемый белок вместо цистеина вводится селеноцистеин.
Насколько вы уверены в описанном механизме, ведь непосредственно «разглядеть» как это происходит попросту невозможно?
Точная структура любой большой молекулы РНК или общая структура мРНК до конца не известны и труднопредсказуемы, так что увидеть, как этот петлеобразный элемент «мешает» или «помогает» попросту невозможно. Но проделанные нами эксперименты позволяют сказать это с очень большой вероятностью...
Это первое исключение из классических свойств генетического кода?
То, что один кодон кодирует две аминокислоты, продемонстрировано нами впервые.
Наиболее близкая к этому ситуация встречается у некоторых дрожжей. У них на место одного кодона тоже могут встраиваться две аминокислоты, но это происходит наугад. Дело в том, что один из видов тРНК, транспортирующих аминокислоты к рибосоме, не «различает» две из них, и в результате в белок встраивается та, что просто оказалась рядом. Кроме того, начало синтеза белка и встраиванием аминокислоты метионин кодируется одним и тем же кодоном АТГ.
Другое своеобразное «исключение» - 21-я и 22-я аминокислоты, неизвестные на момент составления кодон-аминокислотного словаря. Это уже упомянутый селеноцистеин и пирролизин, открытый Джо Крыски лишь в 2002 году. 21-я аминокислота встречается редко, но во многих организмах, (например, у человека мы обнаружили 25 кодирующих селеноцистеин генов). Пирролизин в основном остается прерогативой небольшой группы архей.
Ещё можно упомянуть митохондриальные коды, а так же различия в «прочтении» между отдельными организмами, когда изменяется код, но не правила, по которым он работает.
Большинство этих исключений описано у прокариот. Как Вы думаете, связано ли это с тем, что эукариоты научились регулировать работу своего генома другими методами?
И у эукариот есть исключения, только в случае эукариот они не настолько хорошо изучены. Возможно, что-то изменится с появлением геномных последовательностей других одноклеточных эукариот. У обитающих на Земле как минимум 600 миллионов лет одноклеточных эукариот силиатов, к которым принадлежит Euplotes, известно очень много вариаций генетического кода. Например, у силиата тетрахимены, аминокислота глутамин кодируется через ТАГ и ТАА, а ТГА остается единственным стоп-сигналом.
ТГА - в некотором смысле уникальный триплет, ведь он является ещё и стоп-кодоном. Как Вы думаете, возможен ли этот феномен для других кодонов? Где стоит искать?
We propose that the DNA within the chromatin behaves as a dynamic combinatorial library capable of forming novel structures by reversible processes. We also hypothesize that states within the library may be linked via quantum tunneling. RNA polymerase then could scan these states and the system decoheres to the “appropriate” state. Two ways of sustaining quantum coherence at relevant time scales could be possible, first, screening: the quantum system can be kept isolated from its decohering environment, second, the existence of decoherence free subspaces .We discuss the role of superconductivity in
context of avoiding decoherence in context of our hypothesis
в том числе правящий мужской класс и их жены.