ППГ написал(а):У Крика несколько десятков статей, и в каждой из них была как минимум одна (а обычно и больше чем одна) гипотеза. Например, в свете надавней нобелевской премии за открытие теломеров, уместно вспомнить, что гипотезу о существовании теломеров Крик опубликовал в одной из своих статей через три года после того, как ту же самую гипотезу опубликовал Оловников.

Петр, дайте конкретный примерчик, когда конкретный триплет якобы неоднозначен и приходится счытывать крутильным солитоном всю иРНК, дабы устранить эту якобы неоднозначность

Хайдук написал(а):чегоооо ?.....

limarodessa написал(а):За деталями к автору - ув. Петру Петровичу

mittelspiel написал(а):Всё - край. Если биолог не понимает разницы между кодоном и антикодоном, а 5'-нуклеотид антикодона называет краем кодона (!!!), то это означает, что человек просто не понимает о чем он говорит, т.е. речь его бессмысленна. Его научный уровень в данном вопросе должен был рано или поздно высветиться. Что и произошло. Теперь уже ясно, что спорить с ним бесполезно. Поэтому, любезный mittelspiel, я вывожу вас, уже вторично, из тех, с кем общаюсь здесь. Ранее сделал это из морально-этических соображений, но отступил, надеясь на толковый, умный разговор. Надежда не оправдалась. Поэтому не обессудьте.

Хайдук написал(а):Эээээээ, старина, сам бы хотел это увидеть. До этого далековато, также как до реального экспериментального примера квантовой нелокальности генома высших биосистем. Реально, но не очень просто, показать роль омонимических кодонов в эксперименте. Как это сделать изложил в конце своей 3-й монографии. Сами бы поработали, но все мои 4 группы ликвидированы. Сделаю за бугром, если к тому времени кто-то не опередит.

Отредактировано ППГ (2010-01-05 21:09:28)

limarodessa написал(а):Игорь, в монографии целая глава по солитонам Инглендера-Салерно-Маслова. Вы ее, монографию, видать, и не открывали...

ППГ написал(а):Не юлите Петр Петрович. Я здесь пишу для людей с разным уровнем биологии, поэтому сознательно употребил слова край кодона. При этом в скобках было написано 5'-нуклеотид, так что тем кто знает биологию понятно, что вами имелся в виду крайний в тройке нуклеотид, причем крайний в 5'-направлении. При помоши игнора вам не удастся уйти от ответа на простой вопрос. На данный момент вопрос уже сформулирован настолько просто, что абсолютно все присутствующие (и физики и психологи и биологи) его в состоянии понять. Это уже не биология и не физика, это обычная формальная логика, с которой все присутствующие знакомы. Я его здесь повторю:




Отредактировано mittelspiel (2010-01-05 22:11:56)

ППГ написал(а):Здесь опять логическая ошибка. Если в ходе вашей дискуссии со мной по вопросу триплетного кода вы признаете свою ошибку, этого будет достаточно для того, чтобы сказать, что вы допустили ошибку. Но если в ходе дискусии со мной вы свою ошибку уне признаете, то этого будет недостаточно для того чтобы сказать, что ошибок у вас нет. Я просто взялся раскручивать ваш первый попавшийся перл где явно проявилась логическая ошибка. А таких перлов у вас много, и другие участники вам на это не раз указывали. Поэтому меня конечно в игнор заннести можно, но остальные все равно останутся, и вопросы останутся.

Отредактировано mittelspiel (2010-01-05 22:52:38)

ППГ написал(а):В монографии ознакомился только с главой касающейся квантовой нелокальности генома. Остальное - не совсем сфера моих интересов. Так что простите мне что я не знаю этих вещей. Просто я не встречал в учебных изданиях по физике о «крутильных солитонах» и тем более о солитонах Инглендера-Салерно-Маслова. Вот о фазе Берри слышал. А вообще неплохо было бы выяснить что за издательство. Мы ведь так и не определились с этим.

Отредактировано limarodessa (2010-01-05 22:54:10)

Vladimirovich написал(а):Вот сейчас еще раз попытаюсь...

Ну вот, наконец-то. Красным - омонимы, синим - синонимы. Это стандартная таблица генетического кода. Все мои преобразования в ней свелись к двум вещам - выделение цветом и перегруппировке кодоновых семейств, соответствующей принципу комплементарности: CG и TA по горизонтали и по вертикали. В канонической таблице этот принцип нарушен - там TC и AG по вертикали и горизонтали, против чего протестовал еще Румер в письме Крику. Видите, сходство с символом ИНЬ-ЯНЬ двух начал мира, и человека в т.ч., разительное. Кодирование Аминокисислот и Стоп-ов осуществляется по формуле НЕМНОГОЕ МНОГИМ (синонимия) - МНОГОЕ НЕМНОГИМ (омонимия).

И попутно, появились интересные соображения Дэвида Уилкока по функциям ДНК в духе нашего обсуждения

www.e-puzzle.ru/lib/%C4%FD%E2%E8%E4%20%D...F%FC%FE%F2%E5%F0.doc

divinecosmos.e-puzzle.ru/Article3.htm



Отредактировано ППГ (2010-01-05 23:39:58)

limarodessa написал(а):Послал письмо с этим вопросом, жду ответа. Впрочем, ответ мне не интересен. ВАК меня не интересует.

ППГ написал(а):Петр, Вы запутались и невольно нас запутываете, к сожалению, не квантовым образом . Выходит, что роль якобы омонимических кодонов Вы не проверяли и не устанавливали экспериментом, почем тогда знаете, что роль такая вообще есть, как и (омонимические) кодоны? У Вас также отсутствует пример неоднозначного триплета, не говоря уже о способе (скажем, крутильном солитоне) устранить эту несуществующую неоднозначность. Если у Вас целиком и полностью гипотезы, то ничто не мешает этим гипотезам быть ... неверными, но психологически привлекательными для Вас фантазиями

ППГ написал(а):А есть какие-то публикации в журналах или тезисы докладов на конференциях по солитонам Инглендера-Салерно-Маслова ?

Если Вам нужны ресурсы то вот :

e-learning.onu.edu.ua/blogs/38/23/post325.html

Фаза Берри
В механике (включая классическую механику и квантовую механику), геометрическая фаза или фаза Панчаратнама — Берри (названная в честь С. Панчаратнама и сэра Майкла Берри), также известна как фаза Панчаратнама или фаза Берри, фаза приобретаемая при прохождении по круговому пути, когда система подвержена циклическому адиабатическому возмущению, следует из геометрических свойств параметрического пространства гамильтониана. Явление было сначала обнаружено в 1956, и открыто вновь в 1984. Фаза Берри может наблюдаться в эффекте Ааронова — Бома и при коническом пересечении поверхностей потенциальной энергии. В случае эффекта Ааронова — Бома адиабатическим параметром является магнитное поле в соленоиде, и цикличность означает, что измеряемая величина соответствует замкнутой траектории и рассчитывается обычным способом, используя интерференцию. В случае конического пересечения, адиабатические параметры молекулярные координаты. Кроме квантовой механики, геометрическая фаза возникает во множестве других волновых системах, таких как классическая оптика. За эмпирическое правило можно принять, что фаза Берри возникает всякий раз, когда есть по крайней мере два параметра, влияющих на волну, около особенности или своего рода отверстия в топологии.

Волны характеризуются амплитудой и фазой, и обе характеристики могут измениться как функция некоторых параметров. Фаза Берри возникает когда оба параметра изменяются одновременно, но очень медленно (адиабатично), и в конечном счете возвращаются к начальной конфигурации. В квантовой механике это может, например, вовлечь вращения, но также и переносы частиц, которые очевидно скомпенсированы в конце. Интуитивно кажется, что волны в системе возвращаются к начальному состоянию, к соответствующим амплитудам и фазам (и в согласии с пройденным временем). Однако, если параметр изменяется по циклическому пути вместо восстановления первоначального состояния возможно, что начальные и конечные состояния отличаются своими фазами. Это различие фазы - фаза Берри, и её возникновение типично указывает, что зависимость параметра системы - сингулярна (неопределенна) для некоторой комбинации параметров.

ufn.ru/ru/articles/1993/11/a/

www.eunnet.net/metod_materials/panov/12.html

Отредактировано limarodessa (2010-01-06 09:50:04)

Хайдук написал(а):Говорите за себя. А еще и еще буду распутывать ваше не кв. запутанное состояние. Роль омонимических кодонов выводится чисто логически и без каких либо затруднений. Найдите противоречия в логике обоснования их роли и приведите их здесь. Экспериментальное доказательство этой роли технически не слишкм простое, но реальное. Любая лаба с библиотекой кодоновых мутантов у E.coli и с генетиками средней руки сделает это. Как это сдедать?

Рассмотрим статью «Coding-Sequence Determinants of Gene Expression in Escherichia coli» авторов Grzegorz Kudla, Andrew W. Murray, David Tollervey, Joshua B. Plotkin www.sciencemag.org SCIENCE VOL 324 10 APRIL 2009. Статья на высоком уровне, но содержит очень важную для нас принципиальную ошибку. Авторы использовали библиотеку модифицированных (мутантных) генов так называемого зеленого флуоресцирующего белка (GFP), вводя их в E.coli и анализируя по флуоресценции синтезируемые бактерией GFP. Ключевые сведения, они же — главная демонстрация их ошибок, даны в таблице Авторы приводят выровненные последовательности 15 синтезированных
генов GFP, ошибочно считая, что используют для мутаций по третьему нуклеотиду только кодоны-синонимы. Простое обращение к канон-таблице генетического кода достаточно, чтобы убедиться в этом. Авторы пишут, что они работали только по синонимическим (син-кодонам), вводя мутации по третьим нуклеотидам кодонов в GFP генах, и, естественно, ожидали, что все синтезированные E.coli белки, c использованием этих Генов, будут идентичны. Цитирую авторов: «We synthesized a library of green fluorescent protein (GFP) genes that varied randomly in their codon usage, but encoded the same amino acid sequence. By placing these constructs in identical regulatory contexts and measuring their expression, we isolated the effects of synonymous variation on gene expression». Пишут, что они работали только по синонимическим (син) кодонам, вводя мутации по третьему нуклеотиду и, естественно, ожидали, что все синтезированные E.coli белки, c использованием этих генов, будут идентичны. Цитирую: «We synthesized a library of green fluorescent protein (GFP) genes that
varied randomly in their codon usage, but encoded the same amino acid sequence. By placing these constructs in identical regulatory contexts and measuring their expression, we isolated the effects of synonymous variation on gene expression».
Действительно, если использовать замены по третьему нуклеотиду в син кодонах, то так и будет, что и подтверждается ссылкой авторов на соответствующие протоколы, и тогда действительно можно было бы сказать, что они получили same amino acid sequence в синтезированных белках GFP. Но авторы использовали для своих манипуляций не только син-кодоны, но и омонимичные кодоны. И тут уже выявляется второе авторское упущение, непростительное. Контроля по сиквенсам синтезированных белков не было. Вместо этого авторы смотрели только характер флуоресценции синтезированных белков. Она сильно варьировала. Почему? Авторы считают, что вариации флуоресценции полученных GFP объясняются изменением их первичной и вторичной структур. Это также не проверено. Авторы ушли в сторону, показав то, что и ранее было известно — сильную корреляцию между типом вторичной структуры иРНК и флюоресценцией. Это дало им простое механистическое объяснение, что значительные изгибы (фолдинг) иРНК, кодирующих GFP белки, затрудняют инициацию трансляции, а поэтому затрудняют и синтез GFP белков. Это тривиально, и не это главное. Главное же в том, что авторы вводили мутации в третье положение , в том числе и в кодоны-омонимы, ошибочно считая их синонимами. Парадоксально, такая ошибка наводит на идею проверки роли кодонов-омонимов в синтезе белков. Если следовать нашей гипотезе о такой роли как фактора смысловых (реально иРНК-текстовых) ориентаций генома клеток, то эти манипуляции по мутагенезу меняли тексты (контексты), по крайней мере, части пула иРНК полученной библиотеки генов GFP и, соответственно, смыслы прочтения их омонимических кодонов менялись по сравнению с исходными генами. Если дело
обстоит так, логично ожидать замены аминокислот, по крайней мере, в части синтезированных GFP по сравнению с контролем, которого, напомню, не было. Замены амнокислот в синтезированных GFP, могли пойти по двум путям.
1-й (канонический). Как, например в омонимическом семействе ТТ замена в омониме (TTG---TTT) ведет к замене (Leu---Phe), или в любых других омонимических кодоновых семействах — AT, TA, CA, AA, GA, TG, AG, если произвести замены по третьим нуклеотидам.
2-й (контекстный, гипотетический), когда замены по третьим нуклеотидам в части кодонов-омонимов изменяет контекстный пейзаж оставшихся нетронутыми кодонов-омонимов и, соответственно, их неопределенные смыслы утрачиваются, приобретая точную семантику. В этом случае тРНК трактуют кодоны-омонимы в соответствии с контекстом всей иРНК. Это и позволяет однозначно выбрать ту или иную аминокислоту или стоп. Именно этот путь и будет доказательством кодон-омонимо-смыслового (ментального) вектора работы белок синтезирующей системы клетки и ее генома в целом.

Хайдук написал(а):Примеры неоднозначных триплетов (кодонов) - половина всех кодонов, т.е. красные в приводимой выше таблице кода. Крутильные солитоны - это из другой оперы. Для доказательства роли омонимических кодонов в синтезе белков достаточно провести экспериментальную работу типа той, что привел выше, но с сиквенсом всех полученных белков. Кстати, послал письмо её авторам с предложением проверить нашу версию о роли омонимов. Молчат... Их легко понять - пойманы на том, что не отличают син кодоны от не син кодонов, т.е. от омонимов. И что этот ляп будет раскручен.

Относительно неверности моих и наших гипотез. Всегда говорил и повторяю, что мы не претендуем на истину в последней инстанции. Все могут ошибаться, и мы не исключение.

limarodessa написал(а):Ссылки на Инглендера и Салерно в моей монографии. Ссылки на Инглендера-Салерно-Маслова не искал. Надо бы.

limarodessa написал(а):Ну и к чему это?

ППГ написал(а):Так писали вам уже об очевидном противоречии. Вы только что выше согласились, что код триплетный (три и только три нуклеотида однозначно определяют один аминокислотный остаток). После этого вы вдруг начали утверждать, что один аминокислотный остаток определяется всем текстом иРНК. Это противоречит вашим собственным словам о том, что код ТРИПЛЕТНЫЙ (три и только три нуклеотида однозначно определяют один аминокислотный остаток). Налицо противоречие.

Прошу не грузить меня необходимостью отвечать на некомпетентность. Грамотные биологи видят кто есть кто.

mittelspiel написал(а):Я даже могу продолжить эти рассуждения. Допустим, Петр Петрович откажется от своих слов, что одна аминокислота определяется последовательностью всей матричной РНК (поскольку это уже явный перебор, очевидный каждому кто знает про триплетный код), и допустмм скажет нам Петр Петрович, что одна аминокислота определяется только частью матричной РНК. Какой-то частью, которая больше, чем три нуклеотида. Потому что если это три нуклеотида, то Петр Петрович возвращается к точке зрения, против которой он спорил. Но вот если даже это некоторая часть, болшая чем три нуклеотида, то возникает вопрос: сколько это все-таки нуклеотидов?

Итак, поставим мысленный эксперимент. Допустим, у нас есть последовательность из 27 нуклеотидов. Допустим, это зрелая матричная РНК. Никаких сложных процессов мы не рассматриваем. Никакох сплайсингов, стоп-кодонов, просто вот это кусок гле-то в середине матричной РНК, и мы хотим узнать, какая последовательность аминокислот будет по ней синтезирована. Генетика говорит нам, что это будет 27/3=9 аминокислот, которые однозначно определены соответствующими тройками нуклеотидов. Петр Петрович с генетикой не соглашается и говорит, что эта последовательность зависит от последовательности нуклеотидов всей матричной РНК, то бищ от каждого нуклеотида. То есть, по версии Петра Петровича, например, если мы поменяем нуклеотид под номер 1, то это повлияет не только на аминокислоту под номером 1, но так же и на все остальные аминокислоты. О ужас! А ведь молекулярные биологи проделывали (и проделывают) такой фокус каждый день, и ничего такого не наблюдается.

Отредактировано mittelspiel (2010-01-07 01:17:22)

ППГ написал(а):Хоть одного грамотного биолога покажите мне который с вашими рассуждениями соглашается.

ППГ написал(а):Кстати - ДА! Чорного кобеля добела отмоешь...

ППГ написал(а):Вот список использованных источников Вашей монографии. Салерно и Инглендера я здесь не нашел. В списке русскоязычных источников тоже.

Adleman L.M. 1994. Molecular Computation Of Solutions To Combinatorial Problems. The first
DNA computing paper. Describes a solution for the directed Hamiltonian path problem. Science
, v. 266 (11), pp. 1021–1024.
Albada P. van, Lagendijk A. 1985. Observation of of Weak Localization of Light in a Random
Medium. Phys. Rev. Lett., v. 55, p. 2692-2695.

Allison S.A., Sorlie S.S., Pecora R. 1990. Brownian Dynamics Simulations of Wormlike chains:
Dynamics Light Scattering from 2311 Base Pair DNA Fragments. Macromolecules, v. 23, pр.
1110-1118.
Bell J.S. 1964.On the Einstein-Podolsky-Rosen Paradox, Physics, v. 1, pp. 195-200
Bell J.S. 1976. Einstein-Podolsky-Rosen Experiments. Proceed. Symp. on Frontier Problems in
High Energy Physics, Pisa, pp. 33-45.
Bennet C.H., Brassard G., Crepeau C., Jossa R., Peres A., Wootters W.K. 1993. Teleporting and
unknown quantum state via dual classical and Einstein-Podolsky-Rosen channels. Phys. Rev.
Lett., v. 70, pp. 1895-1899.
Berezin A.A., Gariaev P.P., Reshetniak S.A., Shaitan K.V., Shcheglov V.A. 1996. To the problem of
possible development at a biolaser working on Frolich modes. Препринт Физического Инсти-
тута им.П.Н.Лебедева № 49, 12 с.
Berezin A.A., Gariaev P.P., Gorelik V.S., Reshetniak S.A., Shcheglov V.A. 1996. Is it possible
to create laser based on information biomacromolecules? Laser Physics, v. 6, № 6, pp. 1211-
1213.
Berkovich S.Y. 2001. On the «barcode» functionality of the DNA, or The phenomenon of Life in
the physical Universe, arxiv.org/abs/physics/0111093
Biebricher C.K., Eigen M., Luce R. 1981. Product analysis of RNA Generated de novo by Qb
Replicase. J. Mol. Biol., v. 148, pp. 369-390.
Biebricher C.K., Luce R. 1996. Template-free generation of RNA species that replicate with
bacteriophage T7 RNA polymerase. The EMBO Journal, v. 15, Issue 13, pp. 3458-3465.
Bischof M. 1995. Biophotonen. Das Licht in unseren Zellen. Printed in Germany. ISBN 3-86150-
095-7, ZWEITAUSENDEINS, S. 522.
Bouwmeester D., Pan Jian-Wei, Mattle K., Eibl M., Weinfurter H., Zeilinger A. 1997. Experimental
quantum teleportation, Nature, v. 390, pp. 575-579.
Brandner S., Isenmann S., Raeber A., Fisher M., Sailer A., Kobayshi Y., Marino S., Weissmann C.,
Aguzzi A. 1996. Normal host prion protein necessary for scrapie-induced neurotoxity. Nature,
v. 379, pp. 339-343.
Bueler H., Aguzzi A., Sailer A., Greiner R.A., Autenried P., Aguet M., Weissmann C. 1993. Mice
devoid of PrP are resistent to scrapie. Cell, v. 73, pp. 1339-1347.
Chetverin A.B., Chetverina H.V., Munishkin A.V. 1991. On the Nature of Spontaneous RNA
Synthesis by Qb Replicase. J.Mol.Biol., v. 22, pp. 3-9.
Choudhury G.K., Kejarival P.C., Chattopadhyay A. 1979. The devices for generation of phantom
leaf effect. J. Inst. Eng. (India) 60, Pt. EL 3, pp. 61-66; pp. 67-73.
Crick F.H.C. 1966. Codon-anticodon pairing: the wobble hypothesis, v. 19, pp. 548-555.
Crick F.H.C. 1989. What mad pursuit. A personal view of scientific discovery. Basic Books, Inc.,
Publishers. New York. Перевод на Русский: Фрэнсис Крик «Безумный поиск. Личный взгляд

Crick F.H.C. 2004. A personal View of Scientific Discovery. Basic Books, Inc., Publishers, New
York. Translate into Russian: Institute of computer researches, Moscow-Ijevsk, p. 98.
Dirac P.A.M. 1930. Proceed. of the Royal Society of London.
Du Praw E.J. 1970. DNA and Chromosomes. Holt, Rinehart Winston, New York.
Einstein A., Podolsky B., Rosen N. 1935. Can quantum-mechanical description of physical reality
be considered complete? Phys. Rev., v. 47, pp. 777-780.
Ehrlicher A., Betz T., Stuhrmann B., Koch D., Milner V., Raizen M. G. and K s J. 2002. Guiding
neuronal growth with light. Proc Natl Acad Sci USA, December 10 2002; v. 99, № 25: pp. 16024–
16028. Published online 2002 November 27. doi: 10.1073/pnas. 252631899.
Fermi E., Pasta J., Ulam S. 1955. Studies of nonlinear problems. 1. Physics. Report, www.osti.gov/accomplishments/pdf/A80037041/A80037041.pdf
Frolich H. 1968. Phys. Lett., v. 26A, p. 402.
Frolich H. 1972. Phys. Lett., v. 29A, pp. 153-154.
Frolich H. 1975. Proc. Natl. Acad. Sci., USA, v. 72, pp. 4211-4215.
Frolich H. 1977. Neurosci. Res. Programm. Bull., v. 15, pp. 67-72.
Gariaev P.P. 1994. DNA as source of new kind of God «knowledge», Act and Facts. Impact series,
№ 12, pp 7-11.
Gariaev P.P. 2003. Der wellengenetische Code. Tattva Viveka (in German), № 20, pp. 68-73.
Gariaev P.P., Birshtein B.I., Iarochenko A.M., Marcer P.J., Tertishny G.G., Leonova K.A., Kaempf U.
2001. The DNA-wave biocomputer. «CASYS», International Journal of Computing Anticipatory
Systems (ed. D.M.Dubois), Liege, Belgium, v. 10, pp. 290-310, www.rialian.com/rnboyd/
dna-wave.doc
Gariaev P.P., Chudin V.I., Komissarov G.G., Berezin A.A., Vasiliev A.A. 1991. Hologrphic
Associative Memory of Biological Systems. Proceedings SPIE, The International Society for
Optical Engineering. Optical Memory and Neural Networks., USA, v. 1621, pp. 280-291.
Gariaev P.P., Tertishniy G.G. 1999. The quantum nonlocality of genomes as a main factor of
the morphogenesis of biosystems. 3th Scientific and medical network continental members
meeting. Potsdam, Germany, pp. 37-39.
Gariaev P.P., Vasiliev A.A., Berezin A.A. 1994. Holographic associative memory and information
transmission by solitary waves in biological systems. SPIE, The International Society for
Optical Engineering, CIS Selected Papers, Coherent Measuring and Data Processing Methods
and Devices, v. 1978, pp. 249-259.
Goldman E., Rosenberg A.H., Zubay G., Studier F.W. 1995. Последовательности повторяющихся
редко используемых лейциновых кодонов блокируют трансляцию только тогда, когда они
находятся около 5’ конца. Сообщения в Esherichia Coli. J.Mol.Biol., v. 245. pp. 467-473.
Jan van Duin. 1988. The bacteriophages. Chapter 4. Single-Stranded

Jiang Kanzhen. 1981. The method to change organism’s heredity’s and the device to transmit
biological information. Soviet Union Patent № 1828665.
Jiang Kanzhen. 1991. The method to rejuvenate organisms. Russian Patent № 2057808.
Jiang Kanzhen. 1992. «Bioultra high frequency connection», «A collection of articles on
non-tradition aspects оf natural science». Siberian Scientific Research Centre of Anomalous
Environmental Phenomena, Tomsk, № 1.
Jiang Kanzhen. 1994. The anti-senility effect of the young plant’s biotic field on the aged
mice. Zheng Qian, Jiang Kanzhen, Fаn Shudua, et al. Journal of China Medical University, v. 23,
№ 6.
Jiang Kanzhen. 1995. The device to transmit natural information nutrition to a biological object
«Biotron Tszyan – 2». Russian Patent № 2090013 : Device «Biotron Tszyan -2» for transmiting a
natural information supply to a biological object. Geneva International Patent № Wo 96/41872,
1996; Chinese Patent № CN 1194666A, 1998; EUROPEAN PATENT APPLICATION 96927965.2.
Jiang Kanzhen. 1995-1996. Experiments with AURAS (Bioelectromagnetic Fields). Chiang
Kanzhen (NEXUS), New Times Magazine, v 3, № 1, USA-Canadian Edition.
Jiang Kanzhen. 1999 (a). The conclusion of the broadened seminar on Jiang Kanzhen’s report
(the conclusion made by the Soviet Academy of Sciences. Soviet Academy of Medical Sciences,
Siberian Branch of the Soviet Academy of Agricultural Sciences). Znanie-Sila Magazine, Moscow,
№ X.
Jiang Kanzhen. I999 (b). The health care and anti-ageing effect of the bioelectromagnetic
field emitted by plant seedlings on human beings. Jiang Kanzhen, Zheng Qian, Tang Binghuan,
Gold Award by the Canadian International Medical Achievements, International medical
achievements classics, Hong Kong Sci-Teck United Press
Jiang Kanzhen. 2000. The rejuvenation application of bioelectromagnetic field and its
detection; Jiang Kanzhen, Zheng Qian, Tang Binghuan. A collection of paper abstracts. The
3 National Seminar on Modern Biophysical Technologies held by the Chinese Society for
Biophysics, Zhangjiajie, Hunan.
Josephson B.D., Pallikari-Viras F. 1991. Biological Utilisation of Quantum NonLocality.
Foundation of Physics, v. 21, pp. 197-207.
Hagerman P. J. and B. H. Zimm. 1981. Monte Carlo approach to the analysis of the rotational
diffusion of wormlike chains. Biopolymers, v. 20, pp. 1481–1502.
Kabat Е. A. et al. 1977. Sequence of Immunoglobulin Chains, US Department of Health
Education and Welfare.
Kawabe Y., Wang L., Nakamura T. and Ogata N. 2002. Thin-film lasers based on dyedeoxyribonucleic
acid-lipid complexes. Chitose Institute of Science and Technology, Chitose,
Hokkaido 006-8655, Japan. Appl. Phys. Lett. 81, 1372; DOI: 10.1063/1.1501164, Issue Date:
19 August 2002.
Lagerkvist U. 1978. «Two out of Three

Lemons D., McGinnis W. 2006. Genomic Evolution of Hox Gene Clusters. Science, 29 September,
v. 313, № 5795, pp. 1918 – 1922.
Lolle S.J., Victor J.L., Young J.M., Pruitt R.E. 2005. Genome-wide non-mendelian inheritance of
extra genomic information in Arabidopsis. Nature, v. 434, pp. 505-509.
Lushnikov A.A., Maksimenko V.V.,.Simonov A.J. 1982. Electromagnetic Surface Modes in Small
Metallic Particles, in Electromagnetic Surface Modes, ed. by A.D.Boardman, J. Wiley, Chichester,
pp. 305-345.
Mae-Wan Ho. Dance of life, www.resurgence.org/resurgence/issues/ho216.htm
Maksimenko V.V. 1999. Antoine’s Localization of Photon inside Fractal Cluster, Fractal in
Engineering, Delft, Netherlands, pp. 355-358.
Maksimenko V.V. 1999. Localization of Light in Fractal Cluster, Journal of Aerosol Science, v.
30, p. 291.
Maksimenko V.V. 1999. Localization of Photon between Pair of Particles.-1. Elastic Scattering,
Journal of Aerosol Science, v. 30, p. 287.
Maksimenko V.V. 1999. Localization of Photon between Pair of Particles.-2. Inelastic Scattering,
Journal of Aerosol Science, v. 30, p. 289.
Mantegna R.N., Buldyrev S.V., Goldberger A.L., Havlin S., Peng S.-K., Simons M. and Stanley
H.E. 1994. Linguistic Features of Noncoding DNA Sequences. Phys.Rev.Lett., v. 73, № 23, pp.
3169 3172.
Maslov M.U., Gariaev P.P. 1994. Fractal Presentation of Natural Language Texts and Genetic
Code. 2nd International Conference on Quantitative Linguistics «QUALICO-94», September 20-
24, Lomonosov Moscow State University, Philological Faculty, pp. 193-194.
Matsumoto M., Sakaguchi T., Kimura H., Doi M., Minagava K., Matsuzava Y., Yoshikava K. 1992.
Direct observation of brownian motion of macromolecules by fluorescence microscope. J.
Polimer Sci.B., v. 30, pp. 779-783.
Miller R.A. 1993. The Holographic Paradigm and the Consciousness Restructuring Process,
Chaosophy, O.A.K., Grants Pass, Oregon, www.geocities.com/iona_m/Chaosophy/
chaosophy11.html
Miller R. A., Webb. B. 1973. Embryonic Holography, Psychoenergetic Systems, ed.Stanley
Krippner, presented at the Omniversal Symposium, California State College at Sonoma, Saturday,
September 29. Reprinted in Lyttle's journal Psychedelic Monographs and Essays, v. 6, 1993. pp.
137-156; 2003, www.nwbotanicals.org/oak/newphysics/Helix%20to%20Hologram.pdf
Mills D.R., Peterson R.L., Spiegelman S. 1967. An extracellular Darwinian experiment with a
self-duplicating nucleic acid molecule. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, v. 58, pp. 217-224.
Munishkin A.V., Voronin L.A., Ugarov V.I., Bondareva L.A., Chetverina H.V., Chetverin A.B.
1991. Efficient Templates fpr Qb Replicase are Formed by Recombination from Heterologous
Sequences. J.Mol.Biol., v. 221, pp. 463-472.
Pribram K.H., Nuwer M. Baron R. 1974. The holographic hypothesis of memory structure in
brain function and perception. In: R.C. Atkmson, D.H. Krantz, R.C. Luce P. Suppes (eds).

Contemporary Developments in Mathematical Psychology. San Francisco: W.H. Freeman Co.,
pp. 416-467.
Prusiner S.B. (ed.). 1996. Prions, Prions, Prions. Springer press.
Reshetnyak S.A., Shcheglov V.A., Blagodatskikh V.I., Gariaev P.P. and Maslov M.Yu. 1996.
Mechanism of interaction of electromagnetic radiation with a biosystem, Laser Physics, v. 6,
№ 2, pp. 621-653.
Rouse P E. 1953. A theory of the linear viscoelastic properties of dilute solutions of coiling
polymers. J. Chem. Phys., v. 21, pp. 1272-80.
Sakaguchi S., Katamine S., Okada H., Hasegava S., Miyamoto T., Noda T. 1996. Loss of cerebral
Purkinje cells in aged mice homozigous for a disrupted PrP gene. Nature, Apr.11; v. 380 (6574),
pp. 528-531.
Shabalina S.A., Spiridonov N.A. 2004. The mammalian transcriptome and the function of noncoding
DNA sequences. Genome Biology, v. 5, 105.
Shcherbak V.I. 2003. Arithmetic inside the universal genetic code. BioSystems, v. 70, pp.
187–209.
Spiegelman S., Haruna I., Holland I.B., Beaudreau G., Mills D.R. 1965. The synthesis of a selfpropagating
and infectious nucleic acid with a purified enzyme. Proc. Nat. Acad. Sci., USA, v.
54, pp. 919-927.
Stephen Ross, Richard Newton, Yu-Ming Zhou, Julian Haffegee, Mae-Wan Ho. 1997. Quantitative
Image Analysis of Birefringent Biological Material. J. of Microscopy, v. 187, pp. 62-67.
Sumper M., Luce R. 1975. Evidence for De Novo Production of Self-Replicating and
Environmentally Adapted RNA Structures by bacteriophage Qb Replicase. Proc. Nat. Acad. Sci.,
USA, v. 72, pp. 162-166.
Tuszinski J.A., Paul R., Chatterjee R, Sreenivasan S.R. 1984. Relationship between Frolich and
Davidov models of biological order. Physical Review A, v. 30, № 5, pp. 2666-2675.
University of Chicago Medical Center press release (May 29, 1997)
Weiss S., Porske D., Neumann M., Groschap M.H., Kretzschmar H.A., Famulok M., Winnacker E-L.
1997. RNA aptamers specifically interact with the prion protein PrP. Journal of Virology, v. 71,
№ 11, pp. 8790-8797.
Wolpert L. 1971. Positional information and pattern formation. Curr. Top. Biol. Dev., v. 6, pp.
183-224.
Zimm B H. 1956. Dynamics of polymer molecules in dilute solution: viscoelasticity, flow
birefringence and dielectric loss. J. Chem. Phys., v. 24, pp. 269-78. General Electric Research
Laboratory, Schenectady, NY.

ППГ написал(а):Я полагал, что Вам, как исследователю, занимающемуся волновыми процессами, этот материал будет интересен. Нет - так извините.

limarodessa написал(а):Вот литература из более ранней монографии – тоже не могу найти

1. Anderson S. et al. Sequence and organization of the human mitochondrial genome. // Nature.1981. V. 290. P. 457465.
2. Berezin A.A., Gariaev P.P., Gorelik V.S., Reshetniak S.A., Shcheglov V.A. Is it possible to create laser on information biomacromolecules? // Laser Physics.1996. V.6. № 6. P.12111213.
3. Berezin A.A., Gariaev P.P., Reshetniak S.A., Shaitan K.V., Shcheglov V.A. To the problem of possible development at a biolaser working on Frolich modes. // Препринт Физического Института им. П.Н.Лебедева. 1996. № 49. С.12.
4. Crick F.H.C. Codon-anticodon pairing: the wobble hypothesis.// J. Mol. Biol. 1966.V. 19.P.548555.
5. Gariaev P.P. “In vitro-in vivo” DNA conjugation with brain activity and the supreme intellect. // Creation Recearch Society Quarterly. (in pr. )
6. Gariaev P.P. DNA as source of new kind of God “knowledge”. Act and Facts.// Impact Series.1994. № 12.P. 711.
7. Gariaev P.P., Acupuncture points as a resonance structures. Act and Facts.// Impact Series. (in pr.)
8. GariaevP.P., Chudin V.I., Komissarov G.G., Berezin A.A., Vasiliev A.A. Holographic associative memory of biological systems. SPIE - The International Society for Optical Engineering. CIS Selected Papers. // Coherent Measuring and Data Processing Methods and Devices.1991.V.1621.P.280291.
9. Kirkwood T.B., Rosenberg R.F., Galas D.J., eds. Accuracy in molecular Processes: Its control and Relevance to living Systems.// Chapmen and Hall. London, 1986. (Chapters 46,11).
10 Kuo-Chen Chou. Low-frequency collective motion in biomacro-molecules and its biological functions. // Biophys. Chem.. 1988. V. 30. №1. P. 348.
11. Lagerkvist U. “Two out of Three”: an alternative method for codon reading.Proc.// Natl. Acad. Sci. USA., 1978.V. 75. P. 17591762.
12. Mantegna R.N., Buldyrev S.V., Goldberger A.L., Havlin S., Peng S.-K., Simons M. and Stanley H.E. Linguistic Features of Noncoding DNA Sequences. // Phys. Rev. Lett. 1994.V.73. № 23. P.31693172.
13. Stanley H.E., Buldirev S.V., Goldberger A.L., Havlin S., Mantegna R.N., Peng S. K. and Simons. Statistical and Linguistic Features of Noncoding DNA: A Heterogenous “Complex System”. // IL NUOVO CIMENTO. M.,1994.V.16D. № 9. P.13391356.
14. Maslov M.U., Gariaev P.P. Fractal Presentation of Natural Texts and Genetic Code. “QUALICO-94” (Second International Conference on Qantative Linguistics). September 2024. 1994. Moscow. Lomonosov State University Philological Faculty. P. 107108.
15. Matsumoto M., Sakaguchi T., Kimura H., Doi M., Minagawa K., Matsuzawa Y., Yoshikawa K. Direct observation of brownian motion of macromolecules by fluorescence microscope. // J. Polymer Sci., Part B. : Polymer Physics. 1992.V. 30. № 7. P. 779783.
16. Reshetnyak S.A., Shcheglov V.A., Blagodatskikh V.I., Gariaev P.P., Maslov M.Yu. Mechanism of interaction of electromagnetic radiation with a biosystem. // Laser Physics.1996.V.6. № 2. P.621653.
17. Zipf G.K. Human Behavior and the Principle of Least Effort (Addison -Wesley Press, Cambridge, MA). Shannon C.E. 1948. Bell. Syst.Tech.J. 1949. V.27. P.379. Борода М.Г., Поликарпов А.А. Квантитативная лингвистика и автоматический анализ текстов. Тарту., 1984. С.35-59. Boroda M.G., Polykarpov A.A. Zipf-Mandelbrot Low and Units of Different Text Level Organization. // Muzicometrica. Bohum. 1988. № 1.
18. Агальцов А.М., Гаряев П.П., Горелик В.С., Рахматуллаев И.А., Щеглов В.А. Двухфотонно-возбуждаемая люминесценция в генетических структурах. // Квантовая электроника. 1996. Т.23. № 2. С.181184.
19. Агальцов А.М., Гаряев П.П., Горелик В.С., Щеглов В.А. Спектры нелинейно возбуждаемой люминесценции в нуклеозид-трифосфатах. // Квантовая электроника.1993.Т. 20. № 4. С. 371373.
20. Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж., Рэфф М., Робертс К., Уотсон Дж. // Молекулярная биология клетки. М., 1994г. ТI.
21. Беклемишев В.Н. Методология систематики. KMK Ltd SCIENTIFIС PRESS. (по рукописи 1928г.). М., 1994.С.128.
22. Березин А.А. Анализ процесса формирования и распространения нервного импульса с позиции теории солитонов в длинных линиях передачи. ВИНИТИ ДЕП 1986. № 6852-В86. 09. Березин А.А. Интерпретация молекул ДНК в виде электрического резонатора Ферми-Паста-Улама. Деп. ВИНИТИ 905В88 от 03.08.1988.
23. Березин А.А., Гаряев П.П. доклад: “Моделирование электроакустического излучения ДНК как носителя биоинформации”. Российская Академия Наук. Институт Биохимической Физики. 2-й Международный симпозиум “Механизмы действия сверхмалых доз ионизирующих излучений” (тезисы). М., 2326 мая 1995г. С.122.
24. Благодатских В.И., Гаряев П.П., Леонова Е.А., Маслов М.Ю., Шай-тан К.В., Щеглов В.А. О динамике возникновения дислокаций в молекуле ДНК.// Краткие сообщения по физике. Физический Институт РАН. М., 1996. № 34. С.914.
25. Гаряев П.П. Волновой геном. М., 1994. С.279.
26. Гаряев П.П. Кризис генетики и генетика кризиса. М., 1994. № 16. С. 4649.
27. Гаряев П.П., Васильев А.А., Березин А.А. Геном как голографический компьютер. // Гипотеза (независ. науч. ж. ) 1991. № 1. С. 2443. 19911992. № 1. 49-64.
28. Гаряев П.П., Вихерт А.М., Захаркина Г.А. Биосинтез резерпиноподобных веществ в миокарде и других тканях человека и животных. // Бюлл. Экспер. Биол. 1978. № 8. С. 170172.
29. Гаряев П.П., Внучкова В.А., Шелепина Г.А., Комиссаров Г.Г. Вербально-семантические модуляции резонансов Ферми-Паста-Улама как методология вхождения в командно-образный строй генома.// Журнал русской физической мысли. 1994. № 14. С. 1728.
30. Гаряев П.П., Горелик В.С., Козулин Е.А., Щеглов В.А. Двухфотонно возбуждаемая люминесценция в твердотельной фазе ДНК. //Квантовая электроника. 1994.Т. 21.№ 6. С. 603604.
31. Гаряев П.П., Горелик В.С., Моисеенко В.Н., Попонин В.П., Чудин В.И., Щеглов В.А. Комбинационное рассеяние света на решеточных модах нуклеозид-трифосфатов. // Краткие сообщения по физике. Физический Инст. РАН. М.,1992. № 12. С.3336.
32. Гаряев П. П., Григорьев К. В., Васильев А. А., Попонин В. П., Щеглов В. А. Исследование флуктуационной динамики растворов ДНК методом лазерной корреляционной спектроскопии. // Краткие сообщения по физике. Физический Институт РАН. М., 1992. № 1112. С. 6369.
33. Гаряев П. П., Григорьев К. В., Дзекунов С. В., Щеглов В. А. Динамика плазмидных ДНК. // Краткие сообщения по физике. Физический Институт РАН. М.,1993. № 910. С. 3741.
34. Гаряев П.П., Маслов М.Ю., Решетняк С.А., Щеглов В.А. Взаимодействие электромагнитного излучения с информационными биомакромолекулами. “Антенная модель”.// Краткие сообщения по физике. Физический Институт РАН.1996. № 12. С.5459.
35. Гаряев П.П., Маслов М.Ю., Решетняк С.А., Щеглов В.А. Модель взаимодействия электромагнитного излучения с информационными биомакромолекулами.// Краткие сообщения по физике. Физический Институт РАН.1996. № 12. С.6063.
36. Гаряев П.П., Татур В.Ю., Юнин А.М. Новый подход к эволюции Живого и ноосфера. Клаузура ноосферы. // Ноосфера. М.,1988. Ч.1.С. 286 292.
37. Гаряев П.П., Чудин В.И., Березин А.А., Ялакас М.Э. Хромосомный биокомпьютер.// Врач. 1991.№ 4.С. 3033.
38. Гаряев П.П., Леонова Е.А. Генетический аппарат как волновая управляющая система. Международная научно-практичесая конференция “Анализ систем на пороге XXI века: теория и практика”. М.,1996. С. 6978.
39. Гаряев П.П., Леонова Е.А. Пересмотр модели генетического кода. // Сознание и физическая реальность. 1996. Т.1. №12. С.7384.; Гаряев П.П., Леонова Е.А.,Щеглов В.А., Шашин А.А.Лингвистическая и волновая структуры генетического кода.1996.М.,ИМЕДИС.(в печати).
40. Гаряев П.П., Македонский С.Н., Леонова Е.А. Биокомпьютер на генетических молекулах как реальность.// Информационные технологии. № 5. М.,1997. С.4246.
41. Гаряев П.П., Маслов М.Ю., Решетняк С.А., Шайтан К.В., Щеглов В.А. Влияние нелинейности связей между соседними нуклеотидами на динамику распространения конформационных возмущений в молекулах ДНК.// Краткие сообщения по физике ФИАН. (в печати) 1996.
42. Гаряев П.П., Тертышный Г.Г., Готовский Ю.В. Трансформация света в радиоволны. III международная конференция “Теоретические и клинические аспекты применения адаптивной резонансной и мультирезонансной терапии”. “ИМЕДИС”. М.,1997. 1820 апреля 1997г. С.303313.
43. Готовский Ю.В., Комиссаров Г.Г., Гаряев П.П. Новая методика диагностики заболеваний по семи основным точкам акупунктуры. 2-я Международная конференция “Теоретические и клинические аспекты биорезонансной и мультирезонансной терапии”.“ИМЕДИС”. М., 1996.С.164169.
44. Гриневич Г.С. Праславянская письменность (результаты дешифровки). М., 1993. Т1. С. 323.
45. Гурвич А.Г. Избранные труды. М., 1977.С. 351.
46. Инге-Вечтомов С.Г. Генетика с основами селекции. М., 1989. С. 404405.
47. Любищев А.А.О природе наследственных факторов. Пермь.,1925.С. 120.
48. Маковский М.М. Лингвистическая генетика. М., 1992.С. 190.
49. Налимов В.В. Спонтанность сознания. М.,1989. С.287.
50. Прангишвили И.В., Ануашвили А.Н., Маклаков В.В.,. Закономерности проявления подвижности объекта. Сборник трудов Института проблем управления РАН. М.,1993. Выпуск 1. С.710. (Авторские работы за 1996г. выполнены при финансовой поддержке РФФИ (проект 960218855а), которая продлена и в 1997г.).
51. Соломоник А. Семиотика и лингвистика. М., 1995.С. 346.
52. Тер-Аванесян М.Д., Инге-Вечтомов С.Г. Генетический контроль синтеза белка.. Изд. Ленинградского Университета .Л., 1988. С. 294.
53. Трубников Б.А., Гаряев П.П. Семиотика ДНК. Российский Научный центр “Курчатовский Институт”. ИАЭ5690/1. М.,1993. С.27.
54. Трубников Б.А., Гаряев П.П.. Похожа ли “речь” молекул ДНК на компьютерные программы? // Природа. М.,1995. № 1. С.2132.

limarodessa написал(а):Это во второй монографии Волновой генетический код. Вот эти ссылки: Salerno M. // Phys. Rev. A.1991. V. 44. № 8. P. 5292.
Englender et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 1980.V. 77. P. 7222. Они в сносках.

Отредактировано ППГ (2010-01-07 12:03:30)

ППГ написал(а):Ну вот этого Салерно нашел

Это тот самый Салерно ? Или другой ?

pra.aps.org/abstract/PRA/v72/i3/e033617


arxiv.org/abs/0907.3172
arxiv.org/abs/0907.1987
arxiv.org/abs/nlin/0611004

Вот еще

www.springerlink.com/content/50222717770306p6/

А вот и статья polymer.chph.ras.ru/asavin/dna/s91pra.pdf



Отредактировано limarodessa (2010-01-07 13:45:16)

ППГ написал(а):Englender или Englander ?
Вот интересный материал

www.iop.org/EJ/abstract/1402-4896/29/3/016

Отредактировано limarodessa (2010-01-07 12:42:06)