kushelev написал(а):А сейчас ?

kushelev написал(а):Почему потом по 3000 евро а мне сейчас бесплатно ?

PauLita написал(а):Но не забывайте, что точность нанотехнологических моделей белков бывает местами такой, что не видно десятков аминокислотных остатков... Другими словами ошибка РСА может составлять более 5 нанометров. Точность пикотехнологических моделей - доли пикометра, т.е. в тысячи раз выше точности нанотехнологических моделей, построенных на основе данных РСА.

kushelev написал(а):Вы поняли PauLita ?

А нх это нужно?

PauLita написал(а):PauLita я Вам кажется сказал уже - не встревайте... Вам что не понятно с первого раза ? Обязательно повторять нужно ?

limarodessa написал(а):Может. Есть и другое решение. Если Вы будете участвовать в проверке пикотехнологии, то можете получить несколько версий программы пикотех бесплатно. Например, Виктория Соколик (более 100 научных трудов) пользуется всеми версиями программы пикотех бесплатно. Более того, он создаёт новые версии в сотрудничестве с программистами.

Можете сравнить вторичные структуры по алгоритму Кушелева и Соколик:

limarodessa написал(а):kushelev написал(а):Тогда мне непонятно почему Вы отдаете мне модель бесплатно... Если модель приносит прибыль то почему Вы сами не зарабатываете эти деньги в рамках своей фирмы. Кроме того ведь нет гарантии что заработав 100 тыс. евро я верну их Вам купив у Вас программу...

Мне пока что честно говоря не понятна схема Вашего бизнеса с точки зрения правил его (бизнеса в общем смысле этого слова) ведения... А пока не понятна схема бизнеса то естественно любой здравомыслящий человек в него не сунется

И если можно господин Кушелев я выражу свое мнение - размещение на форумах огромных картинок безусловно оказывает определенный психологический эффект но едва ли способствует проведению научного обсуждения ИМХО

limarodessa написал(а):А сейчас - рекламный период. Первую сотню пикотехнологических моделей я делаю бесплатно. Когда заказчики получат прибыль от первых пикотехнологических моделей, у них появятся средства, чтобы купить пикотехнологические модели других белков. Так что заказывайте, пока бесплатно

Коннексин уже заказали и получили пикотехнологическую модель. Кто следующий?

kushelev написал(а):А как они её получат ? Информацию о рынке сбыта огласите пожалуйста. Иначе повторяю бизнес не делается. Нужен детальный бизнес-план

limarodessa написал(а):Уж поверьте мне как бывшему банковскому работнику. Ни один кредитный отдел не выдаст кредит без бизнес-плана. Этого просто не допустит служба финансовой безопасности банка

PauLita написал(а):Увеличение точности открывает новые возможности. Вот примеры:


Оригинал: img-fotki.yandex.ru/get/5700/nanoworld.2...d1_768200e6_orig.png


Оригинал: img-fotki.yandex.ru/get/4402/nanoworld.2...02_8b0a1fc2_orig.png




Точности нанотехнологий не хватает, чтобы увидеть связь формы белковой молекулы с формой образующих её элементов...

limarodessa написал(а):

Free Molecular Visualization Software www.umass.edu/microbio/rasmol/othersof.htm

Choosing a Molecular Visualization Software

General considerations

Does it have the features and functions you need?
Is it available for your platform?
Is it easy to use?
Is it fast?
Is it commercial or freeware?

Display quality and features

Protein display
Symmetry and packing (crystal) display
Electronic property display (for QM results)
Animation display (reaction paths, MD trajectories)
Atom, residue and molecule label
Stereo view

Analysis measurement

Geometric measurements (distances, angles, torsion angles)
Property calculation (partial charge, hydrogen bond, protein secondary structure, molecular surface area, molecular volume, etc.)

Import export options

File format
Graphic file (gif, jpg, etc.) export
VRML file export
Ray tracing file (e.g. POV-ray) export

Molecule modification

Geometry modification
Atom or residue substitution
Molecule builder
Adding hydrogen atoms

Other features

Atom, residue, molecule selection (graphics or spreadsheet)
Hardware accelerator support
Annotation tool
Save scripts for re-display

Molecular Modeling Package

Cerius2 (SGI IRIX, Linux, commercial)
Insight II (SGI IRIX, Linux, commercial)
Sybyl (SGI IRIX, Linux, commercial)
Chem3D (Windows, Mac OS, commercial)
Spartan (Windows, Mac OS, Unix, Linux, commercial)
PCModel (Windows, Mac OS OS-X, Unix, Linux, commercial)

Molecular Visualization

Qmol (Windows, Linux, source code)
DS ViewerLite or Weblab ViewerLite (Windows, no longer available), DS ViewerPro (Windows, commercial)
RasMol (Windows, Mac OS, Unix, Linux, source code)
Chime (IE or Netscape communicator Plug in, Window, Mac OS)
Prorein Explore (Windows, Mac OS)
Mercury (Windows, Unix, Linux)
Swiss-PdbViewer (Unix, Linux, Windows, Mac OS)
VMD (Unix, Linux, Windows, Mac OS-X, source code)
MOLMOL (Unix, Windows, source code)
MolScript (Unix, Linux, source code)
POV-Ray (Windows, Mac OS OS-X, Linux, source code)
Raster3D (Unix, Linux, source code)
gOpenMol (Unix, Linux, Window, source code)
Molden (Unix, Linux, Windows, Mac OS OS-X, source code)

Molecular Dynamics

Amber (Unix, Linux, source code, parallelized, minor charge)
CHARMM (Unix, Linux, source code, parallelized, minor charge) CHARMm (Unix, commercial)
GROMACS (Unix, Linux, Windows, source code, parallelized)
Tinker (Unix, Linux, Windows, Mac OS, source code)
NAMD (Unix, Linux, Windows, Mac OS-X, source code, parallelized)

NWChem (Unix, Linux, Windows, source code, parallelized)

Quantum Chemistry Computation

Integrated Package (Ab initio, semi-empirical, Density Functional Theory)

Gaussian (Unix, Linux, Windows, Mac OS-X, parallelized, commercial)

NWChem (Unix, Linux, Windows, source code, parallelized)

Ab initio

Jaguar (Unix, Linux, commercial)
GAMESS (Unix, Linux, Windows, Mac OS OS-X, source code, parallelized)

Semi-empirical

AMPAC (Unix, Linux, Windows, commercial)
MOPAC 2000 (Unix, Linux, Windows, parallelized, commercial)
MOPAC 7 (source code)

Molecular Docking

AutoDock (Unix, Linux, Mac OS-X, source code)
Dock (Unix, Linux, source code)

File Format Conversion

Babel (Unix, Linux, Mac OS, source code), BabelWin (Windows), and OpenBabel (Windows, source code)
Mol2Mol (Windows, commercial)

Software Comparisons

By Tamas E. Gunda
By Marc Saric

Molecular Modeling Resources on the Web
General

Computational Chemistry List (CCL)
NIH Center for Molecular Modeling

Courses and Tutorials

CancerWeb Tutorials and Guides
Dave Young's Chemical Topics
Jan K. Labanowski's Molecular Modeling
NetSci's Science Center: Computational Chemistry
CAUT Computational Chemistry Project
Computational Chemistry and Molecular Modeling for Engineers

Software Sites

Structural Biology Software Database at UIUC
World Index of Molecular Visualization Resources
Chemistry Software
Linux4Chemistry
Scientific Applications on Linux (SAL)

Local Resources

IU Cheminfo
IU MolViz facility website
Reciprocal Net at IUMSC

Structural Data Resources

Protein Data Bank (PDB)
Nucleic Acid Database (NDB)
Cambridge Structural Database (CSD) (commercial)

Miscellaneous

Microwave oven FAQ
A basic introduction to microwave chemistry
Water and microwave radiation

Это лишь малый список програмного обеспечения, использующего фемтотехнологии, что на 1000 (тысячу) раз являются более точными, чем уже устаревшие пикотехнологии...

Отредактировано PauLita (2012-01-07 21:52:47)

kushelev написал(а):nanoworld2003.narod.ru/01/DATA/TEXTS.RUS/19990812.htm

PauLita написал(а):Я что то не понял что за резонатор не рассчитался ?

limarodessa написал(а):Но купили почему то в кавычках , может с**ил?

limarodessa написал(а):Схема проста. Я открыл композиционный генетический код в 1992-ом году. В том же году была создана первая версия программы Пикотех, которая убедила меня в том, что пикотех работает. Пикотехнология не была главной темой моих исследований, поэтому внедрение несколько затянулось, тем не менее после того, как этой темой заинтересовалась Виктория Соколик (более 100 научных трудов), сделала ряд докладов на конференциях, построила ряд пикотехнологических моделей белков, ДНК, РНК, интерес к пикотехнологии резко возрос. Создана коммерческая версия Пикотех. Начался рекламный период пикотехнологии. Как только специалисты распробуют пикософт на вкус, на смену рекламному периоду придёт следующий период, массового использования.

Стандартная схема для софта

kushelev написал(а):Типа бизнес модель такая - дам сотне пользователей структуру, авось на шару кому то достанется правильная? Чего не опубликуете свой метод?
У меня кстати вопрос к форумчанам по теме. Не знаете ли если есть база данных с информацией о той части человеческого протеома, которая составляет поверхностъ?

Отредактировано PP (2012-01-07 21:59:38)

limarodessa написал(а):Это не просто картинки. Это - иллюстрации, на которых изображены пикотехнологические модели. Как говорится, лучше один раз увидеть

kushelev написал(а):Разместите здесь пожалуйста в английском написании фамилию и инициалы Виктории Соколик (и её отчество по английски). Я посмотрю в системах Google Scholar и Scopus какие у неё публикации и в каких журналах

kushelev написал(а):Александр Кушелев: Пока Ярослав записывает Ваши замечательные модели на видео, позвольте полюбопытствовать, как Вам удалось сделать модели такими яркими, цветными?
Виктория Соколик: Вообще-то это - Ноу-Хау, но Вам я по секрету скажу. Я покрасила кольца лаком для ногтей разных цветов

PP написал(а):Вы полагаете ув. РР что Нобелевскую премию получает каждый из сотни исследователей ?

limarodessa написал(а):В настоящее время за каждую структуру белка заказчики платят лабораториям РСА в среднем по 10 000 евро. Рынок белковых структур давно известен.

Пикософт идёт на смену нанософта...

Так что детального бизнес-плана не требуется. Рынок белковых структур давно существует.

Ох ни..чего ж себе сапожки...

Отредактировано limarodessa (2012-01-07 22:10:33)

kushelev написал(а):Отстали от жизни - на смену пикософта уже пошел Фемтософт

kushelev написал(а):Я Вас спросил не о мировом рынке (у мирового рынка все в порядке - я знаю) а о перспективах продажи результатов работы с Вашими моделями. Рынок сбыта конкретно Ваших моделей в мире не известен. Так что бизнес-план нужен.