Британцы делают прорыв в судебной медицине
Новая технология в судебной медицине может помочь раскрыть тысячи "глухих" преступлений в Великобритании.
Депаратамент Судебных наук тестирует компьютерную систему анализа, которая может расшифровывать неразборчивые коды ДНК. Представители Департамента утверждают, что система позволит увеличить раскрываемость преступлений на целых 15%.
Благодря ей ученые смогут точно определять ДНК в случаях, если аналитического материала недостаточно, он плохого качества или если к поверхности, с которой снимается образец, дотрагивалось несколько человек.
Новая технология, названная DNAboost, позволит на 40% повысить количество идентифицируемых образцов ДНК. На сегодняшний день она уже используется полицейскими отделами в районах Западный Йоркшир, Южнный Йоркшир, Нортумбрия и Хамберсайд. По окончании трехмесячного тестового периода предполагается начать использование DNAboost полицией остальных графств.
DNAboost warms up cold cases
Scientists at Britain's Forensic Science Service (FSS) have developed computer software they say could radically improve the success of crime-scene DNA profiling. Called DNAboost, it is beginning a three-month trial with four major UK police forces.
But the technique could also have unexpected benefits for the burgeoning field of metagenomics - the systematic investigation, classification, and manipulation of the jumble of genetic material found in environmental samples.
Current technology has trouble interpreting small amounts of mixed DNA samples, especially when the material is poor quality. Martin Bill, a science manager in FSS's R&D department, says, 'DNAboost could increase the effectiveness of DNA profiling in crime-scene detection by over 15 per cent.' The FSS hope that thousands of 'cold' cases - some from over 30 years ago - could be solved with DNAboost-resolved samples.
Modern genetic profiling depends on analysing short tandem repeat (STR) DNA sequences. These sequences, containing two to ten nucleotide bases, are joined head to tail and repeated over and over again in longer DNA strands. Forensic scientists prefer tetra- and penta-nucleotide base pair STRs because their robustness affords a high degree of error-free data and less environmental degradation.
Thousands of such sequences, invariably from the non-coding 'junk' part of the DNA sequence, have been mapped at different locations on almost every chromosome of the human genome. Unique genetic profiles can be built up by counting how many repeats of a specific STR sequence there are at particular points (the FSS use 11) in the genome.
DNA profiling relies on the polymerase chain reaction (PCR) to amplify tiny traces of DNA found at a crime scene into enough material for analysis. Electrophoresis then separates the amplified STRs, which are visualised and identified using sensitive fluorescent dyes. This means that only one nanogram of genetic material is required to get a DNA profile, which can be matched with those stored in data banks.
But crime-scene samples which have come from more than one source, or have become contaminated or degraded over time, have until now proved uninterpretable by DNA profiling.
Enter the FSS's new DNAboost software. It can unravel these complex mixtures, although the FSS is saying little about how because the technology is still awaiting patent protection. 'We have developed a new data storage and coding algorithm that allows suspects to be identified faster and more accurately than by comparing complex samples to every DNA profile in a database,' says Bill. A little vague, perhaps, but DNAboost has got American and Interpol forensic scientists interested.
And the technique could have other applications apart from crime-busting. Rolf Apweiler of the European Bioinformatics Institute in Cambridge, UK, reckons that DNAboost could be useful for analysing the tremendously complex mixtures of genetic material found in soil or ocean samples.
Metagenomics research like this is helping to discover previously unknown microbes in the environment that can be 'mined' for new therapeutic molecules.
'All these species are more genetically distinct from each other compared to the differences between human beings,' says Apweiler. 'So identifying them using DNAboost should be trivial.'
Американские физики впервые экспериментально зарегистрировали связанные состояния из трех фотонов. Образование необычных для фотонов тримеров происходит при прохождении лазерного пучка через облако охлажденных атомов рубидия за счет формирования промежуточных поляритонных состояний, пишут ученые в Science.
В отличие от квантовых частиц, обладающих массой, фотоны очень слабо взаимодействуют друг с другом и практически не образуют связанных состояний. Впервые связанное состояние между двумя фотонами ученым удалось экспериментально зарегистрировать только в 2013 году. Для того, чтобы могли образоваться фотонные димеры, распространение света должно происходить в нелинейной квантовой среде, в которой между возбужденными состояниями атомов и фотонами происходит взаимодействие с формированием поляритонов. Вопрос о том, могут ли при этом фотоны образовывать связанные состояния с большим числом частиц больше двух, оставался до настоящего дня открытым.
Группа американских физиков под руководством Владана Вулетича (Vladan Vuletić) из Массачусетского технологического института и Михаила Лукина (Mikhail D. Lukin) из Гарвардского университета — из той же группы, которая пять лет назад зарегистрировала существование связанных фотонных пар — на этот раз смогла экспериментально получить связанное состояние из трех фотонов. Образование связанного состояния также происходит в нелинейной квантовой среде, при этом в качестве «посредников» при образовании тримера выступают атомы, из которых эта среда состоит.
В качестве такой нелинейной квантовой среды в данной работе использовалось облако из атомов рубидия-87, охлажденных до миллионных долей кельвина — то есть практически до абсолютного нуля. Облучая облако из сверххолодных атомов слабым лазерным пучком, на выходе можно зарегистрировать отдельные фотоны и достаточно надежно определить их свойства. Взаимодействие между фотонами в такой системе происходит через ридберговское состояние атома — высоковозбужденное состояние с маленьким потенциалом ионизации и большим временем жизни. Взаимодействие осуществляется за счет механизма электромагнитно-индуцированной прозрачности, который за счет эффектов квантовой интерференции приводит к появлению полосы пропускания света в области поглощения.
Образующиеся ридберговские поляритоны, каждый из которых включает в себя возбуждение атома рубидия и фотон, взаимодействуют друг с другом, формируя димеры и тримеры. В таком связанном виде они перемещаются по охлажденному атомному облаку, после чего возбуждение вместе с атомом рубидия остается внутри облака, а фотоны. связанные между собой парами и тройками, вылетают дальше.
Чтобы доказать, что в прошедшем сквозь облако атомов рубидия действительно образуют тримеры, ученые измерили их корреляции и провели анализ фазового состояния на выходе из облака. Исходя из полученных данных, авторам работы удалось доказать существование тримеров, а также количественно оценить их основные праметры: силу взаимодействия, характерное расстояние, на котором начинается взаимодействие, и скорость их распространения.
Оказалось, что возникающая у фотонов в тримерах эффективная масса приводит к уменьшению скорости распространения света примерно на 6 порядков относительно обычных 300 тысяч километров в секунду. Кроме того, ученые оценили энергию связи между фотонами в димерах и тримерах, которая оказалась примерно на 10 порядков меньше, чем, например, между атомами в молекуле водорода.
В своей работе физики также предлагают способы для увеличения устойчивости образовавшихся тримеров: в частности, это использование атомных облаков большего размера и изменение формы и площади лазерного пучка. По словам авторов работы, поскольку фотоны в таких димерах и тримерах оказываются запутанными, то за счет довольно сильной связи между ними, это связанное состояние можно использовать для более эффективной передачи информации в квантовых фотонных устройствах.
За счет взаимодействия лазера с облаками охлажденных атомов могут меняться свойства не только фотонов, но и самих атомов. Например, за счет эффекта электрострикции сферическое облако атомов можно растягивать и сжимать лазером. Кроме того, подобное взаимодействие можно использовать и в практических целях, например, для подавления шума при регистрации гравитационных волн.
Американские специалисты провели обследование 21 сотрудника посольства США, которые были подвержены «звуковому или сенсорному воздействию» на Кубе. У всех дипломатов обнаружилось травматическое повреждение головного мозга, передает Американская медицинская ассоциация (JAMA).
Пациенты жаловались на головную боль, снижение зрения и слуха, плохой сон, слабость и нарушения психики. По-видимому, они получили травмы системы клеток мозга, говорится в документе.
Как пояснили эксперты из Пенсильванского университета, такие повреждения сравнимы с последствиями ДТП или контузией при взрыве. При этом их причиной вряд ли было воздействие звуком, но акустические атаки «могли значительно усугубить положение».
В Вашингтоне считают, что с ноября 2016 года по август 2017-го в Гаване происходили акустические атаки. Власти Кубы эти обвинения отрицают. Кроме того, ФБР не обнаружило доказательств подобных атак.
...
Как пояснили эксперты из Пенсильванского университета, такие повреждения сравнимы с последствиями ДТП или контузией при взрыве. При этом их причиной вряд ли было воздействие звуком...
Американский химик Джеймс Ла Клер предложил способ химического кодирования с помощью внедрения меток изотопа углерода-13 в молекулы апигенина. Такой шифр можно использовать, например, для защиты лекарственных препаратов или бумажных документов. Для считывания кода, правда, потребуется спектрометр ядерного магнитного резонанса, сообщает ученый в Chemical Communications.
Защищать с помощью кодирования материалы или химические соединения иногда не менее важно, чем цифровую или печатную информацию. Например, защита всей относящейся к лекарству информации не поможет, если сам препарат поддельный и не содержит действующего лекарственного вещества. Поэтому, чтобы не проводить химический анализ отдельных химических соединений, некоторые ученые предлагают с помощью химического шифрования защищать фармпрепараты от подделок.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
13 Март 2018 23:33 #5774
nonlocality wrote:
поменяй третий в антикодоне на любой нуклеотид - ничего в кодировании не изменится. Почему? Потому что, и это доказано экспериментально, третий нуклеотид в КОДОНАХ не участвует в кодировании - по Ф.Крику. То есть кодируют первые два нуклеотида в кодонах (дублеты), но 3-й, хоть и не участвует, произвольно заменять НЕЛЬЗЯ, будет мутация.
да вы противоречите себе, Петрович: ничего не изменится, но в то же время произвольно заменять нельзя, потому что ... изменится, видимо ; да именно 3-й и определяет АК: 2 или 3 нуклеотида/буквы за одну АК и остальные 2 или 1 за другую АК или стоп, нечего усложнять, заморачиваться и запутывать лохов
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
14 Март 2018 00:24 #5775
nonlocality wrote:
Семантический произвол тут не допустим. Но раз так, то неизбежно возникают ситуации, кода дублет в кодоне будет одновременно кодировать две разные аминокислоты. И соответственно, рибосоме надо ВЫБИРАТЬ из двух разных значений дублета ОДНО правильное, иначе в растущий синтезируемый белок будет включена неправильна аминокислота. А это иногда катастрофа для организма - не правильный белок получится, например, фермент с искаженной функцией. Как решается это противоречие? Рибосома, как нанобиокомпьютер, встретив такой смешанный кодон, анализирует контекст мРНК и делает правильный выбор значения смешанного кодона. Каким образом? Она использует логико-лигвистический прием ДЕЛЕГИРОВАНИЯ ЗНАКОВОЙ функции смешанному кодону путем переобозначения 3-й буквы в смешанном кодоне. Пример-аналог ситуации с текстом-предложением: "Он забыл коГ домофона". Мы, читая этот контекст, ПОНИМАЕМ, что буква Г поставлена ошибочно, и что надо заменить ее мысленно на букву Д. То есть делегируем ПЕРЕОБОЗНАЧЕНИЕ Г на Д. То же делает рибосома по отношению к смешанному кодону мРНК, снимая противоречие. При этом достигается таки ОДНОЗНАЧНОСТЬ генетического кодирования при использовании 4-х буквенного алфавита в применении к смешанным кодонам
выходит, что у ваших "синонимических" кодонов не может быть смертельных мутаций, что суть ахинея
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
14 Март 2018 00:36 #5776
nonlocality wrote:
тРНК, ацилированная аминокислотой, имеет триплеты-антикодоны. Для синонимических кодонов антикодонов в избытке, больше чем один на каждый кодон-синоним.
это чушь, Петрович, 4 нуклеотида составляют 2 пары буква-антибуква (этих пар я не знаю), в любой паре каждый нуклеотид/буква будет анти- другому/другой, потому у любого из 64-ёх кодонов-триплетов будет совершенно единственный антикодон-триплет: каждую из 3-ёх букв кодона заменяют на её анти-букву и получают 3-буквенный антикодон, что и тащит на своей 3-спине АК
антидуплеты будут даже у ваших с Лагерквистом дуплетов, но к сожалению таскать АК на своeй слабенькой спине они не могут и потому кодом генетическим не стали
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
14 Март 2018 12:19 #5778
разумеется, и его нуклеотиды/буквы будут анти- нуклеотидам/буквам соответствующего кодона мРНК, потому антикодон единственен и только к нему может прильнуть как ключ к замку кодон мРНК, тем самым выбирая для синтеза АК на спине антикодона ; а ваши с Лагерквистом дуплеты тихо сосут в сторонке, потому что НЕ могут носить АК на спине и значит (анти)кодонами НЕ будут
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
14 Март 2018 12:48 #5779
Хайдук wrote:
разумеется, и его нуклеотиды/буквы будут анти- нуклеотидам/буквам соответствующего кодона мРНК, потому антикодон единственен и только к нему может прильнуть как ключ к замку кодон мРНК, тем самым выбирая для синтеза АК на спине антикодона ; а ваши с Лагерквистом дуплеты тихо сосут в сторонке, потому что НЕ могут носить АК на спине и значит (анти)кодонами НЕ будут
Вы хотя бы поняли, что написали? К учебнику, любезный и болезный.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
01 Апр 2018 04:58 #5781
Основатель Волнового Генома - подал в отставку.
Сотрудники и пользователи КвантоФорума - в шоке, потому что "Волновой Ломоносов" современности САМ сдался под градом научных аргументов.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
02 Апр 2018 06:06 #5783
Однако "Волновой Ломоносов" даже свою апрельскую распродажу времени лежания на К-кровати проводит без учета требований к оформлению статистически правильно данных., вот пример как не правильно представлено им иформация..
.... До- Хронический панкреато-холецистит вялотекущего течения (признаки загиба ж.протока); проктосигмоидит на фоне дисбактериоза кишечника; геморрой. После- Положительная динамика в состоянии ДПК, толстого кишечника и прямой кишки, улучшения состояния желчных путей печени.
.... До- Хронический аллергический трахеобронхит вне обострения; пневмосклероз (больше справа). После- Положительная динамика в состоянии бронхов; пневмосклероз.
Сердечно-сосудистая и нервная системы:
Напомним Нашему форумному лекарю, что нужны ЗАКЛЮЧЕНИЯ специалистов по этому профилю, а не Ваше лекарское мнение.
Хорошая статистика начинается после 20 наблюдений.
Волновой геном №32. Беседы с Петровичем о главном
02 Апр 2018 19:30 #5784
Как wrote:
Нашему форумному лекарю, что нужны ЗАКЛЮЧЕНИЯ специалистов по этому профилю, а не Ваше лекарское мнение.
Хорошая статистика начинается после 20 наблюдений.
КАК-е. Специалистов по этому профилю нет, кроме нас и еще 2-3 человек. КАК-а в их счет не входит.
...решается эта проблема физиически так — сначала оптический сигнал модулируется вышеупомянутым сверхширокополосным электрическим сигналом, потом промодулированный оптический сигнал проходит полагающееся ему расстояние по оптоволокну и поступает на фотодетектор. На выходе фотодетектора восстанавливается тот электрический сигнал, при помощи которого осуществлялась модуляция оптического сигнала.
II. Радиофотоника - это просто!
Новое направление фотоники - сверхвысокочастотная оптоэлектроника. М.Е. Белкин, А.С. Сигов. // Радиотехника и электроника, том 54, №8, с.901-914. 2009 г. // Смотреть в формате pdf.
О перспективах использования методов и средств микроволновой фотоники в сверхширокополосной радиолокации и сверхширокополосной радиосвязи. Ю.Н. Вольхин, А.М. Мандрик, Ю.И. Носов. // Научный семинар «Современные проблемы радиофизики и радиотехники». 27.11.2010 г. // Скачать архив с презентацией и стенограммой доклада.
Аналоговые ВОЛС СВЧ с положительными коэффициентами передачи. Ю.Н. Вольхин, А.В. Гамиловская. // XXXX Научный семинар «Современные проблемы радиофизики и радиотехники» 27.04.2013 г. // Скачать архив с презентацией и стенограммой доклада.
Обзор возможных способов реализации радиофотонных АЦП. Е.В. Тихонов, Ю.Н. Вольхин.// V общероссийская научно-техническая конференция «Обмен опытом в области создания сверхширокополосных радиоэлектронных систем» (СВЧ-2014). 2014 г. // Смотреть в формате pdf.
Обзор и исследование возможных вариантов реализация сверхширокополосных аналоговых процессоров диапазона СВЧ с использованием методов и средств радиофотоники. А.В. Гамиловская, А.А. Белоусов, Е.В. Тихонов, А.А. Дубровская, Ю.Н. Вольхин.// Электронная техника. Серия 2: Полупроводниковые приборы. №5 (239). С. 4-11. 2015 г. // Смотреть в формате pdf.