Вопреки чему?

Из 64 возможных триплетов 61 является смысловым кодоном, то есть кодирует аминокислоты. Все кодоны триплетны, неразрывны и не перекрываются в тексте, а также не разделены межкодонными знаками (запятыми). Все кодоны однозначны, то есть каждый кодон кодирует единственную аминокислоту.. Иначе говоря, в направлении кодон == аминокислота генетический код однозначен.
Обратное соответствие в направлении аминокислота == кодон неоднозначно, и это свойство называется вырожденностью. Отдельные аминокислоты кодируются группами (сериями) кодонов-синонимов. 18 серий из 20 содержат от двух до шести кодонов, две серии (Met и Trp) не вырождены, содержат по одному кодону. Средняя вырожденность генетического кода приблизительно три кодона на серию.

Вопреки непониманю, что если биосистемы будут сдуру пользоваться канон-таблицей Крика как руководством к синтезу собственных белков, то судьба их незавидна.

по 32 кодонам-омонимам.

Где, Петр, где эти кодоны-омонимы в расписанной выше последовательности гена GFP ? Укажите стартовые позиции омонимических триплетов или даже дуплетов, если хотите. Ведь проще этого не бывает, не правда ли? Вы же не можете привести даже одного точного, бесспорного утверждения

Хайдук написал(а):Вопрос к Миттельшпилю: бывают ли подобные неоднозначности в дальнейшем синтезе рибосомой некоего белка после такого запутанного старта?
В принципе, да. Но не в том смысле который патается притянуть ППГ. Известно много кодов поверх трплетного кода, они обеспечивают регуляцию за счет молекулярного связывания (например, регулируют старт, стоп, кинетику и скорости всех процессов, но они не переписывают триплетный код, который однозначен).

mittelspiel2010-04-22 17:44:59 написал(а):
Хайдук написал(а):Вопрос к Миттельшпилю: бывают ли подобные неоднозначности в дальнейшем синтезе рибосомой некоего белка после такого запутанного старта?
В принципе, да. Но не в том смысле который патается притянуть ППГ. Известно много кодов поверх трплетного кода, они обеспечивают регуляцию за счет молекулярного связывания (например, регулируют старт, стоп, кинетику и скорости всех процессов, но они не переписывают триплетный код, который однозначен).

mittelspiel2010-04-22 17:44:59 написал(а):
Известно много кодов поверх трплетного кода.

Вася, дело в том что ППГ хоть обясняет как это может происходить

А я говорю в направлении кодон == аминокислота генетический код однозначен.

наплевать и забыть. дублировать - пОшло.

Все динамичные части биосистемы в определенной мере спутаны, нелокальны, невещественны, как невещественно, идеально Намерение. Намерение любой биосистемы развиваться и адаптироваться к переменчивым условиям. Но они проявляются в вещественных биохимических и физиологических актах как результат мгновенного осмысления собственного on line состояния.
...
Такой взгляд позволяет объяснить многое непонятное, например, выживание термофилов при температурах выше 100 градусов по Цельсию, когда должны разрушаться ДНК, белки, мембраны. Термофилы выживают, вероятно, за счет быстрых переходов и возвратов из локальных в нелокальные состояния.

Хайдук 2010-04-22 16:09:44 написал(а):

Где, Петр, где эти кодоны-омонимы в расписанной выше последовательности гена GFP ? Укажите стартовые позиции омонимических триплетов или даже дуплетов, если хотите. Ведь проще этого не бывает, не правда ли? Вы же не можете привести даже одного точного, бесспорного утверждения

а мои ответы на них.

В этом смысле вся грандиозная и непонятная доселе проблема геномных транспозиций становится прозрачной как фактор многомерного проявления конкретных семантик для временно омонимичных и/или временно нулевых (типа псевдогенов) знаковых нуклеотидных последовательностей.

Ответа до сих пор нет, только бред

идиотам, конечно, бред. На то они и идиоты.

Внешнее проявление ВИМ ДНК заключаются в том, что при использовании метода лазерной корреляционной спектроскопии, при изучении светорасеяния препаратами ДНК in vitro обнаруживается необычный эффект. В светорассеяние вносит вклад некий фактор, не предусмотренный теорией светорассеяния. Природа феномена не ясна. Группа Р.Пекоры характеризует ВИМ ДНК как «...mimicing the effect of dust» (MED-effect), то есть эффект, имитирующий пыль, хотя исследователями предприняты специальные меры, чтобы в препаратах ДНК не было посторонних частиц.

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

Группа Р.Пекоры обнаружила этот феномен методом корреляционной лазерной спектроскопии, но не на тотальных высокополимерных фракциях ДНК, как в наших экспериментах, а на рестриктных фрагментах ДНК определенной длины. И в этом (рестриктном) случае ДНК тоже вела себя «аномальным» образом: зондирующие фотоны дифрагировали не только на полинуклеотидных цепях, но и на «посторонних частицах», которых в препарате заведомо не было. Этот, никак не прокомментированный группой Р.Пекоры, эффект затруднил ей объяснение необычного характера светорассеяния ДНК с позиций, казалось бы, хорошо разработанной теории Цимма и Роуза для влияния динамики полимеров в водных растворах на зондирующий световой, в том числе и лазерный, пучок.

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

а вот оригинал:
Allison, Sorlie, Pecora, 1990 написал(а):

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

Дискуссия по этому поводу была. См. аналы.

Предполагаемые волновые пути работы хромосом объясняют, как происходит строительство пространственно-временной структуры высших биосистем по волновым и семантическим векторам работы аппарата наследственности. Такие вектора работают через механизмы голографической памяти хромосомного конттинуума и через квази-речевые пути построения. ДНК-РНК-Белков. Считывание-сканирование генома-биокомпьютера здесь происходит, например, за счет эндогеннных лазерных излучений и солитонных возбуждений геноструктур. Нелокальность генома, как кодирующего и отчуждающего геноинформацию хромосомного континуума, уже заложена в его голографических функциях. Такой сорт информации распределен в геноме, как в голограмме и/или квазиголограмме, и как во фрактале одновременно. Это может иметь место, если рассматривать геном с чисто вещественных позиций. На таком уровне геноинформации еще не работает квантовая волновая нелокальность. Геноголограмма, если «считывать» ее волновым образом, приводит к тому, что вещество хромосом отчуждает знако-образные волновые фронты в качестве направляющих морфогенеза.

ППГ написал(а):

Предполагаемые волновые пути работы хромосом объясняют, как происходит строительство пространственно-временной структуры высших биосистем по волновым и семантическим векторам работы аппарата наследственности. Такие вектора работают через механизмы голографической памяти хромосомного конттинуума и через квази-речевые пути построения. ДНК-РНК-Белков. Считывание-сканирование генома-биокомпьютера здесь происходит, например, за счет эндогеннных лазерных излучений и солитонных возбуждений геноструктур. Нелокальность генома, как кодирующего и отчуждающего геноинформацию хромосомного континуума, уже заложена в его голографических функциях. Такой сорт информации распределен в геноме, как в голограмме и/или квазиголограмме, и как во фрактале одновременно. Это может иметь место, если рассматривать геном с чисто вещественных позиций. На таком уровне геноинформации еще не работает квантовая волновая нелокальность. Геноголограмма, если «считывать» ее волновым образом, приводит к тому, что вещество хромосом отчуждает знако-образные волновые фронты в качестве направляющих морфогенеза.

Вот наша статья по этому поводу

Цитируй меня

Фактически близкий эффект наблюдали Allison et. al., которые также использовали ДЛС для изучения рестриктных фрагментов ДНК. Они обнаружили аномальное светорассеяние таких фрагментов. Авторы определили этот феномен как ‘mimicking the effect of dust’, то ест как эффект, имитирующий пыль. В их исследовании этот эффект не являлся результатом пылевых загрязнений, но следствием влияния ‘объекта’, который вел себя как пылеподобные ‘частицы’, рассеивающие свет.

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

в этой статье великий шарлатан Петр Петрович Гаряев использует вот этот прибор c 37 (фото)-диодами:

ППГ написал(а):

Фактически близкий эффект наблюдали Allison et. al., которые также использовали ДЛС для изучения рестриктных фрагментов ДНК. Они обнаружили аномальное светорассеяние таких фрагментов. Авторы определили этот феномен как ‘mimicking the effect of dust’, то ест как эффект, имитирующий пыль. В их исследовании этот эффект не являлся результатом пылевых загрязнений, но следствием влияния ‘объекта’, который вел себя как пылеподобные ‘частицы’, рассеивающие свет.

а вот оригинал:
Allison, Sorlie, Pecora, 1990 написал(а):

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

Фактически близкий эффект наблюдали в Стэнфордском университете [Allison, Sorlie, Pecora, 1990]. Авторы также использовали ДЛС для изучения рестриктных фрагментов ДНК. Они обнаружили аномальное светорассеяние таких фрагментов, которого в соответствии с хорошо разработанной теорией не должно быть. Авторы назвали этот феномен «mimicking the effect of dust», то есть «эффект, имитирующий пыль».

Внешнее проявление ВИМ ДНК заключаются в том, что при использовании метода лазерной корреляционной спектроскопии, при изучении светорасеяния препаратами ДНК in vitro обнаруживается необычный эффект. В светорассеяние вносит вклад некий фактор, не предусмотренный теорией светорассеяния. Природа феномена не ясна. Группа Р.Пекоры характеризует ВИМ ДНК как «...mimicing the effect of dust» (MED-effect), то есть эффект, имитирующий пыль, хотя исследователями предприняты специальные меры, чтобы в препаратах ДНК не было посторонних частиц.

Группа Р.Пекоры обнаружила этот феномен методом корреляционной лазерной спектроскопии, но не на тотальных высокополимерных фракциях ДНК, как в наших экспериментах, а на рестриктных фрагментах ДНК определенной длины. И в этом (рестриктном) случае ДНК тоже вела себя «аномальным» образом: зондирующие фотоны дифрагировали не только на полинуклеотидных цепях, но и на «посторонних частицах», которых в препарате заведомо не было. Этот, никак не прокомментированный группой Р.Пекоры, эффект затруднил ей объяснение необычного характера светорассеяния ДНК с позиций, казалось бы, хорошо разработанной теории Цимма и Роуза для влияния динамики полимеров в водных растворах на зондирующий световой, в том числе и лазерный, пучок.

Фактически близкий эффект наблюдали Allison et. al.13, которые также использовали ДЛС для изучения рестриктных фрагментов ДНК. Они обнаружили аномальное светорассеяние таких фрагментов. Авторы определили этот феномен как ‘mimicking the effect of dust’, то ест как эффект, имитирующий пыль. В их исследовании этот эффект не являлся результатом пылевых загрязнений, но следствием влияния ‘объекта’, который вел себя как пылеподобные ‘частицы’, рассеивающие свет.

Also, shot noise present in experiments would be expected to increase the amplitude of the second and higher peaks. One possible explanation is the presence of trace amounts dust in light scattering experiments. When a small (comparable to the noise level) amplitude component of a gradual exponential decay is added to simulated g(t) data, mimicking the effect of dust, the CONTIN distribution function can be significantly altered.

Лечебно-косметический аппарат «Дюна-Т» создан на основе нового перспективного метода воздействия на ткани организма рассеянными лучами красного и инфракрасного цвета. В результате этого воздействия в тканях происходят уникальные биохимические процессы, направленные на восстановление клеточных структур. Биологическое действие волн красного и инфракрасного диапазонов имеет значительное преимущество перед другими видами излучений, использование же рассеянного, а не сфокусированного луча делает его применение безопасным.

Прощайте, болван.

Прощайте, болван. Теперь вы в вечном игноре у меня

И вам не скучать...

Чтобы проверить свою смелую теорию, учёные построили упрощённую теоретическую модель ДНК на компьютере. В ней каждый нуклеотид состоит из облака электронов вокруг центрального положительно заряженного ядра. Это негативное облако может двигаться относительно ядра, создавая диполь. При этом смещение облака туда и обратно приводит к образованию гармонического осциллятора. Поскольку фононы, по сути, являются квантовыми объектами, они могут существовать в виде суперпозиции состояний и умеют запутываться. Учёные начали с того, что предположили отсутствие любых тепловых эффектов, влияющих на спираль извне. Очевидно, что цепочки попарно связанных гармонических осцилляторов могут быть запутаны лишь при нулевой температуре. В своей пока неопубликованной научными изданиями статье физики приводят доказательство, что эффект запутывания в принципе, может возникнуть и при комнатной температуре.

Чтобы проверить свою смелую теорию, учёные построили упрощённую теоретическую модель ДНК на компьютере. В ней каждый нуклеотид состоит из облака электронов вокруг центрального положительно заряженного ядра. Это негативное облако может двигаться относительно ядра, создавая диполь. При этом смещение облака туда и обратно приводит к образованию гармонического осциллятора. Поскольку фононы, по сути, являются квантовыми объектами, они могут существовать в виде суперпозиции состояний и умеют запутываться. Учёные начали с того, что предположили отсутствие любых тепловых эффектов, влияющих на спираль извне. Очевидно, что цепочки попарно связанных гармонических осцилляторов могут быть запутаны лишь при нулевой температуре. В своей пока неопубликованной научными изданиями статье физики приводят доказательство, что эффект запутывания в принципе, может возникнуть и при комнатной температуре