Контексты и комментарии генома
28 Март 2019 21:38 #61
Хайдук wrote:
издеваетесь, что ли, а хайд? если фсё может быть, какого хрена ради вам таблица?? неужели Петрович просверлил бошку и щас уже поддакиваете его бреду??
Позабавимся еще и еще раз тугодумности товарища. Таблица - эскиз, дружеский шарж на код. Не более. Гибкий выбор сиом противостоит жесткости избыточного кодирования син. кодонами. В этом мудрость кода, единство и борьба противоположностей в нём. Окончательная (но немыслимая) победа син. кодонов или сиом означает гибель биосистем. Этого разумная Вселенная допустить не может, даже если товарищ будет и дальше сильно волноваться.
Контексты и комментарии генома
28 Март 2019 22:57 #70
nonlocality wrote:
Контекст для рибосом в мРНК
Т.е. Вы хотите сказать, что в зависимости от контекста, записанного на мРНК, кодоны UUU,UUC (Phe) и UUA,UUG (Leu) будут прочитаны по-разному? Этот контекст обяжет рибосому ассоциироваться или с тРНК фенилаланина или лейцина?
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 00:47 #73
nonlocality wrote:
Таблица - эскиз, дружеский шарж на код. Не более. Гибкий выбор сиом противостоит жесткости избыточного кодирования син. кодонами. В этом мудрость кода, единство и борьба противоположностей в нём. Окончательная (но немыслимая) победа син. кодонов или сиом означает гибель биосистем.
ага, дружеский шарж это ваши писанины вызывающие бурное и непрекращающееся веселье ; видимо, лозунги Маркса-Ленина-Сталина всё ещё звенят в башке совковой безнадёжной
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 18:05 #76
nonlocality, а почему Вы решили, что таинство перекодировки мРНК происходит именно на рибосоме? Есть факты?
И какой контекст может быть на мРНК, если она несет только первичную последовательность?
The vertebrate mitochondrial DNA (mtDNA) genetic code
Differences between the vertebrate mtDNA code and the "Universal" code are indicated in red. Note that AUA and AUG (AUR) are both Met codons, UGA codes for Trp rather than being a Stop codon such that Trp is now two-fold degenerate (UGR), and AGA and AGG (AGR) codons are read as Stops instead of Arg. The mtDNA code thus has four Stops. Slightly different mtDNA codes are found in Drosophila and other invertebrate groups.
The human mitochondrial (mt) DNA is commonly described as a small, maternally inherited molecule that encodes 13 protein components of the oxidative phosphorylation system and 24 structural RNAs required for their translation. However, recent studies indicate that the human mtDNA has a larger functional repertoire than previously believed. This paper briefly summarizes these studies, which suggest to reconsider our way to describe the human mitochondrial DNA as it may code for more than 13 proteins.
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 20:31 #78
hide wrote:
nonlocality, а почему Вы решили, что таинство перекодировки мРНК происходит именно на рибосоме? Есть факты?
И какой контекст может быть на мРНК, если она несет только первичную последовательность?
Ее контекст и будет. Но он многомерен, как мысль. И глубок, как мысль.
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 20:32 #79
hide wrote:
The vertebrate mitochondrial DNA (mtDNA) genetic code
Differences between the vertebrate mtDNA code and the "Universal" code are indicated in red. Note that AUA and AUG (AUR) are both Met codons, UGA codes for Trp rather than being a Stop codon such that Trp is now two-fold degenerate (UGR), and AGA and AGG (AGR) codons are read as Stops instead of Arg. The mtDNA code thus has four Stops. Slightly different mtDNA codes are found in Drosophila and other invertebrate groups.
The human mitochondrial (mt) DNA is commonly described as a small, maternally inherited molecule that encodes 13 protein components of the oxidative phosphorylation system and 24 structural RNAs required for their translation. However, recent studies indicate that the human mtDNA has a larger functional repertoire than previously believed. This paper briefly summarizes these studies, which suggest to reconsider our way to describe the human mitochondrial DNA as it may code for more than 13 proteins.
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 21:29 #81
nonlocality wrote:
Но он многомерен, как мысль. И глубок, как мысль.
Петр Петрович, Вы выдумали для себя какой-то фетиш и не желаете от него отступиться... Вы же сами говорите, что не понимаете суть контекста, т.е. не его смысл, а материальную реализацию. А я скажу, в чём он. В специфике биохимических реакций, являющихся результатом взаимодействия среды существования организма и реализации его кариотипа.
Контексты и комментарии генома
29 Март 2019 23:59 #82
hide wrote:
почему Вы решили, что таинство перекодировки мРНК происходит именно на рибосоме?
а где тому происходить, если вообще происходит, ведь там видим какую АК выбирает кодон, до этого якобы не знаем, если клюнуть на заверения Петровича
hide wrote:
какой контекст может быть на мРНК, если она несет только первичную последовательность?
никакой, конечно, если не ошибаюсь на мРНК некодирующих участков нет (в критическом отличии от ДНК) и значит не может быть никаких гаряевских контекстов
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 08:32 #83
Организм - клеточное государство с распределением функций, запасов энергии, классов, групп и пр. Все это - совокупность общественных отношений. В этой совокупности выделяются люди - те, кто мыслит более правильно. Их мысль и преобладает. История - отбор этих мыслей. Они, в сущности, есть лингвистический геном каждого государства - руководство к действию.
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 08:38 #84
hide wrote:
Петр Петрович, Вы выдумали для себя какой-то фетиш и не желаете от него отступиться... Вы же сами говорите, что не понимаете суть контекста, т.е. не его смысл, а материальную реализацию. А я скажу, в чём он. В специфике биохимических реакций, являющихся результатом взаимодействия среды существования организма и реализации его кариотипа.
Мы многое не понимаем, но пользуемся. Например, фотонами, электронами, генами, собственными мозгами. Биохимические реакции, в итоге - способ реализации собственных генетических и умственных способностей.
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 08:57 #85
Хайдук wrote:
hide wrote:
почему Вы решили, что таинство перекодировки мРНК происходит именно на рибосоме?
а где тому происходить, если вообще происходит, ведь там видим какую АК выбирает кодон, до этого якобы не знаем, если клюнуть на заверения Петровича
ПГ: Геном и клетка - два компьютера, работающих в параллельном режиме, по сути, это двойной суперкомпьютер. Они, вероятно, объединены квантовой нелокальностью и представляют одно мыслящее целое с выделением мозга как центра. Все это - не замкнутая система, открытая в космос, во Вселенную, принимающую активное участие в нашей Жизни и Мышлении.
hide wrote:
какой контекст может быть на мРНК, если она несет только первичную последовательность?
никакой, конечно, если не ошибаюсь на мРНК некодирующих участков нет (в критическом отличии от ДНК) и значит не может быть никаких гаряевских контекстов
ПГ: Ошибаетесь. Рибосомы, в каких-то текстовых ситуациях на мРНК, совершают "прыжки", транспозиции, игнорируя тот или иной фрагмент РНК текста по каким-то, нам пока неведомым соображениям. Но в иной генетико-метаболической ситуации (мега-контекст?), рибосомы уже будут читать ранее проигнорированный текстовый фрагмент. Это похоже на прыгающие гены (транспозоны), которые, перемещаясь, по ДНК генома, ищут подходящий контекст, который обеспечит узнавание гена и его использование.
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 14:33 #86
nonlocality wrote:
Организм - клеточное государство с распределением функций, запасов энергии, классов, групп и пр. Все это - совокупность общественных отношений. В этой совокупности выделяются люди - те, кто мыслит более правильно. Их мысль и преобладает. История - отбор этих мыслей. Они, в сущности, есть лингвистический геном каждого государства - руководство к действию.
полностью бессмысленное и бесполезное сравнение, 110% пурги
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 14:36 #87
nonlocality wrote:
ПГ: Геном и клетка - два компьютера, работающих в параллельном режиме, по сути, это двойной суперкомпьютер. Они, вероятно, объединены квантовой нелокальностью и представляют одно мыслящее целое с выделением мозга как центра. Все это - не замкнутая система, открытая в космос, во Вселенную, принимающую активное участие в нашей Жизни и Мышлении.
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 14:54 #88
nonlocality wrote:
ПГ: Ошибаетесь. Рибосомы, в каких-то текстовых ситуациях на мРНК, совершают "прыжки", транспозиции, игнорируя тот или иной фрагмент РНК текста
как раз на это и хотел обратить внимание: может мРНК снимает НЕ все триплеты вдоль ДНК, а только те, что наверняка пойдут на выбор соответствующей, практически единственной АК или на стоп/старт синтеза очередного белка; поэтому контекст может быть у исходной ДНК, но никак НЕ у мРНК и значит у рибосомы попросту НЕТ доступа к контексту, if any
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 17:53 #89
Хайдук wrote:
как раз на это и хотел обратить внимание: может мРНК снимает НЕ все триплеты вдоль ДНК, а только те, что наверняка пойдут на выбор соответствующей, практически единственной АК или на стоп/старт синтеза очередного белка; поэтому контекст может быть у исходной ДНК, но никак НЕ у мРНК и значит у рибосомы попросту НЕТ доступа к контексту, if any
Рибосомы прыгают далеко - на сотни нуклеотидов. Контекст на ДНК? Вполне допустимо. Ведь надо выбрать огромный кусок пре-мРНК с нужными смыслами. А потом еще умно вырезать экзоны-нужные тексты (гены). А солитоны (чтецы текстов ДНК и РНК) продемонстрированы нами и другими в рамках мат. моделей.
Контексты и комментарии генома
30 Март 2019 18:07 #90
но это значит, что АК любого кодона фиксирована - прыжки рибосомы не имеют значения, поскольку та может прыгать (если вообще) лишь вдоль мРНК, а не ДНК.
; видимо, лозунги Маркса-Ленина-Сталина всё ещё звенят в башке совковой безнадёжной 
