Ключевое слово
23 | 06 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение)

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:30 #61

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
поскольку авторы вольно или невольно своими размытыми спектрами подтвердили главное - контекст,короткий-ли, длинный-ли, вызывает случайный или не случайный выбор аминокислот (не по Крику)при биосинтезе пептидов . Отсюда и размытие пиков масс спектров.

где контекст в 21-членнике ? )

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:37 #62

  • Чукча не из Сибири ...
  • Чукча не из Сибири ...'s Avatar
В том контексте в котором ищет истину пользователь nonlocality фундамента для ВГ конечно нет.
Именно это и отмечает пользователь Поршень называя эти построения - виртуальными ...(в лучшем случае гипотезами - ничем не подтвержденными)
ps
Нет такого препятствия, которое русский человек не смог бы обматерить.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:40 #63

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
PP wrote:
В статье четко указывается разрешающая способность (в еденицах массы) метода. В статье четко демонстрируется, что замена одной аминокислоты на другую приводит к возникновению дополнительного пика, который отлично разрешается.

какая на какую АК была замена ?

это важно .. - для массы )

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:42 #64

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
nonlocality wrote:
Косвенно это уже получено в скандальной работе Прюита и Лолли. Ссылку дать?


что конкретно там получено ?

- авторы говорят про кэш мРНК только

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:53 #65

  • Вика
  • Вика's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярыня
  • Posts: 3270
  • Thank you received: 6
  • Karma: 0
Олегу, на вопрос о замене амк.
PP wrote:
В статье четко указывается разрешающая способность метода. Авторы могут различить в виде пика замену одной аминокислоты, что они и делают

Слева wild type, справа гетерозиготная мутация в результате которой наблюдаем второй пик (3484.25).
wild type: CCT TCA CAG TGT CCT TTA TGT -> mutant: CCT TCA CAG GGT CCT TTA TGT
Last Edit: 25 Март 2019 05:41 by Vladimirovich.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 09:55 #66

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
www.pereplet.ru/obrazovanie/stsoros/523.html

там ЧТО И КАК ЗАКОДИРОВАНО В мРНК (ОВЧИННИКОВ Л. П. , 1998)

с сылкой на Гаряева и его мысли )
АКЛЮЧЕНИЕ

Таким образом, в молекулах мРНК содержится информация не только о последовательности аминокислот для определенного белка или белков, но также информация о том, когда, в каком количестве, в каком месте клетки и при каких условиях этот белок будет синтезирован. Схема расположения соответствующей информации на молекуле мРНК показана на рис. 5. Последовательность аминокислот в белке закодирована в виде линейной последовательности нуклеотидов. Другая информация в мРНК может содержаться как в виде определенных нуклеотидных последовательностей, так и в форме определенных пространственных структур, которые образует мРНК. Информация об одном и том же свойстве мРНК может содержаться в разных частях молекулы мРНК, иногда отстоящих друг от друга вдоль полинуклеотидной цепочки на значительном расстоянии. Весьма вероятно, однако, что эти участки молекулы мРНК сближаются при формировании ее пространственной структуры. Функциональные сигналы в мРНК могут узнаваться рибосомами, молекулами РНК (тРНК, регуляторными РНК) или белками.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 10:03 #67

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
Вика wrote:
CCT TCA CAG TGT CCT TTA TGT -> mutant: CCT TCA CAG GGT CCT TTA TGT

= посчитайте массу пептида и разницу между цистеином и глицином и сравните с чувств метода .. (лень мне)

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 12:27 #68

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
Олег wrote:
(лень мне)

854 от 808 конечно отличит любой МС..

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 12:38 #69

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Олег wrote:
контексты существуют реально

простейший пример - регуляторные последовательности мРНК, обеспечивающие узнавание старт-кодона

для узнавания третьей буквы триплета для дуплетов-омонимов важна структура тРНК, выбор из аа-тРНК и кучи факторов

все гораздо сложнее, но из изученных примеров декодирования пока нет никаких причин для ВГ и тд

я не сомневаюсь в таких контекстах, Олег, хотя немного удивляет "куча факторов" ради 3-ей буквы, в конце концов 3-ья буква работает, по-видимому; попросту Гаряев ищет контексты там, где они слабо пляшут.
Last Edit: 12 Янв 2015 12:40 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 13:16 #70

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
Хайдук wrote:
хотя немного удивляет "куча факторов" ради 3-ей буквы, в конце концов 3-ья буква работает,

она "работает" (при дуплетах-омонимах) ин виво благодаря десяткам факторов на всех уровнях отбора

ин витро, в минимальной системе трансляции, где ничего лишнего нет - влияние контекста и

хорошо показаны

в

Nat Commun. 2014 Jul 21;5:4459. doi: 10.1038/ncomms5459.
High-efficiency translational bypassing of non-coding nucleotides specified by mRNA structure and nascent peptide.
Samatova E1, Konevega AL2, Wills NM3, Atkins JF4, Rodnina MV1.
Author information
Abstract
The gene product 60 (gp60) of bacteriophage T4 is synthesized as a single polypeptide chain from a discontinuous reading frame as a result of bypassing of a non-coding mRNA region of 50 nucleotides by the ribosome. To identify the minimum set of signals required for bypassing, we recapitulated efficient translational bypassing in an in vitro reconstituted translation system from Escherichia coli. We find that the signals, which promote efficient and accurate bypassing, are specified by the gene 60 mRNA sequence. Systematic analysis of the mRNA suggests unexpected contributions of sequences upstream and downstream of the non-coding gap region as well as of the nascent peptide. During bypassing, ribosomes glide forward on the mRNA track in a processive way. Gliding may have a role not only for gp60 synthesis, but also during regular mRNA translation for reading frame selection during initiation or tRNA translocation during elongation.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 15:26 #71

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Хайдук wrote:
хотя немного удивляет "куча факторов" ради 3-ей буквы, в конце концов 3-ья буква работает,
Олег wrote:
она "работает" (при дуплетах-омонимах) ин виво благодаря десяткам факторов на всех уровнях отбора.
а при дуплетах-синонимах работает ли на всех уровнях? :?

моя мысель заключается в следующем: рибосома может перепрыгивать участки мРНК как приспичит и по науськиванию какого угодно контекста, но когда наконец намылилась запустить очередную аминокислоту (как отрезок текущего производимого ею белка/пептида) на каком именно ТРИПЛЕТ-е остановилась рибосома, отвечает ли этот триплет 64-таблице Крика-Ниренберга (и значит в пику Гаряеву)? :idea:
Last Edit: 12 Янв 2015 15:45 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 15:27 #72

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Вика wrote:
Петрович, похоже, что представленные графики - хроматограмма (см. почту), а не спектрограмма. Однако, указано, что "спектры". :dontknow:
Это масс спектры.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 15:39 #73

  • Globa
  • Globa's Avatar
  • OFFLINE
  • Десятник
  • Posts: 14
  • Karma: 0
Как звёзды и галактики летят в космосе, движимые голограммой.
Так и то же происходит в нас каждое мнгновение.
Всё предопределено.
Нами правит тёмная материя - вселенская голограмма.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 15:42 #74

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 107508
  • Thank you received: 2111
  • Karma: 106
Дорогой Глоба, во всем должна быть мера. Следующие тезисы подобного рода уедут в другую тему
Каждому - своё.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 15:44 #75

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Глоба смахивает на агента/фэна парадигмы ЛВГ :flag:

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:16 #76

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Таким образом, в молекулах мРНК содержится информация не только о последовательности аминокислот для определенного белка или белков, но также информация о том, когда, в каком количестве, в каком месте клетки и при каких условиях этот белок будет синтезирован. Схема расположения соответствующей информации на молекуле мРНК показана на рис. 5. Последовательность аминокислот в белке закодирована в виде линейной последовательности нуклеотидов. Другая информация в мРНК может содержаться как в виде определенных нуклеотидных последовательностей, так и в форме определенных пространственных структур, которые образует мРНК. Информация об одном и том же свойстве мРНК может содержаться в разных частях молекулы мРНК, иногда отстоящих друг от друга вдоль полинуклеотидной цепочки на значительном расстоянии. Весьма вероятно, однако, что эти участки молекулы мРНК сближаются при формировании ее пространственной структуры. Функциональные сигналы в мРНК могут узнаваться рибосомами, молекулами РНК (тРНК, регуляторными РНК) или белками.
акад. Овчинников разъясняет немного как-будто дэбилам :lol: ; лично я не уверен, однако, что туёвой хучи "информацию о том, когда, в каком количестве, в каком месте клетки и при каких условиях" синтезировать белки должно найти на молекуле мРНК или в способах её пространственных конфигураций: может белки заодно с попроще хим. соединениями вроде минералов и других веществ сами-то и поплясывают, далеко НЕ всегда и НЕ обязательно по науськиванию генов :idea:
Last Edit: 12 Янв 2015 17:11 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:18 #77

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
Хайдук wrote:
рибосома может перепрыгивать участки мРНК как приспичит и по науськиванию какого угодно контекста, но когда наконец намылилась запустить очередную аминокислоту (как отрезок текущего производимого ею белка/пептида) на каком именно ТРИПЛЕТ-е остановилась рибосома, отвечает ли этот триплет 64-таблице Крика-Ниренберга

не нужно в этом разбираться тут "всерьез" на таком уровне

не то чукчи устроят поле чудес

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:23 #78

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Холоп
  • Posts: 31409
  • Thank you received: 224
  • Karma: -124
nonlocality wrote:
Молекулярный ион на шкале нельзя растянуть в принципе. Это одна молекула пептида или группа идентичных молекул пептидов. Если же мы имеем дело с группой близких по мол. массе пептидов, что и получено в статье, то растягивать можно - получите мазню, поскольку разрешение спектров мало. Да, если верить статье (есть сомнения), то второй пик действительно появился. Но в аспекте обсуждаемой проблемы это не имеет существенного значения, поскольку авторы вольно или невольно своими размытыми спектрами подтвердили главное - контекст,короткий-ли, длинный-ли, вызывает случайный или не случайный выбор аминокислот (не по Крику)при биосинтезе пептидов . Отсюда и размытие пиков масс спектров.
Физика наука точная и тут надо конкретно указывать какому изменению массы соответствует ширина пика, ваши рассуждения на пальцах не проходят сразу по трем причинам.
1) Если бы действительно мы имели дело с идеализированной системой где пики имеют нулевую ширину, то согласно ВГ мы бы наблюдали не один размытый пик, а много пиков соответствующих омонимам
2) Если бы действительно один размытый пик соответствовал различным пептидам, то мы бы не увидели отдельный пикк для мутанта, ибо мутант отличается заменной одной аминокислоты на другую, т.е. не должен отличаться от омонимов.
3) Идеальных пиков нулевой ширины не бывает на практике, а вы даже раздел метод в статье не удосужились прочитать.
For each sample, we averaged 256 scans obtained with a laser setting of 1,800. Raw data were analyzed using PerSeptive GRAMS/32 soft- ware, and no smoothing was performed on the spectra. Predicted peptide masses were calculated using the Prowl program in monoisotopic mode (prowl.rockefeller.edu/cgi-bin/sequence).

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:24 #79

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Холоп
  • Posts: 31409
  • Thank you received: 224
  • Karma: -124
Vladimirovich wrote:
Дорогой Глоба, во всем должна быть мера. Следующие тезисы подобного рода уедут в другую тему
А зачем их ждать?

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:28 #80

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
Хайдук wrote:
рибосома может перепрыгивать участки мРНК как приспичит и по науськиванию какого угодно контекста, но когда наконец намылилась запустить очередную аминокислоту (как отрезок текущего производимого ею белка/пептида) на каком именно ТРИПЛЕТ-е остановилась рибосома, отвечает ли этот триплет 64-таблице Крика-Ниренберга
Олег wrote:
не нужно в этом разбираться тут "всерьез" на таком уровне

почему же, Олег, ведь как раз в этом и заключается вопрос быть ли вообще ген. коду как таковому или такового попросту ... не бывает, к чему как-будто тяготеет ув. знаток Петрович, по-видимому? :unsure:
Last Edit: 12 Янв 2015 16:29 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:28 #81

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Хайдук wrote:
не знаю зачем разделение пептидов по массам нужно толковать как омонимию, может попросту разные гены/кодоны-триплеты орудовали и потому разные пептиды получились? обсуждаем массы черт знает чего, когда можем точно знать какие гены орудовали и какие точно белки получились :dontknow: за исключением 1-2 омонима Олега других таковых среди 64 кодонов-триплетов как-будто НЕ застукано. Гаряев говорит об омонимии среди дуплетов, которой очевидно не может не быть, но такая "омонимия" улетучивается с легкой руки уже следующей 3-ей буквы, а не неким неопределенным контекстом. Разумеется, можем отказаться от идеи любого ген. кода вообще и объявить, что не знаем как, когда, какие и зачем производятся белки :tired:
Омонимия не может "улетучиться", поскольку 3-я буква в кодоне НЕ УЧАСТВУЕТ в кодировании по Крику. 3-я буква обеспечивает омонимическую гибкость кодирования за счет контекстных нелокальных актов чтения контекста мРНК рибосомой. Надо бы усвоить это.

PP wrote:
Вы не поняли Хайдук. Авторы транслируют коротенький кусочек ДНК длинной в 7 кодонов (21 нуклеотид). В результате получают пептид PSQCPLC. Потом снимают масс спектр и видят пик, там где ему и положено быть исходя из массы пептида. Потом делают точно такой же эксперимент с другим образцом где 50/50 смесь той же ДНК и ДНК с мутацией в результате которой получается PSQCPLC/PSQGPLC. Снова снимают спектр и действительно видят два пика -один для PSQCPLC, а второй для PSQGPLC. Тоесть метод может четко различить изменение массы при замене одной аминокислоты на другую.
А что предсказывает теория ВГ? А теория ВГ предсказывает, что при трансляции короткого куска контекста нет и модель Крика не работает. На выходе в результате должен быть не один пептид, а много разных ибо практически каждый кодон имеет омонимы. Если бы это было так, то мы бы видели либо кучу пиков либо один очень широкий, и тогда было бы невозможно в принципе отличить мутанта от wild type. Итого мы с вами получили противоречие предсказаний ВГ эксперименту, гипотеза (теорией тут называть пока нечего) Гаряева не подтвердилась. Если Гаряев не сможет конструктивно объяснить это противоречие, то тему можно собственно и закрывать.
Наличие второго "мутантного" пика не исключает коротко-контекстных игр, и мы видим это на размытых пиках масс спектров, сопутствующих основному и "мутантному" пикам масс спектров. Имеет место некий уровень неопределенности, стохастики в придании значений кодонам-омонимам как следствие малой длины 7-членного контекста матрицы РНК.
Last Edit: 12 Янв 2015 16:39 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:29 #82

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Холоп
  • Posts: 31409
  • Thank you received: 224
  • Karma: -124
Олег wrote:
какая на какую АК была замена ?

это важно .. - для массы )
Я же привел конкретные последовательности. PSQCPLC -> PSQGPLC
Да и статью можно почитать, у них все точно, а не на пальцах, как у Гаряева :)
The wild-type spectrum for the peptide encoded by codons 51–71 of BRCA1 has a peak at 3,530.13 Da, which agrees well with the predict- ed mass of 3,531.70 Da for the sodium adduct (Fig. 2C). The spec- trum from a carrier for the C61G mutation (Fig. 2D) includes the wild-type signal as well as one at 3,484.25 Da, which corresponds to the predicted mass of 3,485.71 Da for the mutant peptide plus sodi- um. Thus, the observed 46.58 Da difference between the signals in the spectrum is within 1 AMU of the predicted mass difference expected for a cysteine to glycine substitution.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:36 #83

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Чукча не из Сибири ... wrote:
Вообще то аргументов у него и нет. Были гипотезы, оформленные в виде монографий и изданных им же. Насчет ссылки ..можно и тезисно ..
К сожалению, нет. Ваши высказывания, лишены просто фактов. Одни так сказать “смыслы” которые не имеют никакого практического применения, так как оторваны от реальных событий и данных. Вами совершена ошибка (примерно как бы ошибка “второго рода”), когда Вы перескакиваете с понятий реальных химических и электрохимических взаимодействий на словесную пургу - заменяя их как бы “словосочетанями” или “смыслами”. И далее играете этими словосочетаниями отдаляя практику от виртуальной гипотезы. По мере Вашего разоблачения этих “видений” Вы, как обычно дополняете эту “пургу” - добавляя новые требования “смыслы”
Вы впадаете в тот самый грех, что зря приписываете мне. Вместо конкретной критики с вашей стороны - лишь общие фразы, "пурга", как вы изволите выражаться. Задайте конкретный вопрос или дайте конкретный пример моих ошибок с обоснованием ошибочности.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:39 #84

  • Олег
  • Олег's Avatar
  • OFFLINE
  • Бездумный дворянин
  • Posts: 10251
  • Thank you received: 43
  • Karma: 1
PP wrote:
Я же привел конкретные последовательности. PSQCPLC -> PSQGPLC
Да и статью можно почитать, у них все точно, а не на пальцах, как у Гаряева

я разобрался )

замену цистеина на глицин при такой длине различит любой прибор даже с мин разрешением \200

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:50 #85

  • nonlocality
  • nonlocality's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 7340
  • Thank you received: 20
  • Karma: -15
Поршень wrote:
Для пользователя Вика.
Вам же дали ссылку. Фундамента нет. Есть голограмма, что можно где то найти этот фундамент. Сам ППГ утверждает:
"Нет таких исследований по причинам, о которых говорил не раз и не два. Будут такие исследования неизбежно. И вот тогда посмотрим на игрища контекстов".
Небольшая поправка: фундамента нет у сторонников Ф.Крика (похоронившего свою Модель :lol: ). Достроить фундамент можно, добавив второй вектор вырожденности белковому коду - омонимический.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 16:54 #86

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
nonlocality wrote:
Омонимия не может "улетучиться", поскольку 3-я буква в кодоне НЕ УЧАСТВУЕТ в кодировании по Крику. 3-я буква обеспечивает омонимическую гибкость кодирования за счет контекстных нелокальных актов чтения контекста мРНК рибосомой.
как не участвует, когда подавляющее согласие эксперимента с 64-таблицей ТРЁХПЛЕТНОГО кода подтверждает стабильность этого кода?? :flag: как вообще 3-я буква могла бы обеспечить какую бы то ни было "омонимическую гибкость" и почему только для половины (8) дуплетов? :dontknow:

nonlocality wrote:
Наличие второго "мутантного" пика не исключает коротко-контекстных игр, и мы видим это на размытых пиках масс спектров, сопутствующих основному и "мутантному" пикам масс спектров. Имеет место некий уровень неопределенности, стохастики в придании значений кодонам-омонимам как следствие малой длины 7-членного контекста матрицы РНК.
но ведь можем же идентифицировать ВСЕ разные пептиды и в результате бОльше двух разных там попросту НЕ настрогать, нет? :P
Last Edit: 12 Янв 2015 17:05 by Хайдук.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 17:01 #87

nonlocality wrote:
Небольшая поправка: фундамента нет у сторонников Ф.Крика (похоронившего свою Модель :lol: ). Достроить фундамент можно, добавив второй вектор вырожденности белковому коду - омонимический.
Извините господин Пётр Гаряев, но вы не приводите подтверждений своей теории, которая по Вашим словам опровергает существующие схемы коллинеарности.
Я не вдаюсь в профессиональные подробности обсуждения, но следя за ходом Вашего диалога, я наблюдаю что Вы элементарно игнорируете поставленные перед вами вопросы, просто бездоказательно настаивая на верности своих предположений и утверждений.
Так, насколько мне известно, научные диспуты не ведутся.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 17:04 #88

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49513
  • Thank you received: 133
  • Karma: 17
В.Гусев wrote:
наблюдаю что Вы элементарно игнорируете поставленные перед вами вопросы, просто бездоказательно настаивая на верности своих предположений и утверждений. Так, насколько мне известно, научные диспуты не ведутся.
:yess:

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 17:14 #89

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Холоп
  • Posts: 31409
  • Thank you received: 224
  • Karma: -124
nonlocality wrote:
Наличие второго "мутантного" пика не исключает коротко-контекстных игр, и мы видим это на размытых пиках масс спектров, сопутствующих основному и "мутантному" пикам масс спектров. Имеет место некий уровень неопределенности, стохастики в придании значений кодонам-омонимам как следствие малой длины 7-членного контекста матрицы РНК.
Читайте раздел методы. Размытость пиков не имеет ни малейшего отношения к заменам одной аминокислоты, на другую. Пики очень узкие, поэтому и различают с легкостью мутанта от нативного пептида. Статья, ксати далеко не единственная в своем роде, четко показывает однозначность трансляции даже при отсутствии биологического контекста. Итого самое фундаментальное предположение вашей теории находится в прямом противоречии с экспериментом.

Волновой геном №31. Беседы с Петровичем (продолжение) 12 Янв 2015 17:17 #90

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Холоп
  • Posts: 31409
  • Thank you received: 224
  • Karma: -124
В.Гусев wrote:
Так, насколько мне известно, научные диспуты не ведутся.
Полностью с вами согласен. Я надеялся, что Петр Петрович будет возражать предметно - с какими то конкретными выкладками, а не просто отмахиваться от аргументов.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум