limarodessa написал(а):
Никогда не встречал чтобы значение слова гипотеза применялось к технологиям.
И к софту
Заказчикам белковых структур предлагаются файлы в стандарте PDB (Protein Data Base).
Вот пример такого файла, созданного программой Пикотех:
PFRMAT TS
TARGET Insulin
AUTHOR 4236-1297-6301
REMARK Predictor remarks. See DEMO:
REMARK
www.nanoworld.org.ru/data/01/data/images/slides/990709/demo.htm
REMARK
REMARK Target sequence (56 acids)
REMARK REVEELQVGQAELGGGPGAGGLQPSALYLALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN*
REMARK
METHOD Method description
METHOD The strong correlation dependence of spatial structure
METHOD of the protein from its nucleotide sequence was
METHOD theoretically predicted by physical modelling,
METHOD experimentally discovered and statistically confirmed.
METHOD In the process of biosynthesis the third nucleotide of
METHOD the codon controls the orientation of the amino acid
METHOD forming the concrete spatial isomer that is the
METHOD conformation of the protein molecule cutting off
METHOD competition ways of the forming of 2D and 3D structures.
METHOD On this base the computer program Pikotechnology for
METHOD the prediction of 2D structure of the protins on their
METHOD nucleotide sequence was created.
MODEL 1
PARENT N/A 1
ATOM 1 N ARG A 1 10.504 6.874 4.374 1.00 0.50 A
ATOM 2 CA ARG A 1 9.740 6.273 4.413 1.00 0.50 A
ATOM 3 C ARG A 1 9.285 5.939 3.569 1.00 0.50 A
ATOM 4 O ARG A 1 8.721 5.994 3.174 1.00 0.50 A
ATOM 5 CB ARG A 1 8.925 6.792 4.452 1.00 0.50 A
ATOM 6 CG ARG A 1 8.345 6.773 5.159 1.00 0.50 A
ATOM 7 CD ARG A 1 8.503 6.294 5.923 1.00 0.50 A
ATOM 8 NE ARG A 1 9.472 5.753 5.827 1.00 0.50 A
ATOM 9 CZ ARG A 1 8.790 4.996 5.862 1.00 0.50 A
ATOM 10 NH1 ARG A 1 8.119 4.844 5.896 1.00 0.50 A
Далее:
nanoworld.org.ru/topic/5/page/65/?login=1
Этот файл можно смотреть стандартным браузером:
Оригинал:
img-fotki.yandex.ru/get/5414/126580004.3...22_33995f57_orig.gif
Более точная модель (piko-precision) предлагается в новом стандарте (PIKO-3D)
Напомню оригинальное название темы:
Как проверить структуру белка?
Тема с оригинальным названием сохранилась здесь:
molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=496777&st=0