Ключевое слово
23 | 04 | 2019
Новости Библиотеки
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:03 #1

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Продолжим тут. И, надеюсь, это будет достойное обсуждение. Модераторам просьба - сносить оскорбления, переходы на личности, ложь. Ссылки в дискуссиях должны иметь точный адрес и не искажаться, как это было не раз. Призываю говорить только о науке, а не о сплетнях. Эта ветвь важна. Мы накануне мирового рывка в области биологии и медицины, сельского хозяйства, компьютинга. И это связано с доказанным фактом существования работающей генетической информации в форме физических полей. Это выход человечества в другие измерения собственного бытия в этой Вселенной.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:33 #2

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36232
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
ППГ написал(а):
Мы накануне мирового рывка в области биологии и медицины, сельского хозяйства, компьютинга.
Пожалуй


ППГ написал(а):
это связано с доказанным фактом существования работающей генетической информации в форме физических полей
Я бы не трубил, а подождал бы с этим якобы доказанным фактом, тем более, что словесная редакция утверждения не вполне однозначная и строгая


ППГ написал(а):
Это выход человечества в другие измерения собственного бытия в этой Вселенной.
Пока это поэзия, полёт воображения, так сказать, не совсем собачущиеся с призывом говорить здеся только о науке



Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:36 #3

  • Vladimirovich
  • Vladimirovich's Avatar
  • OFFLINE
  • Инквизитор
  • Posts: 77770
  • Thank you received: 1029
  • Karma: 81
Поскольку тема с таким названием есть, в название добавлен №3
Напоминаем, что данная тема будет зоной повышенной модерации.
Настоятельная просьба не выходить за рамки чисто научной дискуссии.

quantoforum.ru/nobelprize/81-lingvistiko...uyushchij-shag-ppg-2 Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. ППГ (№2) - №2 переходит в распоряжение коуаторов и туда будет сноситься все ненужное.
Каждому - своё.
Last Edit: 11 Март 2015 15:20 by Vladimirovich.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:39 #4

  • Lion
  • Lion's Avatar
  • OFFLINE
  • Клон
  • Posts: 130
  • Karma: 0
Vladimirovich написал(а):
Настоятельная просьба не выходить за рамки чисто научной дискуссии.
Ув. ППГ ! Так что там с расчетом спектров на мощном восьмиядерном маке ?

Отредактировано Lion (2011-06-30 20:44:09)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:48 #5

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36232
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
ППГ написал(а):
Хотелось до публикации наших новых статей, где коллеги, клеточные биологи, получили блестящие результаты, заранее обсудить ключевые моменты.
Очень хорошо, ждём-с интересом indeed

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 16:51 #6

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Lion написал(а):
Ув. ППГ ! Так что там с расчетом спектров на мощном восьмиядерном маке ?
К сожалению, там проблемы финансового характера. Обсчетчик спектров затребовал непосильную оплату. Пришлось расстаться.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 17:13 #7

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
ППГ написал(а):
К сожалению, там проблемы финансового характера.
Сколько запросил если не секрет? Подобного рода рутина не должна дорого стоить.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 17:16 #8

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Сколько запросил если не секрет? Подобного рода рутина не должна дорого стоить.
Почему ? Если не персоналка а мощный комп с юниксом и гауссиан зарядить на несколько суток - будет нехило...
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 17:38 #9

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
Почему ? Если не персоналка а мощный комп с юниксом и гауссиан зарядить на несколько суток - будет нехило...
Посмотрите стоимость расчетов на облаке Амазона. Это будут сущие копейки.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 17:40 #10

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Посмотрите стоимость расчетов на облаке Амазона. Это будут сущие копейки
Это для вас там в америках копейки, а мы православные не жируем...


Отредактировано limarodessa (2011-06-30 21:40:33)
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 17:58 #11

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
Это для вас там в америках копейки, а мы православные не жируем...
34 цента в час это для Вас дорого?
aws.amazon.com/ec2/#pricing
Last Edit: 11 Март 2015 15:20 by Vladimirovich.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:00 #12

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
34 цента в час это для Вас дорого?
А при чем здесь я ? Это же Петрович пишет о хвинансовых трутностиях а не я...
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:34 #13

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
А при чем здесь я ?
Ну это ведь Вы пишите о дороговизне использования юниксовского сервера!

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:36 #14

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Ну это ведь Вы пишите о дороговизне использования юниксовского сервера!
Логично. Но если бы было так как Вы пишите по несколько центов в час то народ бы не платил столько за суперкомповские расчеты...
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:43 #15

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
о если бы было так как Вы пишите по несколько центов в час то народ бы не платил столько за суперкомповские расчеты...
Что значит если бы? Это так и есть. Я там линк оставил. Подписывайесь и пользуйтесь на здоровье. Суперкомпы нужны, но для более узкого класса задач.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:47 #16

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Что значит если бы? Это так и есть. Я там линк оставил. Подписывайесь и пользуйтесь на здоровье. Суперкомпы нужны, но для более узкого класса задач.
Я уже не рад что я ввязался в этот спор. В конце концов это проблемы Петровича пусть он и идет по любезно предоставленной Вами ссылке. Мне пока моего ноутбука мощности хватает. Я и ее пока в полной мере использовать не могу - пока не знаю ЧТО считать в гауссиане.
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 18:49 #17

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Суперкомпы нужны, но для более узкого класса задач.
Значит все-таки они дороже ?
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:06 #18

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Вернемся-ка к проблеме фрактальности времени, особенно биологического. Вообще, по времени писано-переписано. И опеделений его - тьма, даже - тьму-таракань. Лично для себя объясняю время как организатор последовательности событий. Или кратко - межсобытийный организатор. Слово 'организатор' предполагает нечто внешнее, управляющее, субъективное, демиургическое. Но можно и без этих тяжелых излишеств - добавить только приставку 'само' к слову 'организатор'. В биосистеме полно процессов самоорганизации (так считается), хотя само или НЕ само - вопрос открытый и важнецкий для регуляции метаболизма в биосистемах. Самоорганизуются вирусы, рибосомы, хромосомы, цитоскелет, ДНК и т.д. Организатора, вроде, не видно, если не считать за такового слепые акты взаимных узнаваний одинарных нитей ДНК и тРНК-мРНК за счет водородных связей, анионов и катионов, взаимоузнаваний сотен белков при генезе рибосомы за счет гидрофобных и ван дер ваальсовых взаимодействий. Сюда же узнавания антигенов антителами. Все это как бы САМОорганизации. Но взять уровнем выше - клетки эмбрионов тоже узнают друг друга в в ранних стадиях. При перемешивании их они затем организуются в исходную номальную структуру. Тоже самоорганизация? А вот тут вопрос жирный. Тут приставка 'само' теряет смысл. А что управляет клетками в эмбриогенезе? Градиены морфогенов? Чушь, натяжка, видная сейчас. Непонятно. Энтелехия Аристотеля-Дриша? Не ясно. При этом организация пространственного расположения клеток в эмбриогенезе имеет временнУю структуру, да и внутриклеточный метаболизм тоже. То есть это 4D мерность, пространственно-временнАя. Вот эта временнАя составляющая в эмбрионе и взрослом организме особенно интересна. Искази ее и получишь патологии, смерть.

Продолжение следует.

Отредактировано ППГ (2011-06-30 23:11:12)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:08 #19

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
ППГ написал(а):
организация пространственного расположения клеток в эмбриогенезе имеет временнУю структуру, да и внутриклеточный метаболизм тоже.

ППГ написал(а):
это 4D мерность, пространственно-временнАя. Вот эта временнАя составляющая в организме и эмбриона, и взрослого особенно интересна. Искази ее и получишь патологии, смерть.
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:13 #20

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36232
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
limarodessa написал(а):
Значит все-таки они дороже ?
Ну да и на них считают действительно громоздкие задачи. Может вычислитель у Петровича потребовал неприличного бабла для составления специализированного софта или для предоставления своих услуг. Значит Петровичу придётся самому считать на облаках в Сети

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:16 #21

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
Ну да и на них считают действительно громоздкие задачи. Может вычислитель у Петровича потребовал неприличного бабла для составления специализированного софта или для предоставления своих услуг. Значит Петровичу придётся самому считать на облаках в Сети
А может у Петровича задача для суперкомпа и облака которые РР посоветал не справятся ?
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:22 #22

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • NOW ONLINE
  • Наместник
  • Posts: 36232
  • Thank you received: 79
  • Karma: 22
limarodessa написал(а):
может у Петровича задача для суперкомпа и облака которые РР посоветал не справятся ?
Вряд ли, у облаков серверов довольно громовержецкой мощи, может РР поможет Петровичу научиться пользоваться на благо.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:24 #23

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
РР поможет Петровичу

Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:54 #24

  • ППГ
  • ППГ's Avatar
  • OFFLINE
  • Петрович
  • Posts: 4393
  • Karma: 0
Численая обработка мШЭИ в txt формате лишь расширяет размеры черного ящика. Какие механизмы работают в мШЭИ мы не знаем до сих пор. Правда, темные фотоны Питканена, вроде, позволяют описать биосистему единой волновой функцией. Постоянная Планка там переменная, поэтому фотоны могут иметь гигантские размеры. Впрочем, это не для моего сознания.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 19:56 #25

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
Хайдук написал(а):
может РР поможет Петровичу
Если бы Петровича мне отправили в качестве студента или интерна, я бы постарался ему помочь. По крайней мере научил бы грамотно ставить задачу и эксперимент. Теперь уже поздно наверное.
Впрочем можно попробовать.
Задача: Экспериментальная проверка верности модели Крика
1А. Заказываем олигомеры у производителя. Олигомеры кодируют короткий пептид, причем контрольный пептид использует однозначные кодоны, а второй олигомер неоднозначные
1Б. Переводим олигомеры в РНК
1В. Заливаем РНК в рибосомный кит
1Д. Проводим синтез пептидов
1Е. Отправляем пептиды на анализ масс-спектра

Как вариант аутсорсим экспериментальную часть китайским товарищам.
В результате или перестаем трепаться о лингвистичности генома или публикуем революционную статью в Nature.
А уже потом можно поставить задачу о влияние облучения МШЭИ пропущенным через препарат ДНК репчатого лука на процесс описанный выше.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 20:01 #26

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
ППГ написал(а):
Постоянная Планка там переменная

Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 20:02 #27

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
ППГ написал(а):
Численая обработка ... в txt формате

Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 20:03 #28

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
ППГ написал(а):
темные фотоны Питканена, вроде, позволяют описать биосистему единой волновой функцией

Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 20:06 #29

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 13717
  • Thank you received: 38
  • Karma: 0
PP написал(а):
Впрочем можно попробовать
А с этим что делать ? :

www.springerlink.com/content/0557v31188m3766x/
'...We initially observed (Montagnier and Lavallee, personal communication) that some filtration procedures aimed at sterilizing biological fluids can yield under some defined conditions the infectious microorganism which was present before the filtration step. Thus, filtration of a culture supernatant of human lymphocytes infected with Mycoplasma pirum, a microorganism of about 300 nM in size, through filters of 100 nM or 20 nM porosities, yielded apparently sterile fluid. The latter however was able to regenerate the original mycoplasma when incubated with a mycoplasma negative culture of human lymphocytes within 2 to 3 weeks....'
‘…In addition to M. pirum, a more classical bacterium, E. Coli, was utilized for the purpose of the analysis….M. pirum is a peer-shaped small bacterial cell, ressembling M. pneumoniae, which can be grown in synthetic enriched medium (SP4) (Tully et al., 1977) but also mutiplies at the surface of human T lymphocytes. The strain (Ber) used in our experiments was isolated from a T lymphocyte culture derived from the blood of an apparently healthy subject (Grau et al., 1993). The strong mycoplasma adherence to lymphocytes is mediated by a specific adhesin, whose gene had been previously cloned and sequenced by the authors (Tham et al., 1994). We used as primary source of the mycoplasma, supernatants of infected human T lymphocyte cultures or of cultures of the CEM tumor T cell line. All cell cultures were first tested for the lack of M. pirum contamination by polymerase chain reaction (PCR) and nested PCR, before starting the experiments. Titers of 106-107 infectious Units/ml of M. pirum were readily achieved after 5-6 days of incubation following deliberate infection of both types of cultures….’
’…Filtration of the clarified supernatant was first performed on 0.45 M (450 nM) Millipore filters to remove debris, and subsequently on 0.1 M (100 nM) Millipore filters or on 0.02 M (20 nM) Whatman filters, to remove mycoplasma cells. Indeed, the two 100 nM and 20 nM filtrates were confirmed sterile when aliquots were incubated for several weeks in SP4 medium. Repeated search for traces of mycoplasma DNA by PCR and nested PCR using specific primers for the adhesion gene or for the 16S ribosomal gene was consistently negative. However when the filtrates were incubated for two weeks (100 nM filtrate) or three weeks (20 nM filtrate) with a culture of human activated T lymphocytes, the mycoplasma was recovered in the medium with all its original characteristics as previously observed…’
Страсти - это ветры, надувающие паруса корабля, иногда они его топят, но без них он не мог бы плавать. (Вольтер)
Last Edit: 11 Март 2015 15:21 by Vladimirovich.

Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3 30 Июнь 2011 20:23 #30

  • PP
  • PP's Avatar
  • OFFLINE
  • Боярин
  • Posts: 23301
  • Thank you received: 137
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
А с этим что делать ?
Это из другой оперы. Физические свойства сложных наносистем должны изучать квалифицированные специалисты, что они и делают кстати говоря. Я интернам и студентам такие сложные проекты не предлагал бы.
Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум