Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
15 Янв 2019 20:55 #7300
limarodessa wrote:
Сила злодействия равна силе противодействия:
Information transmission in microbial and fungal communication: from classical to quantum
Bacterial biophotons as non‐local information carriers: Species‐specific spectral characteristics of a stress response
Entanglement between living bacteria and quantized light witnessed by Rabi splitting
Ну ты, Игорь, снова подтвердил свой высочайший профессионализм научного сыскаря. Эти статьи точно ложатся в русло наших работ. Гигант!
Им бы это модифицировать сторону спинтронных эффектов. Без них ссылки на квантовую запутанность бактериальных биофотонов явно недостаточны. Надо бы с ними связаться. Спишись. Я подключусь.
Ранее, мы выдвинули лингвистико-вероятностную модель языка генетического кода , основываясь на модели естественных и искусственных языков [В.В.Налимов, 1979, Вероятностная модель языка]. Цитирую фрагмент из нашей ранней работы
«Можно постулировать качественную, упрощенную, первичную версию вещественно-волнового контроля за порядком выстраивания аминокислот, задаваемым ассоциатами аминоацилированных tРНК как предшественниками белков. Приняв такую версию, легче понять работу белкового кода как одной из множества иерархических программ вещественно-волновой организации биосистемы. В этом смысле такой код - первый этап хромосомных планов построения биосистемы, поскольку язык генома многомерен, плюралистичен и не исчерпывается задачей синтеза протеинов. Основные положения предлагаемой ориентировочной модели вещественно-волновых знаковых процессов при биосинтезе белков сводятся к следующему:
1. Многокомпонентный рибонуклеопротеидный белоксинтезирующий аппарат является системой генерации высокоорганизованных знаковых излучений акустико-электромагнитных полей, стратегически регулирующих его самоорганизацию и порядок включения аминокислот в полипептидную цепь.
2. Аминоацилированные tРНК ассоциируют в последовательности - предшественники синтезируемых белков до контакта с А-P участком рибосомы. При этом континуум антикодонов пулов tРНК комплементарен всей mРНК, за исключением дислокаций, определяемых наличием не канонических нуклеотидных пар.
3. Порядок чередования аминоацилированных tРНК в ассоциатах-предшественниках белков определяется знаковыми коллективными резонансами всех участников синтеза аминокислотных последовательностей. Ключевые волновые матрицы здесь пре-mРНК и mРНК, работающие как целостный континуум (макроконтекст) разномасштабных по длине гетерополикодонов, включая интронную фракцию пре-mРНК. Главная функция волновых матриц - ассоциативно-контекстная ориентация последовательности аминоацилированных tРНК, ориентация, в большей степени чем "вобл-гипотеза" Ф.Крика, игнорирующая правила канонических спариваний нуклеотидов в одномерном пространстве mРНК-tРНК. На рибосоме, в дополнение и/или наряду с резонансными регуляциями взаимного расположения кодон-антикодоновых континуумов функционируют лазероподобные излучения участников данного процесса, корригирующие порядок включения аминокислотных остатков в пептид. Рибосома энзиматически ковалентно фиксирует “де-юрэ” пептидные связи аминокислотных последовательностей, намеченные “де-факто” в полиаминокислотном-поли-tРНК-ассоциате, как предшественнике белка.
4. Резонансно-волновая “цензура” порядка включения аминокислот в пептидную цепь устраняет потенциальный семантический произвол создания ошибочных белковых “предложений”, следующий из омонимии семейств кодонов, и обеспечивает их правильное “аминокислотное осмысление” за счет контекстного снятия омонимии неоднозначных одинаковых дублетов в кодонах. Тот же механизм работает при неоднозначностях более высокого порядка, когда число кодонов (n+1).
5. Вырожденность генетического кода необходима для пре-mРНК-mРНК-зависимого контекстно-ориентированного точного подбора аминоацилированных tРНК, определяемого характером волновых ассоциативных резонансных взаимодействий в белок-синтезирующем аппарате.
6. Один из механизмов процесса создания безошибочных последовательностей аминоацилированных tРНК на волновых матрицах пре-mРНК-mРНК можно рассматривать как частный случай частично комплементарной реассоциации однотяжных ДНК-ДНК и РНК-ДНК или, в более общем случае, как акт самосборки, известный для рибосом, хромосом, мембран и других молекулярно-надмолекулярных клеточных структур.
7. Рибосома способна работать в направлении синтеза РНК на матрице белков.
Таким образом, роль mРНК знаково многовекторна и дуалистична. Эта молекула, как и ДНК, в эволюции знаменует собой узловое событие - взаимодополняющее синергичное единство вещественной и волновой геноинформации. Неоднозначность вещественного кодирования снимается прецезионностью волнового, которое реализуется, вероятно, по механизмам коллективных резонансов и лазерно-голографических (ассоциативных, контекстно-фоновых) эффектов в клеточно-тканевом континууме. Скачок к более развитому волновому регулированию трансляции РНК® Белок сопровождается частичным или полным отказом от правила канонического спаривания аденина с урацилом (тимином) и гуанина с цитозином, свойственного эволюционно ранним и более простым этапам репликации ДНК и транскрипции РНК. Такой отказ информационно необходим, неизбежен и энергетически предпочтителен на уровне высших биосистем. Еще раз подчеркнем, что контекстные ассоциативно-голографические механизмы работы белок-синтезирующей системы организмов теснейшим образом связаны с так называемым “фоновым принципом” [44], а также, вероятно, с многовекторной и многосмысловой логикой управления сложными системами (кенограмматика Герхарда Томаса) [26]. С этой позиции макроконтексты пре-информационных и контексты информационных РНК можно рассматривать как фон, который в данной ситуации и в данной трактовке является "шумовым источником информации". Это обеспечивает резкое усиление сигнала, по которому происходит точный выбор (волновое распознавание) одной из двух омонимичных аминоацилированных tРНК, одна и только одна из которых должна войти в точные белковые “фразу” или “слово”. Этот выбор возможен после выделения когерентной составляющей в форме повторов одних и тех же "осмыслений" (распознаваний) рибосомой одного из двух одинаковых дублетов в кодонах. Ситуацию можно пояснить на простом примере. Скажем, в предложении надо выбрать одно из двух слов (аналогов кодонов с дублетами-омонимами). Эти слова - “суд” и “сук”. Ясно, что выбор зависит от целого предложения, от контекста, который выступает как фон, позволяющий выделить сигнал - нужное слово. Если предложение звучит “я увидел толстый сук на дереве”, то замена здесь слова “сук” на “суд” будет равносильна введению шума и потере сигнала. Вероятно, аналогична роль пре-информационных РНК и интронов - это различные уровни контекстов, которые должны быть каким-то образом “прочитаны” и “осмыслены” живой клеткой и ее рибосомным аппаратом для принятия точного решения по выбору антикодона tРНК в ситуации омонимии.
Аппаратом континуального (нелокального) “чтения” контекстных РНК-последовательностей как целого может выступать многоликое семейство солитонов - оптических, акустических, конформационных, вращательно-колебательных и иных, возбуждаемых в полинуклеотиде. Функции таких солитонов могут выступать как способы накопления семантической информации о РНК-контекстах и следующей за этим смысловых регуляций кодон-антикодоновых знаковых взаимоотношений. Смысловые оценки при этом проводятся геномами-биокомпьютерами клеток. В качестве одного из способов континуального прочтения полинуклеотидов можно представить именно солитонный, сканирующий последовательность РНК. Например солитоны бегущих крутильных колебаний нуклеотидов на сахаро-фосфатной оси, физико-математически рассмотренный нами для однотяжных РНК-подобных участков ДНК [30, 36]. Такие солитоны реагируют на изменения последовательностей нуклеотидов модуляциями своей динамики, которая приобретает черты знаковости и может, вероятно, передаваться дистантно, то есть на расстояния, существенно превышающие длину водородных связей. Без дальней (волновой, континуальной) миграции сигнала о целом, то есть о пре-mРНК-mРНК-последовательностях, невозможна реализация ассоциативно-контекстных регуляций синтеза белков. Для этого необходима волновая способность солитонов (а также и голографической памяти) работать не только с частями, но и с целым. Такая континуальность, или что одно и то же, нелокальность, обеспечивает узнавание и правильный выбор рибосомным аппаратом истинного кодона из двух дублет-омонимичных, кодона псевдо-зашумленного фоном (контекстом)».
Сейчас мы будем развивать эти представления и наши новые идеи о сиом-кодонах в направлении попыток понять роль кажущейся избыточности тРНК при белковом кодировании. Одновременно это будет расширение вероятностной модели языков В.В.Налимова на язык или языки генома.
Кто-нибудь читал книгу Иоганнеса Марио Зиммеля "Ушли клоуны, пришли слезы..." ? Это детектив. О молекулярных биологах. Автор утверждает, что книга практически полностью основана на реальных событиях. Действие книги происходит в 1986 году в Западной Германии (ФРГ). Я хотел бы узнать о каких реальных событиях идет речь
Вполне вероятно, что с возрастом в процессе сперматогенеза накапливаются ошибки репликации как ДНК, так и РНК, а также при транскрипции мРНК с генов. Статистика упрямая вещь. Только почему только сперматогенез рассматривается. То же может относится и к оогенезу.
Только почему только сперматогенез рассматривается. То же может относится и к оогенезу.
Видно, что Вы не прочли абстракт по ссылке (второй из двух), которую я привел. Там четко написано, что возраст женщин не влияет на вероятность. Только возраст отцов nonlocality wrote:
Вполне вероятно, что с возрастом в процессе сперматогенеза накапливаются ошибки репликации как ДНК, так и РНК, а также при транскрипции мРНК с генов. Статистика упрямая вещь.
"Вполне возможно" не означает, что это и есть причина. Причина может быть в совсем другом, но также связанном со сперматозоидами. Статистика говорит только лишь о том что это сперматозоиды. Но не говорит что это ошибки. Почему и авторы и Вы пишете именно об ошибках как единственно возможном факторе ?
Приняв такую версию, легче понять работу белкового кода как одной из множества иерархических программ вещественно-волновой организации биосистемы.
Это согласуется с метафизической универсальной структурированности всей реальности, как сочетание объект - среда, или точнее, как сочетание относительно локализованных и относительно распределённых объектов.
Что касается лингвистики, то слова, как таковые, представляют из себя запомненный звукоряд, связанный с тем или иным объектом или феноменом. Сами объекты и феномены должны быть воспроизводимы, так же как и слова с ними связанные, например: дерево, гром. Слова нужны в первую очередь для передачи информации другим субъектам, так как наедине с собою, человек может мыслить образами.
Если такое понимание верно, то как это связано с генетической лингвистичностью?
Ведь надо найти генетический аналог мышления образами и понятиями (словами), а также аналог говорения и слушания словами.
Попутно можно сказать, что память слова дерево это квази-цифра памяти аналоговой картинки (образа) дерева.
Если такое понимание верно, то как это связано с генетической лингвистичностью?
Ведь надо найти генетический аналог мышления образами и понятиями (словами), а также аналог говорения и слушания словами.
На это может ответить наша работа по введению словесного алгоритма в опыте на Русском, Английском и Немецком языках в радиационно пораженные семена растений. В контроле - алгоритм-абракадабра. Геномы проростков в опыте достоверно восстанавливались на достоверно значимые величины независимо от языка, в контроле - нет. Независимость положительного эффекта говорит о том, что действующее начало - мысль, которая не вербальна (беЗсловесна), и она первична. Слова и фразы вторичны и материализуют мысль.
Поэтому правильно установлено, что перевод Библейского "Вначале было Слово" неверный. Вначале была Мысль!
Гаряев П.П., Внучкова В.А., Шелепина Г.А., Комиссаров Г.Г., 1994, Знаковые модуляции резонансов Ферми-Паста-Улама как методология вхождения в командно-образный строй генома. Журнал русской физической мысли., N1-4, с.17-28. ukr.rusphysics.ru/files/Garyaev.Verbalno...ntich.modulyacii.pdf
"Вполне возможно" не означает, что это и есть причина. Причина может быть в совсем другом, но также связанном со сперматозоидами. Статистика говорит только лишь о том что это сперматозоиды. Но не говорит что это ошибки. Почему и авторы и Вы пишете именно об ошибках как единственно возможном факторе ?
Возможно - не значит, что так. Любое нарушение сперматогенеза на всех его многочисленных этапах приведет к патологиям. Это тоже возможно.
Хайдук, уже давно произошла инфляция ценности ваших комментариев, поскольку они не содержат ничего, кроме завуалированной или явной ругани. Вы же не раскрываете тайный для нас смысл словосочетания "ерунда несусветная". Все у вас сводится к базарному - ты дурак. Ответ может быть только зеркальный.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Янв 2019 16:18 #7315
Но, с другой стороны, Хайдук в чукч-ветке снова попал в яблочко: "просто не могут кодоны мРНК посредством излучения кучкувать тРНК антикодоны (таскающие АК) как стадо овец".
Разобьем этот тезис на составные: "просто не могут". Это похоже на правду. А если НЕ ПРОСТО, то могут? Речь идет о кодон-антикодоновом взаимодействии (взаимоузнавании) - ключевое место в кодировании аминокислот и стоп-позиций при биосинтезе белков. Считается и доказано, что это взаимодействие идет по водородным связям между азотистыми основаниями кодонов и антикодонов A-U и G-C. НО это близкие и слабые взаимодействия на ангстремном уровне. Помню, еще будучи студентом каф. мол. биологии биол. ф-та МГУ задавал вопрос акад. Сисакяну на его спец курсе по функциональной биохимии клеточных структур в разделе по рибосомам. Вопрос мой ему был таков: как тяжелый комплекс 'тРНК-аминокислота' (тРА) может найти ТОЧНУЮ дорогу к кодону мРНК и своим антикодоном соединится с ним посредством водородных ангстремных связей? Ведь тРА придется преодолеть большие жидко кристаллические вязкие расстояния до мРНК и при этом не заблудится, и при этом преодолевать хаотизирующее броуновское движение при температуре биосистемы в 36,6 гр.по Ц. Ничего мне не ответил Нораир Мартиросович Сисакян... И сейчас нет ответа. Есть идея какого-то организующего полевого влияния. Что за поле или поля у тРА и мРНК и рибосом, на которых идет сборка белков? Если ДНК излучает когерентный свет в диапазоне 250-800нм, то для тРА и мРНК такие излучения пока не зафиксированы. А вот солитонную акустику рибосом и ДНК в рамках феномена ФПУ-памяти я лично регистрировал методом корреляционной лазерной спектроскопии. И фиксировал возвратные изоморфные спектральные состояния для ДНК и рибосом, т.е. фактически резонансы ФПУ. Это описано в моей 1-й монографии "Волновой геном" (1994г.). Имеет-ли это отношение к регуляции биосинтеза белков? Не знаю Возможно.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Янв 2019 16:33 #7316
Вообще-то "Группа Чукч.." говорит об "облаке" (наборе) аминокислот еще не связанных в виде РНК (различных типов), и пытаются объяснить почему и из-за чего это "облако" там присутствует.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
17 Янв 2019 17:21 #7317
nonlocality wrote:
как тяжелый комплекс 'тРНК-аминокислота' (тРА) может найти ТОЧНУЮ дорогу к кодону мРНК и своим антикодоном соединится с ним посредством водородных ангстремных связей?... Ничего мне не ответил Нораир Мартиросович Сисакян... И сейчас нет ответа.
да чего взять было с балбеса с такими именем и отчеством? безусловно щас знают намного бОльше о воссоединении этом
Ирландские медики впервые описали случай, когда пациент лечился собственной спермой. Мужчина ежемесячно, в течение 1,5 лет внутривенно вводил себе свою сперму, пытаясь вылечить боли в спине. Лечение не увенчалось успехом, а пациент вдобавок заработал воспаление на руке. Уникальный случай описан в Irish Medical Journal.
В больницу Аделаиды и Мит в Дублине обратился 33-летний мужчина с жалобами на сильные внезапные боли в пояснице. Они начались три дня назад, после того как пациент поднял тяжелый стальной предмет и с того момента усиливались. Кроме того мужчина и раньше жаловался на постоянные боли в пояснице. Неврологическое обследование не выявило травм позвоночника. Но при дальнейшем осмотре пациента медики обратили внимание на покраснение и сыпь у него на правой руке. Мужчина признался, что для того, чтобы вылечить боли в спине, он в течение последних полутора лет ежемесячно делал себе инъекции собственной спермы. В основном он вводил себе «лекарство» внутривенно, а также несколько «доз» внутримышечно. «Лечение» пациент назначил себе сам, не консультируясь с врачами.
Медики под руководством доктора Лизы Данн (Lisa Dunne) обнаружили у пациента воспаление и проникновение спермы в мягкие ткани правой руки. Мужчине сделали рентенограмму, на которой под кожей обнаружилась эмфизема (скопление воздуха). Его немедленно госпитализировали и провели курс лечения антибактериальными препаратами. За время пребывания в больнице боль в спине у мужчины прошла и он решил выписаться.
В то же время медики поискали сведения о лечении спермой в научной и медицинской литературе. Они нашли упоминания о внутривенных инъекциях бензина, жидкости для зажигалок, ртути, соляной кислоты. Но таким образом люди обычно пытались покончить жизнь самоубийством, а не вылечиться. Ни одного упоминания об использовании спермы в качестве лекарства авторы не нашли и заключили, что это первый подобный случай...
