Ключевое слово
19 | 04 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 19:18 #7501

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так? :?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 19:23 #7502

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
фсё не так, хайд :tired:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 19:26 #7503

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
А как ? :unsure:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 19:31 #7504

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
таблицу ген. кода смотрите, там фсё застукано и лжи Гаряевской нет :flag:
Last Edit: 16 Фев 2019 19:31 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 19:35 #7505

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Так в чем,конкретно,траблы? И что скажет начальник транспортного цеха? :)

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 20:32 #7506

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
траблы в том, что - за исключением только пары исключений - таблица на всё указывает и места для Гаряевского помпёзного бреда НЕ остаётся :figa:
Last Edit: 16 Фев 2019 21:31 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 20:55 #7507

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Где исключения?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 16 Фев 2019 21:34 #7508

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
Петрович говорит, что у некоторых существ УУУ и УГА кодируют АК, что не в таблице :dontknow:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 08:21 #7509

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
nonlocality,освещался ли уже вопрос о функциональном назначении кодонов-синонимов и кодонов-омонимов?
Есть ли у Вас электронная версия "Квантового генома..."?
Дайте свой имэйл, пришлю всё. Если с Английским дружите, то вот последнее наше www.scirp.org/Journal/PaperInformation.aspx?PaperID=57601
www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=85202

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 08:23 #7510

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так?
Упрощенно так.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 08:30 #7511

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
таблицу ген. кода смотрите, там фсё застукано и лжи Гаряевской нет
Это дитя никак не поймет, что реальная Таблица кода не может существовать в статике, поскольку при чтении (динамике) рибосомами мРНК СИОМЫ могут менять кодовые значения, как при чтении в контекстах слова (омонимы) - коса, ключ, рейд, бокс и т.д. могут менять смыслы. Таких двусмысленных слов-кодонов в Таблице Кода - 32 из 64.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 08:36 #7512

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
Петрович говорит, что у некоторых существ УУУ и УГА кодируют АК, что не в таблице
Кодируют, но одновременно по две разных: УУУ - фенил аланин и лейцин, УГА - цистеин и селеноцистеин. Выбор - через контекст мРНК.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 08:55 #7513

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
Кодируют, но одновременно по две разных: УУУ - фенил аланин и лейцин, УГА - цистеин и селеноцистеин
www.kozlenkoa.narod.ru/gencode1.htm
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон... :O
мыло Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты... :?
Last Edit: 17 Фев 2019 10:27 by hide.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 10:32 #7514

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Нашел в вики...
Warning: Spoiler! [ Click to expand ]

Определены ли условия,при которых это происходит???
Last Edit: 17 Фев 2019 10:51 by hide.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 11:31 #7515

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Долго объяснять. Лучше прочитать статьи. Дам вариант на Русском. Имэйлом.
The following user(s) said Thank You: hide

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 12:15 #7516

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
nonlocality wrote:
Долго объяснять. Лучше прочитать статьи. Дам вариант на Русском. Имэйлом.
Отослал

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 12:24 #7517

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
nonlocality,у Вас имеется полная сводная таблица (список) всех исключений при трансляции?

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 12:36 #7518

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
nonlocality,у Вас имеется полная сводная таблица (список) всех исключений при трансляции?
Эти исключения можете найти сами в таблицах белковых кодов для более чем 30 видов биосистем. В статьях, что выслал есть все ссылки, в т.ч. на статью Туранова и др. в Science, где они еще раз показали двойное кодирование по кодону UGA у реснитчатой инфузории.
The following user(s) said Thank You: hide

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 14:42 #7519

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
nonlocality wrote:
двусмысленных слов-кодонов в Таблице Кода - 32 из 64.
а что мешает остальным 32 плясать двусмысленными? :dontknow:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 15:01 #7520

  • Как
  • Как's Avatar
Опять затянул свои мантры пользователь Пескович о том, чего нет ... Ему на молбил.ру уже давно обьясняли, что эти аминокислоты не аналог "целых чисел", и их можно представить как составные, в этом случае "иллюзия" исчезает. Простое добавление "+" или "-", то есть некого кванта энергии в этих молекулах переводит их в другое состояние и они взаимодействуют по нужной схеме. Аналог этого состояния "Группа Чукч..." считают "рамки - варианты бензольного кольца", что вполне вписывается в эти явления снимая с них тех неопределенности

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 15:34 #7521

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
ну вот, угробил хайд даже "синонимы" Песковича :thumbup: : группа дуплета CU внизу оказывается двусмысленным НЕ синонимом, поскольку окромя лейцина может кодировать и серин, и треонин :P

Пескович попросту не понимает, что в разных существах соответствующие антикодоны-двурушники могут закручиваться подходящим образом дабы тащить разные АК и ... вуаля :figa:

IMG_5502_2019-02-17.JPG
Last Edit: 17 Фев 2019 15:38 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 18:26 #7522

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон...
мыло Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты...
Квантовый геном вам выслал.
И в кодонах синонимах, и в кодонах омонимах, и в их гибридах (миксах-сиомах) важны и дуплеты, и 3'-нуклеотиды. Но по разному.

Первая ссылка на одновременную кодировку двух разных аминокислот ФАЛ и ЛЕЙ одним кодоном UUU дана в статье Крика и Ниренберга "Генетический код" в УФН в 1964 г. Вот цитата из их статьи:

Однако все же имеется одна реальная возможность появления не-
определенности при синтезе белка. Эта неопределенность могла бы возник-
нуть, если бы одно кодовое слово соответствовало нескольким аминокис-
лотам. До настоящего времени был отмечен только один случай такой
неопределенности. Белок, синтезируемый поли-U, состоит не только из
лейцина, но и из фенил ал анина, причем на каждую молекулу лейцина
Фермент,
активируюший
аминокислоту
А Д U
! А мимо- '
ι кислота |
154 Φ. КРИК, Μ. НИРЕНБЕРГ
приходится 20—30 молекул фенилаланина. При отсутствии в растворе
фенилаланина поли-U использует лейцин в количестве, равном половине
обычно используемого количества фенилаланина. Молекулярное объяснение этой неопределенности неизвестно.


Второй случай неопределенного кодирования детально описан в статье Туранова и др., популярно изложенной здесь
elementy.ru/novosti_nauki/430968

Общая ссылка на множественность кодов в статье The Genetic Codes
Compiled by Andrzej (Anjay) Elzanowski and Jim Ostell at National Center for Biotechnology Information (NCBI), Bethesda, Maryland, U.S.A.
Last update of the Genetic Codes: Nov. 18, 2016
The following user(s) said Thank You: hide

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 18:31 #7523

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
HIDE,

должен заметить, что за почти 11 лет дискуссий здесь и в Molbiol.ru относительно ложности модели Белкового кода Ниренберга-Крика, вы первый, кто пытается серьёзно разобраться в этой проблеме.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 19:45 #7524

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
довольно наивный лохъ вы, Петрович, хайд просто троллит вас, ржёт над вашей доверчивостью, издеваеццо ни падеццки :lol: ; он вам показал, что даже "синонимы" ваши кодируют 2 или бОльше АК, а я вам объяснил почему и не такое бывает: в некоторых существах некоторых АК просто не стало и антикодоны хфатают за уши другие, что им по душе :idea:
Last Edit: 17 Фев 2019 19:54 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 20:06 #7525

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
довольно наивный лохъ вы, Петрович, хайд просто троллит вас, ржёт над вашей доверчивостью, издеваеццо ни падеццки ; он вам показал, что даже "синонимы" ваши кодируют 2 или бОльше АК, а я вам объяснил почему и не такое бывает: в некоторых существах некоторых АК просто не стало и антикодоны хфатают за уши другие, что им по душе
У вас явный дефицит кодонов личного пользования - только ДУБ и ТУП. У Хайда на порядки больше. Вам - сохнуть, ему - развиваться.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 21:21 #7526

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Не ссорьтесь,девочки... :rofl:
А неувязочки - вопрос интерпретации...
nonlocality,спасибо...Мне бы Ваш оптимизм...
Сейчас пытаю "ИНОЕ ПОНИМАНИЕ МОДЕЛИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА."
to be continued
Last Edit: 17 Фев 2019 21:24 by hide.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 21:30 #7527

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
оптимизм и энтузиазм - удел дураков, поскольку не мешают ни башка, ни образование... :rofl:
Last Edit: 17 Фев 2019 21:43 by Хайдук.
The following user(s) said Thank You: hide

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 17 Фев 2019 21:45 #7528

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49370
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
hide wrote:
Сейчас пытаю "ИНОЕ ПОНИМАНИЕ МОДЕЛИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА."
смотрите не замучите себя насмерть пыткой этой :bugaga:
Last Edit: 18 Фев 2019 17:59 by Хайдук.

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 18 Фев 2019 06:45 #7529

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
nonlocality wrote:
Долго объяснять.

Это после 9 то лет обсуждения здесь ? :glasses:

Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном 18 Фев 2019 07:55 #7530

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
На это может быть пять причин... ;)
1.Нет предмета обсуждения.
2.Вы не умеете слушать.
3.Петрович не может донести суть вопроса.
4.2+3.
5.Вопрос намеренно дискредитируется.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум