Вот это и не понятно. Мы in-vitro насинтезировали другой белок, а думаем, что этот белок "табличный". Петрович, ну как так может быть? Мы ж изучаем на АМ состав, хим.реакции, мол.масса, и т.д. и ничего: ни один параметр, не одна характеристкика не "выдает" нам, что это иной, др.белок. Как так быть может?
Табличный белок, еще раз, будет только если мРНК будет состоять только из кодонов-синонимов, что для естественной мРНК событие мало вероятное. Если же в РНК матрице присутствуют омонимы, то "табличность" исключена, поскольку таблица не предсказывает, какие значения будут приданы омонимам. Их значения задаются контекстом мРНК. Что вы так удивляетесь? Я-то полагал, что вы это уже усвоили, удивляться надо тому, что до сих пор не поняли такое простое положение.
Вот с этим соглашусь. Вобще странно: я привела цитату прямо из статьи. Что можно было не понять? Написано, что две, причем дан комментарий, что это случай единичный (на тот момент). Предлагала статью скинуть. Странно.
Ничего странного. Пи пи Природу подгоняет под свои желания - смотрит в книгу и видит фигу (ц).
"совсем мало" (4х10-4) - это как раз и есть ноль (на уровне точности трансляции)- и это для поли(У)
а средняя частота встречаемости кодона УУУ - есть примерно 20ть на тысячу кодонов
= УУУ бояться - век лейцина не видать при обычной нормальной трансляции
nonlocality wrote:
Контекст же может задать большое и очень большое включение лейцина в растущий пептид, а может и обнулить включение лейцина. И вообще, может играть скоростями и уровнями включений разных аминокислот в пределах компетенции кодона-омонима... Всё под контролем... контекста - и ноль, и много-много, и как надо.
на фоне объективного, с числовыми оценками изложения Олега особо заметно пустословие про "большое и очень большое включение лейцина". Притом выделенное жирно-красным, с ехидной ухмылкой в придачу, свидетельствует о сознательной и целенаправленной манипуляции/пурги/вранья про "вообще, может играть скоростями и уровнями включений разных аминокислот в пределах компетенции кодона-омонима", поскольку - окромя УУУ - у никаких других кодонов НЕ наблюдается даже этого, практически нулевого уровня 0,0004
Я не знаю РР, кто Гаряева из унивира выпер, но то что он недоучка, очевидно, можно в принципе запрос в архив дать по рановской линии, но к чему, и так всё видно.
Ну теперь всем понятно, что этот провидец - очередной купленный тролль, призванный гадить и провоцировать.
о
значит всё верно, слабое место Петровича, раз тут же завизжал. Петрович, тебя чё и правда с биофака попёрли? и ты им всю свою жизнь простить этого не можешь? Спирин гад тебя?
бедолага, ты жизнь целую прожил с такой глупой обидой. nonlocality wrote:
А этот так и будет зарабатывать на собственной подлости. Ну ладно, соображал бы что-нибудь, можно было бы по науке урыть. А так просто тролль, форумный хулиган. провидец, почем продался? По полтиннику за пакость?
Буду Петрович, буду, по 50 евро за секву к основному окладу 8000 евро в мес, мож мне за тебя тыщёнку ещё накинут, как за лаборанта, а там глядишь и уроешь меня через годик другой, по науке своим ууу карасиусом инфузорией омонимной, а пока с пробирками побегаешь, мож и экстернатом у меня тут до диплома дотянешь. урыватель.
на фоне объективного, с числовыми оценками изложения Олега особо заметно пустословие про "большое и очень большое включение лейцина". Притом выделенное жирно-красным, с ехидной ухмылкой в придачу, свидетельствует о сознательной и целенаправленной манипуляции/пурги/вранья про "вообще, может играть скоростями и уровнями включений разных аминокислот в пределах компетенции кодона-омонима", поскольку - окромя УУУ - у никаких других кодонов НЕ наблюдается даже этого практически нулевого уровня 0,0004
Вы, любезный, и на память слабы. Тот же Олег приводил статью (может, напомнит) о двукратном одноврменном кодировании одним кодоном-омонимом аминокислоты и стоп позиции. Приведенные "числовые оценки" никак не влияют на главную идею двукратной вырожденности кода.
Табличный белок, еще раз, будет только если мРНК будет состоять только из кодонов-синонимов, что для естественной мРНК событие мало вероятное. Если же в РНК матрице присутствуют омонимы, то "табличность" исключена, поскольку таблица не предсказывает, какие значения будут приданы омонимам. Их значения задаются контекстом мРНК. Что вы так удивляетесь? Я-то полагал, что вы это уже усвоили, удивляться надо тому, что до сих пор не поняли такое простое положение.
Да еще немного, и Вика наконец-то поймет, что удивляться тут совсем нечему..
- Что для правильного чтения третьей буквы 32х дуплетных кодонов (триплета целиком) совершенно необходим контекст, причем для для каждого о-дуплета - свой и в разных местах.
Теперь все понятно ?
= только не советуйте ей представить себе такую мРНК на ночь - контекст контекста схватить может.
= дайте лучше Провидцу 50 у.е на секву, а еще лучше - последуйте его совету - чтоб и его омоним хватил )
ждём-с ответа Олега (кстати, странно, что сам вы, Петрович, даже не помните и не знаете о тех 1-2 исключениях, которые якобы дуют вам с паруса, как вам хотелось бы)
о
значит всё верно, слабое место Петровича, раз тут же завизжал. Петрович, тебя чё и правда с биофака попёрли? и ты им всю свою жизнь простить этого не можешь? Спирин гад тебя?
бедолага, ты жизнь целую прожил с такой глупой обидой.
Этот мелкий форумный хулиганчик, вероятно, думает, что поведусь на его подлость, буду бить себя руками в грудь, выкладывать свои дипломы..., а "провидец" будет со смаком утверждать, что все это куплено в проходе метро, а мои монографии и статьи уворованы. Проходили все это. Имеем дело с обычным, слабого ума, не ПРОвидцем, а ПРОхиндеем, моральной ПРОституткой. Тролль, он и есть тролль. Купленный за копейки бедолага студентик-второкурсник сельхоз техникума, которому на стипуху жить скучно.
Владимирович, опять ведут форум к грязному вырождению.
единственный кодон, у которого 2 (два) разных смысла это старт-кодон АУГ, может кодировать также аминикислоту метионин; на этом так обзываемая "омонимия" триплетов начинается (старт-кодон) и ... заканчивается, на засыпку Петровичу
= дайте лучше Провидцу 50 у.е на секву, а еще лучше - последуйте его совету - чтоб и его омоним хватил )
ой да
не подумал об этом, он же меня в могилу тут раньше времени сведёт омонимами своими, каждый глюк малды у него открытием будет гнобелевским, его к технике не подпустишь, карасиус бл.
странно, что сам вы, Петрович, даже не помните и не знаете о тех 1-2 исключениях, которые якобы дуют вам с паруса,
а ссылки просит
но не читает
Science. 2009 Jan 9;323(5911):259-61. doi: 10.1126/science.1164748.
Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon.
Turanov AA1, Lobanov AV, Fomenko DE, Morrison HG, Sogin ML, Klobutcher LA, Hatfield DL, Gladyshev VN.
Author information
Abstract
Strict one-to-one correspondence between codons and amino acids is thought to be an essential feature of the genetic code. However, we report that one codon can code for two different amino acids with the choice of the inserted amino acid determined by a specific 3' untranslated region structure and location of the dual-function codon within the messenger RNA (mRNA). We found that the codon UGA specifies insertion of selenocysteine and cysteine in the ciliate Euplotes crassus, that the dual use of this codon can occur even within the same gene, and that the structural arrangements of Euplotes mRNA preserve location-dependent dual function of UGA when expressed in mammalian cells. Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
PMID:
19131629
[PubMed - indexed for MEDLINE]
PMCID:
PMC3088105
Free PMC Article
про его "табличный белок" - ответ понятен ?
свои дипломы..., что все это куплено в проходе метро, а мои монографии и статьи уворованы.
а дипломы правда что ли в метро купил?
а монографии какие? волновой геном твой что ли, так я с пятой страницы уписался не выдержал, функциональный ты мой.
Хайдук, в Гамбурге фабрика скрипок есть для нса пластиковые, а работаю в Берлине.
Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
Вот вот. А дальше пойдут доказательства по всем 32 кодонам-омонимам. А уж когда осмелятся коллинеарности проверить хотя бы на паре-тройке белков и их мРНК - совсем интересно будет. Вот тогда, Олег, и станешь провидцем наоборот. Вот тогда и можешь литровую засосать с чувством исполненного долга. А пока отдыхай. Вся жизнь впереди - разденься и жди.
Вика хотите разобраться с polyU, откройте ветку и там нормально можно обсудить эту тему. Без вранья и истерик Гаряева, а по работам классиков. Благо оригиналы статей легко доступны. Гаряев же заявил, что кодон UUU кодирует две аминокислоты, что явное вранье.
Он никак не поймет, что ПО ТАБЛИЦЕ КОДА UUU кодирует ФАЛ и ЛЕЙ как бы ОДНОВРЕМЕННО (как и остальные омонимы свои пАры), но в реальности и в норме in vivo, и учтя контекст нормальной мРНК, рибосома ВЫБИРАЕТ или ФАЛ, или ЛЕЙ. А в системе in vitro (как это показали отцы кода), при отсутствии контекста в poly U в синтезируемый пептид включаются и ФАЛ, и ЛЕЙ.
Вот с этим соглашусь. Вобще странно: я привела цитату прямо из статьи. Что можно было не понять? Написано, что две, причем дан комментарий, что это случай единичный (на тот момент). Предлагала статью скинуть. Странно.
Статью мне скидывать не надо Вика, я ее в свое время читал причем внимательно. Лучше объясните как вы можете быть согласны, с Гаряевым что "ПО ТАБЛИЦЕ КОДА UUU кодирует ФАЛ и ЛЕЙ ". Покажите мне эту таблицу.
странно, что сам вы, Петрович, даже не помните и не знаете о тех 1-2 исключениях, которые якобы дуют вам с паруса,
а ссылки просит
но не читает
Science. 2009 Jan 9;323(5911):259-61. doi: 10.1126/science.1164748.
Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon.
Turanov AA1, Lobanov AV, Fomenko DE, Morrison HG, Sogin ML, Klobutcher LA, Hatfield DL, Gladyshev VN.
Author information
Abstract
Strict one-to-one correspondence between codons and amino acids is thought to be an essential feature of the genetic code. However, we report that one codon can code for two different amino acids with the choice of the inserted amino acid determined by a specific 3' untranslated region structure and location of the dual-function codon within the messenger RNA (mRNA). We found that the codon UGA specifies insertion of selenocysteine and cysteine in the ciliate Euplotes crassus, that the dual use of this codon can occur even within the same gene, and that the structural arrangements of Euplotes mRNA preserve location-dependent dual function of UGA when expressed in mammalian cells. Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
PMID:
19131629
[PubMed - indexed for MEDLINE]
PMCID:
PMC3088105
Free PMC Article
во во карасиус этот, но не он один, там исключения у примитивных частые, я писал уже.
Вот вот. А дальше пойдут доказательства по всем 32 кодонам-омонимам. А уж когда осмелятся коллинеарности проверить хотя бы на паре-тройке белков и их мРНК - совсем интересно будет.
Давайте зафиксируем вашу позицию. Если я вам приведу последовательности десятков белков, которые согласуются с геномной последовательностью, то вы согласны признать себя неправым?
Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
Вот вот. А дальше пойдут доказательства по всем 32 кодонам-омонимам. А уж когда осмелятся коллинеарности проверить хотя бы на паре-тройке белков и их мРНК - совсем интересно будет.
а их никогда и никто не проверял? бл Петрович, ты ваще в лабах бывал? исключительный бл.
Давайте зафиксируем вашу позицию. Если я вам приведу последовательности десятков белков, которые согласуются с геномной последовательностью, то вы согласны признать себя неправым?
Валяйте. Только с точной разметкой - кодон-аминокислота (стоп позиция). И со ссылкой на источник. И желательно не короткие пептиды, а приличные белкИ.
Science. 2009 Jan 9;323(5911):259-61. doi: 10.1126/science.1164748.
Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon.
Turanov AA1, Lobanov AV, Fomenko DE, Morrison HG, Sogin ML, Klobutcher LA, Hatfield DL, Gladyshev VN.
Author information
Abstract
Strict one-to-one correspondence between codons and amino acids is thought to be an essential feature of the genetic code. However, we report that one codon can code for two different amino acids with the choice of the inserted amino acid determined by a specific 3' untranslated region structure and location of the dual-function codon within the messenger RNA (mRNA). We found that the codon UGA specifies insertion of selenocysteine and cysteine in the ciliate Euplotes crassus, that the dual use of this codon can occur even within the same gene, and that the structural arrangements of Euplotes mRNA preserve location-dependent dual function of UGA when expressed in mammalian cells. Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
PMID:
19131629
[PubMed - indexed for MEDLINE]
PMCID:
PMC3088105
Free PMC Article
Провидец... Вы про эту статью Олега с исключениями кода мне говорили...?
исходя из его толкования масс-спектров пептидов из 7-ми кодонов сомнений на этот счёт вряд ли осталось , но как модератор я прошу держать всё-таки себя в руках и НЕ наезжать, а то потеряем ценного и упорного собеседника
про эту статью Гладышева я ну минимум раз пять ссылался тут..
= для РР - не стоит напрягаться - эффект будет такой же
Да не Олег... я хочу вообще понять кодировку и на примерах исключений как и посоветовал Провидец, понять проще... буду со своим переводчикам пытаться вникнуть, спец. литературу переводит правда полным идиотизмом порой...
