Ключевое слово
20 | 03 | 2019
Новости Библиотеки

Шахматы онлайн

Чессбомб

Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Контексты и комментарии генома

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 09:35 #91

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77017
  • Thank you received: 1002
  • Karma: 81
nonlocality wrote:
Признать надо одно. Оба толкуем об одном и том же с разных сторон.
:writing:
Ну тогда зачем надо было орать? :) Надо было понять сначала
nonlocality wrote:
Вам нравится термин ИНВАРИАНТНОСТЬ, а мне - ДВУМЕРНАЯ ВЫРОЖДЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА.
А вот это неверно. Это разные термины.
Инвариантность это грубо (без формальностей) X=C где C константа

Т.е UC+X= Серин и связь UC-Серин не зависит от Х, т.е имеем инвариантность

Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
величин - см. в Вики например Вырожденная Матрица
ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D1%8B%D1%80...80%D0%B8%D1%86%D0%B0
Формально вырожденность можно связать конечно - существует инвариант для некоей связи между двумя величинами
Например 1*0.5 = поллитра :) Здесь 1 - инвариант :xren:

Но это НЕ ТОТ инвариант. Говоря вырожденность, Вы говорите зависимость.
И тем самым выносите народу мозг :figa:
Вот в чем проблема.
Каждому - своё.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 10:02 #92

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Миражи «Волнового Г.....а» потихоньку растворяются в тумане.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 10:10 #93

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13660
  • Thank you received: 36
  • Karma: 0
Поршень wrote:
Миражи «Волнового Г.....а» потихоньку растворяются в тумане.

Аха, - ужо 10-й год... причем судя по некоторым признакам это явно далеко даже от периода полураспада...
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 12:52 #94

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 6762
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Vladimirovich wrote:
Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот (своя для каждого из 8 семейств), постоянство, игнорирующее кодовые функции 3'-нуклеотида в син. кодонах.
Для сиом кодонов иначе - это мРНК-КОНТЕКСТНО-НАВЯЗАННАЯ ЗАВИСИМОСТЬ от 3'-нуклеотида кодона с делегированным буквенным значением.

Попробуйте сказать короче. Кто-то требовал смысл контекстуальных манипуляций рибосом с мРНК. ВОТ ОН.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:05 #95

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
дэбилизьм Петровича зашкаливает уже, вон снизу таблица железная, только пары-другой исключений пока воспрянуло :xren:

ниже видно, что речь НЕ про группу CU UCC UCA UCG, а про группу серина UCU UCC UCA UCG

эти 4 кодона никак НЕ лучше или хуже кодонов AGU и AGC, что тоже кодируют серин :figa: , остальное суть дэбилизьм непостижимых масштабов с лёгкой руки нашего друга ув. Петровича :beer:

IMG_5502_2019-03-15.JPG
Last Edit: 15 Март 2019 13:20 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:09 #96

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Ваша основная ошибка ППГ, что Вы по не понятной для всех причине « привязались» к « буквенному значению», тем самым ЯВНО не понимаете того факта, что на уровне молекул нет подобных бирок. Есть ЭМ-Облако и оно имеет и другие «сигнальные» значения.
Именно этот факт и сдвигает Вас на уровень лох-ученого

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:15 #97

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
Vladimirovich wrote:
Вырожденность это другое. Это понятие линейной алгебры, грубо (без формальностей) означающее напротив - ЗАВИСИМОСТЬ
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот (своя для каждого из 8 семейств), постоянство, игнорирующее кодовые функции 3'-нуклеотида в син. кодонах.
Для сиом кодонов иначе - это мРНК-КОНТЕКСТНО-НАВЯЗАННАЯ ЗАВИСИМОСТЬ от 3'-нуклеотида кодона с делегированным буквенным значением.

Попробуйте сказать короче. Кто-то требовал смысл контекстуальных манипуляций рибосом с мРНК. ВОТ ОН.
Вы манипулируете терминами,словно теми нуклеотидами в кодонах...Без раскрытия их сущности при выборе того или иного сценария трансляции...Понятно,что контекстно.Почему этот контекст вданное время и в данном месте определяет данную инструкцию?

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:28 #98

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
контекстно лишь для пары-другой триплетов сферху, хайд, и давно застукано какая именно пара-другая контекстов выделяет эту пару-другую триплетов, не стоит цепляться за бредъ Петровича :flag:
Last Edit: 15 Март 2019 13:43 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:36 #99

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77017
  • Thank you received: 1002
  • Karma: 81
nonlocality wrote:
В генетике, при работе белок-синтезирующей машины, по другому. Для син. кодонов вырожденность - это НЕЗАВИСИМОСТЬ (постоянство) кодирования аминокислот
Ну вот, наконец, мы пошли по правильному пути :)
А чей это термин? Хорошо ли придумывать термины, которые противоречат математическим?

Ибо в математике не бывает двусмысленности
А если она есть в биологии, это проблемы биологии

"-- Второй смысл -- вот что вздор! Строгость бывает только одна -- первая, она же и последняя.
А если термин второго смысла, то это означает, что он тухлый!
Строгость, строгость и строгость, вот что должно быть девизом всякого буфетчика биолога." (с)
:beer:
Каждому - своё.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 13:46 #100

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Да тут вааще неправильно подразделяются кодоны...Упор надо делать на функциональные различия при трансляции.
Основным должен быть вопрос : Почему та или иная аминокислота кодируется различным числом кодонов.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 14:03 #101

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
нету функциональных различий, хайд, и бОльше одного триплета кодирует одну АК, поскольку имеем 20+ АК, а дуплетов (!) из 4х букв AUCG всего 16 и значит дуплетов не хватит; триплетов из тех же букв 64, что много бОльше 20 и потому будет большой избыток кодирования, it's as simple as that but still выше башки Петровича :dumb:
Last Edit: 15 Март 2019 14:14 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 14:43 #102

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Так давайте возьмем 20 любых кодонов и будем кодировать. Остальные - лесом ..Почему нет? :flag:
Last Edit: 15 Март 2019 15:24 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 14:51 #103

  • Поршень
  • Поршень's Avatar
Ну а этим должен заниматься био-компьютер в клетке ( по идеологии Группы Чукч... ), но они только только подходят к описанию работы оного, и ещё нужно думать как написать дополнительные программ ЭМ-воздействия для этого воздействия.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:08 #104

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77017
  • Thank you received: 1002
  • Karma: 81
hide wrote:
Основным должен быть вопрос : Почему та или иная аминокислота кодируется различным числом кодонов.
Я вот думаю, что это как раз вторично. Вообще здесь все вторично :)

Первичен сам факт гомоморфизма кодонов на аминокислоты за очень редкими исключениями (№3 в моем списке)
Каждому - своё.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:23 #105

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Гомоморфизм можно отнести к способу организации биосинтеза. А избыточность - к управлению этим процессом.
Last Edit: 15 Март 2019 15:25 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:24 #106

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
hide wrote:
Так давайте возьмем 20 любых кодонов и будем кодировать. Остальные - лесом ..Почему нет? :flag:
с этим вопросом к Природе обращайтесь, если хфатит духу :hihihi:

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:25 #107

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
:mad:
Я изложил гипотезу, а Хфакты найдем... :flag:
Last Edit: 15 Март 2019 15:42 by hide.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:27 #108

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
hide wrote:
Гомоморфизм можно отнести к способу организации биосинтеза. А избыточность - к управлению этим процессом.
опять бессмыслицу сморозил, хайд, чё-то много стало этих бессмыслиц давеча :blush:
Last Edit: 15 Март 2019 16:03 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 15:30 #109

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
hide wrote:
:mad:
Я изложил гипотезу, а факты найдем... :flag:
ага, найдёшь, когда весной расцветут сапоги :bugaga:

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 16:00 #110

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77017
  • Thank you received: 1002
  • Karma: 81
hide wrote:
Гомоморфизм можно отнести к способу организации биосинтеза. А избыточность - к управлению этим процессом.
И то и другое способы.
Избыточность есть факт, что гомоморфизм не является изоморфизмом.
Вот как мы формально поставим вопрос :idea:
Каждому - своё.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 16:58 #111

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 6762
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
дэбилизьм Петровича зашкаливает уже, вон снизу таблица железная, только пары-другой исключений пока воспрянуло

ниже видно, что речь НЕ про группу CU UCC UCA UCG, а про группу серина UCU UCC UCA UCG

эти 4 кодона никак НЕ лучше или хуже кодонов AGU и AGC, что тоже кодируют серин , остальное суть дэбилизьм непостижимых масштабов с лёгкой руки нашео друга ув. Петровича
Народ, вы что нибудь поняли из сказанного г-ном Хайдуком?

Косноязычие и бессвязность... Что это за "снизу таблица железная"? Какое исключения "воспрянули"? Что за группа CU? И причем здесь группа серна? И таинственное: "эти 4 кодона никак НЕ лучше или хуже кодонов AGU и AGC, что тоже кодируют серин , остальное суть дэбилизьм непостижимых масштабов"

Действительно "дэбилизьм"...

Хайдук, вы в порядке?

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 17:05 #112

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
вы, Петрович, не понимаете обыкновенную русскую речь, 2+2 сложить не можете :tired: ; таблицу не видите, что ли, триплеты, что кодируют СЕРИН ? :O

IMG_5502_2019-03-15.JPG
Last Edit: 15 Март 2019 17:07 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 17:15 #113

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
даже хайд понял, но не вы... какую аминокислоту кодируют кодоны UCU UCC UCA UCG AGU AGC согласно таблице сферху, а? :idea:

а исключения это ваша пара случаев, уже забыл каких, когда кодон кодирует АК, что не соответствуют таблице сферху, капиш? :angry:
Last Edit: 15 Март 2019 17:39 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 17:38 #114

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Vladimirovich wrote:
hide wrote:
Гомоморфизм можно отнести к способу организации биосинтеза. А избыточность - к управлению этим процессом.
И то и другое способы.
Избыточность есть факт, что гомоморфизм не является изоморфизмом.
Вот как мы формально поставим вопрос :idea:

Нет..Структура системы и управление ее состоянием через изменение этой структуры - две большие разницы... :flag: Это проявится при проектировании внешнего управления... :writing:

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 17:41 #115

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
in case u don't mind, хайд, это тривиальное и расплывчатое пустословие ни о чём :)
Last Edit: 15 Март 2019 17:45 by Хайдук.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 17:52 #116

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Инквизицию надоть уважать... :lol:

"...соотношение содержания эу- и гетеро-хроматина характерны для клеток каждого типа..." Что бы это значило?

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 18:04 #117

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
хз :dontknow:

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 18:14 #118

  • hide
  • hide's Avatar
  • OFFLINE
  • Сокольничий
  • Fed quod potui, faciant meliora potentes
  • Posts: 345
  • Thank you received: 1
  • Karma: 1
Еще одна нобелиатная гипотеза:
Частота использования каждого из син-кодонов для трансляции данного белка различна для разных типов клеток и кореллирует с функциональным значением данного белка в клетках данного типа.. :flag:

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 18:19 #119

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 6762
  • Thank you received: 14
  • Karma: -15
Поршень wrote:
Ваша основная ошибка ППГ, что Вы по не понятной для всех причине « привязались» к « буквенному значению», тем самым ЯВНО не понимаете того факта, что на уровне молекул нет подобных бирок. Есть ЭМ-Облако и оно имеет и другие «сигнальные» значения.
Именно этот факт и сдвигает Вас на уровень лох-ученого
"Привязанность к буквенному значению" генетического кода первыми обнаружили М.Ниренберг и Ф.Крик, получившие за эту "привязанность" по Нобелевской премии. В отличие от лохизма Поршня, не доросшего для публикации даже в Мурзилке. :lol: Но Ф.Криком и М.Ниренбергом были допущены существенные ошибки по этой части, которые заметил и корректирую. При этом имею в виду, что буквенно-текстовая составляющая генетической информации неисчерпаема. И работы тут хватит еще на столетия.

Контексты и комментарии генома 15 Март 2019 18:20 #120

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 35598
  • Thank you received: 78
  • Karma: 23
ауу, Петрович: где в семействе AG 3ья буква якобы вобулирует, когда по таблице сферху AGU и AGC всегда и во веки веков кодируют серин, а AGA и AGG всегда и во веки веков кодируют аргинин? :popcorn:
Last Edit: 15 Март 2019 18:21 by Хайдук.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум