TOPIC: Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 11:09 #121
геном высших оранизмов рассматривается как солитонный биоголографический компьютер, формирующий пространственно-временную структуру развивающихся эмбрионов по каскадам реестров волновых образов-предшественников. При этом в качестве носителей полевых генов выступает континуум волновых фронтов, задаваемый мультиплексными геноголограммами, образуемыми гелевым жидкокристаллическим хромосомным континуумом.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 11:37 #122
На параграфы 115,118 … без мелочи ..
Есть такое понятие , как доказательство от противного … мы точно, знаем (тут Мендель выступает как независимый эксперт со своей теорией) что должно произойти в 3 поколение. Однако это не происходит, внедренный признак исчез ранее и естественно, возникает вопрос - кто-то тут не прав.
В данном случае модель Крика и К+ сработала явно не удовлетворительно. В ней, что-то не хватило.
В своих еще явно не совершенных постулатах в под параграфе 1.3 мы вводим следующее .. «При этом какой-либо виртуальной частице совсем не просто рассеяться на примесном атоме или каком-либо другом дефекте кристаллической решетки ДНК или РНК, включая тепловые колебания ионов. Для этого ей нужно преодолеть сопротивление всех остальных подобных частиц». Под виртуальной частицей мы понимаем аналог активационный частицы- молекулы порождающей этот эффект. Все это явление и включается в понятие ППГ как контекста Петра .. т.е помимо подключения аналоговых частиц, для какой либо организации (какого действие) нужно подготовить и платформу на ДНК или РНК (в данных терминах энергетическую поддержку в виде добавочных спец частиц постулат 4 «Фантомной Теории» ). Именно в параграфе 5 (этой Фантомной Теории) показано как может решаться эта проблема при случае когда « некий контекст всегда помогает гену заказать правильную аминокислоту». Именно недоучет и последующее накопление таких ошибок в работе модели Крика и приводит к таким расхождениям в теории и практике. Для парирования подобных явлений одни ученые придумывают «божественную волю» или « зеленых человечков», вводят понятие всевидящих молекул белка кои все могут потом исправить .. Решение этих противоречий с помощью варианта «Фантомной теории! – просто несколько упрощает этот поиск законных решений существующих в клетках.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 20:13 #126
Vladimirovich написал(а):
Таки мы будем иметь немного понятную мат.модель или как всегда?
Я вам не скажу за всю одессу, а вот по триплетному коду новая статья появилась. Открыт подкод триплетного кода. Синонимичные триплеты кодируют скорость синтеза аминокислот www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2900189-3#Summary
Пока Петр Петрович с ветряными мельницами сражается, генетики работают.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 20:52 #130
Прохожий написал(а):
PP написал(а):
прохожий, не похожий написал(а): Надо ввести мутации по третьему положению оснований некоторой части омонимических кодонов
Хайдук: Ну что мешает Петру взять конкретные кодоны АВС, ВГД и т.д. и показать на пальцах? А вместо того опять посылает нах к таблице всего кода Потому что неуверен, не знает, в башке аудио-волновой-лингвистический туман
================
Нет, все-таки в Дубае, уж на что дубы в генетике, и то поняли, о чем толкует Гаряев. Побывал, поговорил, убедился.
Хайдук, вы грамотно поставить вопрос можете? Впрочем, что хочу от физика, если уж местные заядлые молбиологи путаютсяя в трех нуклеотидах кодонов...? Просто не хотят задуматься. Это ж опупеть можно - 6-й год не врубятся. Нет, тут только нежелание понимать. Оно происходит от чего угодно, только не от научного отрицания. Тут субъективный фактор главный. Итак, сей мощный вопрос таков: взять конкретные кодоны АВС, ВГД и т.д. и показать на пальцах. Чего показать-то? Конкретно - что показать? Базовое положение - чтение два из трех давно показано. Ф.Крик, правда, скромно назвал это гипотезой шатания, то бишь воблирования [J. Mol. Biol. (1966) 19, 548-555
Codon—Anticodon Pairing: The Wobble Hypothesis F. H. С CBICK, Medical Research Council, Laboratory of Molecular Biology Hills Road, Cambridge, England Received 14 February 1966]. 5' нуклеотид антикодона, спаривающийся с 3' нуклеотидом кодона может быть ЛЮБЫМ из 4-х возможных. Это относится и к синонимичных кодонами, и к омонимичным. С синонимами не опасно для синтеза белков, с омонимами - потенциально опасно: риботсома может ошибиться - дублеты одинаковые, а кодируют РАЗНЫЕ аминокислоты или СТОП сигнал. Ну ясно же как репа. Но опасность легко снимается, поскольку омонимия (неоднозначность) снимается контекстом иРНК. ВСЁ! Чего тут непонятного? Причем тут - взять конкретные кодоны АВС, ВГД и т.д? Ну возьмите, и что дальше? Снимите с них реплику иРНК, дайте в бесклеточную систему - начнется синтез правильного белка, несмотря на встречающиеся неоднозначные кодоны-омонимы. Это классика, тут проверять нечего. Но тут и кроется дьявол иллюзии, что все, мол, понятно, чего тут такого выискивать? Нет-де проблемы и точка. Однако ЕСТЬ ПРОБЛЕМА. Она фундаментальна. Проблема СЕМАНТИКИ иРНК, которая ПОНИМАЕТСЯ рибосомой, читающей КОНТЕКСТ иРНК, контекст, несущий СМЫСЛ. А это уже совсем другая генетика, другая мол. биология, другая медицина, другое сельское хозяйство. Наконец, другая электроника компьютеров – квантовых биокомпьютеров. Ну а уж если так приперло – хочется экспериментальных доказательств роли контекста иРНК в синтезе белков, то извольте поработать, хотя бы с мутантными по 3’ положению кодонами с GFP системой.
Почему семантический аспект синтеза белков вызывает такое сопротивление, кроме чисто эмоционального - «не пущать ППГ»? Потому что придется перестраивать базовые позиции в биологии и мировоззрении вообще. По старинке боимся идеализма, боимся участия РАЗУМНОЙ ВСЕЛЕННОЙ. Ну и признать, что всю жизнь питался жалкой чечевичной похлебкой криковской модели триплетного кода, как чисто физико-химического процесса – тоже трудно. Куда проще с оглядкой говорить о «тексте ДНК и РНК», трусливо считая это метафорой. Проще говорить о «сайтах узнавания», о «редактировании РНК», о «процессинге РНК», не видя и не признавая своего рода микро разумности этих актов. Идея биокомпьютинга рвется в бой и победит, не привлекая мистико-эзотерические пустословия.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 21:03 #131
mittelspiel написал(а):
Я вам не скажу за всю одессу, а вот по триплетному коду новая статья появилась. Открыт подкод триплетного кода. Синонимичные триплеты кодируют скорость синтеза аминокислот www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2900189-3#Summary
Пока Петр Петрович с ветряными мельницами сражается, генетики работают
Любезный, вы саммари усвоили?
Summary
The genetic code is degenerate. Each amino acid is encoded by up to six synonymous codons; the choice between these codons influences gene expression. Here, we show that in coding sequences, once a particular codon has been used, subsequent occurrences of the same amino acid do not use codons randomly, but favor codons that use the same tRNA. The effect is pronounced in rapidly induced genes, involves both frequent and rare codons and diminishes only slowly as a function of the distance between subsequent synonymous codons. Furthermore, we found that in S. cerevisiae codon correlation accelerates translation relative to the translation of synonymous yet anticorrelated sequences. The data suggest that tRNA diffusion away from the ribosome is slower than translation, and that some tRNA channeling takes place at the ribosome. They also establish that the dynamics of translation leave a significant signature at the level of the genome.
Скорость синтеза и участие в этом синонимов ну никакого отношения к идее осмысленности работы белок-синтезирующей системы не имеют. Или только косвенное. А вообще, чувствую - скоро будет традиционное: так и без ППГ было ясно, что регуляция синтеза белков подразумевает некоторую квази разумность, компьютинг. И это будет хорошо. Значит, наша взяла.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
20 Апр 2010 21:12 #132
PauLita написал(а):
Слыша это, мой школьный учитель по биологии в гробу бы перевернулся..
так посетите учителя и помешайте перевернуться, разъяснив суть, в чем преуспели... Да и, пожалуй, останьтесь с ним. Это будет не квази разумно, а толково.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 00:17 #133
прохожий, не похожий написал(а):
рибосома может ошибиться - дублеты одинаковые, а кодируют РАЗНЫЕ аминокислоты или СТОП сигнал.
Одинаковые дублеты кодируют разные аминокислоты, потому что сказывается ТРЕТИЙ нуклеотид, то бишь не дублеты, а триплеты вершат парадом
прохожий, не похожий написал(а):
омонимия (неоднозначность) снимается контекстом иРНК... Проблема СЕМАНТИКИ иРНК, которая ПОНИМАЕТСЯ рибосомой, читающей КОНТЕКСТ иРНК, контекст, несущий СМЫСЛ... хочется экспериментальных доказательств роли контекста иРНК в синтезе белков, то извольте поработать, хотя бы с мутантными по 3’ положению кодонами с GFP системой.
Петр, неужели не понимаете, что такими общими, бессмысленными фразами не отделаться?
Какой конкретно контекст, из каких дублетов/триплетов сей контекст состоит, как конкретные замещения этих дублетов/триплетов другими изменяет сей контекст, что должно привести к производству других аминокислот/белков? Где эти исследования, Петр? Они Ваше дело, именно Вы хлопочете (другим по***) об этом якобы контексте, от Вас ожидают предоставить убедительные свидетельства об этом контексте
Своё время я палить на Ваши гипотезы экспериментами не буду, потому что считаю их бесперспективными (мягко выражаясь
)
прохожий, не похожий написал(а):
боимся идеализма, боимся участия РАЗУМНОЙ ВСЕЛЕННОЙ... не видя и не признавая своего рода микро разумности этих актов. Идея биокомпьютинга рвется в бой и победит, не привлекая мистико-эзотерические пустословия.
Как раз эта цитата есть отличный пример мистико-эзотерического пустословия
. Нас не колышут Ваши красивые слова, Петр, мы интересуемся механизмами, винтиками и гайками Вашего якобы разумного якобы биокомпьютинга. Вывернуться, как с беззубыми старушками, заведомо не удасться. Как говорит ув. Владимирович, мы невозмутимы как удавы и ждём Ваших детальных аргументов с тайной надеждой, что не встретимся с разочарованием
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 04:33 #134
С анекдот.ру
Группа активистов решила вывести на чистую воду одну девицу, будто бы
обладающую экстрасенсорными способностями – в частности, она умела
«читать мысли». Как я понял, девица здорово на этом зарабатывала, чем,
собственно, всех этих активистов и раздражала. Впрочем, среди них были и
поборники чистой науки. Каким-то образом им удалось добиться от нее
согласие пройти тестирование – то есть должен был состояться публичный
эксперимент, который либо подтвердит, либо опровергнет ее
сверхспособности.
Сняли зальчик для проведения банкетов, куда набилось человек двести.
На подиуме оказалась эффектная брюнетка лет под тридцать, в свободном
макси-платье черно-синего цвета, волосы распущены, на голове что-то
вроде диадемы. Она сидела за столом, а напротив нее - бородатый
опять-таки брюнет в очках, и ему тоже в районе тридцати. Он обменялся с
нею какими-то словами, а потом встал и объявил публике, что тестирование
пройдет в три тура. В первом туре испытуемая должна изобразить или
объяснить словами, что находится в конверте у экспериментатора, то есть
у этого очкарика. Конверт из плотной желтой бумаги он вытащил из
принесенной с собой папочки и положил на стол. И при этом посмотрел на
девицу победно-ехидным взглядом. Также ехидно заулыбались и его
единомышленники-активисты.
В ответ на это девица, к всеобщему изумлению, встала и молча пошла к
входным дверям.
- Куда же вы? - Очкарик оперативно прихватил ее за руку.
- Я не терплю, когда меня называют неподобающими словами, - отчеканила
она.
- Но я вам ничего такого не говорил! – возмутился активист.
- Вы это сделали мысленно! Вы, видимо, забыли, что я – экстрасенс.
И далее девица уже беспрепятственно последовала на выход мимо совершенно
обалдевшего от такого ответа активиста и его подавленно молчавших
единомышленников, но под смех в зале тех зрителей, кто оценил ее
находчивость.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 04:39 #135
прохожий, не похожий написал(а):
================Нет, все-таки в Дубае, уж на что дубы в генетике, и то поняли, о чем толкует Гаряев. Побывал, поговорил, убедился.
Возникает естественный вопрос: нахера вернулись ? Если удалось найти свежатинку, то можно некоторое время пудрить им мозги и вешать лапшу на уши. Здесь Вы кому собираетесь свою лапшу развешивать ? Грызлову с Петриком ? Так идите ка в Единую Россию!
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 07:14 #136
На опус 125
Для того, что бы - цитата - Таки мы будем иметь немного понятную мат.модель или как всегда? необходимо достаточно четко описать условия, где эта модель будет существовать ...
Пока тут сделаны только постулаты и некоторые вытяжки из возможных решений.
Если в постулатах нет противоречий, то можно идти далее... и вот поэтому и сидим на одном месте.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 07:26 #137
На параграф 126
mittelspiel написал(а):
Пока Петр Петрович с ветряными мельницами сражается, генетики работают.
Вы хотя бы внимательно почитали заявленную Вами статью - то обращаю внимание - механизмы такого явления опять не раскрыты, а просто есть некое описание что так возможно происходит. Так что говорить, о том что ППГ ничего не приоткрыл в завесах (шторах) генетики еще ох как рано .... можно крепко и поскользнуться.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 07:34 #138
Прохожий написал(а):
На опус 125
Для того, что бы - цитата - Таки мы будем иметь немного понятную мат.модель или как всегда? необходимо достаточно четко описать условия, где эта модель будет существовать ...
Ну так опишите.
Чья модель-то?
Прохожий написал(а):
Пока тут сделаны только постулаты и некоторые вытяжки из возможных решений.
Ааа.... Т.е. проведен мощный гуглинг по некоторым ключевым словам, как солитон, уравнение Матье и далее в соответствии с Торжественным Комплектом.
Прохожий написал(а):
Если в постулатах нет противоречий, то можно идти далее... и вот поэтому и сидим на одном месте.
Т.е сидим, потому что нельзя идти далее. А нельзя идти потому что...
Понятно.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 07:42 #139
Vladimirovich написал(а):
Прохожий написал(а):Если в постулатах нет противоречий, то можно идти далее... и вот поэтому и сидим на одном месте.
Т.е сидим, потому что нельзя идти далее. А нельзя идти потому что...Понятно.
У Михаила чуть по-другому:
Два арестанта за колючкой неспешно общаются...
1: Слышь, Копчённый! А вот ты можешь теорию относительности проиллюстрировать на конкретном примере ?
2: ЛИХКО! Вот мы с тобой вроде бы по периметру гуляем, а на самом деле - СИДИМ !
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 07:46 #140
не согласен с Вашими выводами (пост 130)..
Если хоть один постулат из приведенных в newsample.com/01/TezisPPG.htm будет спорным или не описанным, то построения мат модели просто НЕ ВОЗМОЖНО (вернее будет жестко оплевано).
В постулатах сделана попытка описания того на чем будет базироваться математика для описания этих процессов. Вспомним начало всех тут дискуссий.... все отрицалось, потому что не было предметного описания.
Поясняю, прежде чем описать уравнение движения маятника - нужен сам маятник и нить с подвеской ...
Так и в случае с ППГ - упустил физику возможных процессов - и получил результат несколько оторванный от практики, что и дает возможность в кидание камней (надеюсь для фундамента)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 08:01 #141
Вернемся вновь к общепринятым поначалу основным положениям генетического кода: он является триплетным, неперекрывающимся, вырожденным, не имеет “запятых”, т.е. кодоны ничем не отделены друг от друга. И наконец, он универсален. Что осталось от этих положений? Фактически ничего.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 08:02 #142
mishabara написал(а):
Если хоть один постулат из приведенных в newsample.com/01/TezisPPG.htm будет спорным или не описанным, то построения мат модели просто НЕ ВОЗМОЖНО (вернее будет жестко оплевано).
Закопируем сюда для удобства читателей
( Кстати, Вы зря меня в аффтары записали
Я на создание подобных тезисов в принципе не способен
Одной из особенностей данного подхода, составляет понимания возможности появления электромагнитных полей на ДНК или РНК ( и понятия особенности вольтамперных характеристик Quantrinas ) .
Для описания этого процесса необходим ввод новых констант.
1. Описание явление по аналогии «сверхпроводимости» для существования температурного режима в нормальном диапазоне от -50 до +50 градусов Цельсия. ( варианты )…
1.1. По аналогии с понятием электрона и позитрона явно существует необходимость ввода виртуальных частиц могущих существовать на кристалле ДНК и РНК на базе энергии, и массы солитонов (кинков и антикинков) которые мы условно будем называть положительную как P(s) частицу (кинк) и отрицательную частицу в виде М(s)-частицы (антикинк), абреватура (s) обозначает в дальнейшем солитонное толкование частицы .
1.2. Две отрицательные частицу в виде М(s)-частицы (антикинг) с противоположными спинами и направлениями движения можно объединить в пару, называемую куперовской Эти пары обладают нулевым суммарным спином и поэтому являются бозе-частицами (то есть частицами, подчиняющимися статистике Бозе-Эйнштейна). Такие частицы обладают замечательным свойством: если температура ниже определенной Т, они могут скапливаться на самом нижнем энергетическом уровне (в основном состоянии). Все частицы при этом описываются единой волновой функцией [45] или, другими словами, когерентны.
1.3. Таким образом, эффект наподобие сверхпроводимости можно представить себе так, при Т электрический ток переносится куперовскими парами, то есть элементарными носителями тока с зарядом . При этом какой-либо виртуальной частице совсем не просто рассеяться на примесном атоме или каком-либо другом дефекте кристаллической решетки ДНК или РНК, включая тепловые колебания ионов. Для этого ей нужно преодолеть сопротивление всех остальных подобных частиц.
2. Так как электрическое сопротивление стремиться к нулю, то возбужденный в сверхпроводящем кольце ДНК или РНК ток будет существовать почти бесконечно долго. Электрический ток в этом случае напоминает ток, создаваемый электроном на орбите в атоме Бора: это как бы очень большая боровская орбита. Незатухающий ток и создаваемое им магнитное поле естественно не могут иметь произвольную величину, они квантуются так, что магнитный поток, пронизывающий кольцо, принимает значения, кратные элементарному кванту потока. Другими словами в строго фиксированном диапазоне.
3. Незатухающий ток и создаваемое им магнитное поле пронизывающий кольцо ДНК, принимает значения, кратные элементарному кванту потока (т.е. введем как понятие макроскопическое квантовое явление на ДНК или РНК). Этот переход ( флюксон ) можно использовать для обработки и запоминания информации (квант магнитного потока, то есть нуль и единица - отсутствие или наличие в джозефсоновской ячейке одного кванта потока). Такая схема выгодно для объяснения, например, при учете тактового сдвига - информации с передачей части информации вдоль периодической структуры элементов логики ( как аналог движения на ДНК или РНК), причем информация смещается на единичный период при введении или изъятии единичного кванта потока
3.1. исследованиями подтверждены предположения, что сильная электронная когерентность играет важную роль в процессе переноса энергии. В ходе эксперимента группа ученых под руководством проф. Грэхама Флеминга (Graham Fleming) из Калифорнийского университета в Беркли зафиксировали «квантовые биения» - когерентные электронные осцилляции в молекулах-донорах и молекулах-акцепторах, генерируемые энергетическими возбуждениями.. Quantrinas
4. Введение понятия существования на теле ДНК или РНК аналогов активационных молекул типа Сh555(s) - мультисолитон (с вариантом применения суперпозиции на «такте» сдвига ) может объяснить причину взаимодействия и непосредственного контакта их с телом реальной активационной молекулы именно на нужной пространственной точке тела ДНК или РНК
5. Вариант модели связанной с появлением «интрона» на ДНК. [44]
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 08:22 #143
7. Многокомпонентный рибонуклеопротеидный белоксинтезирующий аппарат является системой генерации высокоорганизованных знаковых семиотико-семантических излучений акустико-электромагнитных полей, стратегически регулирующих его самоорганизацию и порядок включения аминокислот в полипептидную цепь.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 10:26 #144
На пост 142 относительно аффтарства .. именно Ваши искрометные опусы и дали возможность newsample.com/01/Dnk01.htm соединить многие разрозненные мысли в единые понятия, и все ваши репризы зафиксированы, так что не надо отказываться от своих высказываний и предложений ... тем более это проект и не более того ...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 10:41 #145
макроконтексты пре-информационных и контексты информационных РНК можно рассматривать как фон, который обеспечивает резкое усиление сигнала, то есть выбора именно данной из двух омонимичных аминоацилированных тРНК, которая должна войти в белковую “фразу” или “слово”. Этот выбор возможен только после выделения когерентной составляющей в форме повторов одних и тех же осмыслений дублетов-омонимов в кодонах.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 12:14 #146
mishabara написал(а):
На пост 142 относительно аффтарства .. именно Ваши искрометные опусы и дали возможность http://news*********/**/******* соединить многие разрозненные мысли в единые понятия, и все ваши репризы зафиксированы, так что не надо отказываться от своих высказываний и предложений ... тем более это проект и не более того ...
Кто-то нечаянно на коровью лепёшку наступил... Теперь не отмоется...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 13:31 #148
Если доплеровская голограмма формируется волной, отраженной от движущегося объекта, то обращенная такой голограммой волна, идя обратным ходом, фокусируется не на сам объект, а несколько впереди его. При этом существенно, что точка фокусировки обращенной волны является в этом случае именно той точкой, в которую переместится объект за время, пока обращенная волна распространится от голограммы до этого объекта.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 15:38 #149
Нечего Петру ошиваться: ген GFP известен, пусть выпишет там все дублеты и триплеты один за другим и пусть укажет на те из этих дублетов/триплетов, которые неоднозначны. Что может быть проще? Подозреваю, что Петр не знает состава/кодонов/слов гена GFP, скажем, какое число там дублетов/триплетов?
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№7)
21 Апр 2010 15:51 #150
Прохожий написал(а):
Для Чайник555 - для Вас место зарезервировано, и не только в имени сверхчастицы но, и в надежде, что и мысли у Вас по теме конструктивные есть ...
Имею конструктивную мысль по теме: а не пошли бы Вы ... скажем, в Дубаи (а в Дубаи, а в Дубаи сидит под пальмами Махмуд Али, и курит план и чтит Коран и продаёт не за рубли...)
