Ключевое слово
22 | 04 | 2019
Новости Библиотеки
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 09 Янв 2010 23:11 #1

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36225
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
Продолжаем: мРНК (иРНК по Петру), кроме кодирующих белки генов, что еще тащит с собой?

Отредактировано Хайдук (2010-01-10 03:55:32)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 00:26 #2

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36225
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
ППГ написал(а):
С комплексом все известно, по крайней мере, на сегодняшний день. Но без главного - как на самом деле эта сложнейшая работа регулируется. Помню, даже А.С.Спирин - главный рибосомщик СССР, как-то по ЦТ начал было говорить о разумном чуде супер регуляции в синтезе белков, так его быстро урезали. Описательная часть довольно полная, а вот причинно-регуляторная... Теперь о том, что тащит иРНК. Всё то же - информацию о последовательностях аминокислот в белках. И вопрос всё тот же - как решается проблема двусмысленного кодирования при встрече рибосомы с кодоном-омонимом.
Супер-причинно-регуляторная часть всегда неизвестна, Петр, это тривиально, ибо та всегда заключается в том, о чем не знаем, а мы не знать будем всегда
. Подозреваю, что мРНК тащит и что-то еще, а не только гены, кодирующие аминокислоты. Выбор кои гены включать или выключать далеко не обязан происходить согласно Вашей вычурной и весьма сомнительной физически схеме волнового генома, а вполне может направляться разумным чудом биохимии и статистической физики РНК-белковых комплексов


Отредактировано Хайдук (2010-01-10 05:42:17)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 05:44 #3

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Доцент
  • Posts: 13716
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
mittelspiel написал(а):
«…по поводу запутанных электронов я отвечал limarodessa, который предположил их на роль волнового поля…»
Ничё я не предлагал. Чегой-то такого не припомню.
Вообще абстрактные словосочетания типа «волновое поле» не в моем лексиконе. Я всего то только предложил обратить внимание на работы этих товарищей:

Bieberich Erhard. Probing quantum coherence in a biological system by means of DNA amplification. // Biosystems.- 2000. – Volume 57, Issue 2. – pp. 109-124.

Cooper W. Grant. Necessity of Quantum Coherence to Account for the Spectrum of Time-Dependent Mutations Exhibited by Bacteriophage T4. - www.springerlink.com/content/k548422512457312/

Dipankar Home and Rajagopal Chattopadhyaya DNA Molecular Cousin of Schrdinger's Cat: A Curious Example of Quantum Measurement prl.aps.org/abstract/PRL/v76/i16/p2836_1

Dipankar Home and Rajagopal Chattopadhyaya Determination of When an Outcome is Actualised in a Quantum Measurement using DNA - Photolyase System
arxiv.org/abs/quant-ph/9903036


Karafyllidis Ioannis G. Quantum Mechanical Model for InformationTransfer from DNA to Protein. - arxiv.org/ftp/arxiv/papers/0801/0801.2882.pdf

Mayburov S. Quantum Effects and Genetic Code: Dynamics and Information Transfer in DNA Replication. - arxiv.org/ftp/q-bio/papers/0611/0611009.pdf

McFadden Johnjoe. A quantum mechanical model of adaptive mutation./ Johnjoe McFadden and Jim Al-Khalili.// Biosystems. – 1999. – Volume 50, Issue 3, June. – Pages 203-211.

Mirzaee, M.; Chian, M.F. DNA and quantum theory. // Quantum, Nano, and Micro Technologies. – 2007. - Volume , Issue , 2-6. - Page(s):4 – 4.

Nelayev Vladislav V., Dovzhik Krishna N., Lyskouski Viacheslav. Quantum Effects in Biomolecular Structures. - www.ipme.ru/e-journals/RAMS/no_12009/nelayev.pdf

Ogryzko Vasily V. A quantum-theoretical approach the phenomenon of directed mutations in bacteria. - arxiv.org/ftp/q-bio/papers/0701/0701050.pdf

Ogryzko Vasily V. Erwin Schroedinger, Francis Crick and epigenetic stability. - www.biology-direct.com/content/3/1/15

Ogryzko Vasily V. On two quantum approaches to adaptive mutations in bacteria. - arxiv.org/ftp/arxiv/papers/0805/0805.4316.pdf

Ogryzko Vasily V. Origin of adaptive mutants: a quantum measurement ? -
arxiv.org/ftp/arxiv/papers/0704/0704.0034.pdf

Ogryzko Vasily V. Quantum approach to adaptive mutations. Didactic introduction. - arxiv.org/ftp/arxiv/papers/0802/0802.2271.pdf

Ogryzko Vasily V. Quantum information processing at the cellular level. Euclidean approach. -
arxiv.org/abs/0906.4279

Patel Apoorva. Quantum Algorithms and the Genetic Code. - xxx.lanl.gov/abs/quant-ph/0002037

Patel Apoorva. Testing quantum dynamics in genetic information processing. - xxx.lanl.gov/PS_cache/quant-ph/pdf/0102/0102034v2.pdf

Patel Apoorva. Why genetic information processing could have a quantum basis. - xxx.lanl.gov/PS_cache/quant-ph/pdf/0105/0105001v2.pdf

Sugawara Hirotaka. Quantum Theory of DNA. - ptp.ipap.jp/link?PTPS/164/17/

York D. M., Lee, T. S. and Yang W. Quantum mechanical treatment of biological macromolecules in solution using linear-scaling electronics structuremethods. // Physical Review – 1998. – vol. 80. – pp. 5011-5014.

York Darrin M., Khandogin Jana. Quantum descriptors for biological macromolecules from linear-scaling electronic structure methods. - cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=16006968


А также:

An algorithm for the study of DNA sequence evolution based on the genetic code
Biosystems
Volume 77, Issues 1-3, November 2004, Pages 11-23
G. Ch. Sirakoulis, I. Karafyllidis, R. Sandaltzopoulos, Ph. Tsalides and A. Thanailakis

Comment on Book Review of `Quantum Evolution' (Johnjoe McFadden) by Mathew J. Donald
Authors: Johnjoe McFadden, Jim Al-Khalili
arxiv.org/abs/quant-ph/0110083

Отредактировано limarodessa (2010-01-22 07:54:44)
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Last Edit: 21 Дек 2018 07:30 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 06:23 #4

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7026
  • Thank you received: 24
  • Karma: 6
ППГ написал(а):
Поэтому - повторяю, для этой тройки (mittelspiel, чайник, paulita) организовть отдельную тему по критике ППГ.
mittelspiel написал(а):
Вот как за свой сайт вы платите деньги - и делайте там что хотите - соответственно он и рассматривается как рекламный а не как научный.
Есть такой сайт у Петра Петровича и Михаила Баранова www.newsample.com/01/index.html

Как раз там вы можете приобрести знаменитые CD:
В экспериментальной поставке находятся четыре звуковых файла. В файле :№ 1 записан голографический слепок крови (матрица коррекции) донора женщины возраст 21 год групп крови 3+ уровень интеллекта IQ выше 170 (тест Айзенка) кровь взята от предельно насытившегося здорового донора через 30 минут после принятия пищи. В файле № 3 присутствует голографический образ крови для стимуляции стволовых клеток (кровь из плаценты). Файлы предназначены для индивидуального прослушивания, и не являются отменой врачебно-медикаментозных вмешательств, назначенных для реципиента (для слушающего). Все доноры здоровые.

Файл № 1а предназначен для стимуляции организма (в том числе и улучшения иммунного отклика), создания ощущения «сытости», для снижения аномально высокой потребности в пище и связанной с ней ожирением, вариант для женской половины человечества.

Файл № 1б предназначен для стимуляции организма (в том числе и улучшения иммунного отклика), создания ощущения «сытости», для снижения аномально высокой потребности в пище и связанной с ней ожирением, вариант для мужской половины человечества.

Файл № 2 предназначен для стимуляции эндорфинов.

Файл № 3 предназначен для активации стволовых клеток в отношении дополняющего гемопоэза
Пожалуйста помогите Алисе, жертве опытов Петра Петровича Гаряева: vk.com/id11904625
Last Edit: 27 Апр 2015 16:22 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 06:49 #5

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Доцент
  • Posts: 13716
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
What the liar paradox can reveal about the quantum logical structure of our minds
Authors: Erhard Bieberich

arxiv.org/abs/quant-ph/0101062

In human consciousness perceptions are distinct or atomistic events despite being perceived by an apparently undivided inner observer. This paper applies both classical (Boolean) and quantum logic to analysis of the Liar paradox which is taken as a typical example of a self-referential negation in the perception space of an undivided observer. The conception of self-referential paradoxes is a unique ability of the human mind still lacking an explanation on the basis of logic. It will be shown that both classical and quantum logics fail to resolve the paradox because of the particle-like (atomistic) nature of physical events in the moments of perception. I suggest a physical mechanism that can deal with our experience of self-referential paradox. Because it is also shown that this cannot be achieved by any previously suggested classical or quantum mechanical operation, the newly proposed mechanism provides a better model than others for an important aspect of the structure of our minds.
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:23 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 06:50 #6

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Доцент
  • Posts: 13716
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
Non-local quantum evolution of entangled ensemble states in neural nets and its significance for brain function and a theory of consciousness
Authors: Erhard Bieberich
arxiv.org/abs/quant-ph/9906011
Abstract: Current quantum theories of consciousness suggest a configuration space of an entangled ensemble state as global work space for conscious experience. This study will describe a procedure for adjustment of the singlet evolution of a quantum computation to a classical signal input by action potentials. The computational output of an entangled state in a single neuron will be selected in a network environment by survival of the fittest coupling with other neurons. Darwinian evolution of this coupling will result in a binding of action potentials to a convoluted orbit of phase-locked oscillations with harmonic, m-adic, or fractal periodicity. Progressive integration of signal inputs will evolve a present memory space independent from the history of construction. Implications for mental processes, e.g., associative memory, creativity, and consciousness will be discussed. A model for the generation of quantum coherence in a single neuron will be suggested.
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:23 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:14 #7

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Доцент
  • Posts: 13716
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
Петрович. На этого дядю, полагаю, следует обратить этэншион. Он одновременно занимается квантовой запутанностью в ДНК и детерминацией сознания квантовыми эффектами. www.mcg.edu/institutes/immag/Bieberich/homepage.htm
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:23 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:17 #8

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
mittelspiel: И перестаньте употреблять ошибочно термин иРНК. Вы должны говорить мРНК если имеете в виду матричную РНК. А иРНК означает совсем другое (интерферирующая РНК).
ППГ: надо бы в среднюю школу г-ну mittelspiel-ю dic.academic.ru/dic.nsf/medic2/40900
Новоделом пользуйтесь лично для еще большей путаницы в голове. Сочувствую, но ничем помочь не могу. Путаница - ваш выбор. Вежливо предлагаю - смените, пожалуйста, тон. Это с женой ТАК можете разговаривать, если таковая имеется.

Отредактировано ППГ (2010-01-10 11:19:28)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:23 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:22 #9

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77741
  • Thank you received: 1028
  • Karma: 81
ППГ написал(а):
Проблема в нарастании тенденции к превращению темы (усилиями трех) в подобие этого molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=362889
Так и будет.
Отнюдь.

ППГ написал(а):
Поэтому - повторяю, для этой тройки (mittelspiel, чайник, paulita) организовть отдельную тему по критике ППГ. Ежели указанные граждане будут соблюдать правила научной этики, то, думаю, никто не против, включая меня. Пусть себе возражают и критикуют в рамках приличий. Прекрасная возможность донести до биологов идеи лингвистико-волновой генетики.
Пока так и происходит.
Ежели и будут посты, нарушающие правила, то для этого есть соответствующие места

например
->Книга флуда и оффтопа и
->Предбанник
Каждому - своё.
Last Edit: 21 Дек 2018 07:28 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:32 #10

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
mittelspiel: Эти 95% ДНК представляют собой следующее:
1) гены, которые кодируют не белки, а микроРНК (их очень много);
2) регуляторные сайты, такие как промотеры и энхенсеры, которые связывают транскрипционные факторы и другие белки хроматина (именно ими осущетвляется включние/выключение генов);
3) сигналы, необходимые для упорядоченной компактизации ДНК в хроматине;
3а) для упорядоченной расстановки нуклеосом;
3б) для создания специальных участков посередине (центромера) и в конце хромосомы (теломера); Эти участки довольно длинные, они ничего не кодируют но очень важны для физического функционирования хромосомы.
4) инородные включения, доставшиеся от вирусов, роль которых не ясна;
5) и многое другое, что я сейчас перечислить не могу. Надеюсь, того что я уже перечислил достаточно

ППГ: уже привычные искажения. Во-первых, в нашем геноме почти 99% некодирующей ДНК, т.е. она не кодирует ни белки, ни РНК. Во-вторых, эти 99% и есть то самое многое другое, функции которого г-н mittelspiel, естественно, перечислить не может, поскольку не понимает и знать не хочет. Но это его личная проблема.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:40 #11

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77741
  • Thank you received: 1028
  • Karma: 81
Петр, полагаю будет удобнее и Вам и читателям, если Вы воспользуетесь инструкцией по цитированию
quantoforum.ru/about Вопросы и ответы по форуму
Каждому - своё.
Last Edit: 27 Апр 2015 16:24 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 07:47 #12

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
ППГ: Можно считывать не только ленту ДНК, но и ее жк топологии, частным случаем которых выступает голограмма.

Хайдук: В чем может состоять функциональное предназначение считывать топологию и голограмму ДНК?

ППГ: Функциональное назначение этого - задать 4D вектора для развивающегося эмбриона и взрослого организма, чего не дает классические генетика и эмбриология, вводя псевдо объяснения в виде градиентов морфогенов Вольперта или морфогенетических полей. Ни то, ни другое не даёт ни грана информации о 4D структуре биосистем. Подробности в монографии 3.

Хайдук: Проще всего предположить, что разное энзимное и РНК окружение (контекст) считывает разные участки ДНК ленты и выпускает разные белки

ППГ: Это, извините, набор слов, не имеющих смысла. Если есть, поясните, пожалуйста.

Хайдук: Хроматин, регуляторные белки и т.д. определяют сколько и какие белки синтезировать рибосомам из предложенных ДНК или мРНК, то бишь хроматин с ковалентными маркерами (по Миттельшпилю) и белки-энзимы включают и выключают разные гены из одного и того же набора генов.

ППГ: Это уже трюизмы и с этим никто не спорит. Но я толкую о другом - о 4D кодировании и о двукратной синонимо-омонимической вырожденности белкового кода. Оппоненты используют известный прием нечестного ведения дискуссии, незаметно меняя её тему на известные вещи, не имеющие прямого отношения к теме реальной.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 08:00 #13

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Хайдук: Видимо, тут слишком много путей, зависимостей и неизвестного. Как мог Петр додуматься до такой упрощающей и фактически ничего не объясняющей схемы как глобального волнового генома, которому негде прятаться?

ППГ: К сожалению, ВАМ и расстрельной тройке он ничего не объясняет. Но раз вам уже все ясно, то ответте на простые вопросы, что стоят перед генетикой - где и как закодировна 4D структура биосистем в хромосомах? Как на самом деле происходит выбор аминокислот и стопов при биосинтезе белков при встрече рибосомы с НЕ СИНОНИМИЧЕСКИМИ кодонами?
ЛИНГВИСТИКО-ВОЛНОВОЙ геном спрятан в а) в последовательностях нуклеотидов/аминокислот иРНК/белков, б) в 99% некодирующей ДНК хромосом.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 08:17 #14

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7026
  • Thank you received: 24
  • Karma: 6
ППГ написал(а):
ППГ: К сожалению, ВАМ и расстрельной тройке он ничего не объясняет.
А этих куда?

Сергей Кузнецов к.б.н. (генетика, генетика развития, молекулярная биология.). Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Томашевский Андрей к.б.н. ( биохимия, биофизика), Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Тикунов Юрий, кбн, Университет Вагенингена, Нидерланды
Акопова Ирина, кмн, Университет Северного Техаса, Форт Уорт, Техас, США
Зеленская Ольга Борисовна, к.б.н., Lady Davis Inst., Монтреаль
Волков Вадим, кбн, Медицинский факультет Университета Ньюкасл-апон-Тайн, Великобритания
Баев Денис, к.ф.-м.н.(биофизика) Исследовательский центр Сан Раффаэле, Милан, Италия
Перцев Александр, к.б.н., Пенсильванский колледж оптиметрии, Елкинс Парк, Пенсильвания, США.
Бакулина Анастасия, ГНЦ ВБ Вектор, Кольцово
Афанасьев Максим Владимирович м.н.с. НИИ Физико-Химической медицины Росздрава, г.Москва, н.с РОНЦ им.Блохина, НИИ Экспериментальной Диагностики и Терапии Опухолей, г.Москва
Петр Махов к.м.н. Fox Chase Cancer Center Филадельфия
Олеся Букач, к.б.н. каф. биохимии Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова
Пожалуйста помогите Алисе, жертве опытов Петра Петровича Гаряева: vk.com/id11904625

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:22 #15

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
Во-первых, в нашем геноме почти 99% некодирующей ДНК, т.е. она не кодирует ни белки, ни РНК. Во-вторых, эти 99% и есть то самое многое другое, функции которого г-н mittelspiel, естественно, перечислить не может, поскольку не понимает и знать не хочет. Но это его личная проблема.
По-первых, не 99%, а все-таки именно 95% как я сказал. en.wikipedia.org/wiki/Junk_DNA
Во-вторых, фунуции их я перечислил:
1) гены, которые кодируют не белки, а микроРНК (их очень много);
2) регуляторные сайты, такие как промотеры и энхенсеры, которые связывают транскрипционные факторы и другие белки хроматина (именно ими осущетвляется включние/выключение генов);
3) сигналы, необходимые для упорядоченной компактизации ДНК в хроматине;
3а) для упорядоченной расстановки нуклеосом;
3б) для создания специальных участков посередине (центромера) и в конце хромосомы (теломера); Эти участки довольно длинные, они ничего не кодируют но очень важны для физического функционирования хромосомы.
4) инородные включения, доставшиеся от вирусов, роль которых не ясна;
5) интроны белковых и микроРНКовых генов (вариабельные части, которые нужны для сплайсинга мРНК, и удаляются на стадии трансляции);
6) и многое другое. Надеюсь, того что я уже перечислил достаточно

Отредактировано mittelspiel (2010-01-10 13:44:44)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:24 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:24 #16

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
ЛИНГВИСТИКО-ВОЛНОВОЙ геном спрятан в а) в последовательностях нуклеотидов/аминокислот иРНК/белков, б) в некодирующей ДНК хромосом.
А чем, простите, в такой формулировке, это отличается от классической генетики?

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:35 #17

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
limarodessa написал(а):
mittelspiel написал(а):

«…по поводу запутанных электронов я отвечал limarodessa, который предположил их на роль волнового поля…»

Ничё я не предлагал. Чегой-то такого не припомню. Вообще абстрактные словосочетания типа «волновое поле» не в моем лексиконе.
Как скажете
Значит одной гипотезой меньше.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:38 #18

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
PauLita написал(а):
А этих куда?
Сергей Кузнецов к.б.н. (генетика, генетика развития, молекулярная биология.). Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Томашевский Андрей к.б.н. ( биохимия, биофизика), Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Тикунов Юрий, кбн, Университет Вагенингена, Нидерланды
Акопова Ирина, кмн, Университет Северного Техаса, Форт Уорт, Техас, США
Зеленская Ольга Борисовна, к.б.н., Lady Davis Inst., Монтреаль
Волков Вадим, кбн, Медицинский факультет Университета Ньюкасл-апон-Тайн, Великобритания
Баев Денис, к.ф.-м.н.(биофизика) Исследовательский центр Сан Раффаэле, Милан, Италия
Перцев Александр, к.б.н., Пенсильванский колледж оптиметрии, Елкинс Парк, Пенсильвания, США.
Бакулина Анастасия, ГНЦ ВБ Вектор, Кольцово
Афанасьев Максим Владимирович м.н.с. НИИ Физико-Химической медицины Росздрава, г.Москва, н.с РОНЦ им.Блохина, НИИ Экспериментальной Диагностики и Терапии Опухолей, г.Москва
Петр Махов к.м.н. Fox Chase Cancer Center Филадельфия
Олеся Букач, к.б.н. каф. биохимии Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова
А туда же, куда и вас, к тем, кто потом поймет. А нет - их проблема.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:45 #19

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
PauLita написал(а): А этих куда?
Сергей Кузнецов к.б.н. (генетика, генетика развития, молекулярная биология.). Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Томашевский Андрей к.б.н. ( биохимия, биофизика), Университет Вирджинии, Шарлотсвиль, США
Тикунов Юрий, кбн, Университет Вагенингена, Нидерланды
Акопова Ирина, кмн, Университет Северного Техаса, Форт Уорт, Техас, США
Зеленская Ольга Борисовна, к.б.н., Lady Davis Inst., Монтреаль
Волков Вадим, кбн, Медицинский факультет Университета Ньюкасл-апон-Тайн, Великобритания
Баев Денис, к.ф.-м.н.(биофизика) Исследовательский центр Сан Раффаэле, Милан, Италия
Перцев Александр, к.б.н., Пенсильванский колледж оптиметрии, Елкинс Парк, Пенсильвания, США.
Бакулина Анастасия, ГНЦ ВБ Вектор, Кольцово
Афанасьев Максим Владимирович м.н.с. НИИ Физико-Химической медицины Росздрава, г.Москва, н.с РОНЦ им.Блохина, НИИ Экспериментальной Диагностики и Терапии Опухолей, г.Москва
Петр Махов к.м.н. Fox Chase Cancer Center Филадельфия
Олеся Букач, к.б.н. каф. биохимии Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова
А туда же, куда и вас, к тем, кто потом поймет. А нет - их проблема.
А вы их к стенке поставьте, Лысенко вы наш

Они же диски продавать мешают!

Отредактировано mittelspiel (2010-01-10 14:52:44)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 09:54 #20

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7026
  • Thank you received: 24
  • Karma: 6
ППГ написал(а):
А туда же, куда и вас, к тем, кто потом поймет. А нет - их проблема.
Как видите наш полк не так уж мал, а вот несмотря на ваше заявление

ППГ написал(а):
Волновая генетика - идеальное средство прижать к ногтю общество, управлять им как стадом баранов. Вот для чего могут использоваться банки крови всех людей. И, не дай Бог, ЭЭГ людей.
в вашем стаде пока не густо.
Пожалуйста помогите Алисе, жертве опытов Петра Петровича Гаряева: vk.com/id11904625

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 10:51 #21

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
Супер-причинно-регуляторная часть всегда неизвестна, Петр, это тривиально, ибо та всегда заключается в том, о чем не знаем, а мы не знать будем всегда . Подозреваю, что мРНК тащит и что-то еще, а не только гены, кодирующие аминокислоты. Выбор кои гены включать или выключать далеко не обязан происходить согласно Вашей вычурной и весьма сомнительной физически схеме волнового генома, а вполне может направляться разумным чудом биохимии и статистической физики РНК-белковых комплексов
Вот вы и частично согласились с нашими идеями. Разумное чудо биохимии, генетики и мол. биологии - это именно то, что мы проводим в жизнь. Оно начинается с текстов ДНК, продолжается в прочтении и понимании их в рибосомном аппарате с выводом белковых текстов в многомерно-смысловое пространство организма. Особенно это ярко видно в работе нейронов головного мозга, где эта разумность приобретает высшие формы сознания-мышления, образующих идеального двойника человека. Идеального в смысле нашей ментально-духовной невидимой конструкции.

Поздравляю с вступлением в наши ряды! Вот так и надо завоевывать сторонников... По принципу: Дай им согрешить. Согрешат - поймут и придут к тебе.

Отредактировано ППГ (2010-01-10 15:02:05)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 10:54 #22

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
Вот вы и частично согласились с нашими идеями. Разумное чудо биохимии, генетики и мол. биологии - это именно то, что мы проводим в жизнь. Оно начинается с текстов ДНК, продолжается в прочтении и понимании их в рибосомном аппарате с выводом белковых текстов в многомерно-смысловое пространство организма. Особенно это ярко видно в работе нейронов головного мозга, где эта разумность приобретает высшие формы сознания-мышления, образующих идеального двойника человека. Идеального в смысле нашей ментально-духовной невидимой конструкции.

Поздравляю с всупление в наши ряды! Вот так и надо завоевывать сторонников...

Поздравляю, ув. Хайдук. Вас посчитали

Вот так он и Крика с Матвеевым в свои сторонники записал


Отредактировано mittelspiel (2010-01-10 15:03:15)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 10:57 #23

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
mittelspiel написал(а):
ППГ: ЛИНГВИСТИКО-ВОЛНОВОЙ геном спрятан в а) в последовательностях нуклеотидов/аминокислот иРНК/белков, б) в некодирующей ДНК хромосом.

mittelspiel: А чем, простите, в такой формулировке, это отличается от классической генетики?
ППГ: а мы и не рвемся отличаться, но развиваем классическую генетику. Лингвистико-Волновые Генетические представления (ЛВГ) скоро станут частью классики.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 10:59 #24

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
а мы и не рвемся отличаться, но развиваем классическую генетику.
То есть от классической генетики ППГ отличается только тем, что продает в обход налоговой фолшебные диски?


Отредактировано mittelspiel (2010-01-10 15:08:41)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 11:15 #25

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
ППГ написал(а):
mittelspiel: И перестаньте употреблять ошибочно термин иРНК. Вы должны говорить мРНК если имеете в виду матричную РНК. А иРНК означает совсем другое (интерферирующая РНК).
ППГ: надо бы в среднюю школу г-ну mittelspiel-ю dic.academic.ru/dic.nsf/medic2/40900
Видите ли, даже по указанной вами ссылке пишут, что иРНК следует называть мРНК. Кроме того, само понятие иРНК (информационная РНК) было придумано давно-давно, на заре молекулярной биологии, когда еще думали, что есть только матричная РНК, рибосомальная РНК и транспортная РНК. С тех пор много изменилось. Как теперь всем известно, эти три вида РНК, перечисленные выше, представляют мизер из всех видов РНК. Были открыты микроРНК, некодирующие РНК, и их многочисленные подвиды. В частности, термином иРНК стали называть интерферирующие РНК, и соответствено. мРНК и иРНК уже больше не синонимы, и для обозначения матричной РНК следует употреблять только слово мРНК. Так что в среднюю школу скорее Вам надо.

Отредактировано mittelspiel (2010-01-10 15:16:19)
Last Edit: 27 Апр 2015 16:24 by Vladimirovich.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 11:49 #26

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7026
  • Thank you received: 24
  • Karma: 6
ППГ написал(а):
Лингвистико-Волновые Генетические представления (ЛВГ) скоро станут частью классики.
Может и станут, но не Волновые:

д.б.н., проф. В.А. Ратнер (ИЦиГ) написал(а):
Формирование молекулярного представления о генах было развитием идей классической теории генов, устранением ряда ограничений, упрощений, ошибочных гипотез. При этом были использованы новые экспериментальные методы: молекулярная гибридизация ДНК? ДНК, ДНК ? РНК, радиоактивные метки, электрофорез, электронная микроскопия, методы массовой селекции редких событий и т.д. Существенное влияние на теорию генов оказал информационно-лингвистический и кибернетический подход: основные понятия молекулярной генетики были сформулированы в этих терминах – генетический контроль, генетическая информация, генетический код, опероны, информационная РНК, регуляторные гены и белки, и т.д.

В итоге представление о генах в молекулярной генетике существенно изменилось и расширилось:

1. Полностью отпала гипотеза белка как материального носителя генов. Во всех случаях эту роль выполняют ДНК или РНК.
2. Полностью отпала квантовая гипотеза пространственных изомеров макромолекул-генов Дельбрюка. Полностью подтвердилась “гипотеза последовательности” Крика, постулирующая, что генетическая информация в генах кодируется составом и порядком входящих мономеров. Аллели оказались изменениями кодирующего порядка мономеров.
3. Несмотря на открытие мощных факторов индукции мутаций, спонтанный мутагенез все же объясняется ошибками ферментов репликации. Высокая устойчивость генов к мутациям объясняется работой мощных систем репарации, основанных на дублировании генетической информации, а не структурными особенностями двухцепочечной ДНК.
4. Выявлены принципы молекулярной организации и ферментативные системы основных фундаментальных генетических процессов, обеспечивающих свойства и функции генов: репликацию, транскрипцию, трансляцию, мутирование и репарацию, рекомбинацию, сегрегацию и т.д.
5. Выявлены функциональные кодирующие единицы, отвечающие основным матричным генетическим процессам: кодоны и цистроны – трансляции, скриптоны – транскрипции, репликоны – репликации, группы сцепления – мейотической сегрегации. Выявлена пунктуация этих единиц и процессов – знаки начала и конца, которые обеспечивают их ограниченную локализацию и управление в геномах. Этим обеспечивается дискретность всех функциональных единиц во всех отношениях.
6. Решена проблема считывания и реализации генетической информации от генов до ближайших к ним молекулярных признаков: это механизмы транскрипции скриптонов, трансляции цистронов и специфического узнавания функциональных сайтов.
7. Решена проблема гомологичного синапсиса молекул ДНК и хромосом. Фактически синапсис сводится к комплементарности цепей ДНК и участию ферментов- синаптаз. Молекулярный механизм основан на принципах близкодействия макромолекул (комплементарность, физический контакт), а все предложенные механизмы дальнодействия отвергнуты.
8. Показано, что в основе теста комплементарности фактически лежит независимость трансляции отдельных цистронов и функционирования их белковых продуктов. Вместе с тем, тест комплементарности имеет явные ограничения и действует не всегда. Он выявляет функциональные единицы не ниже цистронов.
9. С операциональной точки зрения представление о цистронах наиболее близко к классическому представлению о генах. Исторически на первом этапе молекулярной генетики классическое нестрогое представление о системах ген – признак очень сильно сузилось до принципа “один ген – один фермент”. Понятие “локус”, вместо точки на генетической карте, стало означать “непрерывный участок генома”. Молекулярный размер цистрона оценен в 102- 103 н.п., т.е. разнообразие возможных мутаций очень велико. Последовательность цистрона колинеарна последовательности кодируемого белка. В связи с этим уточнилось понятие аллелизма.
10. Однако, с развитием молекулярно-генетической и биохимической техники представление о системах ген-признак снова быстро расширилось, охватив самые разнообразные генетические структуры и признаки – биохимические, морфологические, функциональные, транспортные, защитные, регуляторные и др. В результате оказалось, что цис-транс-тест имеет дело лишь с ограниченным классом функций и функциональных единиц (с цистронами), которые заведомо не исчерпывают смысловой, кодирующей части генома. Скриптоны т-РНК и р-РНК кодируют только РНК, вообще не кодируют белков, но косвенно участвуют в их синтезе. Знаки пунктуации и управления вообще ничего не синтезируют, но при помощи порядка мономеров кодируют функции специфического опознания регуляторных белков. Тем не менее, все эти единицы локализованы в геномах, реплицируются, рекомбинируют, мутируют, кодируют наследуемые функции наравне с цистронами. Их следует включить в представление о генах.
11. В геномах функциональные единицы всех типов и разделяющие их спейсеры построены из одинакового генетического материала: мономеров ДНК или РНК. Значит, гены являются не физическими, а информационными единицами. В этом смысле они напоминают лингвистические единицы информации в тестах естественных языков. Сравнение их свойств показывает, что кодоны более всего напоминают трехбуквенные слова, цистроны – предложения, скриптоны – абзацы текста, а репликоны – единицы воспроизведения. Смысл закодированной информации – это функции и свойства соответствующих продуктов структурных генов или самих функциональных сайтов генома.
12. Таким образом, информационно-лингвистический подход оказался очень продуктивным для понимания природы генов. В рамках этого подхода понятие “ген” ближе всего к понятию “значащая лингвистическая конструкция”, которое охватывает и слог, и слово, и предложение, и абзац, и печатный лист, и т.д. Это групповое понятие, необходимое как в теоретическом, так и в эвристическом отношении. Экспериментатор-генетик длительное время не знает, какова истинная природа локуса, с которым он работает. В этой ситуации нужен групповой термин, охватывающий широкий круг возможных функциональных единиц.
Пожалуйста помогите Алисе, жертве опытов Петра Петровича Гаряева: vk.com/id11904625

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 12:20 #27

  • mishabara
  • mishabara's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 1177
  • Thank you received: 1
  • Karma: 0
На опус 96 Заседание научно политического парткома продолжается .... Тезисы очередного доклада на очередном сьезде выставлены ... Дело за малым ...
Дело в том, что тут обсуждается достаточно узкая, но внушительная часть, с попыткой обьяснения конкретных опытов ... и не более того...

Отредактировано mishabara (2010-01-10 16:48:32)

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 12:30 #28

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
mishabara написал(а):
На опус 96 Заседание научно политического парткома продолжается .... Тезисы очередного доклада на очередном сьезде выставлены ... Дело за малым ...
А в рецензируемых журналах ППГ тоже партком мешает печататься или просто низкий уровень работ ППГ? Опубликуйте хоть одну статью в Genome Research или Nucleic Acids Research, тогда и поговорим. Не хотите по-научному в научных журналах - получайте критику на форумах, как сами хотели.

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 12:48 #29

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7026
  • Thank you received: 24
  • Karma: 6
mittelspiel написал(а):
Опубликуйте хоть одну статью в Genome Research или Nucleic Acids Research, тогда и поговорим.
Да кто их туда примет - с такими то ляпсусами:


Пожалуйста помогите Алисе, жертве опытов Петра Петровича Гаряева: vk.com/id11904625

Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём. (№3) 10 Янв 2010 12:53 #30

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Доцент
  • Posts: 13716
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
mittelspiel написал(а):
А в рецензируемых журналах ППГ тоже партком мешает печататься или просто низкий уровень работ ППГ? Опубликуйте хоть одну статью в Genome Research или Nucleic Acids Research, тогда и поговорим.
Ну, я надеюсь, Вы и некоторые другие участники обсуждения выступите в качестве рецензентов. А за статьей дело не станет, уверен.

Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум