Немецкие биологи усовершенствовали систему редактирования генома «спящая красавица» — это способ доставки генов в клетку на основе мобильных элементов. Новый вариант метода позволяет избежать бесконтрольного встраивания «груза» в геном. Он работает как на взрослых, так и на стволовых клетках, а технология генной терапии CAR-T с его применением становится быстрее и безопаснее. Работа опубликована в журнале Nature Biotechnology...
...направление редактирования генома — с помощью мобильных генетических элементов, или транспозонов. Это участки ДНК, которые способны вырезать себя из одного места генома и встроить в другое — для этого они кодируют фермент транспозазу. Многие такие последовательности в нашем геноме потеряли активность со временем. Но в 1997 году ученые восстановили один из предковых вариантов транспозазы, который «замолчал» в геноме рыб миллионы лет тому назад — и назвали его «спящей красавицей», в честь долгого «сна» и внезапного «пробуждения».
«Спящую красавицу» уже пробовали использовать на клетках человека, и некоторые технологии с ее применением дошли до 1-2 фазы клинических испытаний...
...Эта система работает эффективно, но с ней есть одна трудность: она не позволяет контролировать работу транспозазы — сколько раз она сумеет встроить «груз» в геном и не попадет ли вместе с ним что-то лишнее. Поэтому клетки, которые редактируют таким способом, после этого долго — до месяца — культивируют, чтобы убедиться в том, что в них не возникло лишних мутаций. Но не каждый пациент — особенно, если речь идет о CAR-T терапии, когда в иммунные клетки «вживляют» рецептор для опухолевых белков — может прождать так долго.
Ирма Керкес (Irma Querques) и ее коллеги из Европейской молекулярной биологической лаборатории (EMBL) в Гейдельберге разработали новый вариант системы на основе «спящей» красавицы. Они предложили вводить в клетку не плазмиду с ферментом транспозазой, а белок в чистом виде. Предыдущие попытки этого добиться закончились неудачей, потому что транспозаза слипается в комки и плохо проходит через мембрану.
Исследователи заменили две аминокислоты в составе транспозазы, что сделало белок более растворимым в воде. Полученную «гипер-растворимую» транспозазу они поместили в клетки с помощью электропорации и сравнили результат с обычной плазмидой: чистый белок постепенно исчез из клеток в течение суток, а плазмида оставалась на месте по меньшей мере 5 дней. Это означает, что действие «усовершенствованной» транспозазы будет коротким, а следовательно, она сможет внести меньше лишних мутаций в геном.
Ученые опробовали свой метод на опухолевых клетках HeLa, затем на эмбриональных стволовых и на кроветворных клетках. И только после этого решили применить его в реальной технологии — CAR-T. Исследователи взяли человеческие Т-клетки и внесли в них ген химерного рецептора, который распознает В-клеточную лимфомы. Эффективность встраивания получилась около 20-30 процентов — примерно такая же, как и в реальной технологии CAR-T, которую применяют в клинике и которая основана на вирусной доставке гена.
В культуре отредактированные клетки уничтожили более 60 процентов опухолевых клеток на своем пути, а также вылечили больных лимфомой мышей в течение недели. При этом в каждой Т-клетке ученые обнаружили около 5 встраиваний гена в ДНК — это в два раза меньше, чем если бы в клетку попала кольцевая ДНК с геном транспозазы. Кроме того, ген примерно в четверти случаев встроился в «безопасные» места генома — это примерно так же часто, как если бы он встраивался случайным образом, и в 8,5 раз чаще, чем векторы на основе ВИЧ.
Авторы работы отмечают, что их новая система может продвинуть редактирование с помощью транспозазы в клинических исследованиях. Она работает безопаснее, чем предыдущие аналогичные методы, но позволяет переносить больший груз, чем точечные редакторы вроде CRISPR/Cas9. Идеальным вариантом, по мнению исследователей, стала бы синтетическая конструкция, которая сочетает в себе точность CRISPR/Cas9 и низкое число осечек транспозазы.
...
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
05 Нояб 2019 18:36 #8885
Хайдук wrote:
неужели красавицу... того... во сне?
На приеме психиатр показывает Хайдуку лист, на котором нарисован
треугольник, и просит рассказать о том, что он видит на рисунке.
- Ну, это совсем просто, доктор! - отвечает Хайдук. Это дом, в котором
двое занимаются любовью.
- Хм. Интересно. А это что? - спрашивает доктор, показывая квадрат.
- А это кровать, на которой двое занимаются любовью.
- Очень интересно. А это, по-вашему, что? - интересуется доктор и рисует
на листе круг.
- А это бассейн, в котором двое занимаются любовью.
- Ну а это что такое? - доктор показывает лист с изображением зигзага.
- Доктор! Да Вы просто сексуальный маньяк!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
05 Нояб 2019 21:20 #8887
limarodessa wrote:
Авторы работы отмечают, что их новая система может продвинуть редактирование с помощью транспозазы в клинических исследованиях. Она работает безопаснее, чем предыдущие аналогичные методы, но позволяет переносить больший груз, чем точечные редакторы вроде CRISPR/Cas9. Идеальным вариантом, по мнению исследователей, стала бы синтетическая конструкция, которая сочетает в себе точность CRISPR/Cas9 и низкое число осечек транспозазы.
Эти редактирования - и это, и crispR Cas9 слепые или полуслепые - куда транспозицируются транспозоны и Cas нуклеазы - они сами не знают. Бьют часто мимо цели (off target). мШЭИ точно знает куда. Почему, не понятно. Думать надо физикам. Но главное - ЗНАЕТ.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
06 Нояб 2019 07:47 #8890
limarodessa wrote:
- А это бассейн, в котором двое занимаются любовью.
- Ну а это что такое? - доктор показывает лист с изображением зигзага.
- Доктор! Да Вы просто сексуальный маньяк Хайдук!
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
11 Нояб 2019 09:29 #8901
а что скажет уважаемый Пётр Петрович на такой вброс? Будет он глотать эстроген, для отращивания бюста, или воспользуется мощью вихревого генома катушек Мишина?
Грипп и ОРВИ, постепенно подрывая здоровье, сокращают на несколько лет среднюю продолжительность жизни человека. www.sunhome.ru/journal/116638
Ученые из Университета Джонса Хопкинса в США определили, что мужской грипп существует. Во-первых, женщины обладают более высоким болевым порогом, что известно уже давно. Он помогает им лучше переносить боли во время родов. Во-вторых, в женском организме отмечается более высокий уровень полового гормона эстрогена, который защищает представительниц прекрасного пола от самых агрессивных проявлений гриппа.
Эстроген подавляет способность вируса воспроизводиться и тем самым наращивать свое присутствие в организме. Данное открытие имеет большое практическое значение. Использование эстрогена в терапевтических целях
=
Когда у 48-летнего англичанина Джонни Нормала появились кашель и высокая температура, то он со смехом говорил жене, что стал жертвой мужского гриппа. Это шутливое название простудных заболеваний, при которых мужчины резко преувеличивают свои страдания, чтобы вызвать симпатию и сочувствие близких. Однако через несколько недель жертва мужского гриппа оказалась в искусственной коме, и врачи сообщили его родственникам, что им, возможно, придется отключить аппараты жизнеобеспечения.
Это стало страшной реальностью после того, как грипп Джонни перерос в пневмонию, при которой инфекция вызвала отек тканей легких, что способствовало трудностям с дыханием. Врачи беспокоились, что мозг Джонни необратимо поврежден из-за нехватки кислорода, и он никогда не сможет очнуться. Сканы также показали, что несчастный мужчина перенес инсульт, вызвавший паралич левой части тела.
Все прогнозы были неутешительными, но к большому удивлению врачей и счастью родственников, которые уже пришли попрощаться с Джонни, мужчина продемонстрировал признаки жизни, а через несколько дней вышел из комы. Эта жертва инсульта следующие 6 месяцев заново училась ходить и говорить, и в настоящий момент он все еще находится дома, восстанавливаясь после тяжелейшей болезни.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
11 Нояб 2019 10:40 #8902
Викторович wrote:
а что скажет уважаемый Пётр Петрович на такой вброс? Будет он глотать эстроген, для отращивания бюста, или воспользуется мощью вихревого генома катушек Мишина?
Грипп и ОРВИ, постепенно подрывая здоровье, сокращают на несколько лет среднюю продолжительность жизни человека. www.sunhome.ru/journal/116638
У меня отработано за десятилетия - утром 1,5 - 2 часовая тренировка в виде бега или ходьбы 1 час, затем силовая зарядка с отжиманиями, приседаниями, качанием пресса, турником.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
11 Нояб 2019 10:50 #8903
Скромнее стал пользователь "Петрович", уже на хвастается 200 "отжиманий" за пять секунд или кросс 5 км за одну минуту, а проще... тренировка в виде ходьбы 1 час.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
11 Нояб 2019 10:53 #8904
nonlocality wrote:
У меня отработано за десятилетия - утром 1,5 - 2 часовая тренировка в виде бега или ходьбы 1 час, затем силовая зарядка с отжиманиями, приседаниями, качанием пресса, турником
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
11 Нояб 2019 13:31 #8908
limarodessa wrote:
Определенный процент привитых прищемленных согласно медицинской статистике все равно заболевает
Ага. Значит, наш любимый вождь старается, и всё зря? А Петрович - сам окопался под турником, обложился.. (обклался?) как катушками, а вождю советовать не желает.. (боится прищемления?)
Члены правительства входят в группу риска по заболеваемости гриппом, а значит обязаны проходить плановую вакцинацию. Об этом Владимир Путин заявил после доклада министра здравоохранения Вероники Скворцовой об эпидемической ситуации в России.
На совещании в Кремле присутствовали члены правительства и руководство администрации главы государства. Как выяснилось, кроме Путина, прививки сделали только трое. Президента такое отношение к профилактике не понравилось.
«Гриппом заболел – самострел. Ну а как? Мог предотвратить – не предотвратил. Я вас прошу подумать об этом»., – резюмировал Владимир Путин