A superspace model of knots and links for DNA time series data is proposed to take into account the feedback loop from docking to undocking state of protein–protein interactions. In particular, the direction of interactions between the 8 hidden states of DNA is considered. It is a unified spin model where the genotype, from active and inactive side of DNA time data series, can be considered for any living organism. The mathematical model is borrowed from loop-quantum gravity and adapted to biology. It is used to derive equations for gene expression describing transitions from ground to excited states, and for the 8 coupling states between geneon and anti-geneon transposon and retrotransposon in trash DNA. Specifically, we adopt a modified Grothendieck cohomology and a modified Khovanov cohomology for biology. The result is a Chern–Simons current in extradimensions of a given unoriented supermanifold with ghost fields of protein structures. The 8 dimensions come from the 8 hidden states of spinor field of genetic code. The extradimensions come from the 3 types of principle fiber bundle in the secondary protein.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
28 Фев 2019 09:09 #7780
Хайдук wrote:
и тебя, игорь, и Петровича как мух на г.... тянет к тому, чего не понимаете, дабы пощеголять и покрасоваться
То есть сам факт примеси спинорных полей к кодонам ДНК тобой уже не оспаривается, но тебя смущает лишь наличие нас с Петровичем на фоне опубликованного ?
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
28 Фев 2019 09:22 #7781
limarodessa wrote:
ПетровичЪ, а ничего вообще что ghost переводится как фантом ?
nonlocality wrote:
Это прекрасно, если перевод точный.
ПетровичЪ, я несколько слукавил, сообщив Вам о фантомах. Я знал уже очень давно, что ghost field это специальное понятие в квантовой теории поля, к Вашим "фантомам" отношения не имеющее:
In the terminology of quantum field theory, a ghost, ghost field, or gauge ghost is an unphysical state in a gauge theory. Ghosts are necessary to keep gauge invariance in theories where the local fields exceed a number of physical degrees of freedom.[1]...
"Bad ghosts" represent another, more general meaning of the word "ghost" in theoretical physics: states of negative norm,[5] or fields with the wrong sign of the kinetic term, such as Pauli–Villars ghosts, whose existence allows the probabilities to be negative thus violating unitarity.[6]
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
28 Фев 2019 09:43 #7783
limarodessa wrote:
ПетровичЪ, я несколько слукавил, сообщив Вам о фантомах. Я знал уже очень давно, что ghost field это специальное понятие в квантовой теории поля, к Вашим "фантомам" отношения не имеющее
In differential geometry, given a spin structure on an n-dimensional orientable Riemannian manifold (M, g), a section of the spinor bundle S is called a spinor field.
Китайские власти опубликовали проект методических указаний, регулирующих эксперименты по генетическому редактированию и другим биомедицинским технологиям...
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
28 Фев 2019 11:12 #7785
limarodessa wrote:
ПетровичЪ, я несколько слукавил, сообщив Вам о фантомах. Я знал уже очень давно, что ghost field это специальное понятие в квантовой теории поля, к Вашим "фантомам" отношения не имеющее:
Отлично. Теперь главное - не запутаться самому. Средство для этого простое - дружить с профессионалами, что и делаю. Но с другой стороны им интересно, что там вытворяет генетика без них. А еще интереснее - с ними.
Despite certain quantum concepts, such as superposition states, entanglement, ‘spooky action at a distance’ and tunnelling through insulating walls, being somewhat counterintuitive, they are no doubt extremely useful constructs in theoretical and experimental physics. More uncertain, however, is whether or not these concepts are fundamental to biology and living processes. Of course, at the fundamental level all things are quantum, because all things are built from the quantized states and rules that govern atoms. But when does the quantum mechanical toolkit become the best tool for the job? This review looks at four areas of ‘quantum effects in biology’. These are biosystems that are very diverse in detail but possess some commonality. They are all (i) effects in biology: rates of a signal (or information) that can be calculated from a form of the ‘golden rule’ and (ii) they are all protein–pigment (or ligand) complex systems. It is shown, beginning with the rate equation, that all these systems may contain some degree of quantumeffect, and where experimental evidence is available, it is explored to determine how the quantum analysis aids in understanding of the process.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
28 Фев 2019 21:10 #7796
ОБ ОТОБРАЖАЮЩИХ СВОЙСТВАХ БЕГУЩИХ ВОЛН ИНТЕНСИВНОСТИ ПРИ ЗАПИСИ ДИНАМИЧЕСКИХ ОБЪЕМНЫХ ГОЛОГРАММ */
Ю.Н.Денисюк
"...В работах /1-3/ было показано, что объемная материальная модель стоячей волны, возникающей в пространстве вокруг объекта при сложении падающего и рассеянного излучения, является своеобразным оптическим эквивалентом этого объекта, т.е. такая модель обладает свойством воздействовать на излучение так же, как и объект..."
Австралийские ученые описали крайне редкий случай рождения полуторазиготных (полуидентичных) близнецов, отчет опубликован в The New England Journal of Medicine. Гены, полученные детьми от матери, полностью идентичны, однако последовательность ДНК от отца совпадает лишь частично.
Принято выделять два типа близнецов: гомозиготные и гетерозиготные. Гомозиготные близнецы генетически идентичны, они получают наследственную информацию от одной яйцеклетки и одного сперматозоида. Гетерозиготные близнецы генетически являются обычными сиблингами, которые наследуют примерно по 50 процентов последовательности ДНК от каждого из родителей. Первые получаются в результате деления одной зиготы, вторые — вследствие оплодотворения двух разных яйцеклеток разными сперматозоидами.
Тем не менее, существует и третий, крайне редкий тип близнецов, — полуторазиготные (sesquizygotic, латинская приставка sesqui переводится как «полтора»). Их генотип совпадает на 50-99 процентов. Первый и до недавнего времени единственный зарегистрированный такой случай был описан в 2006 году американскими учеными. Близнецы родились со специфическими аномалиями — наружными половыми органами промежуточного типа.
В этот раз интерес исследователей вызвали необычные результаты ультразвукового исследования женщины на 28 неделе беременности. При обследовании было обнаружено наличие монохориональной плаценты — одной для двух плодов. Почти всегда это является признаком того, что близнецы гомозиготные и, соответственно, должны быть одного пола, однако в реальности они оказались разного пола.
«Мать пришла для рутинного ультразвукового исследования через несколько месяцев, и мы обнаружили, что один [из близнецов] мальчик, а второй — девочка. С этого момента мы начали генетические исследования», — рассказал The Guardian соавтор исследования доктор Майкл Габбетт (Michael Gabbett) из Квинследского технологического университета.
Чтобы разобраться в ситуации, ученые провели амниоцентез (диагностический прокол обоих плодных пузырей) для получения генетического материала. Параллельно с этим был изучен геном обоих родителей. При анализе последовательности ДНК было показано, что материнские аллели близнецов идентичны, а отцовские сходны лишь на 78 процентов.
Авторы предполагают, что такое распределение генов могло произойти в результате оплодотворения одной яйцеклетки двумя сперматозоидами — подобный феномен уже был описан в исследованиях на животных. После двойного оплодотворения хромосомы яйцеклетки и двух сперматозоидов могут располагаться на трех разных полюсах зиготы. Этому необычному явлению было дано название гетерогенное деление клетки. Образуется триполярное веретено деления, которое далее дает три бластомера: два содержат генетический материал матери и гены одного из сперматозоидов, третий — хромосомы от двух разных сперматозоидов. На определенном этапе клетки, содержащие только мужской генетический материал, прекращают развиваться и «выходят из игры». Бластомеры, содержащие материнские и отцовские хромосомы, продолжают деление. Близнецы, близкие генетически, но не идентичные, начинают развиваться после деления бластоцисты.
Исследователи предупредили родителей о возможных врожденных аномалиях у детей, которые, действительно, проявились. Вскоре после рождения девочке пришлось ампутировать одну руку вследствие тромбоэмболии правой плечевой артерии, развившейся из-за нарушения свертываемости крови. В возрасте трех лет тому же близнецу пришлось удалить яичники в связи с врожденными дефектами.
В заключении авторы дали свое определение понятию «полуторозиготные близнецы», новому виду близнецовости. Это близнецы, «генетически идентичные друг другу в отношении последовательности ДНК, наследуемой от одного родителя, но отличающиеся друг от друга примерно на 50 процентов в отношении набора ДНК, полученных от другого родителя».
Ученые поднимают вопрос, как часто встречаются такие близнецы, не проходят ли некоторые случаи незамеченными. Однако сегодня данные крупных исследований указывают на то, что это действительно очень редкое явление.
