Биома́ркер — характеристика (биологический признак), которая используется в качестве индикатора состояния всего организма[1].
Понятие биомаркера было предложено в 2001 году Национальным институтом здоровья США. Оно формулировалось как характеристика, которую можно объективно измерить, и которая может служить в качестве индикатора физиологических и патологических биологических процессов или фармакологических ответов на терапевтическое вмешательство[1].
К наиболее известным биомаркерам относятся, видимо, такие давно используемые характеристики, как температура тела, кровяное давление, частота пульса.
В настоящее время понятие биомаркеров достаточно широко. В генетике, например, это последовательности ДНК или РНК, которые ассоциированы с развитием заболевания (связаны с восприимчивостью к болезни или вызывают заболевание)[2]. Биомаркерами являются все результаты медицинских анализов. Иллюстрацией последнего могут быть исследования плазмы крови на наличие белков-биомаркеров аутизма[3].
Биомаркеры могут представлять собой вещество, чьё обнаружение указывает на конкретное болезненное состояние или присутствие чужеродных организмов. Так, специфические антитела указывают на конкретную инфекцию[3].
Биомаркером может быть вещество, которое специально вводят в организм. Например, изотоп хлорида рубидия для оценки кровотока при рентгеноскопии.
В настоящее время не существует единой общепринятой системы классификации биомаркеров. Тем не менее, в зависимости от конкретных потребностей, их систематизируют по разным признакам. В общей клинической практике распространена классификация по следующим типам[4]:
0 тип — биомаркеры, указывающие на наличие заболевания и связанные с ним клинические проявления;
I тип — маркеры, связанные с лечебным эффектом и механизмом действия препаратов;
II тип — маркеры, позволяющие предсказать исход заболевания и эффективность лечения.
hide wrote:
Насчитывают ок. 20.000 человеческих болезней...Абсолютно здоровых не бывает...Так что всегда можно найти, что хоцца...На сколько можно доверять диагностике по этим биомаркерам?
Где здесь биомаркеры? Любое измерение начинается со стандартизации оборудования и условий замеров.
Пока этим совсем не озабочены - искать корреляции бессмысленно.
Корелляции биомаркер - патология?
И по чем стандартизировать-то? Вы думаете, этот подвид оборудования (ГРВ) может быть стандартизирован?
Создается впечатление, что обобщенных баз данных по биомаркерам заболеваний человека просто нет...По запросу ссылок не обнаружено. Мелькали сообщения, что японцы (2011г.) собирались создавать базу ЗДОРОВЫХ людей...В основном, отрывочные ссылки по базам для онкологии и старению плюс парочка по другим отделным направлениям медицины...
Это шо ж - самим компилировать?
В медицинской практике, литературе все болезни, можно сказать, условно делят на соматические, нервные и психические болезни.
Соматические – внутренние болезни. Болезни при которых патологические изменения обнаруживают органы и системы человеческого тела. При этом, надо отметить, не делается различий в том, какие причины привели к болезненным изменениям. Хотя существует тенденция выделять из внутренних их болезни собственно соматические и болезни инфекционные. Или болезни собственно соматические и болезни эндокринные и др. Такое деление, впрочем, весьма условно, поскольку основанием для этого деления становятся самые различные критерии. Нервные болезни. В XIX в. «нервные болезни» были выделены из «внутренних болезней» в самостоятельную группу. Главным условием для этого послужили особенности форм патологии. В отличие от соматических, по преимуществу органных форм патологии, нервные болезни в своем большинстве имеют характер системных. При этом имеют в виду повреждение или нарушение тех или иных морфофункциональных систем, составляющих единую нервную систему человека. Особенность нервных болезней состоит, в частности, в том, что в основе их лежат нарушения афферентной – приводящей, чувствительной, или эфферентной – отводящей, двигательной проводимости в нервных путях, вызванные повреждениями самих проводников на разном их уровне, или повреждением центральных – церебральных – мозговых центров их проекции. Нервные болезни являются болезнями нервной системы и мозга. Мозга спинного, продолговатого, головного, включая все его образования. Нервные болезни также объединяют формы патологии с различной этиологией. Этиология может быть инфекционной, вирусной, дегенеративной, сосудистой и др. Психические болезни. Необходимо отметить, что в истории врачевания также произошло вначале отделение «психических болезней» от «соматических», вместе с «нервными». Только позднее «психические болезни» были выделены из них в отдельную самостоятельную группу. В некоторых странах с XX по XXI в. до настоящего времени во врачебной специальности полного разделения нервных и психических болезней не произошло. Сам головной мозг в широком смысле слова является тоже «внутренним» органом, а болезни головного мозга все же являются предметом исследования не клиники внутренних болезней, а невропатологии, психиатрии и др. Как любой другой орган организма, головной мозг обнаруживает, естественно, функции биологические – физиологические. Интересно отметить, многие данные по изучению подростков, с раннего возраста вскормленных в логове животных, т. е. развивающихся вне человеческого общества, вне культурно-исторического воспитания, обнаружило все типичные биологические качества, определяемые современными методами. В то же время признаков самой развитой человеческой психики у таких детей и подростков выявлено не было. studopedia.ru/5_63523_sistematika-bolezney.html
Биомаркеры могут быть клиническими, имиджевыми (например, те, что используются в процессе магнитно-резонансной томографии) или биохимическими (находятся в крови, спинномозговой жидкости, слюне, моче или на поверхности кожи). Различают их и по характеру заболевания: неврологические (скажем, биомаркеры болезни Альцгеймера), метаболические, сердечно-сосудистых заболеваний, онкомаркеры, генетические или выявляющие патологии внутриутробного развития (например, биомаркеры аутизма). www.svoboda.org/a/27560035.html
Команда индийских исследователей использовала в своей работе, результаты которой представлены в Nature, 30 образцов нормальных тканей взрослого организма, семь образцов зародышевых тканей и шесть типов клеток. Из них выделили белки, которые расщепили специальными ферментами и с помощью новейших технологий подсчитали их количество в каждом образце. Было установлено соответствие между 17 294 генами (это 84% от всего генома) и кодируемыми ими белками, причем 2535 из этих соответствий ранее отсутствовали в общих базах данных. Кроме того, были исправлены ошибки предыдущих аннотаций, пропустивших некоторые гены или определяющих экспрессирующиеся (действующие) гены как псевдогены (нерабочие), и кодирующие РНК как некодирующие.
Вторая команда исследователей (Технический университет Мюнхена, Германия) в своей работе, также опубликованной в Nature, изучила более 18 тыс. протеинов, указав в своей базе данных их количество, распределение и модификации в разных типах клеток и тканей.
Создание двух карт протеома, несмотря на их неполноту, значительно облегчает работу будущих исследователей по определению найденных белков. Это позволяет использовать результаты, полученные немецкими и индийскими учеными в различных сферах, в частности в персонализированной медицине, для диагностики заболеваний с помощью поиска биомаркеров (специфических сигнальных молекул) и подбора способа их лечения. www.gazeta.ru/science/2014/05/29_a_6051949.shtml
Случай но ли количество известных болезней кореллирует с количеством активного генома? Думаю, не будет преувеличением говорить о том, что ВСЕ болезни имеют генетическую основу...
Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот. Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии, и, всё чаще, методом криоэлектронной микроскопии вносится в базу данных биологами и биохимиками со всего мира, и доступна бесплатно через интернет сайты организаций-членов (PDBe[1], PDBj[2], RCSB[3]). www.wwpdb.org/
Альтернати́вный спла́йсинг — вариант сплайсинга матричных РНК (мРНК), при котором в ходе экспрессии гена на основе одного и того же первичного транскрипта (пре-мРНК) происходит образование нескольких зрелых мРНК. Структурные и функциональные различия образовавшихся транскриптов могут быть вызваны как выборочным включением в зрелую мРНК экзонов первичного транскрипта, так и сохранением в ней частей интронов[1][2]. Наиболее распространённая разновидность альтернативного сплайсинга предусматривает пропуск экзона[en]: отдельные экзоны транскрипта при определённых условиях могут быть как включены в зрелую мРНК, так и пропущены[3].
Белки, получаемые трансляцией таких мРНК, в результате имеют разные аминокислотные последовательности; таким образом, при альтернативном сплайсинге один транскрипт обеспечивает синтез нескольких белков. Широкое распространение такого сплайсинга у эукариот приводит к значительному увеличению разнообразия белков, закодированных в их геномах[4]. Например, организм человека синтезирует не менее чем 105 различных белков, в то время как число кодирующих их генов примерно 20 тысяч (при этом среди всех генов человека, которые содержат интроны, более 75 % выступают как матрицы для синтеза пре-мРНК, подвергаемых далее альтернативному сплайсингу)[1][2]. ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BB%D1%8C...81%D0%B8%D0%BD%D0%B3
habr.com/ru/post/423979/ Американская федерация исследований старения (AFAR) предложила такие критерии для биомаркеров старения:
Они должны прогнозировать скорость старения (т.е. точно определять, где человек находится в своей общей продолжительности жизни, и это должен быть более точный прогноз продолжительности жизни, чем хронологический возраст);
Они должны контролировать основной процесс, который лежит в основе процесса старения, а не последствия болезни;
Они должны давать возможность проходить повторное тестирование без ущерба для человека (например, анализ крови или метод визуализации);
Это должно быть что-то, что работает на людях и на лабораторных животных, таких, как мыши (чтобы их можно было проверить у лабораторных животных, прежде чем они были проверены на людях)».
Биомаркеры здорового старения
Warning: Spoiler![ Click to expand ][ Click to hide ]
1. Зеленым цветом – биомаркеры физиологической функции.
а) сердечно-сосудистые (липиды крови, артериальное давление)
б) функции лёгких (объем форсированного выдоха за первую секунду (ОФВ1)
в) метаболизм глюкозы (гликированный гемоглобин, глюкоза натощак)
г) состав тела (плотность костной ткани, масса мышц).
3. Сине-зелёным цветом – биомаркеры физической способности
а) прочность (сила сжатия кисти)
б) баланс (постоянный баланс)
в) лвкость (тест Purgee Pegboard )
г) локомоторная функция (скорость походки, тест Timed Up and Go, поднятие со стула)
4. Серым цветом – биомаркеры конгитивной функции.
а) память (тест Rey Auditory Verbal Learning)
б) скорость обработки (цифровое кодирование символов)
в) исполнительные функции (скорость речи).
Соматическое заболевание (от др.-греч. σῶμα — тело) — телесное заболевание, в противоположность психическому заболеванию.
В данную группу заболеваний входят болезни, вызываемые внешними воздействиями или же внутренними нарушением работы органов и систем, не связанные с психической деятельностью человека. В целом значительная часть болезней является именно соматическими, так, например, все травмы (кроме психологических) являются соматическими.
К соматическим заболеваниям относятся:
Заболевания сердца и сосудов
Заболевания дыхательной системы
Поражения печени и почек, ряд поражений желудочно-кишечного тракта
Травмы, ожоги и ранения
Наследственные генетические заболевания
Органические поражения нервной системы
Инфекции и спровоцированные ими поражения внутренних органов
Онкологические заболевания
Паразитарные инвазии
Эндокринные заболевания ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%BE%D0%BC...B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5
У 75 % больных раком обнаруживается повышенный уровень альфа-фетопротеина (АФП). Чаще всего он повышен при раковых заболеваниях печени; также его высокий уровень может говорить о раке яичек и яичников (в 5 % случаев).
Онкомаркер бета-2-микроглобулин свидетельствует о развитии лимфомы и множественной миеломы. Маркеры СА 27-29, СА 15-3 говорят о возможном раке груди, СА 125 — о раке яичников. Биомаркеры LASA-P, СА 72-4 заставляют заподозрить наличие рака яичников и опухолей ЖКТ. Маркер СА 19-9 обнаруживается при онкологическом поражении поджелудочной железы.
ПСА — простатический специфический антиген, который позволяет судить о вероятности рака простаты. Нормы этого неспецифического маркера различаются в зависимости от возраста мужчины (до 4 нг/мл).
АФП — маркер рака печени. Норма — до 10 МЕ/мл (при 400 МЕ и выше можно предположить наличие опухоли).
ХГЧ — хорионический гонадотропин человека, который вырабатывается в организме беременной женщины. Он может повышаться при эмбриональных видах рака или раке яичников. Норма — 2,5 Ед/мл.
CA 15-3 — онкомаркер рака легкого, молочной железы, эндометрия, яичников, мочевого пузыря. Норма — менее 31 Ед/мл.
CA 125 — опухолевый биомаркер, который обнаруживают при поражении яичников, молочной железы, матки, шейки матки, толстой и прямой кишки, поджелудочной железы, печени, легких. Норма — менее 35 Ед/мл.
CA 19-9 — маркер, говорящий о раковом поражении желудка, поджелудочной железы, прямой и толстой кишки, желчного пузыря, печени, желчных протоков. Норма — 37 Ед/мл.
