Victoria написал(а):
Александр Юрьевич, Вы мне рекомендуете программу, в которой белки собираются не из нативных L, а из неприродных D-аминокислот. А потом я в воображаемом зеркале должна всё отражать. Это же бред. Неужели Вы не понимаете, что с зеркалом можно поиграться для одного аминокислотного остатка, но структура всего белка из сотни аминокислот будет совершенно разной (и совсем не зеркальной) из L- и D-кирпичиков аминокислот. Поэтому те модели лизоцима, гемоглобина или коллагена, которые Вы рисуете в своей программе НИЧЕГО общего с реальностью не имеют. До интерпретации вариантов 1, 2, 3 и 4, нужно сначала заложить в программу модели L-аминокислот. Вот с этого и начните, а потом можно отлаживать что угодно.
Nasretdin написал(а):
После такого отзыва специалиста заказывать у вас ваши кривые модели смысла нет.
Кушелев: Начну с того, что упрощённая пикотехнологическая модель, в которой аминокислоты изображены точками, шариками или многогранниками, строится независимо от форм аминокислот. В ней используются только композиционные углы.
А более точная модель действительно требует учёта формы аминокислот. Программа постоянно совершенствуется, поэтому ошибки, замеченные Викторией уже исправлены в более продвинутой версии.
Да и раньше можно было в зеркало посмотреть и увидеть правильную модель
