В дуплетах синонимах, несмотря на однозначность кодирования, третья буква на мРНК придает смысл триплету-кодону-синониму. (горячий чай, жаркий день; молвили уста, губная помада здесь: уста-губы синонимы ). То, что вы называете выходом на ментальный уровень. Что не правильно?
ТСТ, ТСС и AGT, AGC - что триплето, что двуплетно (здесь по пиримидинам Т,С) -синонимы получаются. Или рассматриваются синонимы только по группам -четверкам?
правильно заметили, Вика, тут 6 триплетов ТСТ, ТСС, ТСА, ТСG, AGT, AGC и 2 дуплета TС и AG оказываются синонимами, поскольку облюбовали себе кислоту Ser
Вот с этой синонимией и получается, что триплеты TCT,TCC,TCA,TCG синонимы в своей группе и при этом "синонимичны" триплетам AGT,AGC. Будем считать, что AGT,AGC относятся к омонимам. Но если кодируют дуплеты тогда дуплеты ТС и дуплет AG в "позиции пиримидинов Т и С" синонимы. Это даже для меня слишком.....
Неправильно, что 3-я буква (не на мРНК, а на триплете в мРНК) придает смысл триплету-кодону-синониму. НЕ ПРИДАЕТ. В этой четверке 3-я буква кодона может быть любой из 4-х возможных - T,C,A,G. И так для всех омонимов. Почему решили, что "придаёт"?
если НЕ ПРИДАЕТ, а придаёт контекст, то почему контекст не придаст не только триплету-кодону-омониму, но и триплету-кодону-синониму?
"прочтение" отображается в их модуляциях, определяемых последовательностями нуклеотидов мРНК = контекстами. Прочтенная информация передается рибосомам как нанобиокомпьютерам, принимающим решение о придании точного кода дублету омониму. Рабочая версия
Неправильно, что 3-я буква (не на мРНК, а на триплете в мРНК) придает смысл триплету-кодону-синониму. НЕ ПРИДАЕТ. В этой четверке 3-я буква кодона может быть любой из 4-х возможных - T,C,A,G. И так для всех омонимов. Почему решили, что "придаёт"?
если НЕ ПРИДАЕТ, а придаёт контекст, то почему контекст не придаст не только триплету-кодону-омониму, но и триплету-кодону-синониму?
Впервые, ХАйдук, я с вами соглашусь. Я тоже так подумала.
Вика, не обращайте внимания. Он просто перестал соображать. Или специально путает. Вы же видели его уровень, когда Олег поймал его на элементарном непонимании - когда Т надо, а когда У.... Скорее всего, изначально ничего не понимает и вас вовлекает в путаницу. Забейте.
Теперь "внутренне" и "внешнее" кодирование. Как я понимаю вашу интерпретацию синонимов.
Для синонимов.
TCT
TCC
TCA
TCG
Синонимами являются триплеты. Это правильно?
Дуплет ТС кодирует Ser. Это принято называть однозначностью.
В дуплетах синонимах, несмотря на однозначность кодирования, третья буква на мРНК придает смысл триплету-кодону-синониму. (горячий чай, жаркий день; молвили уста, губная помада здесь: уста-губы синонимы ). То, что вы называете выходом на ментальный уровень.
Что не правильно?
Неправильно, что 3-я буква (не на мРНК, а на триплете в мРНК) придает смысл триплету-кодону-синониму. НЕ ПРИДАЕТ. В этой четверке 3-я буква кодона может быть любой из 4-х возможных - T,C,A,G. И так для всех синонимов. Почему решили, что "придаёт"?
В этом случае, я не совсем понимаю терминологию "синонимы". (Без всякого "подколок" и т.д.)
Третья буква- любая - Так?
Лингвистической нагрузки на триплете в мРНК не несет - Так?
Дуплет ТС (t,c,a,g) кодирует Ser. Это называется однозначностью.
Вот с этой синонимией и получается, что триплеты TCT,TCC,TCA,TCG синонимы в своей группе и при этом "синонимичны" триплетам AGT,AGC. Будем считать, что AGT,AGC относятся к омонимам. Но если кодируют дуплеты тогда дуплеты ТС и дуплет AG в "позиции пиримидинов Т и С" синонимы. Это даже для меня слишком.....
надеюсь сама видите, Вика, что версия Петровича рассыпается нах в противоречиях и несуразицах как карточный домик
однозначность наблюдаем, Вика, только в направлении от кодона-триплета к его единственной кислоте (или стоп, 1-2 исключения по Олегу учитываем и пренебрегаем); напротив, у любой кислоты могут быть несколько (до 6-ти на практике) кодонов-триплетов, избыточности более, чем хватает (20 кислот якшаются с 64-мя триплетами ).
заметим с прискорбием, что дублетам Петровича места как-бы и ... не нашлось, никого не колышут, к сожалению
Какая связь между могут быть??? и таблицами кодонов???солитоны не могут быть "омонимыми" или "синонимыми", Вы уж тут по подробнее ответьте ...
Не откажу все-таки себе в удовольствии показать уровень "оппонента". Мысль простая, но вам недоступная: кодоны "читаются" солитонами данного типа, двигающимися вдоль мРНК. Это "прочтение" отображается в их модуляциях, определяемых последовательностями нуклеотидов мРНК = контекстами. Прочтенная информация передается рибосомам как нанобиокомпьютерам, принимающим решение о придании точного кода дублету омониму. Рабочая версия
Давайте лучше посмотрим на Ваш уровень...
Вы говорите про читающий солитон...
то есть выглядеть это может примерно вот так -
ну а пишет он на себя информацию по ходу методом амплитудной модуляции
(см. АМ)
так...
Или там магнитная лента у солитона где то припрятана?
Ну, насчет син-Гордона я давно все объяснял тут. В среднем, бня.
Почему? Вы читали статьи?
Давайте проверим обладаете ли вы хоть минимальной квалификацией чтобы делать самостоятельные суждения по этой теме. В чем принципиальная разница между следующими уравнениями
[tex]
\frac{d^{2}y}{dt^{2}}+sin(y)=0
[/tex]
[tex]
\frac{d^{2}y}{dt^{2}}+y=0
[/tex]
[tex]
\frac{dy}{dt}+y\left ( t-\tau \right )=0
[/tex]
что вы можете сказать о числе возможных решений?
Выходит Вика за много томов обсуждения так и не поняла сути вашей теории! Теперь я надеюсь ей станет ясно, почему эта ересь противоречит экспериментальной базе, ведь никаких двух равновероятных аминокислот получить не удается, каким бы не был контекст.
Читайте ссылку, что дал Олег. Дал перевод. Там именно это и доказано экспериментально.
Давайте попросим Олега дать комментарий, я не видел ссылок на статьи, где бы для указанных вами кодонов с вероятностью 50% случайным образом выбиралась бы одна из двух аминокислот.
а если Ser кодирует ещё и дуплет АG, то куда катится однозначность сия
Это из другой оперы. Омонимической. Ser будет выбран ТОЛЬКО после манипуляции контекстной ориентации рибосомы на мРНК. А может быть выбран Arg, если контекст будет другой.
ИЗНАЧАЛЬНО и ИЗБЫТОЧНО за счёт чего именно у 8-ми дуплетов синонимических групп? чего именно не хватает остальным 8-ми дуплетам омонимических групп?
Здесь мы как раз входим на тропу СМЫСЛОВ генетических текстов, причем в реальном аспекте, а не в метафорическом, как это принято пока в официальной генетике и мол. биологии. В мРНК сосуществуют два начала (Ин-Ян) - избыточная точность (синонимия кодонов) и многосмыслие (омонимия кодонов). Точность нужна, иначе организма не будет. Многосмыслие тоже нужно, поскольку внешняя по отношению к биосистемам среда изменчива, динамична. И к ней надо приспосабливаться и иметь ВЫБОР возможностей получить нужные белкИ на первично простейшем уровне их биосинтеза. Этот выбор есть выбор аминокислот и стопов - фактически выбор типов белков, необходимых здесь и сейчас и соответствующих данной внешней обстановке и внутреннему метаболическому состоянию. Возможно, высшей формой такого выбора является генез иммуноглобулинов с использованием динамичного реестра мутаций (вспоминаем графики Ву-Кэбота, см. мою 3-ю моногр.) для отбора пробных иммуноглобулинов, подгоняемых под атакующие антигены. Вот тут и нужны кодоны омонимы.
Вика wrote:
Вот с этой синонимией и получается, что триплеты TCT,TCC,TCA,TCG синонимы в своей группе и при этом "синонимичны" триплетам AGT,AGC. Будем считать, что AGT,AGC относятся к омонимам. Но если кодируют дуплеты тогда дуплеты ТС и дуплет AG в "позиции пиримидинов Т и С" синонимы. Это даже для меня слишком.....
Можно привести и другие примеры таких "слишком": Четверка синонимов CG и пара омонимов AG кодируют Arg. Или четверка сининимов CT и пара омонимов TT кодируют Leu. Это кажется Вике разрушительным ударом, хоронящим идею синонимо-омонимической вырожденности кода? Но не аминокислоты кодируют дублеты кодонов, а наоборот. Не следствие определяет причину, но причина определяет следствие. Вика и присудыркивающий ей Хайдук рассуждают примерно так: у всех борцов Сумо толстые животы. У меня тоже толстый живот, следовательно, я - борец Сумо.
однозначность наблюдаем, Вика, только в направлении от кодона-триплета к его единственной кислоте (или стоп, 1-2 исключения по Олегу учитываем и пренебрегаем); напротив, у любой кислоты могут быть несколько (до 6-ти на практике) кодонов-триплетов, избыточности более, чем хватает (20 кислот якшаются с 64-мя триплетами ).
заметим с прискорбием, что дублетам Петровича места как-бы и ... не нашлось, никого не колышут, к сожалению
Ваше словоблудие мЭтр В-генома просто зашкаливает. Не хочется Вас топить в луже, но Вам придется более подробно описать все варианты..
.. манипуляции контекстной ориентации рибосомы на мРНК. А может быть выбран Arg, если контекст будет другой. ..
Иначе это филовское эссе на тему "идите и не просто идите" ... а по Х и У ...