Ключевое слово
30 | 07 | 2026
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Пикотехнология изображения белков

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 14:38 #331

  • Quantumbio
  • Quantumbio's Avatar
  • OFFLINE
  • Ключник
  • Posts: 28
  • Karma: 0
Таня Куева написал(а):
Дорогой наш человек - mittelspiel ! За такие слова вовек на руках носить будем, только скажи где живёшь. Ежели тебе чего помыть, постирать или моделек из колечек навертеть - только намекни.
Всегда твои Кушелевы.
--
Дарагая Тотьяна Куевна ! Будьте осторожны с теми местами где живет дарагой наш шелоффек mittelspiel:

Живешь в заколдованном, диком лесу,
Откуда уйти невозможно.

www.ng.ru/cis/2011-12-22/6_femen.html
Last Edit: 28 Авг 2015 10:32 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 14:39 #332

  • Автор: SI
  • Автор: SI's Avatar
Попробую перевести с куево-загадочного на обыкновенный и понятный язык:

Тунеядцыу куеву очень не хватает денег. Он же нигде не работает и предпочитает сидеть на шее жены, посвящая все свое свободное время спаму и флуду в рунете (полез бы и не только в рунет, но на наше счастье не знает ни одного языка).

По этой причине, тунеядец ежедневно мечтает о перенаправлении мировых денежных потоков в свой собственный карман, не утруждая свою черепную коробку глубокими размышлениями о сути окружающих его вещей. По его мнению, по-видимому сложившемуся еще в школе, классе в восьмом, окружающий мир устроен чрезвычайно просто и может быть описан в рамках таблицы умножения и двух треугольников: прямоугольном и равносторонним. Все то, чего не может понимать черепная коробка куева - по его мнению не имеет никакого отношения к реальонсти, не существует и придумано лишь для того чтоб каике-то люди или целые коллективы могли пилить бабло, отпущенное на развитие науки.

Тунеядец был бы очень рад перенаправить эти деньги на свое собствненое благополучие ибо, по его сложившемуся годами мнению, никто на этом земном шаре не занят настоящей научонй детельностью, за исключением самого тунеядца куева! Поэтому недоучившийся в МЭИ инженер и мнит себя минимум профессоров во ВСЕХ областях науки, а не только в тунеядстве.

Теперь по обсуждаемой здесь теме: никому не удастся в чем-то переубедить или там просветить тунеядца куева, так как он уверен в том что он - гений, его волшебная программа - единственно правильная и верная, а все несовпадения между результатами его программы и реальонстью окружающего мира можно списать на несовершенстов других инструментов. Так, тунеядец куев обожает употреблять словосочетание с надежно установленной структурой, ибо если структура, взятая там из каких-либо других источников, не совпадает с результатами волшебной программы куева - значит эта структура не надежно установлена. Другим способом обойти нестыковки между ненадежно установленными структурами из разных источников по несчастью совпадающими между собой и несовпадающих с видением тунеядца - является неточность метода. Ну, то есть сам метод не позволяет, даже в теории, добиться в точонсти того же результата, что и куев, а значит - этот метод ущербен и подлежит немедленной замене на какой-то другой, правильный метод, результаты которого куеву понравятся больше.

Так тчо зря вы тут стараетесь вытащить из куева какие-то формулы! Он никогда не писал никаикх форумул и даже не знает как это делается! Вот если бы ВЫ написали ему каике-то форумулы - вот это был бы совсем другой разговор! Он бы их тщательно перерисовал в тетрадочку, чтоб как-нибудь потом, через пару месяцев, ввыернуть на очередном, инфицированном им самим форуме о том что профессора, с которыми я беседовал на форуме quantrinas УТОЧНИЛИ МОИ формулы: вот они! И тогда, без сомнения, какой-нибудь лох да и отсыпал бы тунеядцу куеву немного денег на колбасу...

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 14:43 #333

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
Поршень написал(а):
Вообще то подобные построения грешат системной ошибкой...так как они создаются в искусственной среде...а ведь они окружены молекулами жидкости (водой) и без учета этого влияния своеобразной шубы угловых построения вызывают сильное сомнения.
Композиционный генетический код возник в процессе эволюции. Он кодирует углы в естественных условиях, т.е. с учётом молекул жидкости (и не только!)

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 14:46 #334

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
Nasretdin написал(а):
Получилось, что точность моделей пикотеха не выше точности РСА
Не точность, а различие. Неужто не в состоянии понять?

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 15:15 #335

Quantumbio написал(а):
Живешь в заколдованном, диком лесу,
Откуда уйти невозможно.

www.ng.ru/cis/2011-12-22/6_femen.html
По вашей ссылке нот фунд какой то. Кто Вас учил так посылать даму?
Где тут минусы ставить? Одни плюсы...
Last Edit: 28 Авг 2015 10:32 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 15:25 #336

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
SI написал(а):
Так тчо зря вы тут стараетесь вытащить из куева какие-то формулы! Он никогда не писал никаикх форумул и даже не знает как это делается! Вот если бы ВЫ написали ему каике-то форумулы - вот это был бы совсем другой разговор!
Щас, напишем

У нас тут один любитель паленого исландского шпата два года, целых ~20 000 (двадцать тысяч) постов как пытался заполучить хоть какую нибудь формулку. Так фиг ему

Куда уж тут куеву...
Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 15:32 #337

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
kushelev написал(а):
Композиционный генетический код возник в процессе эволюции. Он кодирует углы в естественных условиях
те в свою куеву технологию вы тоже заливаете жидкость? Cравните:

Фемто: Куево:


Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 15:46 #338

Похоже, что с интернет-преступниками выяснили. Они заразили сайт богомерзкого пользователя diprospan (всегда говорила от человека с таким ником хорошего не жди), добавив в программу управления спутниками вредоносную программу в стандарте PDF. Те, кто пользовались ГЛОНАС оказались жертвами интернет-преступников (в т.ч. и богомерзкий diprospan). На их компьютерах живёт вредоносная программа, которая отправляет пароли, отпечатки пальцев и генетические данные, в Корпус Стражей Исламской Революции и Аятоле Хоменеи. Далее они настраивают спутниковую групировку так, чтобы она пересылала копии энцефалограммы мозга на почту преступникам.
Затем они через Пентагон заходят на форум лаборатории Наномир . Тупой админ zoldrax (опять ник определяет сознание этого существа) читает письмо, например, Виктории Соколик и копия содержимого его мозга пересылается через к-эфир. Они идут в атстрал и меняют пароль.
Как только Куев сменил адрес электронной почты у Виктории Соколик с sokolik.@xxx на TP-sokolik@ххх, сигнал ГЛОНАС стал устойчивее и кибер-атаки прекратились.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 16:38 #339

Кушелев: Уважаемая Виктория! Похоже, что Ваш пароль на форуме лаборатории Наномир украли.
Новый пароль: Кушелев
Я временно перевёл Ваш ник в непроверенные пользователи, чтобы пресечь атсрально-ауральную темень. Как только zoldrax проспится , и воссоединится с Шабалой мы восстановим Вас в правах. О Божественная.
Это личное сообщение я получил от Вашего имени. Подозреваю, что это - Анубис:
А.Ю., можете мне дать ненадолго возможность править ?
Мне нужно кое-кого убить и вставить в старые магические поля
Я управлюсь за сегодня. Конец сообщения.

Виктория: Похоже на то,что вчера перебрали с галюциногенами. Я такого сообщения Вам не посылала, поскольку править пока не собиралась.
Кстати, по Вашему примеру, скопировала свою тему постранично в литой гранит. Если сотрут форум, можно будет восстановить.
Кушелев: Понятно. Значит в случае взлома форума опять пострадают темы Тарасенка и др. длбб. Наверняка сохранятся только две наши темы. И это хорошо.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 17:10 #340

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
Профессионально работают дезинформаторы...

Но все желающие могут почитать первоисточник и убедиться, что там написано другое: nanoworld.org.ru/topic/199/page/27/

Администрация форума molbiol.ru переместила эту тему дважды. При этом оставила матершину, оскорбления и другие явные нарушения правил научного форума со стороны интернет-преступников. Таким образом дискредитировала данный интернет-ресурс.

Здесь, как я погляжу, ситуация не лучше...

Если у кого-то остались ко мне вопросы по науке, обращайтесь на форум лаб. Наномир.

Всех благодарю за то, что нашли время для нашей научной дискуссии
Last Edit: 28 Авг 2015 10:32 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 17:51 #341

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 117031
  • Thank you received: 2705
  • Karma: 123
kushelev написал(а):
Здесь, как я погляжу, ситуация не лучше...

Каждому - своё.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 18:04 #342

  • Автор: SI
  • Автор: SI's Avatar
Пока, куев. В следующий раз, как будешь загаживать чей-нибудь форум, ты постарайся че-нить веселое рассказывать: про инопланетных геологов, про золото в болотном хвоще, про то как ты в микроволонвке кусудаму греешь... А то ты какой-то скучный в последнее время стал, нудный - поэтому тебе видимо и денег не дают!

И эта... ты береги себя, а то возраст понимаешь... неровен час прихватит - будешь потом обвинять святую инквизицию во всех своих грехах. Мясо не кушай - вредно это. Макаронами не объедайся, а то разорвет без масла-то. Сахар в чай не клади - а то диабет! То что ты в дырявых калошах ходишь - это хорошо, закаляешься. Так что продолжай в том же духе и протянешь еще пяток лет на радость всем нам!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 18:13 #343

kushelev написал(а):
Всех благодарю за то, что нашли время для нашей научной дискуссии
И я. И я. И я. Того же мнения...
Аукцион рубиновых генераторов.
В настоящее время к эксперименту в Дубне подготовлено 10 рубиновых генераторов. Планируется включить сначала те, что точно настроены на частоту генератора в Дубне. После этого будут включены и остальные путём выравнивания резонансных частот с помощью измерения температуры жидким азотом или технологией ступенчато-последовательного приближения будильниковидным механизмом разработанным очумелоручками лаборатории Онаномир.
nanoworld.org.ru/post/7510/#p7510

Сегодня со мной на связь вышел хозяин ускорителя Ашот. Не того, что в Дубне, а другого в Армавире. В целях информационной безопасности я не буду называть город, где находится этот ускоритель.

Сегодня посчастливилось найти кристалл, который ещё лучше, чем рубин за 1000. Из него можно сделать генератор, мощность которого можно плавно увеличивать от 10 до 100 $.
Ну и мне кой чего обломится.

Этот материал стоит значительно дороже рубина, зато и возможности на порядок круче. Чтобы купить этот материал, а также заплатить за изготовление заготовок (тех, что уже сделаны и тех, что предстоит сделать) мы решили организовать аукцион рубиновых генераторов.

Условия следующие:

Каждый желающий может уже сегодня купить любое из этих изделий:

Любое из 10 этих изделий продаётся за 1000 евро.

Если не удастся их включить, то у Вас останется дорогая безделушка фактически по себестоимости.

Если же эти девайсы будут включены, то у Вас будет 100500-киловаттный автономный источник энергии, который входит в десятку первых на нашей планете.

Конечно, Вы можете приобрести и продвинутую модель, мощность которой можно будет плавно менять от 100 до 100500 МВатт. Но эта модель стоит 10 000 евро.

Если у Вас есть 20 000 евро, то Вы можете купить все изделия и в случае удачи, т.е. если все они будут включены, у Вас будет 11 бус, которые Вы сможете продать в разные страны хоть по миллиону долларов за каждый.

Зачем это нужно нам?

Мы голодаем...

Естественно, что после эксперимента в Дубне в случае включения девайсов, которые уже готовы, цены на первые включенные генераторы будут совсем другими

Дешёвыми будут рубиновые генераторы массового производства, но это будет позже...
Last Edit: 28 Авг 2015 10:33 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 18:13 #344

  • Автор: Чукча не из Сибири..
  • Автор: Чукча не из Сибири..'s Avatar
На пост 333 ... где ..
Поршень написал(а):
Вообще то подобные построения грешат системной ошибкой...так как они создаются в искусственной среде...а ведь они окружены молекулами жидкости (водой) и без учета этого влияния своеобразной шубы угловых построения вызывают сильное сомнения.
..
Просто в Ваших моделях нужно предусмотреть и возможность моделирования внешней шубы так как хотя Вы и написали, что ..
Композиционный генетический код возник в процессе эволюции. Он кодирует углы в естественных условиях, т.е. с учётом молекул жидкости (и не только!)
но события то рассматриваются сейчас и учет этих угловых компонентов в новой среде так же ВАЖЕН, потому что он несет в себе тоже часть информационного комплекса ...
ps
- Меня не надо носить на руках... Я сяду тебе на шею!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 18:51 #345

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
kushelev написал(а):
Всех благодарю за то, что нашли время для нашей научной дискуссии
И так, сколько же нам понадобилось для задания правильного вопроса:
Куев - 340 постов (слабак!)
wpiter - ~4000
ППГ - ~20000
Кто следующий?

Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:08 #346

  • Quantumbio
  • Quantumbio's Avatar
  • OFFLINE
  • Ключник
  • Posts: 28
  • Karma: 0
kushelev написал(а):
Администрация форума molbiol.ru переместила эту тему дважды. При этом оставила матершину, оскорбления и другие явные нарушения правил научного форума со стороны интернет-преступников. Таким образом дискредитировала данный интернет-ресурс.
Где то я это уже слышал. Какое то дежавю. PauLita вам не кажется что мы где то это уже неоднократно от кого то слышали...

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:19 #347

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
А вот бизнес план, профуканный куевым:


Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:32 #348

kushelev написал(а):
Если у кого-то остались ко мне вопросы по науке, обращайтесь на форум лаб. Наномир.
Да да. У нас на форуме созданы фсе условия для научных разговоров.
Во первых вы хрен зарегистрируетесь.
Во вторых ниччо не напишете пока не пройдёте капчу и личное одобрение Куя. Не факт, что опубликованное сообщение будет соответствовать первоначальному, потому как Куй лучше знает, что хотели написать.
В третьих: только избранные жополизы будут допущены к прямому написанию научных постов.
В четвёртых: часть адресов инета вообще забанена для доступа на чисто научный ресурс. Лучше перебдеть, чем недобдеть.
В пятых: нельзя редактировать своё сообщение. Всё немедленно отливается в граните копируется на DVD.
Между сообщениями интервал то ли 600 секунд то ли минут. Но это мелочи в сравнении со счастьем общения с куе-подобными.
В общем Добро пожаловать.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:34 #349

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
kushelev написал(а):
Например?
Например вот гистоны которые вы в самом начале темы
изобразить попытались. БОльшая часть этих белков,
в особенности несколько десятков аминокислот на концах
находится в абсолютно неструктурированном состоянии.
Ну то есть нет структуры. Вообще. Как тут быть?
Что по этому поводу говорит пикотехническая гипотеза?

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:41 #350

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
mittelspiel написал(а):
БОльшая часть этих белков, в особенности несколько десятков аминокислот на концах находится в абсолютно неструктурированном состоянии
Для куевых технологий это не проблема:


Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:42 #351

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49571
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
mittelspiel написал(а):
несколько десятков аминокислот на концах находится в абсолютно неструктурированными состоянии. Ну то есть нет структуры. Вообще.
В каком смысле нет структуры, это ничему ли не претит?

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 19:51 #352

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Хайдук, не претит.
Болтаются случайным образом в растворе.
Если подойдет другая макромолекула,
то электростатические взаимодействия
эти аминокислоты упорядочивают. а если нет, то нет.
Друг от друга такие аминокислоты электростатически отталкиваются,
так что получается обычный полимер, веревка.
Расположение в пространстве - случайное.
Вообще очень мало белков имеют однозначную структуру.

Пикотехнология изображения белков 10 Янв 2012 20:08 #353

PauLita написал(а):
А вот бизнес план

Там написано - ваши студенты могут сделать лед, какую то соль, какую то воду, бла бла и открыть ЭТАНОЛ и много много ...
Хоть и игрушка, а с понятием.

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 05:53 #354

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5

Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 10:24 #355

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
mittelspiel написал(а):
несколько десятков аминокислот на концах
находится в абсолютно неструктурированном состоянии.
Ну то есть нет структуры. Вообще. Как тут быть?
Что по этому поводу говорит пикотехническая гипотеза?
Если структуру не удалось определить, это не значит, что её нет

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 10:25 #356

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
The translation mechanism


Details: nanoworld88.narod.ru/data/250.htm
Pikotechnology (Manuals for schools)


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5304/nanoworld20...b1_6906ec93_orig.png
DNA-step model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5504/nanoworld20...4b_e7cfcf19_orig.png
Nucleotides


DNA model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5706/nanoworld20...35_3e755a19_orig.gif
tRNA model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4704/nanoworld20...79_8e2a3282_orig.gif
tRNA (detail) model


methyl inosine model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5606/nanoworld20...63_ece58a32_orig.gif
ACC-end model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5607/nanoworld20...84_78556da6_orig.png
Animation: nanoworld88.narod.ru/data/240_files/0_4f985_f662331c_orig.gif
Translation makhanizm


Details: nanoworld88.narod.ru/data/227.htm
The translation mechanism


Details: nanoworld88.narod.ru/data/227.htm
Rybosome's navigation system
Last Edit: 28 Авг 2015 10:34 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 10:26 #357

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0
PIKO standart (project)

Introduction.

METHOD Method description
METHOD The strong correlation dependence of spatial structure
METHOD of the protein from its nucleotide sequence was
METHOD theoretically predicted by physical modelling,
METHOD experimentally discovered and statistically confirmed.
METHOD In the process of biosynthesis the third nucleotide of
METHOD the codon controls the orientation of the amino acid
METHOD forming the concrete spatial isomer that is the
METHOD conformation of the protein molecule cutting off
METHOD competition ways of the forming of 2D and 3D structures.
METHOD On this base the computer program Pikotechnology for
METHOD the prediction of 2D structure of the protins on their
METHOD nucleotide sequence was created.

Composition genetic code table (1992)


Samples:


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5700/nanoworld.2...d1_768200e6_orig.png


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4402/nanoworld.2...02_8b0a1fc2_orig.png


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5106/nanoworld.2...08_9fa5c119_orig.gif


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4714/126580004.3...fd_af7c9696_orig.gif
Collagen, 3D structure


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4525/126580004.3...50_31b552b6_orig.gif
Collagen, 4-structure, Helix


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/3008/126580004.3...ee_51f54771_orig.png
Collagen, 4-structure, Helix


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4426/126580004.3...02_4d48f4b5_orig.gif
Collagen, 4-structure, piko-precision


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/4525/126580004.3...48_451d0c8f_orig.gif
Insulin, 3D-structure


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5706/nanoworld20...8a_18732968_orig.gif
Insulin, 3D-structure


Insulin, 2D-structure (PIKO-2D standart (project))

compositional code:
1,1,4,1,1,4,1,4,4,1,4,1,4,1,4,1,1,1,4,1,1,4,1,1,4,4,3,3,4,1,4,1,1,1,1,1,4,1,1,3,1,1,1,1,1,4,1,1,1,4,1

Kushelev's script for 3DS Max:

angx=#(-24,180,60,-45,-45); angy=#(-10.89167,83,0,15,15); angz=#(92,120,60,110,110)
dx=#(2,1.5,1.6,2,2); dy=#(0.6,1,0.8,1,0.6); dz=#(-0.45,0,-0.6,-0.15,-0.45)
kk=#(1,1,4,1,1,4,1,4,4,1,4,1,4,1,4,1,1,1,4,1,1,4,1,1,4,4,3,3,4,1,4,1,1,1,1,1,4,1,1,3,1,1,1,1,1,4,1,1,1,4,1,1,1,1,1,1)
peptide=box length:1 width:1 height:1 position:[0,0,-.5] wirecolor:[250,250,250]; Converttomesh peptide
for k = 1 to 56 do(
element = Hedra family:1 scalep:100 scaleq:100 scaler:100 radius:1 pos:[0,0,0] p:0.4; Converttomesh element
attach peptide element; peptide.pivot = [0,0,0]; move peptide [dx[kk[k]],dy[kk[k]],dz[kk[k]]]
rotate peptide angx[kk[k]] [1,0,0]; rotate peptide angy[kk[k]] [0,1,0]; rotate peptide angz[kk[k]] [0,0,1])


Origin size: nanoworld88.narod.ru/data/263_files/0_af548_451d0c8f_orig.gif
Kushelev's script - top model


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5414/126580004.3...20_2c87f90a_orig.gif
Insulin, 3D-structure, piko-precision (PIKO-3D standart (project))
Savin-Kushelev's script result

Savin-Kushelev's script for 3DS Max (Light): nanoworld.narod.ru/EMBLReader023L_20101113.txt
Details: nanoworld88.narod.ru/data/212.htm

Input data:

ID OCINSAA standard; RNA; MAM; 250 BP.
XX
AC M61153;
XX
DT 12-APR-1991 (Rel. 28, Created)
DT 15-APR-1994 (Rel. 39, Last updated, Version 2)
XX
DE Oryctolagus cuniculus insulin mRNA, partial cds.
XX
KW insulin.
XX
OS Oryctolagus cuniculus (rabbit)
OC Eukaryota; Animalia; Metazoa; Chordata; Vertebrata; Mammalia;
OC Theria; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae.
XX
RN [1]
RP 1-250
RA Giddings S.J., Carnaghi L., Devaskar S.;
RT Nucleotide sequence of a cDNA encoding rabbit preproinsulin;
RL Unpublished.
XX
CC NCBI gi: 165444
XX
FH Key Location/Qualifiers
FH
FT source 1..250
FT /organism=Oryctolagus cuniculus
FT CDS 1..168
FT /note=NCBI gi: 470321
FT /product=insulin
FT /codon_start=1
XX
SQ Sequence 250 BP; 36 A; 105 C; 78 G; 31 T; 0 other;
cgcgaggtgg aggagctgca ggtggggcag gcggagctgg gcgggggccc cggcgcgggc
ggcctgcagc cctcggcgct ttatctggcc ctgcagaagc gcggcatcgt ggagcagtgt
tgcaccagca tctgctcgct ctaccagctg gagaactact gcaactaggg gtgcccccca
cccacccctg cccgcgcccc ccacgccccc cgccctcgcc cccacccaat aaacccctcc
acgcgccccc
//

Output data:

PFRMAT TS
TARGET T00xx
AUTHOR 4236-1297-6301
REMARK Nanoworld Laboratory
REMARK nanoworld.narod.ru
REMARK Predictor remarks. See DEMO:
REMARK nanoworld88.narod.ru/data/270.htm
REMARK
REMARK Target sequence (56 acids)
REMARK REVEELQVGQAELGGGPGAGGLQPSALYLALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN*
REMARK
METHOD Method description
METHOD The strong correlation dependence of spatial structure
METHOD of the protein from its nucleotide sequence was
METHOD theoretically predicted by physical modelling,
METHOD experimentally discovered and statistically confirmed.
METHOD In the process of biosynthesis the third nucleotide of
METHOD the codon controls the orientation of the amino acid
METHOD forming the concrete spatial isomer that is the
METHOD conformation of the protein molecule cutting off
METHOD competition ways of the forming of 2D and 3D structures.
METHOD On this base the computer program Pikotechnology for
METHOD the prediction of 2D structure of the protins on their
METHOD nucleotide sequence was created.
MODEL 1
PARENT N/A 1
ATOM 1 N ARG A 1 10.504 6.874 4.374 1.00 0.50 A
ATOM 2 CA ARG A 1 9.740 6.273 4.413 1.00 0.50 A
ATOM 3 C ARG A 1 9.285 5.939 3.569 1.00 0.50 A
Details: nanoworld.org.ru/topic/199/page/28/


Origin size: img-fotki.yandex.ru/get/5414/126580004.3...22_33995f57_orig.gif

***
1. Sokolik V.V. Algorithm of protein structural template decoding according to its determined nucleotide sequence // Fist International Conference “Fundamental Medicine: From Scalpel Toward Genome, Proteome and Lipidome” (April 25-28, 2011), Pax Grid Virtual Conferences, Kazan, Russia. – P. 117-119.

2. Sokolik V.V. Protein is coded in genome and synthesized in ribosomes as a structural template of a rotameric version sequence of peptide bound configuration // The International Moscow Conference on Computational Molecular Biology, МССМВ-11 (July 21-24, 2011), Moscow, Russia. – P. 347-348.

Отредактировано kushelev (2012-01-11 16:48:07)
Last Edit: 28 Авг 2015 10:36 by Vladimirovich.

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 10:50 #358

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
Фемто: Куевы:


Слава Україні!!! Героям Слава!!!

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 11:06 #359

  • kushelev
  • kushelev's Avatar
  • OFFLINE
  • Думный дьяк
  • Posts: 266
  • Karma: 0

Ширина ступеней пикотехнологической модели совпадает с толщиной двойной спирали ДНК, которую видно в электронный микроскоп

Пикотехнология изображения белков 11 Янв 2012 11:14 #360

  • PauLita
  • PauLita's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Рыцарь Желтого Ведерка
  • Posts: 7557
  • Thank you received: 44
  • Karma: 5
Фемто Куево


Слава Україні!!! Героям Слава!!!
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум