Ключевое слово
24 | 08 | 2019
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 20:58 #31

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
nonlocality wrote:
Объясняю я. Но вы не понимаете объяснения, по сути, школьного уровня. Это удивительно...
Ну вот... И не можете обхяснить простейших вещей... Позор, Петр :glasses:
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 21:00 #32

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
nonlocality wrote:
Что сказал, то сказал - "роли не играет". Недостаточно? Вы хоть в святцы-то загляните - в Таблицу ген. кода.
Т.е. поздравляем Вас, гражданин, соврамши
Третий нуклеотид по Ф.Крику не участвует в кодировании.
:glasses:
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 21:07 #33

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
Обратимся, так сказать, к истокам, к перовисточникам, триплетам...
Три составных источника, как говорили марксисты.

profiles.nlm.nih.gov/SC/B/C/B/J/_/scbcbj.pdf
GENERAL NATURE OF THE GENETIC CODE FOR PROTEINS
By CRICK...
genetic code is of the following general type:
(a) A group of three bases (or, leas likely, a multiple of three bases) codes one amino-acid.

Петр, Вы аглицкий то понимаете?
three bases

В словарь загляните
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 21:37 #34

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Ну обратились вы в прошлое. А надо в будущее. Увы, даже такие умницы, как Ф.Крик, ошибались. Мог-ли он подумать, что его и Ниренберга постулат об однозначности кодирования аминокислот должен будет проделать такой длинный объезд через сиомию и текстовость мРНК, чтобы в конце объезда выйти-таки на однозначность кодирования. Но для этого ему надо было принять для неприемлемое для себя - способность генома к элементарному мышлению. Отцы модели кода споткнулись о КАК БЫ неоднозначность кодирования кодоном сиомом UUU одновременно двух разных аминокислот - фенилаланина и лейцина, не поняли этот многозначительный феномен и просто проигнорировали его, как непонятный. По крайней мере, они были честны. Но не до конца. А сейчас, через 50 лет, Туранов и соавт. переоткрыли этот же феномен на примере кодона-сиома UGA, кодирующего тоже одновременно две разные аминокислоты - цистеин и селеноцистеин. И миру открылась благодатная бесконечность речевого кодирования генетической информации. Оцените это, кто понял.
Last Edit: 16 Март 2018 21:41 by nonlocality.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 21:40 #35

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Без прочтения нашей, готовой к печати статьи, где все разжевано, всё-таки не обойтись.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 16 Март 2018 21:44 #36

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
У меня научный подход, Петр и очень методичный.
Давайте по шагам.... Я нашел противоречие...
nonlocality wrote:
Ну обратились вы в прошлое.
Третий нуклеотид по Ф.Крику не участвует в кодировании.

Согласно Крику, участвует.
И что Вы нам тут преподносите тогда? :glasses:
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:16 #37

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Vladimirovich wrote:
И что Вы нам тут преподносите тогда?
Тогда я еще и еще раз преподношу цитату из Ф.Крика:

“An important point to notice is that although the genetic code has certain regularities—in several cases it is the first two bases that encode one amino acid, the nature of the third being irrelevant—its structure otherwise makes no obvious sense.”
"Важно отметить один момент, что, хотя генетический код имеет определенные закономерности — в некоторых случаях именно первые два основания кодируют одну аминокислоту, характер же третьего основания роли не играет — структура кода в противном случае не имеет никакого очевидного смысла".

Слово 'irrelevant' можно также перевести как 'не имеет значения', то есть НЕ КОДИРУЕТ . Если вы подчеркиваете, настаиваете, что кодируют только триплеты, то для 32-х триплетов-синононимов это очевидно, а для 32-х сиом-триплетов становится очевидным только ПОСЛЕ делегирования их третьим нуклеотидам нового значения-перекодировки. Как в примере предложения с точным смыслом контекста: "Я забыл ког своей электронной почты". Из контекста следует смысл, что вместо буквы Г надо читать букву Д, иначе говоря, делегировать букве Г значение буквы Д (перекодировка). И тогда этот словесный триплет приобретет истинный смысл. Точно также как при встрече рибосомы с сиом-кодоном, третья буква которого противоречит смыслу контекста мРНК, как предложения. И в этом случае 3-я буква будет перекодирована. И ТРИПЛЕТ, наконец, ПРИМЕТ УЧАСТИЕ В КОДИРОВКЕ одной аминокислоты из двух разных. Вроде просто и понятно. К сожалению, этот аспект был чужд отцам модели кода, которые дали точный постулат об однозначности кодирования аминокислот, но проигнорировали, не заметили лингвистико-смысловой аспект шифров не синонимических кодонов.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:27 #38

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
nonlocality wrote:
любому триплетному кодону будет соответствовать строго единственный триплет-антикодон, контекстуально ВЫБРАННЫЙ рибосомой из ДВУХ, кодирующих РАЗНЫЕ аминокислоты.
это ахинея, поскольку кодон может пришвартовать только к одному-единственному, комплементарному себе антикодону, что тащит свою АК; по-видимому, известно всего лишь двух (из милльярдов!) случаев, когда антикодон может потащить вторую АК: UUU - фенилаланин и лейцин и UGA - цистеин и селеноцистеин :flag:
Last Edit: 17 Март 2018 05:34 by Хайдук.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:28 #39

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
nonlocality wrote:
Тогда я еще и еще раз преподношу цитату из Ф.Крика:

“An important point to notice is that although the genetic code has certain regularities—in several cases it is the first two bases that encode one amino acid, the nature of the third being irrelevant—its structure otherwise makes no obvious sense.”
"Важно отметить один момент, что, хотя генетический код имеет определенные закономерности — в некоторых случаях именно первые два основания кодируют одну аминокислоту, характер же третьего основания роли не играет — структура кода в противном случае не имеет никакого очевидного смысла".

Написано - "в некоторых случаях". Это совсем другое дело.
Если основных аминокислот 20, ну пусть 30, то вполне возможно, что возникает синонимия - одну аминокислоту генерируют разноые кодоны.
В этом то удивительного ничего нет.
Вот я смотрю CGх - это всегда аргинин. Тут только два получаются. Ну и что?

Вот Вы сами что хотите доказать? (Извините, столько всего понаписано)
Скажите в двух словах, без ссылок на монографии.
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:41 #40

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
nonlocality wrote:
Из контекста следует смысл, что вместо буквы Г надо читать букву Д, иначе говоря, делегировать букве Г значение буквы Д (перекодировка).
ждём-с примера такой "перекодировки" трётьей буквы некоего триплета :idea: :popcorn:
Last Edit: 17 Март 2018 05:44 by Хайдук.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:42 #41

  • Чукчи не из Сибири ....
  • Чукчи не из Сибири ....'s Avatar
И опять нужно отметить, что ни где не было сказано о "воблирование" именно третьего основания.
И опять нет ответа на вопрос-чтения-движения рибосомой этих оснований "слева на право" при ее движение - один вариант, а если движется в противоположную сторону - то будет несколько другой вариант.
И тогда первое основание - будет третьим, а третье будет первым.
И какое тогда основание - главное?
ps
- Чем отличается парашют от презерватива?
- Когда рвется парашют, - одним человеком меньше, а когда рвется презерватив - одним человеком больше...

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:51 #42

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
вон таблица

IMG_5502_2018-03-17.JPG

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 05:57 #43

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
к примеру, когда и где САС якобы "перекодируют" в САА ? :popcorn:
Last Edit: 17 Март 2018 13:37 by Хайдук.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 06:14 #44

  • Как
  • Как's Avatar
Ответ П.Гаряева к сожалению предсказуем... читайте аналы или мои статьи, все уже показано ...

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 08:14 #45

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Vladimirovich wrote:
Написано - "в некоторых случаях". Это совсем другое дело.

ПГ: "Некоторые случаи" - это 32 кодона-синонима. Ну и что? Там 3-й явно не играет роли в кодировании.

Если основных аминокислот 20, ну пусть 30, то вполне возможно, что возникает синонимия - одну аминокислоту генерируют разноые кодоны.
В этом то удивительного ничего нет.
Вот я смотрю CGх - это всегда аргинин.

ПГ: ну да, всегда аргинин. Ведь семейство CG-кодонов синонимическое.

Тут только два получаются. Ну и что?

ПГ: Не понял, целиком мысль изложите.

Вот Вы сами что хотите доказать? (Извините, столько всего понаписано)

ПГ: Доказали, но не объяснили Туранов и соавт. Доказали, что один кодон (не синоним) UGA кодирует две разные аминокислоты одновременно, что никак не следует из "отцовской" модели и из их таблицы. Я объяснил это тем, что рибосома в таких 32 случаях ВЫБИРАЕТ одну аминокислоту из двух, за счет учета контекста мРНК. Извините, чуть больше двух слов... :)



Скажите в двух словах, без ссылок на монографии.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 08:43 #46

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 80178
  • Thank you received: 1102
  • Karma: 82
nonlocality wrote:
ПГ: "Некоторые случаи" - это 32 кодона-синонима. Ну и что? Там 3-й явно не играет роли в кодировании.
Т.е где-то играет, где-то не играет
Ну мы это и так знаем. В чем научная новизна?
nonlocality wrote:
Не понял, целиком мысль изложите.
Ну нет, Петр. Тут это я не специалист. Это Вы поймите мою мысль и популярно объясните :rain:
Каждому - своё.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 09:00 #47

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Играет и не играет потому, что синонимы и сиомы устроены по разному и назначение разное. Синонимы дают высокую точность кодирования за счет его избыточности. Сиомы дают противоположное - мобильность, многообразие, гибкость кодирования и возможность организмам приспособится к динамичной окружающей среде, создавая новые пробные белкИ. Единство противоположностей по Гегелю.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 09:04 #48

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Как в чем новизна?! Новизна в том, что атомы и молекулы имеют «смыслы» и они «мыслят» следовательно существуют.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 09:19 #49

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Поршень wrote:
Как в чем новизна?! Новизна в том, что атомы и молекулы имеют «смыслы» и они «мыслят» следовательно существуют.
Ответил, но стерлось. Коротко. Новизна в квантовом регулировании жизнедеятельности организмов на основе обнаруженных возможностей создавать искусственно словесно-генные программы для длительной и здоровой жизни людей. Возможности создания квант. биокомпьютеров мгновенного действия и дальних космических связей. И еще многое...

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 09:33 #50

  • Чукчи не из Сибири ....
  • Чукчи не из Сибири ....'s Avatar
ППГ wrote:
Коротко. Новизна в квантовом регулировании жизнедеятельности организмов на основе обнаруженных возможностей создавать искусственно словесно-генные программы для длительной и здоровой жизни людей. Возможности создания квант. биокомпьютеров мгновенного действия и дальних космических связей. И еще многое...
и тут "Остапа понесло..."
ps
памятка Петровичу ...
Утро начиналось неважно: в один глаз светило солнце, из другого торчало копье...

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 09:34 #51

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Чукчи не из Сибири .... wrote:
памятка Петровичу ...
Утро начиналось неважно: в один глаз светило солнце, из другого торчало копье...
Лучше, как у Олеши: "он по утрам поёт в сортире" :lol:

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 12:31 #52

  • Чукчи не из Сибири ....
  • Чукчи не из Сибири ....'s Avatar
Мы полностью согласны, что П.Гаряев, ОН как певец "Волнового Г...а" превзошел ВСЕ мыслимые ожидания
ps
Плакат на вокзале: "Не прыгайте с платформы. Пользуйтесь мостом". Конечно, с моста оно — наверняка...

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 13:41 #53

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
ну вот, молчит Петрович в жопу по поводу моих возражений в точку, потому что и Бох не мог бы ответить :popcorn:

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:07 #54

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
к примеру, когда и где САС якобы "перекодируют" в САА ?
Да, если будет соответствующий контекст мРНК.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:13 #55

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
и кто, где и когда стал этому свидетелем? :popcorn:
Last Edit: 17 Март 2018 14:13 by Хайдук.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:16 #56

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
и кто, где и когда стал этому свидетелем?
Вот люди - туранов и соавт. работали и доказали мою работу.
Вот и вы поработайте.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:24 #57

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
и в какую букву "перекодировали" Туранов и соавт. А в UGA: U или С ? :popcorn:

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:43 #58

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 37703
  • Thank you received: 85
  • Karma: 22
тащут на спине цистеин UGU или UGC, а не UG, Петрович, чего ещё выворачиваться? Finita la commedia :dontknow:
Last Edit: 17 Март 2018 14:52 by Хайдук.

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 14:44 #59

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Утопили Петровича. Только Группа Чукч ещё пока на плаву судя по посту 3 этой темы

Волновой геном №36. Беседы с Петровичем о триплетах 17 Март 2018 15:28 #60

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7064
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
тащут на спине цистеин UGU или UGC, а не UG, Петрович, чего ещё выворачиваться? Finita la commedia
Безграмотности даже хватает у этих господчиков, чтобы не помнить или не понять, что ни UGU, ни UGC и не UG работают, а другие нуклеотиды. Это прощальный ответ хайдуку, вывернувшемуся в тысячный раз на изнанку от тупости в безграмотность и наоборот.
Пожалуй, только Владимирович пытался что-то разумное сформулировать.
А пока нашу статью отослал в журнал. Ответили:"We will endeavour to reply to your query within 48 hours".
Last Edit: 17 Март 2018 17:11 by Хайдук.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум