TOPIC: Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:11 #511
Abstract DNA-type systems
Authors: Diederik Aerts, Marek Czachor
(Submitted on 15 Nov 2004 (v1), last revised 22 Dec 2005 (this version, v2))
Abstract: An abstract DNA-type system is defined by a set of nonlinear kinetic equations with polynomial nonlinearities that admit soliton solutions associated with helical geometry. The set of equations allows for two different Lax representations: A von Neumann form and a Darboux-covariant Lax pair. We explain why non-Kolmogorovian probability models occurring in soliton kinetics are naturally associated with chemical reactions. The most general known characterization of soliton kinetic equations is given and a class of explicit soliton solutions is discussed. Switching between open and closed states is a generic behaviour of the helices. The effect does not crucially depend on the order of nonlinearity (i.e. types of reactions), a fact that may explain why simplified models possess properties occuring in realistic systems. We explain also why fluctuations based on Darboux transformations will not destroy the dynamics but only switch between a finite number of helical structures.
Two-state dynamics for replicating two-strand systems
Authors: Diederik Aerts, Marek Czachor
(Submitted on 30 Dec 2005)
Abstract: We propose a formalism for describing two-strand systems of a DNA type by means of soliton von Neumann equations, and illustrate how it works on a simple example exactly solvably by a Darboux transformation. The main idea behind the construction is the link between solutions of von Neumann equations and entangled states of systems consisting of two subsystems evolving in time in opposite directions. Such a time evolution has analogies in realistic DNA where the polymerazes move on leading and lagging strands in opposite directions.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:33 #515
Abstract. The study of solitary wave solutions is of prime signicance for nonlinear physical systems. The Peyrard-Bishop model for DNA dynamics is generalized specically to include the di®erence among bases pairs and viscosity. The small amplitude dynamics of the model is studied analytically and reduced to a discrete complex Ginzburg-Landau (DCGL) equation. Exact solutions of the obtained wave equation are obtained by the mean of the extended Jacobian elliptic function approach. These amplitude solutions are made of bubble solitons. The propagation of a soliton-like excitation in a DNA is then investigated through numerical integration of the motion equations. We show that discreteness can drastically change the soliton shape. The impact of viscosity as well as elasticity on DNA dynamic is also presented. The prole of solitary wave structures as well as the energy which is initially evenly distributed over the lattice are displayed for some xed parameters.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:42 #516
Dynamical theory of soliton excitations in deoxyribonucleic acid (DNA) double helices has been studied by a revised Hamiltonian in which the dipole-dipole interaction and the dipole-induced-dipole interaction between two bases in a complimentary base pair are taken into account in addition to the hydrogen-bond energy. The motion equations of bases are a set of coupled sine-Gordon equations. The soliton solutions of theses equations are studied in detail and the results are compared with the experimental data in the H-D exchange measurements of DNA chains.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:43 #517
Vladimirovich написал(а):
попытки mishabara и Петра настаивать на син-Гордоне могут быть несовместными
Они не знают на чем настаивают или, точнее, им по барабану на чем настаивают
- лишь бы присобачить гламурную и сногсшибательную терминологию. Уверен, что возьмут на вооружение и работы группы Флеминга по квантовому фотосинтезу - предвосхитили, мол, их своим якобы волновым геномом. По-видимому, Мишу и Петра смущать не будут разницы между ихними гипотетическими классическими волнами типа мШЭИ
и квантовыми волновыми аспектами в работах группы Флеминга - лишь бы слово волна присутствовало, дабы оправдать пантеистические натур-философские замашки группы Гаряева
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:45 #518
Abstract: We present a simplest model describing opening of DNA double helix. Corresponding differential equations are solved analytically using multiple-scaleexpansions after transition to complex variables. Obtained solution corresponds to localized torsional nonlinear excitation – breather. Stability of breather is also investigated. We view two cases: strong and weak interchain interaction. We have shown that in the case of strong interchain coupling only in phase breathers can exist. If interchain coupling is weak enough, the strong energy exchange between the chains turns out to be possible. Such an exchange can be realized by nonlinear periodic waves as well as by breathers.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:47 #519
Abstract: It was first suggested by Englander et al to model the nonlinear dynamics of DNA relevant to the transcription process in terms of a chain of coupled pendulums. In a related paper [4] we argued for the advantages of an extension of this approach based on considering a chain of double pendulums with certain characteristics. Here we study a simplified model of this kind, focusing on its general features and nonlinear travelling wave excitations; in particular, we show that some of the degrees of freedom are actually slaved to others, allowing for an effective reduction of the relevant equations.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
28 Март 2010 17:50 #520
We study the nonlinear dynamics of a deformed Deoxyribonucleic acid (DNA) molecular chain which is governed by a perturbed sine-Gordon equation coupled with a linear wave equation representing the lattice deformation. The DNA chain considered here is assumed to be deformed periodically which is the energetically favourable configuration, and the periodic deformation is due to the repulsive force between base pairs, stress in the helical backbones and due to the elastic strain force in both the strands. A multiple scale soliton perturbation analysis is carried out to solve the perturbed sine-Gordon equation and the resultant perturbed kink and antikink solitons represent open state configuration with small fluctuation. The perturbation due to periodic deformation of the lattice changes the velocity of the soliton. However, the width of the soliton remains unchanged.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 00:45 #523
На параграф 512
«The effect does not crucially depend on the order of nonlinearity (i.e. types of reactions), a fact that may explain why simplified models possess properties occuring in realistic systems.»
Конечно нужно читать и саму статью, однако она косвенно объясняет позицию 4 отрабатываемых тезисов «фантомной теории», и противоречий пока не видно ..
На параграф 517
Да, конечно группа Гаряева вышла на сходные проблемы в 1986 году, подтверждение основных моментов группы Флеминга (в 2007 году) тянет за собой целую цепочку событий … тут и передача энергии (постулат 2 тезисов «фантомной теории»), тут и возможность создания лазера на ДНК, тут и подтверждение связанное с «гипотетическими классическими волнами типа мШЭИ» , тут и возможные подходы к голографическому образу передачи информации …
Тут и вопросы, … почему у ППГ забрали лаборатории, почему 99 % его видения проблемы подтверждается на диком западе, а не в родных пенатах…
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 02:28 #524
Прохожий написал(а):
подтверждение основных моментов группы Флеминга (в 2007 году)
Миша, вы подтвердили в 2007-ом основные моменты группы Флеминга (какими конкретно вашими работами?) или группОЙ Флеминга в 2007-ом были подтверждены ваши разработки/идеи?
Прохожий написал(а):
тут и передача энергии (постулат 2 тезисов «фантомной теории»), тут и возможность создания лазера на ДНК, тут и подтверждение связанное с «гипотетическими классическими волнами типа мШЭИ» , тут и возможные подходы к голографическому образу передачи информации … почему 99 % его (ППГ) видения проблемы подтверждается на диком западе
Миша, не пресмыкайтесь, пожалуйста, к успехам дикого Запада, потому что мы начеку в ожидании подобного с вашей стороны
. Флеминг с группой выполнил, по-видимому, скрупульёзное исследование конкретной ограниченной проблемы в пределах пресловутого фотосинтеза, где геномом, тем более волновым, и не пахнет
Его скромные и локальные гипотезы ни в коем случае не могут сравниваться с революционностью, глобальностью (и фантасмагоричностью в смысле неподтверждённости опытом) ваших замашек типа мШЭИ, ДНК лазера, передачи информации голографическим образом и других гранд-построений гения Петра
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 04:13 #525
Насколько я понимаю, работы Флеминга представляют собой серьёзное научное исследование с внятной формулировкой, что ещё не гарантирует верность вывода, будем разбираться.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 05:41 #526
Прохожий написал(а):
Да, конечно группа Гаряева вышла на сходные проблемы в 1986 году, подтверждение основных моментов группы Флеминга (в 2007 году) тянет за собой целую цепочку событий … тут и передача энергии (постулат 2 тезисов «фантомной теории»), тут и возможность создания лазера на ДНК
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 13:56 #527
На пост 526
Если представители мобилру не успеют опровергнуть результаты группы Флеминга , то это дело просто времени ...., и так же о получении голограмм по передачи информации...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 14:27 #529
Прохожий на mishabara похожий написал(а):
Если представители мобилру не успеют опровергнуть результаты группы Флеминга , то это дело просто времени ...., и так же о получении голограмм по передачи информации...
Вопрос к знатокам!!!
Когда муж и жена создают семью и жена рожает ребёнка, то и муж и жена чувствуют в нём родство - родную кровь.
Когда рабыня рожает от рабовладельца - она не чувствует родства с ребёнком и такой ребёнок чувствует родство только лишь с папой.
Когда рабыня рожает от кого-угодно, но не от рабовладельца, то она чувствует родство с ребёнком, т.е. она чувствует что это именно её ребёнок.
Можно ли этот феномен хоть как-то объяснить с точки зрения генетики? Можно любой, а не только волновой.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
29 Март 2010 19:45 #533
PauLita написал(а):
Вопрос к знатокам!!!
Когда муж и жена создают семью и жена рожает ребёнка, то и муж и жена чувствуют в нём родство - родную кровь.
Когда рабыня рожает от рабовладельца - она не чувствует родства с ребёнком и такой ребёнок чувствует родство только лишь с папой.
Когда рабыня рожает от кого-угодно, но не от рабовладельца, то она чувствует родство с ребёнком, т.е. она чувствует что это именно её ребёнок.
Можно ли этот феномен хоть как-то объяснить с точки зрения генетики? Можно любой, а не только волновой.
Кстати, вы знаете, что роддома придумали рабовладельцы?
— Нет. А зачем они их придумали?
— Нужно же было как-то продлевать рабский род а значит, рабам нужно было где-то рожать и потом куда-то девать детей. Вот и придумали: рабыня-мамочка рожала в роддоме, а на третий-четвертый день возвращалась на рабочее место. Ребенок же оставался другим рабам, которые воспитывали его. В лучшем случае, если хозяин был добрый, бедная мама договаривалась время от времени кормить дитя грудью.
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
30 Март 2010 09:31 #535
Видно ,что широта информации получаемых из зарубежных источников (и главное отсутствие на творческом поле Запада различных представителей мобилру ) дает возможность понять, что ряд спорных вопросов , которые даже и не пытаются понять тут (в России) пополняет правильность выводов ППГ.
Разберем, например конструкции, которые вызвали явное недоумение и неожиданный ступор у оппонентов ППГ. Группа исследователей под руководством профессора Грэхама Флеминга (Graham Fleming) опубликовала в своем университетском вестнике (явно не рецензируемом по терминологии оппонентов ППГ) свою работу, в дальнейшем разнесенную ветром сенсации на многие издания. Что там интересного с точки зрения «фантом теории» для ППГ. Вот этот ненавязчивый вывод - зафиксировали «квантовые биения» - когерентные электронные осцилляции в молекулах-донорах и молекулах-акцепторах, генерируемые энергетическими возбуждениями.. Именно этот вывод ставит взгляды ППГ из разряда гипотетической гипотезы (теории) в практически выполнимую плоскость для решения тех задач кои им и обозначены.
Переведем это на язык более понятный для физика-надсмотрщика Хайдук и с товарищами из организации противников ППГ…
… Квантовые биения обычно могут наблюдаться при переходе системы из импульсно возбуждённого суперпозиционного состояния в собственное. В простейшем случае суперпозиции двух уровней (1 и 2) интенсивность спонтанного излучения в определенном направлении оказывается модулированной во времени …
Именно этим аспектом проблемы и упрекают в недоказанности у ППГ в получении информации по мШЭИ… однако это оказалось возможным, по другим источникам.
Какое еще нужно заключение получить ППГ, что бы доказать что излучение типа мШЭИ можно получить и на территории России.
Именно эти аспекты и записаны в постулатах тезисов (краткой выжимкой из огромного теоретического материала ППГ newsample.com/01/TezisPPG.htm ) и дополненного специалистами этого форума.
Но положения эти, что, то никто не опровергает, а суют информацию о том, что слишком много формул.., но даже краткую пробежку по их написанию сделать то оказывается сложно … только реплики и ни чего не значащие афоризмы про зубы..коды Рида Соломона и так далее .. а наглядное пособие улыбки зубов и постельные сцены …
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
30 Март 2010 10:04 #537
mishabara написал(а):
Видно ,что широта информации получаемых из зарубежных источников (и главное отсутствие на творческом поле Запада различных представителей мобилру ) дает возможность понять, что ряд спорных вопросов , которые даже и не пытаются понять тут (в России) пополняет правильность выводов ППГ.
Если Вы чего-то не знаете, то это не значит, что этого - не существует...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
30 Март 2010 10:08 #538
mishabara написал(а):
Вот этот ненавязчивый вывод - зафиксировали «квантовые биения» - когерентные электронные осцилляции в молекулах-донорах и молекулах-акцепторах, генерируемые энергетическими возбуждениями.. Именно этот вывод ставит взгляды ППГ из разряда гипотетической гипотезы (теории) в практически выполнимую плоскость для решения тех задач кои им и обозначены.
Этот вывод вовсе не переводит взгляды ППГ из разряда гипотезы в практически выполнимую плоскость. Только физический и биологический эксперимент может оправдать этот научный бред. Пока - нет...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
30 Март 2010 10:10 #539
mishabara написал(а):
Но положения эти, что, то никто не опровергает, а суют информацию о том, что слишком много формул.., но даже краткую пробежку по их написанию сделать то оказывается сложно … только реплики и ни чего не значащие афоризмы про зубы..коды Рида Соломона и так далее .. а наглядное пособие улыбки зубов и постельные сцены …
У Вас буйная фантазия... Объяснимая правда Вашим окружением...
Волновой геном еще и еще раз. Пока не поймём (№6)
30 Март 2010 20:11 #540
mishabara написал(а):
Переведем это на язык более понятный для физика-надсмотрщика Хайдук и с товарищами из организации противников ППГ…
… Квантовые биения обычно могут наблюдаться
Так вы квантовые биения наблюдаете в опыте с крысами?
