Интересную реплику дали в пп.37 (правда другой темы). Стоит подумать, а почему же не получилось?.Не удержали по времени t созданное облако ЭМ-полей имитирующую молекулу колхицина? или по тому, т.е. не смогли собрать устойчивый пул ЭМ-полей и он развалился не выполнив свои функции? Или почему?
ps - Абрам, я не глупая, у меня просто, таки, склад ума такой!
- Склад твой, Цилечка, по ходу, ограбили!
Продолжим эпопею про био-компьютер внутри клетки ...
Сети взаимодействующих биомолекул выполняют многие важные функции в живых клетках , но «принципы проектирования», лежащие в основе функционирования таких внутриклеточных сетей, остаются недостаточно понятными, несмотря на интенсивные усилия, включая количественный анализ относительно простых систем В начале 2000-х Джеймс Коллинз и Тим Гарднер стали создателями первого искусственного генетического триггера, обладающего поведением, сходным с триггером в электроинженерии.
Он представлял собой систему из двух генов (ген A и ген B), репрессирующих друг друга. При этом за синтезом одного из репрессоров следовал синтез флуоресцентного белка, для возможности отследить извне динамику системы. После краткой индукции система переходила из первого состояния (ген А включен, ген B выключен) во второе (ген B включен, ген А выключен), что сопровождалось исчезновением или появлением сигнала. Такая система обладает памятью: после исчезновения воздействия индуцирующего сигнала система сохраняет способность поддерживать свое состояние.
Чуть позже Майкл Эловиц и его коллега Станислав Лейберг сконструировали первый осциллятор,
представляющий собой систему из трех генов, связанных между собой петлями связи. Продукт первого гена подавляет действие второго, второй — третьего, и, замыкая круг, продукт третьего гена репрессирует экспрессию первого. Концентрации трех белков представляли собой гармонические колебания с заданными значениями амплитуды. Осцилляция детектировалась с помощью репортерной плазмиды с геном GFP.
Несмотря на то, что идея для создания биологических аналогов осциллятора и триггера пришла из электронной инженерии, за основу воплощения на уровне клетки этих устройств были взяты системы, реально существующие в природе. Каркасом для осциллятора стали биологические часы цианобактерий, а для триггера — система бактериофага лямбда, ответственная за вступление бактериофага в литический цикл.
Это цитаты из работы Синтетическая колебательная сеть транскрипционных регуляторовМайкл Б. Эловиц, Станислас Лейблер
ps - Понимаете, Абрам, если вам налили чай доверху, то это не от щедрости, нет...
- А от чего?
- А чтобы вы не смогли положить туда сахар...
Метаболические пути — это связанные серии химических реакций, происходящих внутри клетки. Реагенты, продукты и промежуточные продукты реакции называют метаболитами, которые модифицируются последовательностью химических реакций, катализируемых ферментами.
Получается, что параллельно существует и "осцилляторная колебательная сеть" для этого управления
Тут еще нужно определить, что первично, что вторично.
ps Жила себе царевна-лягушка, не тужила. Тут явился Иван-царевич, и началось: пироги пеки, ковры тки, перед гостями пляши да ещё и утешай его! Называется – в сказку попала!
т.е. это морфизм в категории алгебраических систем. Это отображение алгебраической системы А, сохраняющее основные операции и основные отношения. Отображение называется гомоморфизмом групп , если оно одну групповую операцию переводит в другую...
К разделу Метаболические Пути. Лактатдегидрогеназа: механизм каталитической реакции и опыты подтверждающие ВНЕШНЮЮ инициализацию этих путей на пуле сыворотки крови.
Так, что не все так безнадежно.
ps - Из всех религий большевики больше всего не любили иудаизм.
- С чего ты взял?
- Они придумали назло иудеям субботник. Мало того, что в этот день нужно работать, так ещё и бесплатно.
Вопрос, как предлагаемые варианты внутренней информационной сети контролируют все основные процессы, протекающие в живых системах:
а) как, поддерживают в организме устойчивые состояния, характеризующиеся постоянством концентраций веществ (гомеостаз, стационарные состояния);
б) как, обеспечивают периодические незатухающие колебания концентраций определенных групп веществ (осцилляции, циклы);
в) как, контролируют необратимые процессы: развитие, рост, дифференцировка, апоптоз.
При чему тут Пескович???Тут же не разбирают "вакумные измы" от физиков-неудачников типа Г.Шипова и К0
Тут примериваются к возможным вариантам, где основной структурной единицей является осциллятор и этой фактуре соответствует аминокислоты (со своими рамками- типа того же "бензольного кольца"). На этой основе и показывают, что эта БАЗА (и теоретически и практически) ставится НА все биологическое наследства данное НАМ природой.
Стоит напомнить, что сейчас в научную среду врывается новый термин "генные сети" (или регуляторные сети генов).
Структура сети
Ядро сети – группа координировано экспрессирующихся генов.
Белки, кодируемые этими генами.
Отрицательные и положительные обратные связи, координирующие работу генной сети.
Низкомолекулярные соединения (метаболиты) и внешние сигналы, обеспечивающие переключение состояний генной сети. Классификация генных сетей
Генные сети, обеспечивающие осуществление циклических процессов, например, клеточного цикла, цикла сокращения сердечной мышцы и т.д.
Генные сети, обеспечивающие процессы роста и дифференцировки клеток, морфогенеза тканей и органов, роста и развития организмов.
Генные сети, обеспечивающие гомеостаз биохимических и физиологических параметров организма.
Генные сети, обеспечивающие реакции организмов на изменение состояния внешней среды, например, стрессовый ответ.
Наша группа, просто рассматривает взаимодействие этих вещей на нижнем функциональном уровне, т.е. на базе участия в этих процессах молекулярных осциляторов на аминокислотах.
ps 25
www.library.biophys.msu.ru/gettext?Serial=76491 БАЗЫ ДАННЫХ ПО РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ЭУКАРИОТ
Ананько Е. А., Подколодная О. А., Игнатьева Е. В., Кель А. Э., Колпаков Ф. А., Кель-Маргулис О. В., Меркулова Т. И., Подколодный Н. Л., Фролов А. С., Григорович Д. А., Степаненко И. Л., Горячковская Т. Н., Ромащенко А. Г., Колчанов Н. А.
Лаборатория теоретической генетики,институт цитологии и генетики СО РАН, 630090 Новосибирск
Поток информации по регуляторным процессам в клетке в последние годы растет очень стремительно. Для накопления и систематизации подобной информации в институте Цитологии и Генетики СО РАН создается комплекс взаимосвязанных баз данных. Регуляция экспрессии генов - сложный и многостадийный процесс, в каждой базе данных накапливается информация об отдельных аспектах этого процесса. Была предпринята попытка интеграции всей имеющейся информации на уровне генных сетей. Разработана технология их формализованного описания в базе данных GeneNet, позволяющая накапливать информацию по элементарным структурам, событиям и процессам. В настоящее время в базе данных содержится информация о четырех генных сетях, регулирующих противовирусный ответ, липидный метаболизм, дифференцировку эритроцитов и азотфиксацию у бобовых. Создан также Java-апплет, позволяющий визуализировать информацию из базы данных GeneNet на трех иерархических уровнях: целого организма, отдельной клетки и отдельного гена. Уровень отдельного гена представлен в виде его регуляторной карты, полученной на основе информации, содержащейся в TRRD - базе данных по регуляции экспрессии генов эукариот, также разрабатываемой в институте Цитологии и Генетики. База данных TRRD создана для описания протяженных регуляторных районов генов эукариот. В основе этого описания лежит модель иерархической блочно-модульной организации регуляторных районов транскрипции. В настоящее время пополнение базы данных TRRD ориентировано на описание функциональных генных систем. В TRRD имеются следующие специализированные разделы: гены с эритроид-специфичной регуляцией (ESG-TRRD), гены клеточного цикла, гены липидного метаболизма (LM-TRRD), интерферон-регулируемые гены (IIG-TRRD), глюкокортикоид-регулируемые гены, гены эндокринной системы (ESTRRD), гены теплового шока (HS-TRRD), гены растений (PLANT-TRRD).
Классификация генных сетей
Генные сети, обеспечивающие осуществление циклических процессов, например, клеточного цикла, цикла сокращения сердечной мышцы и т.д.
Вот тут взять да и сказать - блаженные ботаники занимаются псевдонаукой дистантного воздействия.
Но лучше спросить про публикации. Или Базы данных засекречены?
Для пользователя с ником Наблюдатель. Как видно без Блаженного Ботаника и его Виртуального Генома с набором "бубликаций" ученые смогли обойтись.
Для пользователя Хайдук - вообще то это все хозяйство сидит на "осцилляторах" в аминокислотах, вот они то ВСЕ и колышат.
ну, и как "приобретённый опыт" в жызни существа успевает вызывать мутации как раз у тех регуляторных генов, что якобы "отвечают" за этот конкретный опыт?
Исследователи получили 60 транскриптомов (совокупность молекул РНК, образующихся при работе генов) нематод Caenorhabditis elegans разного возраста, включая четыре мутанта-долгожителей. Средняя продолжительность жизни последних в 2,2-9,4 раза выше, чем у обычных. Оказалось, что с возрастом происходят изменения в концентрации различных транскриптов, называемые транскриптомным дрейфом (transcriptomic drift), при этом данные изменения у разных червей обладали схожими признаками.
Ученые предположили, что это объясняется существованием программы старения. Главная идея заключалась в том, что должна существовать какая-то одна переменная, характеризующая состояние регуляторной сети генов, и при этом она должна определять биологический возраст.
Анализ транскриптомов показал, что свой вклад в биологический возраст вносит 71 ген. Это позволило исследователям определить по хронологическому возрасту биологический возраст каждой нематоды вне зависимости от ее продолжительности жизни. Иными словами, исследователи определили общий для всех показатель «критичности» регуляторной сети генов
ps Не гонитесь за новинками: способ размножения человека не меняется уже долгое время — и ничего.
