Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Апр 2011 09:57 #214
Статью написали биоинформатики, они про биологию ничего не пишут естественно. Но само по себе существование микробных микросистем с устойчивым составом микробов говорит о том, что они естественно взаимодействуют. Как правило - химическим путем. Посмотрите в гугле bacterial quorum sensing
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Апр 2011 10:38 #216
limarodessa написал(а):
А не слишком ли много биоинформатиков (при отсутствии биологов) на одну статью ?
Почему при отсутствии, биологи там присутствуют, просто писали статью биоинформатики. Основная работа - биоинформатическая. Отсеквенировать всю ДНК что нашли и идентифицировать каким бактериям она принадлежит. И повторить такое для 22 пациентов. Это работа рутинная но довольно дорогая. Бюджет проекта ~10 миллионов евро примерно. На выходе одна статья. Но в Nature.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Апр 2011 11:31 #217
— Так вот, уважаемые студенты, алкоголь, содержащийся в одной кружке пива убивает 10 в 6 степени клеток головного мозга
— Профессор, а сколько всего клеток?
— 10 в 12 степени.
— Так что же, две кружки пива и все?
=============
Профессор-паразитолог, глядя в микроскоп:
- Что-то тебя зараза давно видно не было?
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Апр 2011 11:55 #218
mittelspiel написал(а):
Почему при отсутствии, биологи там присутствуют, просто писали статью биоинформатики. Основная работа - биоинформатическая. Отсеквенировать всю ДНК что нашли и идентифицировать каким бактериям она принадлежит. И повторить такое для 22 пациентов. Это работа рутинная но довольно дорогая. Бюджет проекта ~10 миллионов евро примерно. На выходе одна статья. Но в Nature.
Пригласили ветеринара, статистика и физика, чтобы каждий за
$100,000 в течении недели придумал способ для угадывания коня,
который победит на скачках.
Через неделю все трое приходят...
Ветеринар:
- Я разработал таблицу, по которой, зная физические данные
коней, можно будет предсказать победителя.
Комиссия:
- Очень полезная информация...
Статистик:
- Я построил регрессию, по которой, зная предыдушие забеги,
можно предсказать коня-победителя.
Комиссия:
- Очень полезная информация!
Физик:
- Мне нужно для работы еще два года и 1 млн. долларов -
но к настоящему моменту я построил модель для победы сферического коня в вакууме.
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
25 Апр 2011 13:52 #219
limarodessa написал(а):
Пригласили ветеринара, статистика и физика, чтобы каждий за
$100,000 в течении недели придумал способ для угадывания коня,
который победит на скачках.
Через неделю все трое приходят...
Ветеринар:
- Я разработал таблицу, по которой, зная физические данные
коней, можно будет предсказать победителя.
Комиссия:
- Очень полезная информация...
Статистик:
- Я построил регрессию, по которой, зная предыдушие забеги,
можно предсказать коня-победителя.
Комиссия:
- Очень полезная информация!
Физик:
- Мне нужно для работы еще два года и 1 млн. долларов -
но к настоящему моменту я построил модель для победы сферического коня в вакууме.
В данном случае речь идет о сотрудничестве статистика с ветеринаром. Они обрабатывают огромное количество информации, и на выходе показывают некие корреляции, кластеры, и.т.д. Физика в этой работе нет, поэтому нет моделирования и объяснения что именно происходит. Но современная биология в основном такая. Физические модели сферических коней в вакууме отошли на второй план под напором данных биоинформатики.
Крайне интересная лекция о том, как устроено наше поведение. Становится многое ясно о том, как мы мотивируем сами себя. Лекцию читает Дмитрий Шаменков – врач, директор Центра биомедицинских исследований НИИ Фармации 1-го Московского государственного медицинского университета им. И.М.Сеченова Минздравсоцразвития РФ.
...Пишу диссертацию. Для защиты диссертации необходимо написать несколько ВАК статей. Но так как я много работаю, то на написание статей времени совсем не остается. Может ли кто-нибудь помочь с написанием статей? Обо всем договоримся...
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
01 Июнь 2011 05:01 #225
PP написал(а):
И какие в наши времена расценки? Не проще ли сразу купить диссер?
Не ф эттом дело уфффашаемый... Просто люди всецело и самоотверженно заняты наукой и недосуг пиарить себя им всякими там формальными бубликациями заниматься...
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
04 Июнь 2011 08:19 #230
Китайские товарищи уже отсиквенировали и даже собрали версию генома кишечной палочки свирепствующей в европе. Данные можно загрузить вот ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/Ecoli_TY-2482 тут. Забавно, что немцы не стали сиквенировать геном сами, а попросили китайцев.
— Пролегомены науки, — говорю я. — Победа разума над сарсапариллой...
— О каких это параферналиях вы говорите, доктор? ...
— Я говорю о великой доктрине психического финансирования, о просвещенном методе подсознательного лечения абсурда и менингита внушением на расстоянии,...
— Я один из Единых Сенедрионов
Я — медиум, колоратурный гипнотизер...
председатель Уксусно-Горького общества ...
А в настоящее время я и сам негативно отношусь к этому направлению
On the basis of the first- and second-order Gompertzian kinetics it has been proved that the growth of the bacterial colony belongs to the class of quasi-quantum nonlocal coherent phenomena. The notion quasi-quantum refers to the possibility of application of the quantum language and formalism in description of macroscopic biological systems, e.g. organism, tumor, bacterial colony. The approach proposed reveals that the formation of the specific growth patterns during bacterial growth is a result of the nonlocal long-range cooperation between the microlevel - the individual bacterium and the macrolevel - the colony as a whole. Such nonlocal cooperative self-organization and intricate communication capabilities are observed during collective production of extracellular wetting fluid for movement on hard surfaces, long-range chemical signaling, e.g., quorum sensing, chemotactic signaling, collective activation and deactivation of genes, large-scale coherence in the bacterial swimming order. Those processes utilize the long-range communication and cooperation between microorganisms resulting in spatially coherent growth of the colony. An extension of the approach proposed to include von Bertalanffy model, which provides much accurate bacterial growth curve than the Gompertz function, is also presented
Молекулярная и клеточная биология, генетика, биология развития.
14 Июнь 2011 15:01 #237
Пока ППГ занят всякой фигней, люди обнаруживают интересные вещи. Оказывается РНК может серьезно отличаться от ДНК!
Widespread RNA and DNA Sequence Differences in the Human Transcriptomе
The transmission of information from DNA to RNA is a
critical process. We compared RNA sequences from
human B cells of 27 individuals to the corresponding DNA
sequences from the same individuals and uncovered more
than 10,000 exonic sites where the RNA sequences do not
match that of the DNA. All 12 possible categories of
discordances were observed. These differences were
nonrandom as many sites were found in multiple
individuals and in different cell types including primary
skin cells and brain tissues. Using mass spectrometry, we
detected peptides that are translated from the discordant
RNA sequences and thus do not correspond exactly to the
DNA sequences. These widespread RNA-DNA differences
in the human transcriptome provide a yet unexplored
aspect of genome variation.
Previous experiments have suggested that 3T3 cells were able to extend pseudopodia toward latex particles up to 60 m away from the cell body if the particles were irradiated by an infrared beam in the range of 700–900 nm [Albrecht-Buehler, 1991: J. Cell Biol. 114:493–502]. The present article reports that this response of cells to infrared light can be inhibited if the cell center is simultaneously irradiated with a beam of the same light. In marked contrast, the cells responded normally to the presence of infrared light scattering particles if the second beam irradiated other parts of the cell body. The results imply that the cellular mechanism of infrared detection is located at the cell center. The infrared sensing mechanism remains intact in enucleated cells and in cells which were incubated in monensin to vesiculate their Golgi apparatus and inhibit their Golgi functions. Accordingly, it is proposed that the centrosome which contains the centrioles is the only remaining candidate in the cell center for a cellular detection device for the direction of infrared signal sources. The results support an earlier suggestion that centrioles may be such detection devices [Albrecht-Buehler, 1981: Cell Motil.