Ключевое слово
25 | 04 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Контексты и комментарии генома

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 13:41 #31

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
чё-то начал пороть пургу про гексаграммы а ля Петрович, хайд, не ли случаем воюешь в АТО на Домбассе и стучишь в отгулах меж стрельбой? :angry:

легко прикинуть, что ФСЁ об очень длинной линейке нуклеотидов/букв днк давно уже пропахано компами и просто глупо выпендриваться любыми предложениями по поводу :blush:
Last Edit: 27 Март 2019 14:41 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 15:09 #32

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Повторю вопросы-рассуждения, а они ключевые, если хотим понять КОД таким, кокой он есть.

1. Почему "принцип" коллинеарности НЕ СОБЛЮДАЕТСЯ строго? (Предсказываю)...

2. Почему это не проверяется в нужном объеме?

Если будет, рано или поздно, поверено и достоверна доказана не строгая коллинеарность
КОДОН-АМИНОКИСЛОТА, то модель кода будет иной. Работу с новой моделью начал и продолжаю.

Хайд, вольно или невольно, идет по ложным тропинкам в полях, где пасутся тысячи исследователей, питаясь иллюзорной травой.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 20:18 #33

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
"принцип" коллинеарности НЕ СОБЛЮДАЕТСЯ строго
Наверно,лучше говорить о КОРЕЛЛЯЦИИ...

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 20:52 #34

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 106837
  • Thank you received: 2078
  • Karma: 105
nonlocality wrote:
Если будет, рано или поздно, поверено и достоверна доказана не строгая коллинеарность...
Петр, Вам ясно было сказано, что это бредятина.
Сколько можно болтать ерундой и использовать известные термины в своих бестолковых целях? :)
Строгая, не строгая...

Коллинеарность - это свойство векторов, означающее, что они параллельны.
Из Вики...
Если [tex]{{\vec {a}}||{\vec {b}}}[/tex] и [tex] {{\vec {b}}\neq 0}[/tex] , то cуществует действительное число [tex]{\lambda }[/tex] такое, что [tex]{{\vec {a}}=\lambda{\vec {b}}}[/tex]

Очередной "Ротор поля наподобие дивергенции градуирует себя вдоль спина" (с)
Каждому - своё.
Last Edit: 27 Март 2019 20:56 by Vladimirovich.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:10 #35

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
hide wrote:
nonlocality wrote:
"принцип" коллинеарности НЕ СОБЛЮДАЕТСЯ строго
Наверно,лучше говорить о КОРЕЛЛЯЦИИ...
полагаю, что корреляция совсем не то, что коллинеарность кодон-АК, насчёт которой Петрович занимается инсинуациями и вводит в заблуждение :angry:

коллинеарности естественно ожидать, то бишь линейный порядок кодонов задаёт соответствующий линейный порядок АК в цепочке белка/пептида; с какого перепугу (окромя злой инсинуации) эти два порядка могут не соответствовать друг другу, когда даже Петрович не знает о таких фактах?? совершенно бессмысленная (и злая) инсинуация Петровича :mad:
Last Edit: 27 Март 2019 21:18 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:12 #36

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
Наверно,лучше говорить о КОРЕЛЛЯЦИИ...
Нет. Именно об отсутствии 100% однозначного соответствия кодон-аминокислота, что постулировано станд. моделью КОДА Ниренберга-Крика.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:13 #37

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Таки это и есть корелляция... :P

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:21 #38

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
nonlocality wrote:
Именно об отсутствии 100% однозначного соответствия кодон-аминокислота, что постулировано станд. моделью КОДА Ниренберга-Крика.
примерчики в студию, иначе это инсинуация :popcorn:

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:23 #39

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
hide wrote:
Таки это и есть корелляция... :P
само словцо несущественно, хайд :beer:
Last Edit: 27 Март 2019 21:25 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:33 #40

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Vladimirovich wrote:
Петр, Вам ясно было сказано, что это бредятина.
Сколько можно болтать ерундой и использовать известные термины в своих бестолковых целях?
Строгая, не строгая...

Коллинеарность - это свойство векторов, означающее, что они параллельны.
Из Вики...
Если a⃗ ||b⃗ a→||b→ и b⃗ ≠0b→≠0 , то cуществует действительное число λλ такое, что a⃗ =λb⃗ a→=λb→

Очередной "Ротор поля наподобие дивергенции градуирует себя вдоль спина" (с)
В генетике братки-"спецы" живут по понятиям, не по математике. :lol:

Вот определения коллинеарности в "братковом" понимании - yandex.ru/search/?text=%D0%BA%D0%BE%D0%B...clid=1955453&win=232

Вместе с тем, в ВИКИ уже не употребляют термин "коллинеарность", но применяют слово "соответствие", ссылаясь на С.Очоа. Почему не употребляют? Сообразили, что "коллинеарность" - это слишком жестко...

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:36 #41

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Вот, из ВИКИ - "Дальнейшие правила соответствия между кодонами и аминокислотами были установлены в лаборатории Северо Очоа".

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:39 #42

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
железное соответствие будет пожёстче коллинеарности :xren:

Контексты и комментарии генома 27 Март 2019 21:41 #43

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
железное соответствие будет пожёстче коллинеарности
железо плавится в жаркой печи контекстов.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 00:19 #44

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
вам, ув. Петрович, не ли стыдно тупо долдонить о неких гипотетических контекстах без каких-либо примеров "плавления" железной (с парой-другой очень редких исключений) Таблицы ниже? :O

IMG_5502_2019-03-28.JPG
Last Edit: 28 Март 2019 10:57 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 08:18 #45

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
вам, ув. Петрович, не ли стыдно тупо долдонить о неких гипотетических контекстах без каких-либо примеров "плавления" железной (с парой-другой очень редких исключений) таблицы ниже?
При "плавлении" надо анализировать не Таблицу в её тупой мертвой статике, а чтение рибосомой информационной РНК (мРНК). Именно тогда Таблица Кода начинает оживать. мРНК начинает играть живыми смыслами потенциальных генов, кои есть контексты. Они же и начинают делегировать значения букв 3'-нуклеотидам кодонов сиом, что приводит в итоге к точной аминокислотно-стоповой семантике всего триплета сиом. Единственное препятствие понять это, незамысловато простое, не в вашем способе размышлять, но в безуспешном желании что-то "логичное" противопоставить мне. Проще говоря, вами руководят эмоции, а не наука и логика.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 15:51 #46

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
ну, если вами руководят не эмоции, а наука и логика, то почему не воспринимаете "логичную" на 99,99% и простую как щебень с галькой таблицу сферху? вместо этого вы ухитрились нарисовать её как Инь и Ян, кто в позе 69 друг другу отсасывают... :rofl:
Last Edit: 28 Март 2019 15:54 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 16:56 #47

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Таблица Кода НЕ ЛОГИЧНА. Это другим, кто не понял, не вам. Контекстные ориентации рибосом поняты частью мол. биологов и генетиков. См., например, высказывания акад. РАН, Дир. Инст. Белка РАН в Пущино Л.П.Овчинникоа об этом. И это направление названо "второй генетический код". Ссылку на статью Л.П.Овчинникова давал не раз.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 17:09 #48

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
но ведь вами руководят якобы наука и логика, как поняли тогда, что НЕ ЛОГИЧНА ?

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 17:17 #49

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
полагаю, что 2й ген. код это эпигенетика, метилирование и пр. хня, но никак НЕ ваше "32 сиомы кодируют любую из 20+ АК" :flag:

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 19:55 #50

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
но ведь вами руководят якобы наука и логика, как поняли тогда, что НЕ ЛОГИЧНА ?
Легко. Сиомы одновременно кодируют разные две аминокислоты См. экСп.доказательство этого (Туранов и др, 2009г., ссылку давал), предсказанное мной в 1997г. ССЫЛКУ ДАВАЛ.
Суть: сиомы должны ВЫБИРАТЬ правильную аминокислоту. Таблица кода не дает ответа, как выбирать. Ответ: выбирать рибосоме по контексту мРНК. Всё. Если снова не понял, сам сообрази, кто и что ты есть. :lol:

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 20:00 #51

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
полагаю, что 2й ген. код это эпигенетика, метилирование и пр. хня, но никак НЕ ваше "32 сиомы кодируют любую из 20+ АК"
Эпигенетика шире. Это все, что не укладывается в модель Кда Ниренберга-Крика.

32 сиом кодона могут кодировать любую из 20 аминокислот, плюс 3 экзотические. ВСЁ зависит от контекста мРНК.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 20:00 #52

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
Таблица кода не дает ответа, как выбирать. Ответ: выбирать рибосоме по контексту мРНК
На то она и таблица...Показывает, ЧТО может быть...А контекст для рибосомы где расположен? На мРНК? :?
Last Edit: 28 Март 2019 20:01 by hide.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 20:42 #53

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
nonlocality wrote:
Сиомы одновременно кодируют разные две аминокислоты
nonlocality wrote:
32 сиом кодона могут кодировать любую из 20 аминокислот, плюс 3 экзотические.
режет мозг противоречьем :tired:

hide wrote:
На то она и таблица...Показывает, ЧТО может быть...
издеваетесь, что ли, а хайд? :O если фсё может быть, какого хрена ради вам таблица?? неужели Петрович просверлил бошку и щас уже поддакиваете его бреду?? :tired:

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 20:46 #54

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Читайте внимательно...В таблице просто установлено соответствие "кодон-АК"...

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:10 #55

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
... но Петрович утверждает, что будет намного бОльше соответствий и значит таблица ничем их не лучше... :dontknow:

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:27 #56

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Перевод кодонов на язык Книги перемен...

BooK.png
Last Edit: 28 Март 2019 21:28 by hide.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:27 #57

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
hide wrote:
На то она и таблица...Показывает, ЧТО может быть...А контекст для рибосомы где расположен? На мРНК?
Огорчаете. Был уверен, что уж вы-то поняли не сложные триплет-аминокислотно-стоповые кодовые отношения при биосинтезе белков. Контекст для рибосом в мРНК.

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:32 #58

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
hide wrote:
Перевод кодонов на язык Книги перемен...

BooK.png

??

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:33 #59

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 1010
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Что есть что? :?

Контексты и комментарии генома 28 Март 2019 21:34 #60

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49377
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
??
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум