Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так?
nonlocality,освещался ли уже вопрос о функциональном назначении кодонов-синонимов и кодонов-омонимов?
Есть ли у Вас электронная версия "Квантового генома..."?
Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так?
таблицу ген. кода смотрите, там фсё застукано и лжи Гаряевской нет
Это дитя никак не поймет, что реальная Таблица кода не может существовать в статике, поскольку при чтении (динамике) рибосомами мРНК СИОМЫ могут менять кодовые значения, как при чтении в контекстах слова (омонимы) - коса, ключ, рейд, бокс и т.д. могут менять смыслы. Таких двусмысленных слов-кодонов в Таблице Кода - 32 из 64.
Кодируют, но одновременно по две разных: УУУ - фенил аланин и лейцин, УГА - цистеин и селеноцистеин
www.kozlenkoa.narod.ru/gencode1.htm
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон...
мыло
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты...
Warning: Spoiler![ Click to expand ][ Click to hide ]
Неканонические значения кодонов
По крайней мере у 16 типов организмов генетический код отличается от канонического. Например многие виды зелёных водорослей Acetabularia транслируют стандартные стоп-кодоны UAG и UAA в аминокислоту глицин, а гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
Существование таких вариаций свидетельствует о возможной эволюции генетического кода.
Представители всех трёх доменов живых организмов иногда прочитывают стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к 20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на стадии, когда последний ещё не отсоединился от тРНК в составе рибосомы.
Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.
Отличия от универсального кода имеются и в митохондриальной ДНК (см. раздел Особенности).
Определены ли условия,при которых это происходит???
nonlocality,у Вас имеется полная сводная таблица (список) всех исключений при трансляции?
Эти исключения можете найти сами в таблицах белковых кодов для более чем 30 видов биосистем. В статьях, что выслал есть все ссылки, в т.ч. на статью Туранова и др. в Science, где они еще раз показали двойное кодирование по кодону UGA у реснитчатой инфузории.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 15:01 #7520
Как
Опять затянул свои мантры пользователь Пескович о том, чего нет ... Ему на молбил.ру уже давно обьясняли, что эти аминокислоты не аналог "целых чисел", и их можно представить как составные, в этом случае "иллюзия" исчезает. Простое добавление "+" или "-", то есть некого кванта энергии в этих молекулах переводит их в другое состояние и они взаимодействуют по нужной схеме. Аналог этого состояния "Группа Чукч..." считают "рамки - варианты бензольного кольца", что вполне вписывается в эти явления снимая с них тех неопределенности
гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
ну вот, угробил хайд даже "синонимы" Песковича : группа дуплета CU внизу оказывается двусмысленным НЕ синонимом, поскольку окромя лейцина может кодировать и серин, и треонин
Пескович попросту не понимает, что в разных существах соответствующие антикодоны-двурушники могут закручиваться подходящим образом дабы тащить разные АК и ... вуаля
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон...
мыло
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты...
Квантовый геном вам выслал.
И в кодонах синонимах, и в кодонах омонимах, и в их гибридах (миксах-сиомах) важны и дуплеты, и 3'-нуклеотиды. Но по разному.
Первая ссылка на одновременную кодировку двух разных аминокислот ФАЛ и ЛЕЙ одним кодоном UUU дана в статье Крика и Ниренберга "Генетический код" в УФН в 1964 г. Вот цитата из их статьи:
Однако все же имеется одна реальная возможность появления не-
определенности при синтезе белка. Эта неопределенность могла бы возник-
нуть, если бы одно кодовое слово соответствовало нескольким аминокис-
лотам. До настоящего времени был отмечен только один случай такой
неопределенности. Белок, синтезируемый поли-U, состоит не только из
лейцина, но и из фенил ал анина, причем на каждую молекулу лейцина
Фермент,
активируюший
аминокислоту
А Д U
! А мимо- '
ι кислота |
154 Φ. КРИК, Μ. НИРЕНБЕРГ
приходится 20—30 молекул фенилаланина. При отсутствии в растворе
фенилаланина поли-U использует лейцин в количестве, равном половине
обычно используемого количества фенилаланина. Молекулярное объяснение этой неопределенности неизвестно.
Второй случай неопределенного кодирования детально описан в статье Туранова и др., популярно изложенной здесь elementy.ru/novosti_nauki/430968
Общая ссылка на множественность кодов в статье The Genetic Codes
Compiled by Andrzej (Anjay) Elzanowski and Jim Ostell at National Center for Biotechnology Information (NCBI), Bethesda, Maryland, U.S.A.
Last update of the Genetic Codes: Nov. 18, 2016
должен заметить, что за почти 11 лет дискуссий здесь и в Molbiol.ru относительно ложности модели Белкового кода Ниренберга-Крика, вы первый, кто пытается серьёзно разобраться в этой проблеме.
довольно наивный лохъ вы, Петрович, хайд просто троллит вас, ржёт над вашей доверчивостью, издеваеццо ни падеццки ; он вам показал, что даже "синонимы" ваши кодируют 2 или бОльше АК, а я вам объяснил почему и не такое бывает: в некоторых существах некоторых АК просто не стало и антикодоны хфатают за уши другие, что им по душе
довольно наивный лохъ вы, Петрович, хайд просто троллит вас, ржёт над вашей доверчивостью, издеваеццо ни падеццки ; он вам показал, что даже "синонимы" ваши кодируют 2 или бОльше АК, а я вам объяснил почему и не такое бывает: в некоторых существах некоторых АК просто не стало и антикодоны хфатают за уши другие, что им по душе
У вас явный дефицит кодонов личного пользования - только ДУБ и ТУП. У Хайда на порядки больше. Вам - сохнуть, ему - развиваться.
Не ссорьтесь,девочки...
А неувязочки - вопрос интерпретации... nonlocality,спасибо...Мне бы Ваш оптимизм...
Сейчас пытаю "ИНОЕ ПОНИМАНИЕ МОДЕЛИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА."
to be continued
На это может быть пять причин...
1.Нет предмета обсуждения.
2.Вы не умеете слушать.
3.Петрович не может донести суть вопроса.
4.2+3.
5.Вопрос намеренно дискредитируется.