TOPIC: Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 16:03 #1
Продолжим тут. И, надеюсь, это будет достойное обсуждение. Модераторам просьба - сносить оскорбления, переходы на личности, ложь. Ссылки в дискуссиях должны иметь точный адрес и не искажаться, как это было не раз. Призываю говорить только о науке, а не о сплетнях. Эта ветвь важна. Мы накануне мирового рывка в области биологии и медицины, сельского хозяйства, компьютинга. И это связано с доказанным фактом существования работающей генетической информации в форме физических полей. Это выход человечества в другие измерения собственного бытия в этой Вселенной.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 16:36 #3
Поскольку тема с таким названием есть, в название добавлен №3
Напоминаем, что данная тема будет зоной повышенной модерации.
Настоятельная просьба не выходить за рамки чисто научной дискуссии.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 18:47 #16
PP написал(а):
Что значит если бы? Это так и есть. Я там линк оставил. Подписывайесь и пользуйтесь на здоровье. Суперкомпы нужны, но для более узкого класса задач.
Я уже не рад что я ввязался в этот спор. В конце концов это проблемы Петровича пусть он и идет по любезно предоставленной Вами ссылке. Мне пока моего ноутбука мощности хватает. Я и ее пока в полной мере использовать не могу - пока не знаю ЧТО считать в гауссиане.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:06 #18
Вернемся-ка к проблеме фрактальности времени, особенно биологического. Вообще, по времени писано-переписано. И опеделений его - тьма, даже - тьму-таракань. Лично для себя объясняю время как организатор последовательности событий. Или кратко - межсобытийный организатор. Слово 'организатор' предполагает нечто внешнее, управляющее, субъективное, демиургическое. Но можно и без этих тяжелых излишеств - добавить только приставку 'само' к слову 'организатор'. В биосистеме полно процессов самоорганизации (так считается), хотя само или НЕ само - вопрос открытый и важнецкий для регуляции метаболизма в биосистемах. Самоорганизуются вирусы, рибосомы, хромосомы, цитоскелет, ДНК и т.д. Организатора, вроде, не видно, если не считать за такового слепые акты взаимных узнаваний одинарных нитей ДНК и тРНК-мРНК за счет водородных связей, анионов и катионов, взаимоузнаваний сотен белков при генезе рибосомы за счет гидрофобных и ван дер ваальсовых взаимодействий. Сюда же узнавания антигенов антителами. Все это как бы САМОорганизации. Но взять уровнем выше - клетки эмбрионов тоже узнают друг друга в в ранних стадиях. При перемешивании их они затем организуются в исходную номальную структуру. Тоже самоорганизация? А вот тут вопрос жирный. Тут приставка 'само' теряет смысл. А что управляет клетками в эмбриогенезе? Градиены морфогенов? Чушь, натяжка, видная сейчас. Непонятно. Энтелехия Аристотеля-Дриша? Не ясно. При этом организация пространственного расположения клеток в эмбриогенезе имеет временнУю структуру, да и внутриклеточный метаболизм тоже. То есть это 4D мерность, пространственно-временнАя. Вот эта временнАя составляющая в эмбрионе и взрослом организме особенно интересна. Искази ее и получишь патологии, смерть.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:08 #19
ППГ написал(а):
организация пространственного расположения клеток в эмбриогенезе имеет временнУю структуру, да и внутриклеточный метаболизм тоже.
ППГ написал(а):
это 4D мерность, пространственно-временнАя. Вот эта временнАя составляющая в организме и эмбриона, и взрослого особенно интересна. Искази ее и получишь патологии, смерть.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:13 #20
limarodessa написал(а):
Значит все-таки они дороже ?
Ну да и на них считают действительно громоздкие задачи. Может вычислитель у Петровича потребовал неприличного бабла для составления специализированного софта или для предоставления своих услуг. Значит Петровичу придётся самому считать на облаках в Сети
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:16 #21
Хайдук написал(а):
Ну да и на них считают действительно громоздкие задачи. Может вычислитель у Петровича потребовал неприличного бабла для составления специализированного софта или для предоставления своих услуг. Значит Петровичу придётся самому считать на облаках в Сети
А может у Петровича задача для суперкомпа и облака которые РР посоветал не справятся ?
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:54 #24
Численая обработка мШЭИ в txt формате лишь расширяет размеры черного ящика. Какие механизмы работают в мШЭИ мы не знаем до сих пор. Правда, темные фотоны Питканена, вроде, позволяют описать биосистему единой волновой функцией. Постоянная Планка там переменная, поэтому фотоны могут иметь гигантские размеры. Впрочем, это не для моего сознания.
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 19:56 #25
Хайдук написал(а):
может РР поможет Петровичу
Если бы Петровича мне отправили в качестве студента или интерна, я бы постарался ему помочь. По крайней мере научил бы грамотно ставить задачу и эксперимент. Теперь уже поздно наверное.
Впрочем можно попробовать.
Задача: Экспериментальная проверка верности модели Крика
1А. Заказываем олигомеры у производителя. Олигомеры кодируют короткий пептид, причем контрольный пептид использует однозначные кодоны, а второй олигомер неоднозначные
1Б. Переводим олигомеры в РНК
1В. Заливаем РНК в рибосомный кит
1Д. Проводим синтез пептидов
1Е. Отправляем пептиды на анализ масс-спектра
Как вариант аутсорсим экспериментальную часть китайским товарищам.
В результате или перестаем трепаться о лингвистичности генома или публикуем революционную статью в Nature.
А уже потом можно поставить задачу о влияние облучения МШЭИ пропущенным через препарат ДНК репчатого лука на процесс описанный выше.
'...We initially observed (Montagnier and Lavallee, personal communication) that some filtration procedures aimed at sterilizing biological fluids can yield under some defined conditions the infectious microorganism which was present before the filtration step. Thus, filtration of a culture supernatant of human lymphocytes infected with Mycoplasma pirum, a microorganism of about 300 nM in size, through filters of 100 nM or 20 nM porosities, yielded apparently sterile fluid. The latter however was able to regenerate the original mycoplasma when incubated with a mycoplasma negative culture of human lymphocytes within 2 to 3 weeks....'
‘…In addition to M. pirum, a more classical bacterium, E. Coli, was utilized for the purpose of the analysis….M. pirum is a peer-shaped small bacterial cell, ressembling M. pneumoniae, which can be grown in synthetic enriched medium (SP4) (Tully et al., 1977) but also mutiplies at the surface of human T lymphocytes. The strain (Ber) used in our experiments was isolated from a T lymphocyte culture derived from the blood of an apparently healthy subject (Grau et al., 1993). The strong mycoplasma adherence to lymphocytes is mediated by a specific adhesin, whose gene had been previously cloned and sequenced by the authors (Tham et al., 1994). We used as primary source of the mycoplasma, supernatants of infected human T lymphocyte cultures or of cultures of the CEM tumor T cell line. All cell cultures were first tested for the lack of M. pirum contamination by polymerase chain reaction (PCR) and nested PCR, before starting the experiments. Titers of 106-107 infectious Units/ml of M. pirum were readily achieved after 5-6 days of incubation following deliberate infection of both types of cultures….’
’…Filtration of the clarified supernatant was first performed on 0.45 M (450 nM) Millipore filters to remove debris, and subsequently on 0.1 M (100 nM) Millipore filters or on 0.02 M (20 nM) Whatman filters, to remove mycoplasma cells. Indeed, the two 100 nM and 20 nM filtrates were confirmed sterile when aliquots were incubated for several weeks in SP4 medium. Repeated search for traces of mycoplasma DNA by PCR and nested PCR using specific primers for the adhesion gene or for the 16S ribosomal gene was consistently negative. However when the filtrates were incubated for two weeks (100 nM filtrate) or three weeks (20 nM filtrate) with a culture of human activated T lymphocytes, the mycoplasma was recovered in the medium with all its original characteristics as previously observed…’
Лингвистико-Волновой геном. Следующий шаг. №3
30 Июнь 2011 20:23 #30
limarodessa написал(а):
А с этим что делать ?
Это из другой оперы. Физические свойства сложных наносистем должны изучать квалифицированные специалисты, что они и делают кстати говоря. Я интернам и студентам такие сложные проекты не предлагал бы.
