TOPIC: Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 11:55 #1621
Чукча не из Сибири ... wrote:
Звучное сочетание "воблирование" с катастрофическим не пониманием не замкнутых множеств и отсутствия здорового реализма
Опять БЗ блажит о коде, которого не понимает. А спроси его о связи кода с "не замкнутыми множествами", что БЗ ответит? Минутой молчания... после прочтения хотя бы этого www.mccme.ru/mmmf-lectures/books/books/b....php?book=20&page=14 с последующей истерикой
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 11:59 #1622
nonlocality wrote:
Чукча не из Сибири ... wrote:
Звучное сочетание "воблирование" с катастрофическим не пониманием не замкнутых множеств и отсутствия здорового реализма
Опять БЗ блажит о коде, которого не понимает. А спроси его о связи кода с "не замкнутыми множествами", что БЗ ответит? Минутой молчания... после прочтения хотя бы этого www.mccme.ru/mmmf-lectures/books/books/b....php?book=20&page=14 с последующей истерикой
Вот так и начинается.....А ведь говорили о том, Петрович, сами говорили!, что только по теме отвечаю!!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 12:02 #1623
nonlocality wrote:
И второе, он не понял, как и "отцы" модели кода, явление омонимии в кодировании и его двумерную вырожденость.[/b]
Это вопрос: не поняли или поняли нечто иное.
Вот таблица из статьи "Два из трех" Лагерквиста (комментарии в статье к таблице иные, не по "омонимии")."Омонимию" видно, сразу видно.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 13:54 #1624
Специально для пользователя Вики и временно примкнувшему к Ней Блаженного Ботаника из подвального клана "ЛжеУченых"
Ваши таблицы которыми Вы пытаетесь оперировать, можно отнести к четким множествам. На самом деле - это не четкие множества, что иногда и выявлено в Ваших примерах. Вместо того, что бы оперировать дополнительными условиями существования новых построений на фундаменте старых,но не полных взглядов, надо просто изучать дополнительные материалы, а не строить липовые теории о пустых пузырях называя эти явления "воблированием" или мистикой..
ps Многие знают, что собака Павлова при виде лампочки пускала слюни, но мало кто знает, что она вытворяла при виде паяльника!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 14:12 #1625
Вика wrote:
nonlocality wrote:
Чукча не из Сибири ... wrote:
Звучное сочетание "воблирование" с катастрофическим не пониманием не замкнутых множеств и отсутствия здорового реализмаОпять БЗ блажит о коде, которого не понимает. А спроси его о связи кода с "не замкнутыми множествами", что БЗ ответит? Минутой молчания... после прочтения хотя бы этого www.mccme.ru/mmmf-lectures/books/books/b....php?book=20&page=14 с последующей истерикой
Вот так и начинается.....А ведь говорили о том, Петрович, сами говорили!, что только по теме отвечаю!!
Это сугубо в рамках темы. Я демонстрирую уровень г-на в отношении кода. Может ответить, если я не прав. Лексика нормальная. Всегда подчеркивал, что юмор и нестандартная форма ответа приветствуется, если нет этических перекосов.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 14:32 #1626
Вика wrote:
Это вопрос: не поняли или поняли нечто иное.
Вот таблица из статьи "Два из трех" Лагерквиста (комментарии в статье к таблице иные, не по "омонимии")."Омонимию" видно, сразу видно.
Так это давно было видно, и до этой непонятой им классификации. Ин-Ян распределения тут не обнаружить. Да и роли этих семейств он недопонял. Отсюда и странные выводы Лагерквиста. Но то, что он все-таки поднял вопрос о роли этих групп кодонов с двойной функцией и о потенциальных опасностях такой двойственности, делает ему честь. И главное - сформулировал правило "два из трех". Но ответа на вопрос, распространяется ли воблирование на ВСЕ кодоны или только на синонимы, он не дал, как и Ф.Крик. Я не нашел. Если кто нашел, прошу ссылку.
Еще раз дам соображения по семействам дублетов омонимов, уже с учетом попарных противостояний в них:
Как идет выбор аминокислот (и стопов) в не синонимических кодонах? При Криковском условии воблирования (не участия в кодировании) 3-го нуклеотида во всех (?) кодонах (на этот вопрос ни Ф.Крик, никто не отвечает). Например, семейство кодирующих дублетов AG кодируют ОДНОВРЕМЕННО Ser и Arg. Причем, попарно они синонимичны и избыточно кодируют Ser и Arg и там выбор прост - наличествуют изоакцепторные тРНК. Но триплеты AGT и AGC (Ser) ОМОНИМИЧНО противостоят триплетам AGA и AGG (Arg) в пределах семейства AG. А тут уже НАДО делать ВЫБОР - либо Ser, либо Arg - одна тРНК не может посадить на себя две разные аминокислоты. Выбор идет с использование контекстных ориентаций рибосомы на мРНК. Такая внутренняя синонимо-омонимического дуалистичность не синонимических кодонов существенна. Биофункция такого дуализма (в пределах семейств омонимических кодонов) пока мне не понятна. Возможно, она в придании еще большей гибкости коду с преобладанием синонимии?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 14:45 #1627
Олег wrote:
суть у тебя простая рогатая триплетный код белков работает у меня в руках и у всех которые могут синтезировать олиги могут получить нужный белок ну как я а ты бля - никто по сути уеп
Главный коловед-липкотолог Лимародесса увидев такое рассердился бы наверное
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 14:49 #1628
nonlocality wrote:
Таких кодонов (омонимы) по крайней мере 16, если учесть попарное омонимическое противостояние триплетов в омонимических семействах, о чем говорил неск. постами выше.
а куда еще ваших 16 омонимов делись ? ...
= просто запомните
код перевода посл нуклеотидов в последовательность аминокислот
- триплетен
дуплетным он не может быть
даже если бы было всего 15ть аминокислот и один стоп кодон
= триплет же в мРНК
позволяет выбирать какую аа-тРНК рибосоме выбрать - там четвертичный комплекс выбирает
= триплетный кодон - этим комплексом - выбирается без всяких дуплетов с воблами - начиная с термодинамики констант связывания
и ИФ-Ту с ГТФ решает (две попытки) - как твои долбанные дуплетные омонимы с неправильной конформацией аа-тРНК - выкинуть
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 15:07 #1631
Олег wrote:
код перевода посл нуклеотидов в последовательность аминокислот
- триплетен
дуплетным он не может быть
Жаль, что не усваиваешь простого. Код дуплетен для синонимов. Это давно показано. 3-й нуклеотид в кодоне может быть любым, поэтому и работает синонимия. Другое дело что 3-й в синонимах нужен как "стерический костыль", дающий более прочную кодон-антикодоновую связь. Но при сдвиге рамки считывания 3-й может стать вторым или первым.
В отношении уменьшения количества кодонов-омонимов с 32 до 16, это объяснил в ближних постах. Но это не меняет их роли. Поиск однозначности для этих 16 по прежнему необычайно важен. Код дуплетен и для омонимов, но там игра сложнее.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 15:13 #1634
Вот и все доказательства Блаженного Ботаника о дублетности...
Ему объяснять просто ничего не возможно. Только хвалить за усердие, с которым он и сидит в подвале ...
ps На собеседовании:
- Как у вас дела с многопоточным программированием?
- Отлично! Отлично без него обхожусь...
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 15:22 #1635
Чукча не из Сибири... wrote:
Специально для пользователя Вики и временно примкнувшему к Ней Блаженного Ботаника из подвального клана "ЛжеУченых"
Ваши таблицы которыми Вы пытаетесь оперировать, можно отнести к четким множествам. На самом деле - это не четкие множества, что иногда и выявлено в Ваших примерах. Вместо того, что бы оперировать дополнительными условиями существования новых построений на фундаменте старых,но не полных взглядов, надо просто изучать дополнительные материалы, а не строить липовые теории о пустых пузырях называя эти явления "воблированием" или мистикой..
Коль скоро пользователь Чукча вновь вернулся к доморощенным кличкам, то отвечу ему как Блажному Зяме (БЗ). В основе белкового кода на вещественном уровне лежит четкая биохимия взаимодействия ДНК-мРНК-тРНК плюс белковые факторы и термодинамика. Никакой мистики. Лингвистическая часть мистична ровно настолько насколько мистичны или не мистичны все тексты, написанные человечеством. Где здесь место не четким множествам? Поясните пожалуйста.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 16:12 #1638
На пост 1637. Вы почему то фигурируете только целыми множествами, совершенно забывая о том, что например молекула А, может отличаться (естественно не значительно по Нашим меркам, но фундаментально по меркам микромира) от другой молекулы А. Во первых ее место в кодоне, так как ее ЭМ-поля участвуют во взаимодействии и удержании этой сцепки, уже это условие делает различие по месту ее расположения, т.е. А, А*,А** по ЭМ-полям будут зависеть от ее место расположения в кодоне (это и есть понятие не четкого множества), только этот посыл, сразу же раздвигает возможности кодирования на целый порядок, что сразу же раздвигает рамки таблиц. Если к этому прибавить возможности которые дают мРНК и тРНК при выборе, то уже можно говорить о N-мерном варианте -ичных комплексов для кодирования
ps Звонит Абрам Исааку и говорит:
- Я так полюбил Путина.
- С чего бы это вдруг?
- У нас в Луганске уже месяц в кране нет воды и никто не сказал, что это мы с тобой виноваты.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 16:49 #1639
Чукча не из Сибири ... wrote:
На пост 1637. Вы почему то фигурируете только целыми множествами, совершенно забывая о том, что например молекула А, может отличаться (естественно не значительно по Нашим меркам, но фундаментально по меркам микромира) от другой молекулы А. Во первых ее место в кодоне, так как ее ЭМ-поля участвуют во взаимодействии и удержании этой сцепки, уже это условие делает различие по месту ее расположения, т.е. А, А*,А** по ЭМ-полям будут зависеть от ее место расположения в кодоне (это и есть понятие не четкого множества), только этот посыл, сразу же раздвигает возможности кодирования на целый порядок, что сразу же раздвигает рамки таблиц. Если к этому прибавить возможности которые дают мРНК и тРНК при выборе, то уже можно говорить о N-мерном варианте -ичных комплексов для кодирования
ps
Вполне возможно. Но покажите хотя бы одну работу, где продемонстрировано различие по этим непонятным меркам (каким?), например, двух аденинов или двух тиминов, двух цитозинов, гуанинов и пр. биоактивных веществ. По оптической активности не надо - in vivo все метаболиты имеют L-форму. После этого от абстракции можно к делу.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 17:10 #1640
Косвенно это подтверждено в работе пользователя Олега и его группы, когда ЭМ "белым шумом" выбивал "связки" из мертвых остатков ДНК. Статья уже напечатана в рейтинговом журнале.
ps - Он чихнул, значит, правду говорю!
- Товарищ адвокат, у вас все?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 17:19 #1642
Чукча не из Сибири ... wrote:
Косвенно это подтверждено в работе пользователя Олега и его группы, когда ЭМ "белым шумом" выбивал "связки" из мертвых остатков ДНК. Статья уже напечатана в рейтинговом журнале.
ps
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 17:22 #1643
Не надо так шуметь спиртонозавр Питерский. Как раз из мертвых ДНК и выбивались эти данные вопреки табличным условиям ..
ps Баскервиль-холл, замок сэра Генри.
Дворецкий подает завтрак.
- Что это, Бэрримор?
- Овсянка, сэр!
- Но почему?
- Гречка, сэр, нам уже не по карману!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 18:03 #1645
Чукча не из Сибири ... wrote:
Косвенно это подтверждено в работе пользователя Олега и его группы, когда ЭМ "белым шумом" выбивал "связки" из мертвых остатков ДНК. Статья уже напечатана в рейтинговом журнале.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 18:27 #1647
Олег wrote:
к какому делу еще
если ты совсем спятил
рибоза ин виво = Д
Пусть D-форма в РНК. Ну и что? L-формы там нет. Роль, допустим, в коде сравнивать не с чем. Интереснее пурины и пиримидины. Чем могут различаться два аденина, два гуанина, цитозина, тимина in vivo? Надо за что-то зацепиться. И уйти от абстракций.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 18:34 #1648
Олег wrote:
а ты - гад
Утомил. Ну не хочет он мирно и достойно разговаривать. И Владимирович потакает этому.
Олег, ты понимаешь, что ты - сволочь и подонок? Прошу извинить, но это единственный способ поставить его на место. Был бы он рядом, дал бы ему в пьяную и наглую рожу. Он еще и трус. Знает, что физически его не достанешь.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 18:41 #1649
nonlocality wrote:
И уйти от абстракций.
= конформацией их аа-тРНК если про рибосомы
а так -
Пусть D-форма в РНК. Ну и что? L-формы там нет. Роль, допустим, в коде сравнивать не с чем. Интереснее пурины и пиримидины. Чем могут различаться два аденина, два гуанина, цитозина, тимина in vivo? Надо за что-то зацепиться. И уйти от абстракций.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
12 Авг 2015 19:28 #1650
Ладно. Рано или поздно надо заканчивать работу тут. Что мог - сказал.
Приношу благодарность Олегу за возможность расстаться с кванто форумом.
Надеюсь, что полезное в моем участии было.