Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 18:45 #633
Skype:
2012-01-16
[22:38:42] В: А как клиент узнает, что твои структуры точнее? И по чем бы ты хотел продавать свои структуры?
[22:43:40] Кушелев Александр Юрьевич: Очень просто. Он заказывает бесплатно несколько моделей для тех белков, за которые он уже заплатил по 10 килоевро. Далее смотрит на пикотехнологические модели и сравнивает с нанотехнологическими. Для некоторых белков бОльшая точность пикотехнологических моделей просто очевидна. Например, для гистонов, шаперонов, коллагена, тубулина, тропонина-Ц и многих других. Естественно, что часть клиентов будет сомневаться, часть откажется, а часть закажет уже за деньги. На первом этапе нам не нужно взвинчивать цены. Пусть клиенты распробуют пикотехнологию на вкус. А когда выстроится очередь, тогда уже будем поднимать цены, согласно законам рынка. Начинать надо с подарков
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:21 #635
Skype
2012-01-16
[23:09:32] В: market of protein structures набирай и ищи!
[23:19:51] Кушелев Александр Юрьевич: Надо попробовать. Правда, я английский практически не знаю. Тут нужен человек со знанием английского языка...
[23:21:02] Кушелев Александр Юрьевич: Набрал. protein structure находит, а market не находит...
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:30 #637
kushelev написал(а):
бОльшая точность пикотехнологических моделей просто очевидна
Аксиома проистекающая из названия. Осталось доказать соответствие колечковых построений реальным величинам.
kushelev написал(а):
часть клиентов будет сомневаться, часть откажется, а часть закажет уже за деньги
Если допустить, что куев доведёт алгоритм и софт до приемлемого качества и куемодели будут покупать, то тут же возникнет масса альтернативного софта. Благо горе-пикотехнолог везде разбросал описалово и даже исходники где то валяются.
Но таковы все изобредения пациента. Конечный продукт не важен, важны денежки спонсоров на неосуществимые прожекты.
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:42 #639
Если допустить, что куев доведёт алгоритм и софт до приемлемого качества и куемодели будут покупать, то тут же возникнет масса альтернативного софта. Благо горе-пикотехнолог везде разбросал описалово и даже исходники где то валяются.
Вы не учитываете известную истину. Развитие происходит по экспонетне, поэтому разработчика никто не может обогнать
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:46 #640
V: Начинать надо с подарков начинать надо не сподарков. на голодный желудок много не надаришь )
тут чт-то устойчиво-среднее должно быть
[23:45:31] Кушелев Александр Юрьевич: У любого продукта есть затратный период. Сначала раздают бесплатно попробовать, а потом набегает толпа, и возникает спрос, после чего устанавливают цены. Законы рынка однако...
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:48 #641
Ты эта... слыш куев... ты попробуй не просто market, а market of набрать! Неужели с тех пор как ты писал письмо английской королеве маргарет Тэтчер - ты так ничего и не вспомнил из школьного и институтского английского?
С другой стороны - я не понимаю чего именно ты мечташеь найти? Неужели твоей прямой извилине, резонирующей в пустом черепе, кажется что в интернете существует какой-то волшебный market на котором любой тунеядец может торговать protein structure? Очень, очень странные у тебя, куев, представления об интернете! Флудерастия мешает... Как тебе мерещатся слуды от летающих тарелок за твоим сараем на даче, точно так же тебе мерещятся какие-то market-ы в интернете...
Знашеь куев, я тебе открою одну тайну: в интернете можно запросто найти милую твоему сердцу порнуху. Или же тучу форумов, которые ты способен засрать по причине своего клинического тунеядства. Можно также лоха или лохушку какую найти и развести его через интернет - этому ты тоже, с грехом пополам, обучился. Но вот чего в интернете нет - так это market для protein structure. Потому что кроме тебя никому в голову не придет шарашиться там по сайтам и предлагать купить достоверную структуру белка. Или тебе кажется что ученые так же как и ты - просиживают на табуретках целые дни перед компьютером и весь рабочий день заняты только тем, как бы им найти тунеядца куева с его волшебной программой?
Так что придется тебе куев смириться с мыслью что наличие целой очереди заинтересованных в твоей волшебной программе людей - это всего-навсего плод твоей воспаленной фантазии, отягощенной болезненной реакцией на внешние раздражители в виде, к примеру, слова деньги...
Кушелев: Друзья, подскажите, о чём написано по-английски (в двух словах)
The Distribution is shepherding
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
, a repository of over 4 million small molecule structural coordinate files in PDB format, which is accessible by FOSS molecule viewer software that is provided by the Distro, such as PyMOL and RasMOL. over 50 million structures are in the pipe.
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
demonstrates the kind of great work that can be done in the scientific and education fields with GNU-Darwin OS and free and open source software. There are also some notes about the package set and Molecules machine. Molecules of the Day has an RSS News Feed
Некий Distribution (
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
), содержит структурные файлы с координатами атомов (в формате PDB) более 4 миллионов маленьких молекул и доступен программным обеспечением пользователей FOSS молекулы (?), которые обеспечены Distro (?), таким как вьюеры PyMOL и RasMOL.
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
приводит пример большой работы (более 50 миллионов структур), которая может быть сделана в научных и образовательных областях с помощью GNU-Darwin OS (?) и общедоступного программного обеспечения. У них есть служба рассылки новостей RSS.
Вопросы в скобках свидетельствуют о том, что я не знаю как расшифровать аббревиатуру.
Кушелев: Понятно. Они прелагают моделирование белковых структур. 50 миллионов - это как раз количество известных на сегодня белков, точнее нуклеотидных, а следовательно и аминокислотных последовательностей.
Теперь нужно понять, как заказчики к ним приходят и выйти на тот же рынок с пикософтом.
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 19:55 #643
SI написал(а):
Ты эта... слыш куев... ты попробуй не просто market, а market of набрать! Неужели с тех пор как ты писал письмо английской королеве маргарет Тэтчер - ты так ничего и не вспомнил из школьного и институтского английского?
С другой стороны - я не понимаю чего именно ты мечташеь найти? Неужели твоей прямой извилине, резонирующей в пустом черепе, кажется что в интернете существует какой-то волшебный market на котором любой тунеядец может торговать protein structure? Очень, очень странные у тебя, куев, представления об интернете! Флудерастия мешает... Как тебе мерещатся слуды от летающих тарелок за твоим сараем на даче, точно так же тебе мерещятся какие-то market-ы в интернете...
Знашеь куев, я тебе открою одну тайну: в интернете можно запросто найти милую твоему сердцу порнуху. Или же тучу форумов, которые ты способен засрать по причине своего клинического тунеядства. Можно также лоха или лохушку какую найти и развести его через интернет - этому ты тоже, с грехом пополам, обучился. Но вот чего в интернете нет - так это market для protein structure. Потому что кроме тебя никому в голову не придет шарашиться там по сайтам и предлагать купить достоверную структуру белка. Или тебе кажется что ученые так же как и ты - просиживают на табуретках целые дни перед компьютером и весь рабочий день заняты только тем, как бы им найти тунеядца куева с его волшебной программой?
Так что придется тебе куев смириться с мыслью что наличие целой очереди заинтересованных в твоей волшебной программе людей - это всего-навсего плод твоей воспаленной фантазии, отягощенной болезненной реакцией на внешние раздражители в виде, к примеру, слова деньги...
Кушелев: Допустим, Вы во всём правы, и в инете нет интернет-магазина белковых структур. Но лабораториям РСА эти структуры кто-то заказывает? Как связаться с этими заказчиками?
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 20:21 #647
ну с фотографией разобрались.
талант дизайнера имеется.
занялись бы фотографией что ли
а вот с моделированием не очень.
скажите, почему у вас пиррольное кольцо квадратное?
модель сферического коня в вакууме?
To obtain service, please call or email Martin-Protean.
Protein Structure Products
Determine protein three-dimensional structure | Discover protein-protein interfaces in solution | Discover drug-binding sites on proteins in solution | Guidelines for submitting plasmids |
Determine protein three-dimensional structure
Over the past 8 years Martin-Protean developed the underlying technical capabilities to determine the three-dimensional structure of a protein without needing protein crystals and without nuclear magnetic resonance (NMR). For more information contact Martin-Protean today.
Discover protein-protein interfaces in solution
Using the technologies developed to determine protein three dimensional structure and our technology for probing the solvent accessibility of protein surfaces to constrain them Martin-Protean guides its own proprietary protein docking software to obtain the structure of your proteins in complex in solution. For more information contact Martin-Protean today.
Discover drug-binding sites on proteins in solution
Using our solvent accessibility probing technology to constrain it Martin-Protean guides its own drug docking software to obtain the structure of the protein-drug complex in solution. For more information contact Martin-Protean today.
Guidelines to submit plasmids encoding proteins for expression and analysis:
To perform its analyses, Martin-Protean will produce its own versions of your protein. To do this we will begin with either the plasmid you provide containing the gene for the protein of interest, or the sequence for that gene. Martin-Protean will also leverage whatever information you provide regarding effective recombinant expression systems and obtained expression levels. To submit plasmid DNA simply put 500ng of DNA (3-5uL of miniprepped DNA) in a labeled eppendorf tube.
Чтобы получить обслуживание, пожалуйста, позвоните или свяжитесь по электронной почте Martin-Protean.
Продукты Структуры белка
Определение трехмерной структуры белка | Обнаружение белок-белкового взаимодействия в растворе | Обнаружение лиганд-связывающих участков в белках в растворе | Предпосылки для конструирования плазмид |
1. Определение трехмерной структуры белка
За предшествующие 8 лет Martin-Protean развил основные технические способности для определения трехмерной структуры белка, не нуждаясь в кристаллах белка (РСА) и без ядерного магнитного резонанса (NMR). За дополнительной информацией свяжитесь с Martin-Protean сегодня.
2. Обнаружение белок-белкового взаимодействия в растворе
Используя технологии, разработанные для определения трехмерной структуры белка и собственную технологию для исследования растворимости белка, Martin-Protean разработала собственное программное обеспечение стыковки белков в комплексы в растворе. За дополнительной информацией свяжитесь с Martin-Protean сегодня.
3. Обнаружение лиганд-связывающих участков в белках в растворе
Используя нашу технологию исследования доступности доступности белка в растворе, Martin-Protean разработала собственное программное обеспечение стыковки лиганда (препарата) с белком в растворе с моделированием структуры комплекса препарат-белок. в решении. За дополнительной информацией свяжитесь с Martin-Protean сегодня.
4. Предпосылки для конструирования плазмид
Выполнив это исследование, Martin-Protean синтезирует собственные версии Вашего белка. Чтобы сделать это, мы начнем или с плазмиды, содержащей ген белка интереса, которую обеспечиваете Вы, или с нуклеотидной последовательности этого гена. Martin-Protean усилит любую информацию, которую Вы предоставляете относительно эффективных рекомбинантных систем полученных уровней экспрессии. Чтобы представить ДНК плазмиды просто поместите 500 нанограммов ДНК (3-5uL из минипрепарата ДНК) в маркированной эппендорфовской пробирке.
Похоже наши конкуренты
.
Меня особо заинтересовал пункт №4 из перечня их услуг. Если бы они не только могли наработать белок с плазмиды (очистить, выделить, ну всё как положено), но ещё и с помощью NMR хотя бы приблизительно установить его структуру, а не смоделировать её виртуально, то нам такие коллеги Очень пригодились бы.
Кушелев: Да это просто везуха! Нужно срочно с ними связаться!
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 21:34 #652
Похоже все-таки куев что ты клинический идиот и уже никакими лекциями это не исправить...
Но я еще раз попытаюсь, последний.
Возьмем абстрактную фармацевтическую компанию Пупкин и сыновья которые разрабатывают там новое лекарство... ну допустим от врожденного кретинизма, как у тебя. Все мы наслышаны что процесс это очень долгий и дорогой. Чтоб выпустить новое лекарство на рынок требуется от 5 до 10 лет и денег ухлопывается в десятки миллионов долларов. Поэтому народ стремится какие-то процессы, ну те которые не top secret и не know how - сгрузить на внешние лаборатории, больницы и всякие центры лечения умственно отсталых. В том числе вовсю пользуются там банками данных и пр.
Теперь спроси самого себя: а за какой-такой радостью фармацевтическая компания Пупкин и сыновья бует платить какой-то там лаборатории РСА по 10К долларов за какую-то там картинку? Или нет, не так: чем именно руководствуется лаборатория РСА, предлагая картинки за такие деньги? Ты никогда об этом не задумывался?
Конечно же, в эту стоимость входит и затраты на оборудование, и на зарплаты сотрудникам, но львиную долю этих денег лаборатория берет за гарантию. Только это не так гарантия, когда какой-то тунеядец куев говорит сделаем две структуры и потом посмотрим какая из них больше подойдет. Ты про это можешь жене рассказать или там дочке перед сном.
Гарантия нужна для того, что если у компании Пупкин и сыновья что-то пойдет не так, ну там взорвется что-нибудь или умрет пациент на испытаниях - то немедленно возникнет судебное дело на ровном месте. И начнут копать. А там возьмут и раскопают что все дело изначально было в том что некая лаборатория РСА вместо правильной структуры прислала картинку жопы в разрезе. И тогда все шишки и издержки полетят в эту лабораторию. Поэтому в РСА и берут так много ибо страхуются от собственных ошибок!
А теперь спроси сам себя - а какое отношение имеет тунеядец куев, какой-то хрен с бугра, вообразивший наличие у себя какой-то там лаборатории, к большому фармакологическому бизнесу? Ты че, куев - с дуба рухнул? Тебе кажется что ты такой вот весь из себя гениальный, в 3D Студии нарисовал скрипт и тебе придет счастье? И - никакой отвествтенности? Нет, куев... на кого-то ответственность надо будет ложить, именно поэтому тебе раньше и говорили про сертификацию. Случись вдруг непоправимое - что с тебя взять, кроме дырявых калош и раздутого самомнения? Можно конечно тебя в бетон закатать, но кому от этого легче станет?
Так что ты, куев, губу закатай чтоб слюни по бороде не текли! И разводи дальше лохов своими шариками - твоя пустая бородатая тыква будет гораздо целее!
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 21:37 #653
Агенство Мудакис приняло решение о понижении кредитного рейтинга темы господина Кушелева. Сейчас решается вопрос о том сохранить ли на текущем уровне или же понизить кредитный рейтинг темы ППГ
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 22:32 #654
я конечно дико извиняюсь,
но такой вот четкий квадрат,
которым вы пытаетесь описать
порфириновое кольцо
мне ничего кроме модели
сферического коня в вакууме не напоминает.
похоже на детский сад.
Пикотехнология изображения белков
16 Янв 2012 23:16 #655
mittelspiel написал(а):
я конечно дико извиняюсь,
но такой вот четкий квадрат,
которым вы пытаетесь описать
порфириновое кольцо
мне ничего кроме модели
сферического коня в вакууме не напоминает.
похоже на детский сад.
Да нет... скорее это не детский сад а годами выработанная рекламная стратегия... посмотрите на телевизионные рекламные ролики... там тоже все очень наивно выглядит с точки зрения профессионала от науки когда подводят научную базу при рекламе например кремов от морщин... какие только термины не приводят чтобы впечатлить зрителя... и коэнзим ку10 и прочая хрень... специалисты конечно знают истинную цену этим репликам... но.. но... работает.. деньги крутятся немалые в косметологическом бизнесе... так что предлагаю отделять рекламные акции в виде цветных анимированых картинок господина Кушелева от собственно науки...
Пикотехнология изображения белков
17 Янв 2012 00:02 #656
телевизионные ролики с рекламой крема от морщин
нацелены на теток которые вполне могут их купить.
реклама же товарища кушелева нацелена на ученых,
которые никогда ни при каких условиях в принципе не могут
ничего у него купить. поэтому это всё таки детский сад.
[8:10:10] L: Поправленный перевод:
The business offer for a owners of your company.
In the near future auction of high technologies of laboratory the Nanoworld can take place.
We offer the new standard of structure of peptide (protein) PIKO. This standard now is discussed at forums. At schools of Russia since 2005 study pikotechnological models of atoms, molecules and crystals.
Precision pikotechnological models ~1000 times higher than precision of nano-models.
Your firm could become the leader of sales pikotech-models...
I invite you to auction of high technologies of laboratory the Nanoworld: nanoworld.org.ru/topic/205/
[8:49:32] Кушелев Александр Юрьевич: Благодарю!
[8:52:29] Кушелев Александр Юрьевич: Сегодня мне удалось сделать очередное научное открытие. Выяснилось, что в рибосоме есть разрыв информационной РНК длиной около 3 витков (~30 нуклеотидов). И этот гигантский разрыв не заметил никто, в т.ч. нобелевские лауреаты, которые получили нобелевскую премию за структуру рибосомы в 2009 году
Ошибка в 3 витка спирали РНК - это ошибка в 700 ангстрем
Такова реальная ошибка в определении структуры рибосомы.
Пикотехнология изображения белков
17 Янв 2012 05:30 #658
SI написал(а):
Похоже все-таки куев что ты клинический идиот и уже никакими лекциями это не исправить...
Но я еще раз попытаюсь, последний.
Возьмем абстрактную фармацевтическую компанию Пупкин и сыновья которые разрабатывают там новое лекарство... ну допустим от врожденного кретинизма, как у тебя. Все мы наслышаны что процесс это очень долгий и дорогой. Чтоб выпустить новое лекарство на рынок требуется от 5 до 10 лет и денег ухлопывается в десятки миллионов долларов. Поэтому народ стремится какие-то процессы, ну те которые не top secret и не know how - сгрузить на внешние лаборатории, больницы и всякие центры лечения умственно отсталых. В том числе вовсю пользуются там банками данных и пр.
Теперь спроси самого себя: а за какой-такой радостью фармацевтическая компания Пупкин и сыновья бует платить какой-то там лаборатории РСА по 10К долларов за какую-то там картинку? Или нет, не так: чем именно руководствуется лаборатория РСА, предлагая картинки за такие деньги? Ты никогда об этом не задумывался?
Конечно же, в эту стоимость входит и затраты на оборудование, и на зарплаты сотрудникам, но львиную долю этих денег лаборатория берет за гарантию. Только это не так гарантия, когда какой-то тунеядец куев говорит сделаем две структуры и потом посмотрим какая из них больше подойдет. Ты про это можешь жене рассказать или там дочке перед сном.
Гарантия нужна для того, что если у компании Пупкин и сыновья что-то пойдет не так, ну там взорвется что-нибудь или умрет пациент на испытаниях - то немедленно возникнет судебное дело на ровном месте. И начнут копать. А там возьмут и раскопают что все дело изначально было в том что некая лаборатория РСА вместо правильной структуры прислала картинку жопы в разрезе. И тогда все шишки и издержки полетят в эту лабораторию. Поэтому в РСА и берут так много ибо страхуются от собственных ошибок!
А теперь спроси сам себя - а какое отношение имеет тунеядец куев, какой-то хрен с бугра, вообразивший наличие у себя какой-то там лаборатории, к большому фармакологическому бизнесу? Ты че, куев - с дуба рухнул? Тебе кажется что ты такой вот весь из себя гениальный, в 3D Студии нарисовал скрипт и тебе придет счастье? И - никакой отвествтенности? Нет, куев... на кого-то ответственность надо будет ложить, именно поэтому тебе раньше и говорили про сертификацию. Случись вдруг непоправимое - что с тебя взять, кроме дырявых калош и раздутого самомнения? Можно конечно тебя в бетон закатать, но кому от этого легче станет?
Так что ты, куев, губу закатай чтоб слюни по бороде не текли! И разводи дальше лохов своими шариками - твоя пустая бородатая тыква будет гораздо целее!
Кушелев: И всё же позвольте не согласиться, что деньги платят исключительно за гарантию.
Пикотехнология изображения белков
17 Янв 2012 05:51 #659
Зелёным цветом показана информационная РНК, которая якобы проходит сквозь рибосому. В действительности существует разрыв иРНК длиной ~30 нуклеотидов. Откуда он берётся? тРНК приплывает с очередной аминокислотой, врезается во входящий в рибосому конец иРНК и откусывает от неё триплет. Далее поворачивается по инерции до терминирующего поворот рибосомального нуклеотида. После этого другой (АСС) конец тРНК вставляет аминокислоту в растущую белковую молекулу. Затем тРНК (вместе с триплетом иРНК!) поворачивается вокруг аминокислотного остатка на тупой угол. При этом триплет иРНК уходит на расстояние около 3 витков спирали РНК от первоначального положения. Далее тРНК снова поворачивается, отсоединяясь от растущей белковой молекулы, но после того, как к ней присоединён следующий аминокислотный остаток. Вращается она до тех пор, пока не присоединит триплет иРНК к выходящему концу. Таким образом создаётся иллюзия, что иРНК проходит сквозь рибосому без изменений. На самом деле на входе в рибосому иРНК дробится на триплеты, а на выходе из рибосомы снова собирается в спираль РНК.
Этот процесс оказался незамеченным для исследователей структуры рибосомы, которые получили за эту структуру нобелевскую премию в 2009-ом году. При этом заявленная точность структуры рибосомы ~2 ангстрема, а реальная ошибка превосходит в полтора раза габариты тРНК, т.е. достигает ~3 витков РНК (~30 нуклеотидов). Таким образом реальная ошибка модели рибосомы порядка 700 ангстрем (70 нанометров, 70 000 пикометров).