Пикотехнология изображения белков
22 Янв 2012 16:08 #991
Пиная в очередной раз злостного лжеученого Цзяна автор статьи, скорее всего, и не догадывается, что тот здесь и сейчас без шума и пыли успешно реализует пикотехнологию. Ту самую пикотехнологию, священный крестовый поход за овладение которой провозгласило мировое научное сообщество, суля в туманной перспективе решение наболевших проблем современности за о-очень большие деньги.
Пикотехнология изображения белков
22 Янв 2012 17:32 #993
Я родом из Хабаровска. В 83 году в своей поликлинике встретил деда за 70 с иконостасом орденских планок на груди. Разговорились в очереди. Он рассказал мне про Цзяна. Передаю его рассказ, ничего от себя не добавляя.
У него случился инсульт. Парализовало левую сторону. Наши врачи,как водится, отдали его на мучения родственникам. Одна знакомая деда рассказала ему, что в Хабаровске есть чудо-китаец, и что он может его вылечить. Слава богу, дед еще мог коряво говорить и махать правой рукой. Он ЗАСТАВИЛ своих родственников оттащить его к Цзяну. Тот сказал ему в очередь (она была не маленькой). Дед начал бить себя правой рукой в грудь с орденами. Цзян сообразил, что это политика, и что деда надо без очереди. Тут же принял. Спросил деда, что ему первым делом поправить. Дед попросил ногу. Цзян воткнул ему в ногу
ЗОЛОТЫЕ иголки и подключил провода. Дед сам ушёл домой на ДВУХ ногах.
Всего было три серии по 7 сеансов. За каждый сеанс Цзян брал по 5(Пять) рублей = 105рублей-не особо большие деньги по тем временам.
Он полностью восстановил деда. На мой вопрос А что наши врачи?,
дед развёл руками:А что наши, хорошо,говорят.
Американские биологи разработали специальный компьютерный алгоритм, позволяющий получить эскиз трехмерной структуры произвольного белка по снимкам высокого разрешения с нескольких ракурсов, говорится в статье, опубликованной в журнале Structure.
Проблема восстановления трехмерной структуры белков является одной из самых сложных вычислительных задач. Как правило, белки состоят из множества тысяч остатков аминокислот, которые могут взаимодействовать друг с другом сотнями путей. Расчет всех возможных комбинаций и поиск правильного варианта занимает непозволительно много времени даже у современных суперкомпьютеров. В 2008 году группа программистов и биологов из университета штата Вашингтон привлекла к этой задачи коллективный интернет-разум, разработав компьютерную игру - белковый конструктор FoldIt.
Группа биологов под руководством Мэттью Бейкера (Matthew Baker) из медицинского колледжа Бейлор в городе Хьюстон (США) разработала компьютерную программу, которая позволяет относительно быстро получать примерную структуру того или иного белка по нескольким снимкам его молекулы с разрешением в 3-8 ангстрем (десятых частей нанометра).
По словам биологов, данная методика универсальна и не требует предварительных знаний о поведении и функциях белковой молекулы, в других методов восстановления структуры белков по фотографии.
Это особенно важно при работе с гигантскими белковыми комплексами из 10 или 30 отдельных молекул. Вы можете знать структуру одного или двух его компонентов, но вам нужно понимать, как все компоненты структуры взаимодействуют друг с другом. И если вам удастся разделить составляющие, вы сможете использовать наш метод для получения модели всех белков в комплексе, - заключает Мэтью Бейкер.
Группа физиков из Массачусетского технологического института под руководством Андрея Токмакова научилась количественно определять элементы вторичной структуры белка на основе спектров, полученных с помощью скоростного лазера за 10-12 секунды. Работа опубликована в журнале Analyst, с пересказом можно ознакомится на сайте института.
Исследователи облучали образцы белков в растворе импульсами инфракрасного света длительностью менее 1 пикосекунды и проводили сложный анализ происходящего поглощения. Свет поглощался основной полипептидной цепью, которая может быть в трех основных состояниях: уложенной в альфа-спираль, сложенной в Z-образный бета-слой или неструктурированной. Поскольку в трех этих структурах атомы углерода и кислорода взаимодействовали по-разному, то менялся и спектр поглощения белков, содержащих разное количество того или иного структурного элемента. На основе анализа получившегося спектра ученые делали вывод о содержании в белке разных элементов структуры.Чтобы проверить корректность нового метода, исследователи сравнивали результаты, полученные для 16 тестовых белков с известной структурой.
Работы лауреатов Нобелевской премии по химии-2013 — Мартина Карплюса, Майкла Левитта и Ари Уоршела — позволили ученым с атомной точностью увидеть процессы химических реакций между биологическими молекулами, сказал РИА Новости профессор Константин Шайтан, сотрудник биологического факультета МГУ.
"Современными экспериментальными методами мы не можем увидеть, как перестраиваются атомы, как они движутся, их пространственно-временные характеристики. А вот с помощью компьютерного моделирования мы это можем увидеть. Это, фактически, синтез биологии и суперкомпьютерных технологий. Это уникальная информация о самых интимных механизмах биологических процессов", — сказал эксперт.
Пикотехнология изображения белков
09 Окт 2013 15:13 #999
Кушелев это хто?
Интересно для молекул какой сложности такие методы моделирования начинают задыхаться и вязнуть в вычислениях?
Каким может быть уровень элементов/степеней свободы описания дабы путём вычисления взаимодействий между ними заполучить полную картину их коллективного (emergent/результирующего) макроскопического поведения? Пи*дец будет в том, что индивидуальная динамика элементов будет не до конца известна по той же самой причине, что сама является коллективным эффектом динамики большого числа ещё более элементарных степеней свободы и т.д.
Пикотехнология изображения белков
04 Апр 2015 15:55 #1004
А потомушо я в шоке от такого нездорового интереса... мне ведь небезразлично психологическое благополучие модератора форума психологической разгрузки...
Лично мне и в голову бы не пришло отслеживать состояние сайта Кушелева. 
