Ключевое слово
29 | 03 | 2024
Новости Библиотеки
Шахматы Онлайн
Welcome, Guest
Username: Password: Remember me

TOPIC: Базы по пространственной структуре биомолекул

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:12 #121

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
limarodessa написал(а):
Ну что у нас там в реакцию вступает ? Ну хорошо - сами напросились - фрагменты Оказаки
мало. что еще?

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:13 #122

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
не помню есть ли ветка под кроссинговер, но если хотите то мжете создать. оно того заслуживает. там не так просто

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:14 #123

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
mittelspiel написал(а):
мало. что еще?
Как мало ? Куда уже больше ? Ну давайте тогда структуру Холлидея

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:15 #124

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
limarodessa написал(а):
Как мало ? Куда уже больше ? Ну давайте тогда структуру Холлидея
Давайте молекулы называть. 1 - ДНК, это понятно. Что еще? давайте в отдельной ветке, будет удобнее.

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:18 #125

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
mittelspiel написал(а):
давайте в отдельной ветке, будет удобнее.
mittelspiel написал(а):
не помню есть ли ветка под кроссинговер, но если хотите то мжете создать. оно того заслуживает. там не так просто
Да я бы с удовольствием но :

quantrinas.bbhit.ru/viewtopic.php?id=14&p=14

Vladimirovich написал(а):
Бояре и Боярыни

Данное сообщение Инквизиции касается всего форума, но прежде всего биологических тем.

Большая просьба при создании тем убедиться, что темы аналогичного содержания отсутствуют
Если вам кажется что ваша тема содержит существенный нюанс, который делает ее отличной от других, сообщите об этом при ее открытии.
Иначе мы имеем ( прежде всего в Биологии) кучу еле начатых тем, перебитых позже другими.

Я позволил себе поставить номера для тем близкого содержания.
Предпочтительнее сначала закрыть более старые.
Если есть возражения, welcome
Правда Вы здесь тоже модер

Отредактировано limarodessa (2011-06-18 21:20:13)
Last Edit: 15 Сен 2015 08:47 by Vladimirovich.

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:22 #126

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
mittelspiel написал(а):
не помню есть ли ветка под кроссинговер
quantoforum.ru/category-60/238-mitoz-mej...tseplennost?start=90 Митоз, мейоз и квантовая сцепленность
Last Edit: 15 Сен 2015 08:48 by Vladimirovich.

Базы по пространственной структуре биомолекул 18 Июнь 2011 17:23 #127

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
limarodessa написал(а):
Митоз, мейоз и квантовая сцепленность
отлично, вот там и продолжим

Базы по пространственной структуре биомолекул 29 Июнь 2011 10:06 #128

  • Quantrinas
  • Quantrinas's Avatar
  • OFFLINE
  • Физик
  • Posts: 12340
  • Thank you received: 7
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
Quantrinas написал(а):

HyperChem - попса, на нём много не сделаешь, разве что визуализировать

Что Вы рекомендуете ? Какие проги ?
Quantrinas написал(а):
Смотря для чего.
limarodessa написал(а):
А Вы огласите весь список: и для квантохимии, и для молекулярной механики, молекулярной динамики и для комбинированных - QM/MM
Для квантохимии лично я использую семейство GAMESS: GAMESS US, GAMESS UK, Firefly (PC GAMESS).

Некоторые мои коллеги используют TurboMOL и MolPro.

Самая известная коммерческая программа - Gaussian.

Есть и другие перспективные проекты, например NWChem, ORCA.
Audiatur et altera pars

Базы по пространственной структуре биомолекул 29 Июнь 2011 10:27 #129

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Quantrinas написал(а):
Для квантохимии лично я использую семейство GAMESS: GAMESS US, GAMESS UK, Firefly (PC GAMESS).
Некоторые мои коллеги используют TurboMOL и MolPro.
Самая известная коммерческая программа - Gaussian.
Есть и другие перспективные проекты, например NWChem, ORCA.
Спасибо - очень ценная информация

Базы по пространственной структуре биомолекул 29 Июнь 2011 19:21 #130

  • mittelspiel
  • mittelspiel's Avatar
  • OFFLINE
  • Посадник
  • Posts: 3974
  • Thank you received: 14
  • Karma: 1
Quantrinas написал(а):
HyperChem - попса, на нём много не сделаешь, разве что визуализировать
А для данной задачи больше и не надо (вернее, больше и не сделаешь)

Базы по пространственной структуре биомолекул 30 Июнь 2011 17:19 #131

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Quantrinas написал(а):
HyperChem - попса
Хм... так ведь совсем недешевая эта попса если неворованную копию юзать

Базы по пространственной структуре биомолекул 30 Июнь 2011 19:09 #132

  • Quantrinas
  • Quantrinas's Avatar
  • OFFLINE
  • Физик
  • Posts: 12340
  • Thank you received: 7
  • Karma: 0
limarodessa написал(а):
Хм... так ведь совсем недешевая эта попса если неворованную копию юзать
Так и что? Дорогая игрушка для лохов.
Audiatur et altera pars

Базы по пространственной структуре биомолекул 03 Июль 2011 16:37 #133

  • limarodessa
  • limarodessa's Avatar
  • OFFLINE
  • Доцент
  • Posts: 16793
  • Thank you received: 79
  • Karma: -22
Господа ! Кто то знает софт который позволяет визуализировать и моделировать молекулы не только в статике а который может показать движение молекул и динамику электронных оболочек во время химических реакций, в идеале - в биологии ?

Базы по пространственной структуре биомолекул 04 Июль 2011 03:08 #134

  • Хайдук
  • Хайдук's Avatar
  • OFFLINE
  • Наместник
  • Posts: 49331
  • Thank you received: 130
  • Karma: 16
Симмуляторы хим. реакций должны это делать, зависит от разрешающей способности вычислений. Если вычисляют, значит могут нарисовать

Рейтинг@Mail.ru

Научно-шахматный клуб КвантоФорум