Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
13 Фев 2019 22:11 #7473
nonlocality wrote:
Как wrote:
Вот конспект лекций по ..сиомам.., которые говорят, что при отражение множества как бы праэлементов типа кодонов на множества выбора при выборе последних множеств определимо как параметрами , которые являются ординалы и являются параметрами другого множества, и что бы получить противоречие надо доказать, что такой формулы выбора нет, другими словами интерпретации по "гаряевскому" типу не существует.
Никакого отношения к СИОМИИ белкового кода это не имеет.
... а могло, если вместо физиков-жуликов Шипова с Максименким наняли бы математиков-жуликов
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
16 Фев 2019 15:59 #7476
nonlocality,освещался ли уже вопрос о функциональном назначении кодонов-синонимов и кодонов-омонимов?
Есть ли у Вас электронная версия "Квантового генома..."?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
16 Фев 2019 19:18 #7477
Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 08:21 #7485
hide wrote:
nonlocality,освещался ли уже вопрос о функциональном назначении кодонов-синонимов и кодонов-омонимов?
Есть ли у Вас электронная версия "Квантового генома..."?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 08:23 #7486
hide wrote:
Нашел в третьей монографии гипотезы о семантической значимости избыточности кода...В сухом остатке,как понимаю:для синонимов действует правило двух и спонтанная осцилляция третьего основания,а для омонимов - зависимость выбора от контекста вторичной структуры рибосом...так?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 08:30 #7487
Хайдук wrote:
таблицу ген. кода смотрите, там фсё застукано и лжи Гаряевской нет
Это дитя никак не поймет, что реальная Таблица кода не может существовать в статике, поскольку при чтении (динамике) рибосомами мРНК СИОМЫ могут менять кодовые значения, как при чтении в контекстах слова (омонимы) - коса, ключ, рейд, бокс и т.д. могут менять смыслы. Таких двусмысленных слов-кодонов в Таблице Кода - 32 из 64.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 08:55 #7489
nonlocality wrote:
Кодируют, но одновременно по две разных: УУУ - фенил аланин и лейцин, УГА - цистеин и селеноцистеин
www.kozlenkoa.narod.ru/gencode1.htm
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон...
мыло
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты...
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 10:32 #7490
Нашел в вики...
Warning: Spoiler![ Click to expand ][ Click to hide ]
Неканонические значения кодонов
По крайней мере у 16 типов организмов генетический код отличается от канонического. Например многие виды зелёных водорослей Acetabularia транслируют стандартные стоп-кодоны UAG и UAA в аминокислоту глицин, а гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
Существование таких вариаций свидетельствует о возможной эволюции генетического кода.
Представители всех трёх доменов живых организмов иногда прочитывают стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к 20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на стадии, когда последний ещё не отсоединился от тРНК в составе рибосомы.
Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.
Отличия от универсального кода имеются и в митохондриальной ДНК (см. раздел Особенности).
Определены ли условия,при которых это происходит???
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 12:36 #7494
hide wrote:
nonlocality,у Вас имеется полная сводная таблица (список) всех исключений при трансляции?
Эти исключения можете найти сами в таблицах белковых кодов для более чем 30 видов биосистем. В статьях, что выслал есть все ссылки, в т.ч. на статью Туранова и др. в Science, где они еще раз показали двойное кодирование по кодону UGA у реснитчатой инфузории.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 15:01 #7496
Опять затянул свои мантры пользователь Пескович о том, чего нет ... Ему на молбил.ру уже давно обьясняли, что эти аминокислоты не аналог "целых чисел", и их можно представить как составные, в этом случае "иллюзия" исчезает. Простое добавление "+" или "-", то есть некого кванта энергии в этих молекулах переводит их в другое состояние и они взаимодействуют по нужной схеме. Аналог этого состояния "Группа Чукч..." считают "рамки - варианты бензольного кольца", что вполне вписывается в эти явления снимая с них тех неопределенности
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 15:34 #7497
гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
ну вот, угробил хайд даже "синонимы" Песковича : группа дуплета CU внизу оказывается двусмысленным НЕ синонимом, поскольку окромя лейцина может кодировать и серин, и треонин
Пескович попросту не понимает, что в разных существах соответствующие антикодоны-двурушники могут закручиваться подходящим образом дабы тащить разные АК и ... вуаля
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 18:26 #7498
hide wrote:
А почему тут не так? А UGA - вообще стоп-кодон...
мыло
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
А где приводятся данные о кодировке двух АК одним кодоном?И мне сдается,Вы делаете ставку больше на дуплеты...
Квантовый геном вам выслал.
И в кодонах синонимах, и в кодонах омонимах, и в их гибридах (миксах-сиомах) важны и дуплеты, и 3'-нуклеотиды. Но по разному.
Первая ссылка на одновременную кодировку двух разных аминокислот ФАЛ и ЛЕЙ одним кодоном UUU дана в статье Крика и Ниренберга "Генетический код" в УФН в 1964 г. Вот цитата из их статьи:
Однако все же имеется одна реальная возможность появления не-
определенности при синтезе белка. Эта неопределенность могла бы возник-
нуть, если бы одно кодовое слово соответствовало нескольким аминокис-
лотам. До настоящего времени был отмечен только один случай такой
неопределенности. Белок, синтезируемый поли-U, состоит не только из
лейцина, но и из фенил ал анина, причем на каждую молекулу лейцина
Фермент,
активируюший
аминокислоту
А Д U
! А мимо- '
ι кислота |
154 Φ. КРИК, Μ. НИРЕНБЕРГ
приходится 20—30 молекул фенилаланина. При отсутствии в растворе
фенилаланина поли-U использует лейцин в количестве, равном половине
обычно используемого количества фенилаланина. Молекулярное объяснение этой неопределенности неизвестно.
Второй случай неопределенного кодирования детально описан в статье Туранова и др., популярно изложенной здесь elementy.ru/novosti_nauki/430968
Общая ссылка на множественность кодов в статье The Genetic Codes
Compiled by Andrzej (Anjay) Elzanowski and Jim Ostell at National Center for Biotechnology Information (NCBI), Bethesda, Maryland, U.S.A.
Last update of the Genetic Codes: Nov. 18, 2016
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 18:31 #7499
HIDE,
должен заметить, что за почти 11 лет дискуссий здесь и в Molbiol.ru относительно ложности модели Белкового кода Ниренберга-Крика, вы первый, кто пытается серьёзно разобраться в этой проблеме.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Фев 2019 19:45 #7500
довольно наивный лохъ вы, Петрович, хайд просто троллит вас, ржёт над вашей доверчивостью, издеваеццо ни падеццки ; он вам показал, что даже "синонимы" ваши кодируют 2 или бОльше АК, а я вам объяснил почему и не такое бывает: в некоторых существах некоторых АК просто не стало и антикодоны хфатают за уши другие, что им по душе