Как не странно Вы Олег,натыкаетесь на ту же ошибку,что и ППГ... Цветной волчек можно запустить только имея Две Волны...то есть почти что на встречных пучках..только тогда можно получить эти 3-х мерные ЭМ образования....и мощность их должна быть минимальной....тогда и воспроизводить будет максимальной ( наведенные помехи уйдут )

Поршень написал(а):Как это ?))

Я не последователь ППГ, даже в теории ВГ. Просто наблюдатель. А до цветных революций волчков пока просто не дорос.

Гаряев никак не устает повторять, что его толкнуло на лингвистику и волны.

- Ниренберг, который не смог объяснить, почему когда отсутствует фенилаланин, то на поли(У) рибосома может включать и лейцин. Причем ин витро и в ненормальных условиях.

А в нормальных, примерно так -

UUU Phe 42.3%
UUC Phe 57.6%

UUA Leu 10.2%
UUG Leu 23.0%

Да еще третья буква либо пиримидин, либо пурин.

---

Но успокоится на этом примере кодирования он не может до сих пор.



Встреча с П. П. ГАРЯЕВЫМ 25 апреля 2012 года СПб

Отредактировано Олег (2012-05-22 12:54:26)

Многие направления близки по смыслу. ..вот уже научились записывать информацию на днк....так что не все так плохо...*** m.gazeta.ru/science/2012/05/22_a_4596573.shtml ***

На пост 602 .... не надо быть последователем мистика Пети Г... за 20 лет он так и не привел НИ ОДНОГО ПРИМЕРА для подтверждения своей правоты... что до фильма то это фильм о том, как Русский Ученый Хочет Добиться Признания .... но у него явно не все получается ...
ps
Жалость раздают бесплатно, а вот зависть нужно заслужить.

Чукча не из Сибири.. написал(а):Да надо))

я то счас злой на РР)

= повторюсь - ППГ то по сути прав, но делает все возможное, чтоб на него плевали...

- Спроси Михаила Б. - я то за..ся в мозгах - мож он объяснит

Олег написал(а):Чем?

Хайдук написал(а):Поршень написал(а):Это то и может привести к пониманию всего механизма, который позволяет клеткам задействовать нужные для них гены, но запрещает им включать гены, предназначенные quantoforum.ru/nobelprize/100-lingvistik...tomy?start=60#153116 для другого типа клеток
Именно этот процесс и поддерживает все видение этого направления ...
ps
Жизнь - как поезд. Встанешь у неё на пути - раздавит, отойдёшь чуть в сторону - пронесётся мимо.

Олег написал(а):Урацил может спариваться с ЛЮБЫМ азотистым основанием - могу даже структуры привести. Кстати в антикодонах РНК митохондрияй ТАК И ЕСТЬ.
И вообще не забывайте, что по некоторым оценкам в функциональных РНК (рибозимах, тРНК) 40 процентов (!) спариваний оснований НЕ Уотсон-Криковские - по крайней мере ОЧЕНЬ МНОГО.
Школьные учебники и вопросы ЕГЭ по биологии составляли не совсем грамотные в биологии люди. Они НА САМОМ ДЕЛЕ думают, будто бы антикодон в тРНК связывается ИСКЛЮЧИТЕЛЬНО Уотсон-Криковскими связями.
Эти не совсем грамотные люди - составители ЕГЭ - на полном серьёзе дают задание, где правильным ответом бывает наличие урацила в первом положении антикодона, который якобы должен спариваться с аденином. Как они заблуждаются! Урацила в первом положении НЕ БЫВАЕТ. НИКОГДА. Плавание идёт не только по первому, но и даже по третьему кодону, причём в связывании антикодона участвует и рибосомная РНК, которая вводит свои коррективы и обеспечивает так очаровавшее мистиков румеровскую симметрию: заменим А на G или наоборот, G на U, или наоборот, и перейдём от вырожденного кодона (кодирование определяется ТОЛЬКО первыми двумя нуклеотидами) к невырожденным); а заменим первый нуклеотид кодона на комплементарный - останется в первой группе вырожденности. Какой только мистики по этому поводу не приходилось слышать.
А неправильное чтение кодонов - вещь ОБЫЧНЕЙШАЯ. Мы заклонировали ген AluI рестриктазы, где в рамке считывания 5 (!) стоп-кодонов - ничего читает еколятина.

Отредактировано LUKA (2012-05-23 10:48:50)

LUKA]Урацил может спариваться с ЛЮБЫМ азотистым основанием/quote]

---

Да смысл то не в этом.

Я привел пример, из-за чего Гаряев смертельно обиделся на Ниренберга и Крика. И применил понятия лингвистики к трансляции мРНК, как единстренно правильную модель (контекст важнее самого текста), полностью отвергая триплетное кодирование. Чем навел на себя гнев очень многих, чуть более реально смотрящих на вещи.
Так вот, я довольно долго мучал рибосомщиков отдела на предмет контекста. Некоторые его почти вообще не допускают для рибосом. Триплет + одна буква и точка. Другие допускают влияние до восьми букв. А Гаряев считает, что правильная трансляция зависит всех букв гена.


quote=LUKA написал(а):

---

Насчет этого и вопросами ЕГЭ морочте голову Хайдуку )
Чтоб не задавал лишних вопросов про в чем и где Гаряев прав.


LUKA написал(а):А этим - самому ППГ ). Ему понравится очень.
Но в подавляющем большинстве при клонировании не то что генов, но и синтезе геномов - правил триплетного кодирования вполне достаточно.

---

В настоящий момент ППГ, как показано в его апрельской лекции этого года - до сих пор злится на Ниренберга с Криком. Чем еще больше отталкивает людей от попыток понимания волновой природы матриц клеток и организмов.

Отредактировано Олег (2012-05-23 12:00:39)

LUKA написал(а):Вы чего, их туда специально вставляли?
Если нет, то сколько раз был сделан сиквенс? Вы точно уверены в их наличии?)
Если да, опубликовали хоть?

Отредактировано Олег (2012-05-23 19:35:43)

Олег написал(а):Я тут и в вверху загнул немного.

Но не хотелось бы, чтоб многие влазили в специфику перевода текста нукл кислот в пептидный. Это предмет НЕ обсуждения тут. Т.е., чем меньше понимаешь классиков, тем больший идиотизм может из тебя вылезть. Причем, иногда очень полезный.

Типа - ну не обязательно человеку знать всю совокупность знаний по механизмам трансляции, которая зависит от сотен факторов даже для прокариот, чтоб придумать альтернативу кодирования. Кстати, для вирусов и прокариот не существует мусорной РНК\ДНК - даже наоборот. А они и по массе, и тем более по количеству - несравнимы со всеми остальными.

Самый близкий к идеям контекста из профессиональных транслянщионников - это Майк Ярус. Он смотрел сайт-направленным мутагенезом тРНК в антикодонах и вне, на реакцию аминоацил-тРНК синтетаз. Последние отвечают, какую АК присоединить в зависимости от последовательности антикодона. И ВСЕ их взаимодействия для его глаз.

Он ничего не мерял термодинамически. А наши без этого не могут по образованию политеха Питера. Там у них только один биолог с ЛГУ. И он им выделяет десятками грамм рибосом и тРНК. А они мерят т\д константы. Теперь уже в Германии с дружественной лабораторией Ниер-за

=

читайте, кто хочет Yarus about tRNA mutation

Ну а мы - ну все-таки про источник волн водки для самообразования

Отредактировано Олег (2012-05-23 20:17:35)

Олег написал(а):А разве ответ не ясен?
Олег написал(а):Я читал его некоторые статьи. И вагон других статей по этой теме - исследованию специфичности АРСаз и кодирования - ничего общего с фантастикой Гаряева.
Олег написал(а):AluI - это старейшая известная рестриктаза, которую у нас использовали ещё в эпоху диалектического материализма. Его исследовали вдоль и поперёк (а я нашёл и запатентовал т.н. AluBI - отличающийся по чувствительности к метилированию, и выделить его можно зараз ведро, а не каплю).
Сам сиквенс давно и благополучно хранится у буржуев в базе данных rebase.neb.com/cgi-bin/seqget?AluI
Те, кто занимаются клонированием знают эти ОБЫЧНЕЙШИЕ вещи не по литературе, а по роду работы.

Отредактировано LUKA (2012-05-24 07:20:21)

Уважаемый LUKA в своих постах Вы не однократно подтверждали, что варианты воздействия на работу клетки достаточно туманны и как вывод из этого делаете странный скачок что мистик П.Гаряев - фантаст. К сожалению на этом форуме такие заявления не сколько опрометчивы... особенно в доказательной части. Есть опыты которые, расходятся с мистикой П.Гаряева, есть опыты и подтверждающие его взгляды ... может быть Вы сможете спуститься с академических вершин, и более подробнее объяснить Ваш скепсис на некоторые явления зацепленные тут ... а именно ответная реакция полосок сухой химии на 3-х мерное воздействие файлов мШЭИ на водный раствор, не понятные dtob с изменением глюкозы и инсулина при воздействия на органы человека, к стати подверженные лаб. исследованиями ... ну и конечно искуственный очень быстрый апостоз яблочек и долгое мучительное засыхание оных при разных формах воздействия файлами мШЭИ на практически одни и те же клеточные структуры ...
ps
главное что бы ответы не выглядели бы вот так ...
- Никогда не пытайся понять, то чего не можешь понять.
- Не понял...
- И не пытайся!

Чукча не из Сибири.. написал(а):Охотно отвечу. Я действительно читал его шизофрению несколько лет назад - прикрытое наукообразие. Как- даже давал ПОДРОБНУЮ критику его положенииям на сайте upself.ru, но сейчас этот сайт закрыт. Перечитывать нет желания. Ну если будут здесь на форуму ВСЁ-ТАКИ конкретные заявления - положения - опыт, то пожалуйста, готов обсуждать. А пока мой вопрос о том, что же здесь конкретно заявляется остался без ответа.
А тратить время ОПЯТЬ на перечитывание - нет желания - ни про фантомы с хромосом, которые якобы перезаписываются, ни про голографические коды.

Если бы Горяев был бы НЕ ТОЛЬКО фантазёром-выдумщиком, его бы разработки получили бы широкое применение. А так, типичное для людей с нетрадиционной научной ориентацией чтение мантры про преследование академиками.
Теперь даже людей лечат sva-genetica.narod.ru :
Наша лаборатория представляет уникальные, не имеющие аналогов в мире препараты, созданные для омоложения и для борьбы со страшными болезнями.... С помощью наших препаратов вы сможете полностью вылечить как функциональные так и органические болезни (рассеянный склероз, сахарный диабет, паралич, болезнь Паркинсона, Альцгеймера, гипертонию, нейроциркуляторную дистонию, астму, ВИЧ и СПИД, онкологические заболевания и т.п., в том числе: восстановление ауры человека после негативного влияния естественного радиационного фона Земли - полное, 100% исцеление от самых тяжелых органических заболеваний). В том числе болезни переданные генетическим путем.... методика лечения органических заболеваний основана на безлекарственном информационном восстановлении здоровья человека... Это панацея в прямом значении этого слова.. Сильнее этих технологий только лечение от Бога.


Взял бы Гаряев да проверил, как изменяется первичная структура ДНК и последовательности кодируемых ими белков при воздействии голограмм - получил бы Нобелевскую премию. А так даже шнобелевской недостоин.

Отредактировано LUKA (2012-05-24 09:39:01)

LUKA написал(а):мне - немного, а Хайдуку - нет. А цитирование из контекста выдернуто.

LUKA написал(а):фантастика Гаряева в механизмах трансляции в том, что это не линейный перевод одного текста (алфавита) в другой типа компьютерного (со множеством ошибок), а более осмысленный. Под чутким руководством партии и правительства волновой матрицы. Работы Яруса наиболее близки к такому пониманию управления смысловой трансляции. Для меня, правда. Каждый читает и воспринимает как может.
Скрытый текст:Разве сложно ответить по существу вопроса о пяти стоп-кодонах в рамке считывания?
По данной ссылке в посл там их нет.
А по роду работы эти ОБЫЧНЕЙШИЕ вещи приходилось делать не раз ))

LUKA написал(а):Его особо не интересует проблема 1-2% кодирующего человеческого генома. Он мечтает о возможности управлять здоровьем неизлечимо больных. В том числе и себя.
Как он это делает - дело другое.

Олег написал(а):И не стыдно Вам его так его пинать и издеваться над ним? Вы хотите выдать его не только фантазёра, за некоего идиота, которому не интересно ФУНДАМЕНТАЛЬНЕЙШЕЕ открытие - изменение 1-2 процентов генома (даже это открытие потянуло бы на Нобелевку), про которые ОН НАСТОЛЬКО УВЕРЕН УМОЗРИТЕЛЬНО, что даже проверять не нужно. Зачем Вы его так опускаете?

Олег написал(а):Разве сложно ПОВНИМАТЕЛЬНЕЕ прочитать ссылку? Придётся разжёвывать. Открываем ссылку rebase.neb.com/cgi-bin/seqget?AluI
Находим В ПРАВОЙ СТОРОНЕ ВНИЗУ подпись
DNA (FASTA style): View * Download
Protein (FASTA style): View * Download
Нажимаем нужный даунлоуд. Получаем сиквенс.

Отредактировано LUKA (2012-05-24 11:30:49)

LUKA написал(а):))) - абсолютно не стыдно.

Это он сам себя так. Ведь он до сих пор вполне серьезно плачется про напрасно потраченные несколько миллиардов баксов на программу геном человека. Внимательней читайте его опусы - тогда еще и не так опустите

Олег написал(а):Сейчас стоимость сиквенса генома человека уже приближается 30 тысячам долларов. Предполагается, что через несколько лет стоимость сиквенса генома человека будет стотить 1000 долларов - есть такая уже программа.

Вот бы слушались этого умозрителя-фантазёра-(Гм!)неадеквата!

Отредактировано LUKA (2012-05-24 11:43:36)

LUKA написал(а):...

Сиквенс по той ссылке увидел сразу. В самой длинной рамке считывания (539-1765) стоп-кодонов НЕТ.

Не играйте в дурачка. Такие ответы начинают напоминать стиль ППГ.

Вопрос был - уверены ли Вы, что колятина пережевывает (слова Ваши) пять стоп кодонов.... (читайте пп.610)

Отредактировано Олег (2012-05-24 11:58:08)

Давайте определимся в терминологии...
Классический подход - это то что устаканено.
Имитационный подход (как замена устаревшего названия Волновой Геном) это процесс связанный с ЭМ имитацией 3-х мерных молекул на работу Генома..как вариантов полученные из исследований на базе классического подхода к решению задачи по Геному...
Может тогда и не будет особой путанице в понятиях заложенных Нашим Мистиком П.Гаряевым... Правда и тут есть особенность...имитация ЭМ 3-х мерными молекулами то есть запуск дальнейших процессов возможен.... только если последующий процес включается по тригерному варианту...
Может быть таким образом можно обойти острые углы....

Поршень написал(а):Придумайте сами подходящую замену термину волновой геном, который сильно опошлил его автор...

Хотя еще не вечер. У ППГ есть время его распошлить и показать всем волнистую кузькину мать )

LUKA написал(а):геном за 1000 рублей - так планирует новое правительство РФ.

А Гаряеву не понятно и жалко - почему потрачены деньги не на его ВГ(
Только одно это уже отпугивает от восприятия его текстов.

Олег написал(а):Играете в дурачка Вы. Сначала Вам ОЧЕНЬ ЛЕНЬ посмотреть где же закачивается сиквенс. Затем Вам ОПЯТЬ ЖЕ ЛЕНЬ проанализировать все рамки считывания, как будто их здесь десяки.
Специально для откровенно ленивых и невнимательных. См. рамку ATGTGTTC CGGCGGTTCA
Не ошибитесь в наборе стоп-кодона, а то опять придётся писать подробную инструкцию.

Поршень написал(а):Напоминает попытку сделать Лысенко основателем эпигенетики.

LUKA написал(а):Были просмотрены все рамки. В гене AluI стоп-кодонов нет. А на другие рамки насрать.

Должен быть дан четкий ответ на вопрос п.610 - ДА или НЕТ. А не ссылки с подъебками, как это любил делать ППГ на конкретные вопросы инквизиции.

---

Чуть добавлю.
Хотя вопрос про AluI-стоп не в теме, но когда начинают отвечать в стиле ППГ, начинаешь задумываться, а стоит ли всерьез воспринимать остальные тексты. Особенно когда начинают строить из себя очень крутого генного сантехника.

Отредактировано Олег (2012-05-24 12:34:49)

Олег написал(а):Перевожу на русский - дайте и здесь мне ПОДРОБНУЮ ИНСТРУКЦИЮ. Я же Вас просил - набирайте последовательность стоп-кодонов ПРАВИЛЬНО. Для тех, кому трудно правильно вбить стоп-кодон. Их всего три - TAA, TAG TGA. Вбивать желательно без ошибок. Лучше копипастой.
Нажимаем сонтрал F - это значит найти - вписываем стоп-кодон. Вставляем туда последовательность TGA. Смотрим.

Ладно, чувствую, что Вам тяжело это даётся.
Сделаю эту сложную работу за Вас. Вот результат
ATG TGT TC C GGC GGT TCA ACC AGG ACT TCT TCA CTG GCA GAT GGC TGC GCG CTC TCG ACG CGG TTC AGG AGA TGC ACG CTG CCG CGT GGC CCG ACA GGT TCC AGA ACG AGT GGG CTG GCT TCT ACC TCG AGT ACC GCT TCG ACA GGT TCG

TGA



GAG CGG AGG GGC TTG CGG ACA TCG TCC AGT TCC AGA AGA AGA AGC AGC GCG GGG GCT ACG ACT ACG ACC TGG TCT TCC ACG ACG GGC CGC GTG TCG ACT TCT ACG GTG ATC


TGA


AGG CCT CCA ACA TCG CCA AGC AGG AGG CCA TCG GCA ACG ACC GCG ACG ACC TGG TCC GCT GCC TCG AGG AGT TCG GCC GCT TCT GGT ACG

TGA


TCT ACG AGC ACG ACA CGG TCC ACG GGA AGG CCA ACG GCG ACG TCG CCA CGA TCG AGT GGA ACG AGT GGC GGC GGT CCG TCG GGC ACG TTC AGG GCA AGG AGT ACA GCC
CGC TCT CCT ACT CTG GGC GGT TCA AGG AGT CGG TGC GGT TCG CCC GGA TGC AGG TGC TCG AGG

TGA

ACG AGG CGA ACG CTA GCC TCG TTC TCG GCG ACC ATC ACC AAG GCC GGC AAC CCA GCG GTG CCT CGC GCG AGC CCA AGG TCA AGA TCC

TGA


AGAA GCACATCGAC AACTTCCTGA TCTTCTCCAG CGCGCTGCCC
GAGGTGCCGA GCGGCCTACG TGTCTGA

На этом же сайте в разделе AluI НЕСЛОЖНО найти ссылки, касающиеся клонирования этой рестриктазы. Наши заклятые друзья-конкуретны и Biolabs - тоже клонировали её в еколятину.
Мы позднее, нам незачем публиковать, а у буржуев можете посмотреть.

Отредактировано LUKA (2012-05-24 12:58:48)

На пп.625...Наш мечтатель Так далеко не заглядывал. Однако управление мембранными парами с помощью ЭМ имитации молекулы инсулина для прохода реальной молекулы глюкозы....заставляет отвлечся от стоп-кодонов и поразвлекаться мыслью что стоп-кодон может включаться и другим образом....

п.628 гласит
Ладно, чувствую, что Вам тяжело это даётся.
Сделаю эту сложную работу за Вас. Вот результат
ATG TGT TC C GGC GGT TCA ACC AGG ACT TCT TCA CTG GCA GAT GGC TGC GCG CTC TCG ACG CGG TTC AGG AGA TGC ACG CTG CCG CGT GGC CCG ACA GGT TCC AGA ACG AGT GGG CTG GCT TCT ACC TCG AGT ACC GCT TCG ACA GGT TCG

TGA ...
Ранее ЛУКА дал ссылку на
Сам сиквенс давно и благополучно хранится у буржуев в базе данных **rebase.neb.com/cgi-bin/seqget?AluI**

:Жмем на указанную ссылку и там - на DNA (FASTA style):View
Получаем -
GTGGGATCAA TCGTCGTTGA CCAGATCGGC CCTGATGGGG AACTCGTTCC AGACGTCGAC ACGACGCTCA GCGAAAAGGA GAAGAACGAC CTCCTCCTGT CCGCGCTGCC CGGCGCCACG ACGTCGACGT ACGGTGGCGC CCGCGTGGTC AGGTTCCACG ACCAGATCAT CCTCAAGGCT CAGGTCACAC ACCTCGGACA CCCGTGGCCC GCCTACAAGA AGCGCATCCA GATCCCGAAG TCTTGGCTGG AGGTCGAGCG ACGGGCCACG CGCGACGGAC TGGTGACCCG CTTTGTCGGC ATCTATCGGT ACCGCGCCGT CACCGTTTTC GTCGACTTCG ACCCGCGGAC GTACATCCAG CGCGCTGCCA ACAACTCTGC GGCCCACGTC TCGACCAACG ACCTGCACCA GGCACAGACG CTCGGGCTGT TCGAGCGCGT CGATCGCAAC GGGAACTGTC TGACCAGCGT CCGGGCTGAA CTGCTCGCCG ACTACCTTGT CGGTGTCGCA GACACCACTC ACCCGAGCGT CGATGTGTTC CGGCGGTTCA ACCAGGACTT CTTCACTGGC AGATGGCTGC GCGCTCTCGA CGCGGTTCAG GAGATGCACG CTGCCGCGTG GCCCGACAGG TTCCAGAACG AGTGGGCTGG CTTCTACCTC GAGTACCGCT TCGACAGGTT CGTGAGAGCG GAGGGGCTTG CGGACATCGT CCAGTTCCAG AAGAAGAAGC AGCGCGGGGG CTACGACTAC GACCTGGTCT TCCACGACGG GCCGCGTGTC GACTTCTACG GTGATCTGAA GGCCTCCAAC ATCGCCAAGC AGGAGGCCAT CGGCAACGAC CGCGACGACC TGGTCCGCTG CCTCGAGGAG TTCGGCCGCT TCTGGTACGT GATCTACGAG CACGACACGG TCCACGGGAA GGCCAACGGC GACGTCGCCA CGATCGAGTG GAACGAGTGG CGGCGGTCCG TCGGGCACGT TCAGGGCAAG GAGTACAGCC CGCTCTCCTA CTCTGGGCGG TTCAAGGAGT CGGTGCGGTT CGCCCGGATG CAGGTGCTCG AGGTGAACGA GGCGAACGCT AGCCTCGTTC TCGGCGACCA TCACCAAGGC CGGCAACCCA GCGGTGCCTC GCGCGAGCCC AAGGTCAAGA TCCTGAAGAA GCACATCGAC AACTTCCTGA TCTTCTCCAG CGCGCTGCCC GAGGTGCCGA GCGGCCTACG TGTCTGA

Видим GTG как старт (для E.coli примерно 14% от всех старт-кодонов) и в конце один TGA.
Переводим последовательность и получаем пептид в 408 АК

Откуда взялось то, что приведено в пп. 628 – известно только автору и никак не соответствует приведенной им же ссылке на последовательность AluI.
В последний раз спрашиваю – клонированный вами ген имеет внутри рамки пять TGA ? ДА или НЕТ ? )))