TOPIC: Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 13:29 #181
PauLita написал(а):
в принципиальном плане можно представить уже не только внутреннее динамическое пространственное “самоотслеживание” биосистемой самой себя, но и аналогичный контроль за структурой собственного времени с анализом коротких временных отрезков, направленных как в прошлое, так и в будущее
Молоток, паулита. Отличная цитата из ППГ. Да вы, я вижу, знаток ППГ. И цитаты ключевые даёте. Внутренний пространственно-временной автоскан биосистем - штука важная, стратегическая. Фантомные ДНК реплики, что обнаружила группа Гаряева и вслед за ними группа Р.Пекоры из Стенфордского Университета, это большой предмет больших будущих исследований. Напомню тем, кто не знаком, что есть такое фантомные реплики ДНК и ее способность сканировать окружающее пространство www.wavegenetics.jino-net.ru/zip/DNK-repliki-new.zip
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 13:36 #182
Рассмотрение генетических структур как космических волновых антенн хорошо согласуется с идеями Хозе Аргуэльеса относительно генетического кода. Он считает, что последний описывает лишь часть общей картины жизни, и дополнением к нему является свет лучистая энергия. Это резонансная лучистая инфраструктура световое тело входит в диапазон излучения, который управляется кодом Цолькина, гармонического модуля майя .
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 13:42 #183
PauLita написал(а):
Рассмотрение генетических структур как космических волновых антенн хорошо согласуется с идеями Хозе Аргуэльеса относительно генетического кода. Он считает, что последний описывает лишь часть общей картины жизни, и дополнением к нему является свет лучистая энергия. Это резонансная лучистая инфраструктура световое тело входит в диапазон излучения, который управляется кодом Цолькина, гармонического модуля майя
Аргуэльес - голова, не чета... Советую всем прочитать его книгу Фактор Майя.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 14:09 #186
прохожий, не похожий написал(а):
Но применить к кодонам-омонимам не может или не хочет, а точнее, боится. Это же на Крика кричать... Проблема кодонов-омонимов есть заглавный фактор белкового синтеза, выводящий его в иные кодовые горизонты. Это тот самый второй ген. код, о котором так невнятно и боязливо промямлил Овчинников
Где, Петр, где эти кодоны-омонимы в расписанной выше последовательности гена GFP ? Укажите стартовые позиции омонимических триплетов или даже дуплетов, если хотите. Ведь проще этого не бывает, не правда ли? Вы же не можете привести даже одного точного, бесспорного утверждения
. Второй ген. код Овчинникова ну совсем, никак не то, что Вам мерещится, должно же быть очевидно даже Вам
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 14:24 #187
прохожий, не похожий написал(а):
применить к кодонам-омонимам не может или не хочет, а точнее, боится... избегает он, явно избегат этих вопросов... ТрУсы... Это тот самый второй ген. код, о котором так невнятно и боязливо промямлил Овчинников
...потому что у Овчинникова внутренняя дисциплина ума учёного, которая не позволяет ему делиться дикими и пока совершенно бесполезными спекуляциями, для которых у него нет сколько-нибудь достаточных оснований
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 15:44 #188
Хайдук написал(а):
Вопрос к Миттельшпилю: бывают ли подобные неоднозначности в дальнейшем синтезе рибосомой некоего белка после такого запутанного старта?
В принципе, да. Но не в том смысле который патается притянуть ППГ. Известно много кодов поверх трплетного кода, они обеспечивают регуляцию за счет молекулярного связывания (например, регулируют старт, стоп, кинетику и скорости всех процессов, но они не переписывают триплетный код, который однозначен).
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 16:16 #190
Хайдук написал(а):
Можно ли считать, что в этих случаях однозначность нарушается?
Однозначность не нарушается потому что соответствующие кодоны как кодировали изолейцин и лейшин, так и кодируют. Ничего в этом плане не изменилось.
На ДНК (и на РНК) известно много кодов поверх триплетного кода который кодирует аминокислоты. Но эти коды не модифицируют триплетный код. Они отвечают за другие вещи. Все эти коды работают на механистическом уровне - создают сайты связывания для определенных молекул.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 16:32 #191
mittelspiel написал(а):
На ДНК (и на РНК) известно много кодов поверх триплетного кода который кодирует аминокислоты. Но эти коды не модифицируют триплетный код. Они отвечают за другие вещи. Все эти коды работают на механистическом уровне - создают сайты связывания для определенных молекул.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 19:11 #192
Добрый вечер, судари, позвольте присоединиться к вашей беседе, так как тема наследуемой информации мне близка, а с ППГ общался письменно, но взаимности не нашли.
Так вот можно немного уточнить? Наследуемая и генетическая информация - это одно и тоже или нет. ИМХО
генетическая информация - та что записана в ДНК несёт информацию о структуре белков и всё. Наследуемая информация сцеплена с генетической, но это отдельный пласт информации и непосредственного отражения в ДНК не имеет. ППГ валит всё на электромагнитные волны, в том числе свет, а на этом уровне не всё сходится, в этом мы и разошлись с ним.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 19:23 #195
Неужели уважаемый Крыс, достигший уровня посадника полагает, что мир начинается и кончается уровнем ЭМ энергии. Мир весьма разнообразен в своих проявлениях и из этого многообразия складывается его относительно устойчивое единство. Вот Ваши мысли - это что ЭМ волны? мои точно нет, а электрическая активность мозга при этом лишь вторичный продукт.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 19:42 #196
Хайдук написал(а):
Где, Петр, где эти кодоны-омонимы в расписанной выше последовательности гена GFP ? Укажите стартовые позиции омонимических триплетов или даже дуплетов, если хотите. Ведь проще этого не бывает, не правда ли? Вы же не можете привести даже одного точного, бесспорного утверждения . Второй ген. код Овчинникова ну совсем, никак не то, что Вам мерещится, должно же быть очевидно даже Вам
Вот и мне мерещится, что вам что-либо доказывать дело бесполезное. Вы долдоните одно и то же, не обращая внимания на ответы. Другим говорю - Овчинников понял роль контекстов мРНК в биосинтезе белков. Это неоспоримо. Цитировал его. Относительно кодонов-омонимов ничего не сказал? Это бывает. Зато я сказал. Что есть по Овчинникову второй ген. код, он ни гу-гу. Страшно, аж жуть ему. Тоже бывает. Зато я сказал. На этом дискуссию по этому вопросу с Хайдуком прекращаю.
Отредактировано прохожий, не похожий (2010-04-22 23:43:14)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 19:52 #198
mittelspiel написал(а):
В принципе, да. Но не в том смысле который патается притянуть ППГ. Известно много кодов поверх трплетного кода, они обеспечивают регуляцию за счет молекулярного связывания (например, регулируют старт, стоп, кинетику и скорости всех процессов, но они не переписывают триплетный код, который однозначен)
Вот ведь вопиющая безграмотность - путать регуляцию с кодами. Митек пытается быть святее Ф.Крика, который честно сказал, что генетический код не имеет очевидного смысла. Неочевидный смысл, задаваемый кодонами-омонимами, вскрывается вторым генетическим кодом, коим является его реальная лингвистичность, наполненность смыслами. Их дешифровать надо. Не поняли этого - получили пищевой трансгенный удар по пчелам. Цена дремучести митьков от генетики.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 20:13 #200
прохожий, не похожий написал(а):
Овчинников понял роль контекстов мРНК в биосинтезе белков. Это неоспоримо. Цитировал его.
Тут маленькая особенность: конекст мРНК Овчинникова - это никак не гранд-контекст неясно чего и вся Гаряева
прохожий, не похожий написал(а):
Что есть по Овчинникову второй ген. код, он ни гу-гу.
Гипотез не измышляю (с) (не то, что Гаряев)
Крыс написал(а):
Относительно кодонов-омонимов ничего не сказал (Овчинников)? Это бывает. Зато я сказал.
Сказали что, Петр? С каких позиций из всего 715 (семиста пятьнадцати) начинаются якобы омонимические дублеты/триплеты? Нуклеотидная последовательность гена GFP перед глазами, Петр, когда начнём тыкать карандашом в якобы омонимические триплеты?
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 20:13 #201
mittelspiel написал(а):
Хайдук: Можно ли считать, что в этих случаях однозначность нарушается?
Мит: Однозначность не нарушается потому что соответствующие кодоны как кодировали изолейцин и лейшин, так и кодируют. Ничего в этом плане не изменилось.
На ДНК (и на РНК) известно много кодов поверх триплетного кода который кодирует аминокислоты. Но эти коды не модифицируют триплетный код. Они отвечают за другие вещи. Все эти коды работают на механистическом уровне - создают сайты связывания для определенных молекул.
Отредактировано mittelspiel
Ну что же вы так врете-то бессовестно. Возвращаемся к РАНовскому классику акад. Л.П.Овчинникову (ссылка выше). Цитирую:
ПЕРЕКОДИРУЮЩИЕ СИГНАЛЫ В мРНК ИЛИ ВТОРОЙ ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД
Инициирующий кодон узнается только в опреде¬ленном контексте. Если мы зададим вопрос, можно ли, имея перед собой последовательность нуклео¬тидов какой-либо мРНК, таблицу генетического кода и зная, что трансляция мРНК идет в направле¬нии от 5'- к З'-концу а белковая цепочка растет от N-конца к С-концу, написать последовательность аминокислот белка, закодированного в этой мРНК, то будем вынуждены ответить на поставленный во¬прос отрицательно. Исходя из перечисленных све¬дений нельзя определить, с какого места мРНК мы должны начать переводить (транслировать) после¬довательность нуклеотидов в последовательность аминокислот.
Уже очень давно стало ясно, что начало транс¬ляции мРНК (инициация) не совпадает с нача¬лом самой мРНК. Свидетельством этому служат
СОРОСОВСКИЙ ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫЙ ЖУРНАЛ, №4, 1998
полицистронные мРНК бактерий, в которых ини¬циация белкового синтеза происходит на каждом цистроне, а также присутствие в мРНК про- и эука-риот 5'-концевых нетранслируемых последователь¬ностей. Вместе с тем установлено, что биосинтез белка как у про-, так и у эукариот всегда начинается с одной и той же аминокислоты — метионина. Мож¬но было бы предположить, что трансляция инфор¬мации, закодированной в мРНК, начинается с пер¬вого от 5'-конца метионинового кодона, которым является триплет AUG. Для многих моноцистрон-ных эукариотических мРНК это действительно так, хотя бывают и исключения. Однако это совсем не так для полицистронных мРНК бактерий, где ини¬циация часто происходит на триплетах AUG, отсто¬ящих очень далеко от начала мРНК. Этим трипле¬там может предшествовать большое количество других AUG, на которых инициации не происходит. Более того, оказалось, что первый метионин в белке в некоторых случаях включается не на метионино-вом кодоне AUG, а на кодоне GUG, который соот¬ветствует в таблице генетического кода аминокис¬лоте валину.
Иногда инициация с метионина может происхо¬дить и на других кодонах: AUA и AUU (кодонах изо-лейцина), UUG и, возможно, CUG (кодонах лей¬цина). Стало очевидным, что для узнавания кодона в качестве инициирующего важен не только сам и, может быть, не столько сам кодон, но какой-то кон¬текст, делающий его инициирующим.
Отредактировано прохожий, не похожий (2010-04-23 00:20:13)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 20:27 #203
WsK написал(а):
Добрый вечер, судари, позвольте присоединиться к вашей беседе, так как тема наследуемой информации мне близка, а с ППГ общался письменно, но взаимности не нашли.
Так вот можно немного уточнить? Наследуемая и генетическая информация - это одно и тоже или нет. ИМХО
генетическая информация - та что записана в ДНК несёт информацию о структуре белков и всё. Наследуемая информация сцеплена с генетической, но это отдельный пласт информации и непосредственного отражения в ДНК не имеет. ППГ валит всё на электромагнитные волны, в том числе свет, а на этом уровне не всё сходится, в этом мы и разошлись с ним.
я поправил ваши высказывания:
1) генетическая информация - та что записана в ДНК - Правильно.
2) Наследуемая информация сцеплена с генетической, но это [в дополнение к генетической еще и] отдельный пласт информации - Правильно.
3) Наследственная информация непосредственного отражения в ДНК не имеет - Не правильно.
По наследству передается: ДНК, РНК, белки. Наследственная информация включает в себе генетическую и эпигенетическую.
Генетическая информация содержится в ДНК (последователтьность ДНК). Эта информация включает в себя триплетный код, кодирующий аминокислоты, код позиционирования нуклеосом, сайты связывания регуляторных белков, псевдогены кодирующие нетранслируемую РНК, участки теломеры и центромеры, отвечающие за структуру хромосом, повторы, повторы необходимые для позиционирования архитектурных белков, и.т.д.
Эпигенетическая информация содержится в РНК (микроРНК, некодирующая РНК, и.т.д.), химических ковалентных модификациях гистонов (метилирование, ацетилирование, фосфорилирование и.т.д.), и химических ковалентных модификациях ДНК (метилирование, оксиметилирование).
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 20:33 #204
прохожий, не похожий написал(а):
Стало очевидным, что для узнавания кодона в качестве инициирующего важен не только сам и, может быть, не столько сам кодон, но какой-то контекст, делающий его инициирующим
Почему оборвали цитату на полуслове, Петр?
Да потому, что Вам не выгодно её продолжение Овчинниковым:
Оказалось, что у прокариот для эффективной инициации кодон должен находиться на вершине шпилечной структуры, образуемой смежными комплементарными участками мРНК, а предшествовать ему примерно за 3-10 нуклеотидов должна полипуриновая последовательность (последовательность Шайна-Дальгарно, SD) (рис. 3, а). Эта последовательность комплементарна рибосомной РНК и, по-видимому, способствует связыванию рибосом в районе инициирующего кодона
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
22 Апр 2010 20:48 #205
Хайдук написал(а):
Почему оборвали цитату на полуслове, Петр? Да потому, что Вам не выгодно её продолжение Овчинниковым:
Оказалось, что у прокариот для эффективной инициации кодон должен находиться на вершине шпилечной структуры, образуемой смежными комплементарными участками мРНК, а предшествовать ему примерно за 3-10 нуклеотидов должна полипуриновая последовательность (последовательность Шайна-Дальгарно, SD) (рис. 3, а). Эта последовательность комплементарна рибосомной РНК и, по-видимому, способствует связыванию рибосом в районе инициирующего кодона
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
23 Апр 2010 07:08 #208
Для Хайдука
Не проще ли согласится, что существует подмножество (не пустое) где эти требований не соблюдаются. И механизм реализации коих не описан ни одним исследователем (или ученым), ну кроме того, что так надо значит и надо ... То есть нужна физика этих явлений. и Великий ППГ в порыве открывающего перед всем миром счастья... просто предложил некий механизм могущий реализовать его, а мы тут в терминах Фантомной Теории и пытаемся промоделировать возможность, такого действия ... Для Мittelspiel
С 3 пунктом есть явные расхождения ... в 1 и 2 пункте ДНК определены как носитель оной, а в третьем пункте , хотя вы и сделали определение эпигенетическую однако все равно оставили фразу
и химических ковалентных модификациях ДНК (метилирование, оксиметилирование)... которая приводит к пунктам 1 и 2 ... так как ДНК вообще то существует не в космическом пространстве а в окружение некой биологической среды (в клетке)... так что это просто элемент тавтологии
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
23 Апр 2010 08:23 #209
Прохожий написал(а):
С 3 пунктом есть явные расхождения ... в 1 и 2 пункте ДНК определены как носитель оной, а в третьем пункте , хотя вы и сделали определение эпигенетическую однако все равно оставили фразу
и химических ковалентных модификациях ДНК (метилирование, оксиметилирование)... которая приводит к пунктам 1 и 2 ... так как ДНК вообще то существует не в космическом пространстве а в окружение некой биологической среды (в клетке)... так что это просто элемент тавтологии
химические модификации ДНК (метилирование, оксиметилироание...) всегда относились к эпигенетической информации. Читайте учебники, просвещайтесь.