И вот эта песня про "палку" - бесконечная она или конечная, поет мЭтр в виде измышлений про кодоны уже лет тридцать. Правда эту канарейку уже посадили в подвал, что бы не мешал науке двигаться далее. На самом деле, это словоблудие не имеющее никакого практического применения как лилось так и льется .. правда уже этот ручей почернел и запах соответствующий, но он в виртуальном изображении мЭтра самое главное его достижение за 60 лет испражнений на официальную науку.
ps Очень хитрая свинья уговорила волка принять ислам.
Попытаемся фуфлотрон В-генома раскрыть полностью. Учитывая что мЭтр не силен ни в каких областях, кроме своего самомнения. Введем дополнительные информационные данные, аденин - два бензольных кольца и две возможности водородных связей, гуанин - два бензольных кольца и три водородных связи, цитозин одно бензольное кольцо и три водородные связи, тимин -одно бензольное основание. Следовательно только в этом случае видно, что на сколько более многообразие в образование дополнительных связей как пространственных так и ЭМ-х связей. И они так же влияют на выбор.
Так, что учите вариационную математику с комбинаторикой ППГ и расширяйте Ваши таблицы, вместе с Вашей последователем Викой. Волны бесконечности ждут Вас в виде таблиц. Однако в пп. 2258 "Чукчи ..." зарыли мину. Вернее две мины. Наличие двух бензольный колец жестко определяет пространственное положение объекта, а это зависит от сохранения энергии, что в свою очередь связано с водородными связями и ЭМ облаками кочующими на самой молекуле. Наличие бензолового кольца (своеобразного варианта антенны) дает возможность внешнего удаленного контакта, так и расход самого ЭМ облака. Следователь есть уязвимые места в этой конструкции - потеря и воспроизведение потерянной энергии. А вот это уже относится к работе мШЭИ и настройках в контурах воздействия.
Приговор ко коду окончателен и пересмотру не подлежит ... Так что, осталось в осадке только ЭМИ и роль мШЭИ с цветными 3-х мерными волчками во главе их ...
ps - У вас водка есть?
- А тебе 18 есть?
- А у вас лицензия есть?
- Да ладно, чего завелся сразу...
все остальные триплеты - кодируют только ОДНУ аминокислоту и
молекулярные механизмы "выбора" третьей буквы известны и не нуждаются в ЭМИ
Ссылку, пожалуйста, на это "известное". Предлагал уже. Уже смотрел твои 2 ссылки на работу рибосом. Они никакого отношения к омонимии не имеют.
"Выбирается" не 3-я буква, она уже данность, но контекстно определяется смысл дублета-омонима, т.е что он кодирует. Как только такая информация получена, 3-я буква по прежнему вне игры, но дуплет СТАНОВИТСЯ ОДНОЗНАЧНО кодирующим. О роли 3-й буквы, точнее, о роли 3'-5' кодон-антикодоновой пары уже неоднократно говорил.
Фраза "все остальные триплеты - кодируют только ОДНУ аминокислоту" вообще чудовищна, если учесть каноническое и реально доказанное явление синонимии с ее изо-акцепторными тРНК. Об омонимах особый разговор, что веду тут 5-й год. В этом случае кодирование одной аминокислоты из 2-х возможных идет через контекстуальность. Которую ты уважаешь, но не до конца. Её главное проявление в осмыслении дублетов омонимов в соответствующих триплетах.
Фраза "все остальные триплеты - кодируют только ОДНУ аминокислоту" вообще чудовищна,
= для всех остальных триплетов - каждый из них кодирует только ОДНУ аминокислоту...
- там достаточно факторов трансляции и контекста, чтобы ОДНОЗНАЧНО посадить соответствующий триплетный антикодон аа-тРНК (их может быть несколько на одну аминокислоту) на триплетный кодон
- вариации ГК есть, но все они - изучены
не раз же об этом тут..
и больше не буду принимать никакого участия в обсуждении этого вопроса
но еще раз подчеркну
что для выбора правильной аа-тРНК пока достаточно описанных механизмов точности трансляции на всех ее стадиях без всяких мшей
===============
Предлагал уже. Уже смотрел твои 2 ссылки на работу рибосом. Они никакого отношения к омонимии не имеют.
Для пользователя Олега..
мШЭИ не работают в выборе самого кода. Роль мШЭИ в другом, сбор и сортировка ЭМ-роя молекул для подтягивания их к очагам взаимодействия (рибосомам), и перемещение электронных облаков среди этого сборища, другими словами влияние на энергетику..
ps Проблема этого мира в том, что воспитанные люди полны сомнений, а идиоты полны уверенности.
Чарльз Буковски (с)
Именно эти эффекты и демонстрируют опыты на растениях. К сожалению магнитные частицы (по объему, весу, и так далее) по отношению к молекулам и силы которые действуют на те или иные объекты очень разные, и требуют соответствующего оборудования для их фиксации (мы не говорим ,что это не возможно). Нам на этом этапе дискуссии этого пока сделать не удалось, слишком затратно.
ps Богаче всего тот человек, чьи радости требуют меньше всего денег.
nonlocality wrote:
Фраза "все остальные триплеты - кодируют только ОДНУ аминокислоту" вообще чудовищна,
= для всех остальных триплетов - каждый из них кодирует только ОДНУ аминокислоту...
- там достаточно факторов трансляции и контекста, чтобы ОДНОЗНАЧНО посадить соответствующий триплетный антикодон аа-тРНК (их может быть несколько на одну аминокислоту) на триплетный кодон
- вариации ГК есть, но все они - изучены
не раз же об этом тут..
и больше не буду принимать никакого участия в обсуждении этого вопроса
но еще раз подчеркну
что для выбора правильной аа-тРНК пока достаточно описанных механизмов точности трансляции на всех ее стадиях без всяких мшей
===============
Предлагал уже. Уже смотрел твои 2 ссылки на работу рибосом. Они никакого отношения к омонимии не имеют.
Насчет "чудовищности" - так и есть: ты забыл про синонимию в пылу дискуссии. А насчет обзора - благодарю. Вот как раз из него взял ссылку. Она хорошо соответствует моему утверждению, что кодоны омонимы кодируют по две аминокислоты или стоп и аминокислоту. Вот эта статья и резюме:
Science. Author manuscript; available in PMC May 5, 2011.
Published in final edited form as:
Science. Jan 9, 2009; 323(5911): 259–261.
doi: 10.1126/science.1164748
PMCID: PMC3088105
NIHMSID: NIHMS161479
Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon
Anton A. Turanov,1,* Alexey V. Lobanov,1,* Dmitri E. Fomenko,1 Hilary G. Morrison,2 Mitchell L. Sogin,2 Lawrence A. Klobutcher,3 Dolph L. Hatfield,4 and Vadim N. Gladyshev1,§
Author information ► Copyright and License information ►
The publisher's final edited version of this article is available at Science
See other articles in PMC that cite the published article.
Strict one-to-one correspondence between codons and amino acids is thought to be an essential feature of the genetic code. However, here we report that one codon can code for two different amino acids with the choice of the inserted amino acid determined by a specific 3′-UTR structure and location of the dual-function codon within the mRNA. We found that TGA specifies insertion of selenocysteine and cysteine in the ciliate Euplotes crassus, that the dual use of this codon can occur even within the same gene, and that the structural arrangements of Euplotes mRNA preserve location-dependent dual function of UGA when expressed in mammalian cells. Thus, the genetic code supports the use of one codon to code for multiple amino acids.
Строгое соответствие один-к-одному между кодонами и аминокислотами, как полагают, является существенным признаком генетического кода. Тем не менее, здесь мы приводим, что один кодон может кодировать две различных аминокислоты с выбором вставляемой аминокислоты, определенной конкретной структурой 3'-UTR и расположение двойной функции кодона в мРНК. Мы обнаружили, что TGA определяет вставку селеноцистеина и цистеина в ресничных Euplotes, и это указывает, что двойное использование этого кодона может происходить даже в пределах одного и того же гена, и что структурные компоновка мРНК Euplotes сохраняет местоположение в зависимости от двойной функции TGA при экспрессии в клетках млекопитающих. Таким образом, генетический код поддерживает использование одного кодона для кодирования нескольких аминокислот.
Обращаю внимание, что исследуемый кодон TGA - ОМОНИМ.
Олег, ты добился обратного и доказал, что я прав. За что выношу тебе благодарность с предупреждением о повышении.
"Выбирается" не 3-я буква, она уже данность, но контекстно определяется смысл дублета-омонима, т.е что он кодирует. Как только такая информация получена, 3-я буква по прежнему вне игры, но дуплет СТАНОВИТСЯ ОДНОЗНАЧНО кодирующим.
Петрович, в этом нет никакой логики, подумайте только: с какого перепугу ваш "контекст" НЕ колышет первых 8 синонимов-дуплетов и в то же время колышет остальные 8 якобы омонимы-дуплеты?? получается крайне неестественно и подозрительно: контекст давит только на половину дублетов? в то же время, если элементарно учесть 3-ю букву, то мистериозно выключать и включать некий туманный и иллюзорный "контекст" попросту НЕ приходится
nonlocality wrote:
Фраза "все остальные триплеты - кодируют только ОДНУ аминокислоту" вообще чудовищна, если учесть каноническое и реально доказанное явление синонимии с ее изо-акцепторными тРНК.
где чудовище-то, Петрович? ведь как раз в этом и состоит синонимия: несколько триплетов кодируют одну и ту же аминокислоту, потому они и синонимы между собою. По-вашему выходит, что триплет (или любой кодон вообще, скажем дуплет) может и должен кодировать бОльше одной кислоты, зачем вам такое? чтобы присобачить ваш неопределённый и широчайший контекст? Олег указал вам на 1-2 исключения, условия/"контекст" для которых давно известны; в остальном остаётся железное правило: одну кислоту ухаживают много кодонов, но многим кислотам намыливаться на один и тот же кодон постыдно и запрещено
По-вашему выходит, что триплет (или любой кодон вообще, скажем дуплет) может и должен кодировать бОльше одной кислоты, зачем вам такое? чтобы присобачить ваш неопределённый и широчайший контекст? Олег указал вам на 1-2 исключения, условия/"контекст" для которых давно известны; в остальном остаётся железное правило: одну кислоту ухаживают много кодонов, но многим кислотам намыливаться на один кодон постыдно и запрещено
Снова элементарные непонимашки ваши. Не любой кодон, а только кодоны омонимы (их дублеты) могут ПОТЕНЦИАЛЬНО кодировать одновременно две аминокислоты или аминокислоту и стоп позицию. Такая двойственность и неоднозначность снимается и становится однозначностью для определенной аминокислоты или стопа при учете контекста мРНК. В данной статье приведен строгий анализ пока ОДНОГО случая, а их много - еще 31 кодон омоним. И предстоит еще много тяжелой работы для доказательства не соблюдения коллинеарности для триплетов экзонов и соответствующих им аминокислот и стопов. То, о чем я говорил и говорю в молбиол.ру и здесь вот уже 10 лет. И наконец, идут подтверждения. Хотя были и раньше, но менее четко. Приводил. Относительно принципиальной важности омонимии для половины кодонов детально в моей монографии "Лингвистико-волновой геном. Теория и практика" (2009г.). Есть в ГУГЛе.
Гаряев... в соседней ветки по вопросам к Вам возник вопрос с Владимировичем о беседах с Вами...вот если Вы наглым образом игнорируете мои аргументы, и вопросы к Вам по теме тут текущей, чья в этом вина? Ваша или моя?
Ведь Вы же прекрасно знаете, что если Вы ответите мне, то окажитесь вновь заткнутым за пояс...или у Вас есть возражения по этому поводу?
видимо, у вас опять трудности с результатом 2+2=?, Петрович : у вас омоним НЕ триплет TGA, а только дуплет TG; у них триплет TGA оказывается омонимом для какого-то жывотного и это очень редкое исключение; вы хотите заблудить нас утверждением, что все 32 триплета будут омонимами, но это видимо НЕ так, только TGA и указанные Олегом прокололись пока. Липовыми "омонимами" вашими остаются лишь дуплеты в этих триплетах, но эти дуплеты вообще НЕ кодируют, к вашему сожалению.
почему не можете элементарно мыслить, Петрович? к моему личному удручению я давно заметил, что потуги делать выводы из посылок не самое сильное ваше качество, в отличие от раздувания всякой эзотерической пурги ни о чем
видимо, у вас опять трудности с результатом 2+2=?, Петрович : у вас омоним НЕ триплет TGA, а только дуплет TG; у них триплет TGA оказывается омонимом для какого-то жывотного и это очень редкое исключение; вы хотите заблудить нас утверждением, что все 32 триплета будут омонимами, но это видимо НЕ так, только TGA и указанные Олегом прокололись пока. Липовыми "омонимами" вашими остаются лишь дуплеты в этих триплетах, но эти дуплеты вообще НЕ кодируют, к вашему сожалению.
почему не можете элементарно мыслить, Петрович? к моему личному удручению я давно заметил, что потуги делать выводы из посылок не самое сильное ваше качество, в отличие от раздувания всякой эзотерической пурги ни о чем
Сожалею, но вы Н И Ч Е Г О не понимаете в модели белкового кода. Просто следите за развитием событий в генетике, а они уже зримо подтверждают мою позицию. Вал таких "исключений" будет нарастать.
Н И Ч Е Г О не понимаете в модели белкового кода. Просто следите за развитием событий в генетике... Вал таких "исключений" будет нарастать.
щас стукнуло, что может TGA это то же самое исключение-омоним, что и УГА Олега (см. ниже), попросту тимин (Т) заменили на урацил (У) ?
наконец то вы поняли (с попытки десятой), что это исключения из стандартного ГК
что даже про УУУ не вспомнили
= триплетов-омонимов больше пока нет
это вы Н И Ч Е Г О(шеньки) не смыслите, Петрович, на неудобные вопросы (почему 8 синонимов и столько же омонимов, почему не бОльше или меньше? и пр.) не отвечаете, может потому, что не дуют вам в паруса или совсем их нахрен НЕ понимаете
Что Вы все пристали к академику из прошлого??? Он же Вам таблицы представлял,и при том цветные... А Вы все ничего не понимаете. Даже пользователь Вика, сегодня на его защиту не встала. Лучше согласитесь и попросите его или модель работы по этому принципу написать и затем продемонстрировать или опыты на эту тему сделать...
ps Гидре отрубили голову, у гидры выросло две.
Гидре отрубили две головы, у гидры выросло четыре.
Гидре отрубили четыре головы, гидра обиделась и умерла.
Я это к тому, что зае*ать можно кого угодно.
Петрович и Хайдук.
Вот меня тоже "стукнуло" насчет терминологии "синонимы" и "омонимы".
Синонимы, это слова, которые (вольным переводом) пишутся по - разному, но обозначают одно и тоже. Вроде так.
ТСТ, TCC, TCA, TCG - пишутся по-разному, кодируют Ser. Все так.
Омонимы, это слова, которые пишутся одинаково, однако обозначают разное. Важен смысл фразы.
AAT, AAC, AAA, AAG - пишутся по -разному. Петрович эту группу относит к категории омонимов. Почему? Потому, что третья буква не кодирует. Тогда, да - дуплеты АА -омонимы. Но дуплеты, а не триплеты.
Но в этом случае, и синонимы не триплеты, а дуплеты. Дуплет ТС(третья буква t,c,a,g не кодирует ) кодирует Ser. В этом случае -где синонимия? Имеем всегда Ser.
В чем я не права?
Что Вы все пристали к академику из прошлого??? Он же Вам таблицы представлял,и при том цветные... А Вы все ничего не понимаете. Даже пользователь Вика, сегодня на его защиту не встала. Лучше согласитесь и попросите его или модель работы по этому принципу написать и затем продемонстрировать или опыты на эту тему сделать...
Вот же чукча, вы Чукча. Пользователь Вика всегда стоит на защите идеи, которая у Петровича -правильная. Однако, эту идею надо доказывать. А вы, Чукча, даже теоретическую составляющую, все время пытаетесь испортить.
Потому что Вы Вика не стали верить на слово мЭтру. Вас могут перевести в штаты врагов ...
ps Ничто в доме не хранится так трепетно, как ненужный хлам под названием "А вдруг пригодится".