Сегодня ученые представили, по их словам, самую масштабную модель искусственного интеллекта (ИИ) для биологии.
Модель, обученная на 128 000 геномов, охватывающих древо жизни, от людей до одноклеточных бактерий и архей, может писать целые хромосомы и небольшие геномы с нуля. Она также может понимать существующую ДНК, включая трудно интерпретируемые «некодирующие» варианты генов, которые связаны с болезнями.
Evo-2, совместно разработанный исследователями из Института Arc в Пало-Альто, Калифорния, и производителем микросхем NVIDIA, доступен ученым через веб-интерфейсы или они могут загрузить его свободно распространяемый программный код, данные и другие параметры, необходимые для воспроизведения модели.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Март 2025 05:57 #572
ШАНХАЙ, 25 марта. /ТАСС/. Строительство крупного научного центра исследований клеточных линий человека началось в южном китайском городе Гуанчжоу. Как сообщила Китайская академия наук, комплекс оснастят технологиями искусственного интеллекта (ИИ), которые в цифровом виде будут отображать динамический процесс эволюции каждой клетки человеческого тела на протяжении всего ее жизненного цикла.
«Анализ клеточных линий рассматривается как ключ к тайнам развития и эволюции жизни, а также к управлению жизнедеятельностью человека», — говорится в сообщении академии наук.
Центр займется разработкой инновационных технологий. Он интегрирует в исследованиях передовые разработки, в частности искусственный интеллект, для создания цифровой модели клеточной линии. Научная работа сосредоточится вокруг трех направлений: развитие, болезнь и старение клеток.
........................
...................... news.mail.ru/society/65421834/
...ученые расчитали, что вероятность встретить пару «Г − Ц» в таутомерном состоянии при температуре 300 кельвин составляет примерно 0,17 процентов, что на четыре порядка больше классического значения. Другими словами, перенос протонов вполне может играть гораздо более важную роль в мутации ДНК, чем предполагалось до сих пор. Такая колоссальная разница заставит биологов по новому взглянуть на роль механизма мутаций, предложенного Уотсоном и Криком.
Физики проверили устойчивость эффекта к различным модификациям условий. Так, оказалось, что туннельная поправка остается существенной, даже если высота реакционного барьера вырастет в полтора раза. Кроме того, температурная зависимость туннельного эффекта оказалась чувствительной к изотопным изменениям, а именно к замене водорода на дейтерий.
жаль петрович не дожил, ато бы не стал мудроствовать со всем присущим ему юмором..
Знаковая структура жидкокристаллических топологий хромосомного континуума как система преобразования эндогенных полей организма, а также внешних по отношению к нему излучений должна быть шире и составлять некий языковый плюрализм, своего рода многомерное семантическое пространство, свойственное каждому генотипу
а просто бы почитал физику вечерком на диване без встроенной антенны на 7 витков.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
27 Нояб 2025 14:58 #574
Чернобыльский биолог, который больше пятнадцати лет живёт среди заброшенных деревень, заросших лесом и тишиной, как-то сказал на конференции в Праге фразу, после которой зал замер в тишине на несколько минут:
«Радиация оказалась добрее человека...»
Тишина была глубока, как Чернобыльский лес ночью. Потому что все знали: он не преувеличивает.
Тридцать девять лет прошло со дня катастрофы. И территория, которую мир считал обречённой на тысячелетие, превратилась в один из самых чистых и диких заповедников Европы. Там, где когда-то стояли бетонные блоки, сейчас прорастает жизнь — упрямая, мудрая и почти первозданная.
Популяция больших зверей увеличилась в семь раз.
Волки поселились в старых школах, уютно зажили под партами, где когда-то сидели дети.
Медведи вернулись сюда впервые за сто лет.
Рысь ходит по крышам домов, покрытых мхом.
Олени, лось, дикие кони Пржевальского бродят по улицам, которые до сих пор помнят человеческие голоса.
То, что мы называли мёртвой зоной, стало местом триумфа жизни.
Статистика, сухая и безэмоциональная, говорит простую вещь: отсутствие человека — лучшее условие для восстановления природы.
Но самое интересное — не только возврат. Это эволюция прямо на наших глазах.
Животные мутируют... не во вред, а во благо выживания.
Чернобыльские волки в шесть раз устойчивее к инфекциям. Их клетки способны самостоятельно восстанавливать ДНК после облучения.
Лягушки почернели — их кожа богата меланином, который впитывает излучение, как броня.
Собаки, живущие рядом с реактором, имеют более 200 уникальных генетических вариаций, не встречающихся нигде на планете. Некоторые учёные полагают, что эти мутации могут стать ключом к развитию противораковых и радиационных средств.
Даже птицы другие.
Их кровь содержит в десять раз больше антиоксидантов, чем обычная кровь. Они прочнее, размножаются быстрее и ещё громче поют. Орнитолог, изучивший этих птиц, сказал фразу, ставшую символом нового Чернобыля:
«Это не чудо — это биология, которая научилась не бояться».
И растения... Они просто нарушили правила.
Берёзы растут сквозь бетон, сосны пробиваются сквозь асфальт, а виноград сплетает старые антенны, превращая металл в живую рамку.
Возле реактора учёные нашли грибы, которые питаются радиацией. Они поглощают ионизирующее излучение и превращают её в энергию для роста. Это явление назвали радиотрофией — впервые в истории зафиксировано, как живое тело буквально «ест» радиацию.
А некоторые деревья в зоне растут в три раза быстрее, чем за её пределами.
Почвы содержат уникальные микроорганизмы, способные разлагать изотопы цезия и стронция. Природа, похоже, начала очищаться — без помощи, без технологии, без человека.
Чернобыль больше не является символом разрушения.
Он стал лабораторией будущего. Место, где биология пишет новый сценарий, — сценарий, где жизнь побеждает даже там, где мы думали, что всё умерло.
Там, среди руин, природа тихо говорит нам правду, которую мы не хотели слышать:
Ты не центр мира.
Ты всего лишь гость.
И, пожалуй, самое страшное открытие Чернобыля — не в радиации,
а в том, что мир прекрасно живёт без нас.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
01 Фев 2026 16:26 #575
В Японии найден новый гигантский вирус, чье поведение внутри клетки напоминает работу клеточного ядра. Это открытие поддерживает идею о том, что вирусы могли сыграть роль в появлении сложных клеток и многоклеточной жизни. Результаты исследования опубликованы в Journal of Virology (JVI).
Ушикувирус нашли в пресноводном пруду недалеко от Токио. Он заражает амеб и относится к гигантским вирусам — редкой группе, представители которой по размеру и сложности сопоставимы с бактериями. Такие вирусы обладают крупным геномом и способны формировать внутри клетки-хозяина собственные структуры для размножения.
Во время заражения ушикувирус разрушает оболочку ядра клетки-хозяина и создает так называемую вирусную фабрику — замкнутое пространство, где копируется вирусная ДНК и собираются новые частицы. По форме и функциям эта фабрика во многом напоминает клеточное ядро.
Клеточное ядро — это «командный центр» эукариотических клеток (к ним относятся растения, животные и человек), где хранится ДНК. У более простых организмов, таких как бактерии, ядерного аппарата нет. Появление ядра считается одним из ключевых шагов в эволюции сложной жизни, но до сих пор неясно, как именно оно возникло.
Существует гипотеза вирусного происхождения эукариогенеза, согласно которой ядро могло произойти от древнего ДНК-вируса. Предполагается, что такой вирус однажды проник в клетку-предка, не уничтожил ее, а со временем стал постоянной структурой, взяв на себя хранение и защиту генетического материала. Со временем эта структура могла превратиться в полноценное клеточное ядро.
Особенности ушикувируса — сочетание черт разных гигантских вирусов и способ взаимодействия с ядром клетки — дают новые подсказки в пользу этой идеи. По словам авторов, такие находки помогают реконструировать ранние этапы эволюции сложных клеток и лучше понять роль вирусов в истории жизни на Земле.
Геном ушикувируса насчитывает не менее 666 тысяч пар оснований и содержит 784 предполагаемых гена. Более половины из них не имеют известных аналогов, что указывает на большое число пока нераспознанных функций.
Международная группа ученых из Института Фрица Хабера, Лейпцигского университета и научных центров США впервые детально изучила, как именно происходит перенос протонов в молекулах фосфорной кислоты — ключевом компоненте биологических и энергетических систем.
Фосфорная кислота и ее производные играют центральную роль в живых организмах. Они входят в состав ДНК, РНК, клеточных мембран и АТФ — главной энергетической молекулы клетки. Кроме того, эти соединения обеспечивают эффективную передачу положительных зарядов (протонов), что важно не только для биологии, но и для современных технологий — например, для работы топливных элементов и аккумуляторов.
В отличие от обычного движения частиц, протоны в таких системах не перемещаются свободно, а «перепрыгивают» между молекулами по цепочке водородных связей. Этот механизм называют «протонным шаттлом».
Открытие помогает объяснить, почему фосфорная кислота обладает столь высокой протонной проводимостью — ее часто называют «природной протонной магистралью». Новые данные позволят усовершенствовать квантово-химические модели и разработать материалы с улучшенной протонной проводимостью для энергетики. Кроме того, исследование углубляет понимание фундаментальных процессов переноса заряда в живых организмах
так и знал, что без водородных связей ничего в биосистемах не происходит. включая и "волновые геномы" петровича. а ведь мог со своим неуемным мозгом накопать во много раз более интересное, чем диплом околодемика липовой околодемии в переходе и генератор волн в диване. жаль.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
16 Май 2026 05:07 #577
знакомьтесь (кто не знал), валерий фокин - химик, один из изобретателей реакции катализируемого азид-алкинового циклоприсоединения, а по сути - нового направления в билогии: клик-химии, которая отмечена нобелем
он родом из нижнего, там учился и вырос, но еще на 5 курсе уехал в пиндосию. ну и открыл эти важнейшие реакции, прорывно нашедшие применение во многих областях. сегодня без этого просто немыслима никакая билогия и генетика. правда работал он одновременно, независимо и совместно с другими учеными, дело о первенстве там путаное и темное. валерия, наряду с коллегами, как самых высоко цитируемых ученых в мире, уже давно номинировали на нобелевку, но в 2022 году ее получили только коллеги (датчанин мортен мельдаль, американцы каролин бертоцциа и знаменитый барри шарплесс (уже вторую) «за работы по развитию клик-химии и биоортогональной химии», а нашего фокина кинули.
вот тут анализ ситуации с недачей нобеля фокину (он ее заслуживал больше других) hij.ru/read/issues/2022/october/29754/
— Сегодня мой интерес все больше смещается в сторону понимания того, как работает мозг на молекулярном уровне. В частности, меня глубоко интересуют процессы нейротрансмиссии и роль эндоканнабиноидной системы как одного из ключевых регуляторов нейронной активности, пластичности и баланса в нервной системе.
Эндоканнабиноидная система уникальна тем, что она не просто передает сигнал, а тонко настраивает работу нейронных сетей — по сути, действует как «мастер-регулятор», согласующий возбуждение и торможение, память и адаптацию. Понимание того, как именно эта система работает на уровне отдельных молекул и рецепторов, открывает принципиально новые возможности как для фундаментальной нейронауки, так и для медицины.
В более широком смысле меня по-прежнему занимает вопрос, как химия может помочь нам увидеть сложные биологические процессы. В свое время химические инструменты позволили визуализировать ДНК, белки, клеточные структуры. Следующий шаг — научиться с молекулярной точностью наблюдать динамику нейронных процессов, лежащих в основе мышления, памяти и сознания.
В этом я вижу глубокую и красивую связь между химией и когнитивными науками. Создавая новые молекулярные метки и реакции, совместимые с живыми системами, мы постепенно приближаемся к возможности визуализировать не просто структуру, а функцию — своего рода «молекулярную кинематографию» работы мозга. Это не быстрый путь, но именно такие технологии со временем позволяют задавать вопросы, которые раньше казались философскими, а не научными.
выделенное чрезвычайно интересно, считаю, хотя и далеко еще до него.
в общем, я к чему? в среду, 20 мая валерий приезжает к нам в академ. где в нгу прочтет лекцию
Тема лекции:«От молекулы к человеку: природа научного открытия»
В начале XXI века органическая химия умела создавать всё более сложные молекулы, но ей не хватало простого и надёжного языка для их модульного соединения. Разные функциональные фрагменты можно было синтезировать по отдельности, однако их объединение часто требовало специальных условий, защитных групп и длительной оптимизации. Реакция CuAAC, разработанная Валерием Фокиным, стала ответом на этот вызов: она позволила быстро, избирательно и почти без побочных продуктов «сшивать» молекулярные блоки, в том числе в воде, превратив молекулярную сборку в стандартизируемый инструмент современной биомедицины.
Но эта история — и о том, как рождаются открытия. Универсальная технология выросла из момента неопределённости, когда учёный распознаёт простое в сложном. На лекции Валерий Фокин расскажет, что интуиция в науке — не противоположность рациональности, а концентрированный опыт, и что в эпоху вычислительных методов и искусственного интеллекта только человек способен изменить саму постановку вопроса. Путь «от молекулы к человеку» — это не только технологическая траектория, но и размышление о человеческой природе открытия.
я уже зарегился и собираюсь послушать очно. это вам не петрович с антеннами на 7 витков заговаривающий гены. а веть тоже мог, наверное, пользу принести.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
20 Май 2026 09:47 #579
только что с лекции валерия фокина.
очень интересный рассказ от первого лица об истории открытия важнейшей химической реакции с использованием металлоорганических молекул, давшей целое направление клик-химии (кстати, сам валерий объявил этот термин пустым и ничего не значащим, а придумал его тот самый шарплес, дважды получивший нобеля, коллега валерия, которому премия не досталась. ну вы поняли... ). ну и параллельно не только об этом открытии, но и о роли интуиции, как продукте опыта, в науке вообще. понятно, что его лекции уже были, можно в инете найти, но слушать вживую - это, конечно, энергетически совсем другое.
рассказывал об эффектах, которые позволяет наблюдать вживую его молекулярные шпионы, подсаженные с помощью воды и куска меди. даже в нейронах
о разработке аппарата, эффективно лечащего онкологию, в частности молочной железы. счет уже на миллионы - успехи не у всех, но есть.
ну и самое интересное-кухня открытия, когда на салфетках в ресторане и дневниках записывались сумасбродные идеи, а потом они превращались в настоящий клондайк. часть этого демонстрировалась. причем, с одной стороны, для демонстрации научного процесса, с другой (как я думаю) для демонстрации своего первичного вклада в разработку. чтобы никто не сомневался кто почем.
как он доказывал боссам важность своей работы
демонстрировал, как в то время оценивали эксперты его проект (не заснял экран, дословно не помню, но примерно - бред собачий).
поскольку в зале было много студентов (лекция в НГУ, напомню, была), то много вопросов и внимания было уделено ии. как я понял. пока валерий скептически относится к его возможностям в области открытий - разве что банальные статьи написать, заменив одни молекулы на подобные и получить публикацию, которую эксперты не поймают. но принципиально нового это не принесет. и главная проблема, как он видит, тут не в синтезе информации для каких-то новых парадигм или прорывных идеях, а в качестве информационной базе. правильно обучить сеть сегодня - проблема. откуда и где взять стопроцентно достоверную фактуру? в статьях, даже если их все впилить ии, половину составит или бред, или раздумья и непроверенные варианты, или подлог. в любом случае качество и достоверность информации сегодня не позволяют обучить нейронку настолько, чтобы она была способна на верный синтез. в противном случае цена ее продукции - пшик.
впрочем, это проблема известная, и он ее только подтвердил.
после окончания лекции мы небольшой разрозненной группой минут на 15 зажали чувака по частным вопросам, проблемам научных традиций и публикаций, когда акцент делается только на положительных моментах, а отрицательный результат (который не менее информативен и важен в науке) считается не достойным опубликования. да и не только в статьях так обстоит дело - все научные проекты и гранты заточены на показ положительного результата (не в смысле практической значимости, это понятно и так, а в смысле фундаментальной науки, проверок гипотез и пр...).
на фото он объясняет юным студенткам, которые подошли к нему и спросили - мы мол зачали научную ячейку революционную исследовательскую, хотим срочно почувствовать себя бомбометателями учеными, с чего посоветуете начать? я бы им ответил просто - бросайте бонбу это дело чем раньше, тем лучше)))), но валерий принялся любезно им объяснять, что лучше пойти в институт, благо в академе их навалом, и пристегнуться к чемунть под руководством когонть. потом те пригласили его на фотосессию в холл. и когда он по дороге на секунду остался без назойливых мух вокруг, я сам решил исполнить партию шмеля и спросил в лоб примерно так: вы деликатно не затронули тему нобелевской за это открытие клик-химии (хотя на одном слайде во время лекции он демонстрировал высказывания шарплеса о роли его, фокина - там однозначно было признание доминирующей роли валерия), но как вы сами относитесь к решению нобилистов, в чем вам видится причина вашего зажима комитетом? честно говоря, я думал, он или уйдет от ответа или смягчит градус. но он улыбнулся и отчетливо сзаявил - во-первых, людям свойственно ошибаться, и это был тот случай. а во-вторых, премию получают те, кто больше всего громко кричит и шибко машет. а когда я в ответ ему напомнил про высказывания шарплеса, он (опять с типично американской улыбкой, явно не новгородской закваски ) заявил - шарплесс по этой проблеме не сделал ничего! вообще. больше я его мучить не стал. и так все понятно. в целом. наверняка там куча других нюансов и политеса, но почему он должен их раскрывать какому-то дяде с базара?
весь этот проект (новый, ему всего пару лет), включающий науные гастроли с лекциями, называется премия вызов. fondvyzov.ru/
смысл простой - подаются заявки от ученых по 5 номинациям, включая опцию для иностранцев. газпром выделяет на это дело 65 млн, каждый номинант получает 13. ну и в качестве нагрузки к премии - цикл лекций по городам рф. москва. питер, н-ск, нн, томск. кратко об этих гастролях научных звезд на сайте. кстати, там уже есть новость про сегодняшнюю лекцию фокина: fondvyzov.ru/news/vyzov-v-novosibirske/
Австралийские ученые из лаборатории Cortical Labs обучили выращенные в лаборатории клетки человеческого мозга играть в легендарный шутер Doom. Исследователи соединили живую биологическую ткань со специальным кремниевым чипом CL1. Проект доказывает, что подобные гибридные системы способны адаптироваться к сложным стимулам в режиме реального времени и обучаться для выполнения конкретных задач.
Биологический компьютер содержит около 200 тысяч живых нейронов, полученных из стволовых клеток донорской крови. Ранее эта мини-культура успешно освоила простую аркаду Pong, где нужно двигать платформу для отбивания мяча. Теперь же ученые перешли к трехмерному виртуальному пространству.
Ученые обнаружили специфический белок, который мог сыграть решающую роль в этом этапе эволюции растений — и, как следствие, помог им в завоевании суши. Примечательно, что найден он во мхе Physcomitrium patens — любимом исследователями и потому изученном, казалось бы, вдоль и поперек. Статья об открытии вышла в New Phytologist.
Если взглянуть на современное дерево, его рост зависит от фундаментальных биологических механизмов, возникших на заре эволюции растений. К ним относятся способы деления клеток в разных направлениях, получение клетками энергии для роста и регуляция белков внутри клетки.
«Без способности к трехмерному росту ландшафт выглядел бы совсем иначе. Не было бы деревьев и кустарников таких, какими мы видим их сегодня. Жизнь на суше, скорее всего, оставалась бы гораздо более ограниченной», — полагает биохимик Томас Юэль Аммитсё из Копенгагенского университета, один из первых авторов.
Белок RAK1 представляет собой гибрид двух уже известных белков — киназы и ацетилтрансферазы (очередной пример «лени» эволюции — для нее проще комбинация имеющегося, нежели изобретение чего-то нового). Влияя на энергетический обмен клетки, он помогает ей делиться в нескольких направлениях, формируя почки и побеги.
Для проверки роли этого сигнального белка у части мха его удалили. «Мы увидели, что клетки мха без RAK1 делились неправильно и формировали дефектные почки. Это показывает, что RAK1 критически важен для того, чтобы мох мог эффективно расти», — подчеркивает другой первый автор Клоэ де Люксан-Эрнандес.
Мхи стали одними из самых первых наземных растений, появившихся на Земле. До сих пор обретение мхом способности к трехмерному росту объясняли регуляцией генов. Теперь выясняется, что RAK1 помогает координировать метаболический баланс, необходимый для трехмерного роста.
«Наши результаты говорят о том, что переход от плоского к трехмерному росту растений зависит не только от регуляции генов, но и от точного метаболического контроля во время деления стволовых клеток и формирования почек», — отмечает Родригес.
норвежцы просто не были знакомы с петровичем и его открытием. иначе они бы уже давно поняли, что командовать кому и куда расти необязательно экзотическим замшелым белкам, достаточно намотать на катушку семь витков барановской проволоки и подключить флягу буха фугу баха. и получи любой сфагнум. ну или показать фотографию болота.
Ethical, Legal, and Regulatory Issues Associated with Neural Chimeras and Organoids[ Click to expand ][ Click to hide ]
An ad hoc committee of the National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine will examine the scientific, ethical and regulatory issues associated with neural chimeras and neural organoid research. The committee will review the status of research, consider the benefits and risks of such research, discuss associated ethical issues, and consider what oversight mechanisms might be appropriate in this area. A final report providing the committee’s findings will be issued at the conclusion of the project and published by the National Academies Press.
An ad hoc committee of the National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine will examine the scientific, ethical and regulatory issues associated with neural chimeras and neural organoid research. The committee will review the status of research, consider the benefits and risks of such research, discuss associated ethical issues, and consider what oversight mechanisms might be appropriate in this area.
The committee will consider questions such as:
How would researchers define or identify enhanced or human awareness in a chimeric animal?
Do research animals with enhanced capabilities require different treatment compared to typical animal models? What are appropriate disposal mechanisms for such models?
What types of brain tissue are appropriate for use as neural organoids?
How large or complex would the ex vivo brain organoids need to be to attain enhanced or human awareness?
What kind of “humanized” brain, in size and structures, would be acceptable in a research animal?
Should patients give explicit consent for their cells to be used to create neural organoids?
What regulatory mechanisms relating to organoid and chimeric animal research are currently in place? Are there gaps in the current regulatory framework?
What regulatory mechanisms exist for similar research?
What further regulatory mechanisms might be appropriate?
Clusters of living brain cells are teaching scientists about diseases like autism. With a new finding, some experts wonder if these organoids may become too much like the real thing.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
02 Июль 2026 10:46 #584
Илон Маск захотел обзавестись ручным мамонтом.
На саммите Abundance360 Илон Маск с энтузиазмом рассказывал о желании завести миниатюрного мамонта. При этом ведущий Питер Диамандис пообещал пообщаться на эту тему с генеральным директором биотехнологической компании Colossal Biosciences, которая занимается проектами по возрождению вымерших видов животных.
Основанная в 2021 году предпринимателем Беном Ламмом и генетиком Джорджем Черчем, Colossal Biosciences специализируется на технологиях деэкстинкции и сохранения биоразнообразия. Компания редактирует ДНК азиатских слонов, чтобы наделить их характерными признаками шерстистых мамонтов, включая густую шерсть, устойчивость к холоду и изогнутые бивни.
По планам компании, первые гибридные детеныши могут появиться уже к 2028 году. Для этого ученые намерены отредактировать более 20 генов и использовать технологии экстракорпорального оплодотворения. По состоянию на начало 2025 года рыночная оценка Colossal Biosciences достигла 10,2 млрд долларов.
чем бы дитя... шерсть, бивни и устойчивость - это не мамонт, а беноммодифицированный мохнатый корпоративно оплодотворенный слон.
). ну и параллельно не только об этом открытии, но и о роли интуиции, как продукте опыта, в науке вообще. понятно, что его лекции уже были, можно в инете найти, но слушать вживую - это, конечно, энергетически совсем другое.
) заявил - шарплесс по этой проблеме не сделал ничего! вообще. больше я его мучить не стал. и так все понятно. в целом. наверняка там куча других нюансов и политеса, но почему он должен их раскрывать какому-то дяде с базара?
